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Elementos de transposição - transposons e retrotransposons Aulus Barbosa Elementos de transposição Presentes em quase todos os organismos Correspondem a 50% dos cromossomos humanos Função incerta Tipos Classe 1 – através de RNA, retrotransposons Classe 2 – Via DNA Elementos de transposição em procariontes Seqüências de inserção bacterianas Podem bloquear a expressão de genes, mesmo em operons. Demonstração da inserção de DNA Características das sequencias de inserção procarióticas Todos codificam transposase Transposons procarióticos Transposon composto – elementos IS orientado em direções opostas (IR - repetição invertida) Transposon simples – flanqueado por sequencias IR curtas (< 50 pb) e não codificam a enzima transposase Mecanismo de transposição Transposase – corte no sítio alvo do DNA Inserção em outro sítio Ação das enzimas de reparo Duplicação do sítio alvo Mecanismo replicativo Um nova cópia é gerada Mecanismo conservativo O elemento é removido e inserido em um novo local Mecanismo replicativo Elementos de transposição em eucariontes Retrotransposons – classe 1 Transposons – classe 2 Retrotransposons Elementos Ty – 35 cópias no genoma de leveduras Transcriptase reversa Similares a retrovírus. Flanqueados por seqüências LTR Genes gag e pol Transposons de DNA Elementos P em Drosophila Apresentaram de 30 a 50 cópias no genoma de moscas de laboratório. Variando de 0,5 a 2,9 kb Codifica uma transposase – 3 íntrons e 4 exons Repetições invertidas de 31 pb das pontas Uso de elementos P para marcar genes de clonagem Criar mutações por inserção Marcar posição de genes Facilitar a clonagem de genes O genoma dinâmico Grandes genomas apresentam muitos elementos de transposição Ex: Salamandra e humanos, cevada e arroz Elementos de transposição no genoma humano Quase metade do genoma humano é formado por elementos de transposição LINE, longos elementos nucleares intercalados Retrotransposon SINE, curtos elementos nucleares intercalados Não codificam transcriptase reversa Alu (mais de 1 milhão, ou mais de 10% do genoma humano) 285 pb Elementos de transposição no genoma humano >gi|178514|gb|M21204.1|HUMALUTRA Human Alu transposable element DNA – 285pb CAGATCCGGGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGAGG GCAGATCACCTGAAGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCC AACATGGTGAAACTCCATCTCTACTGAAAATACAAAAATT AGCCAGGCATGGTGATGCGTGCCTGGTTAATCCCAGCTAC TTAGGAGGCTGAGACAGAAGAATCCCTTAAACCAAGAGGT GGAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACGGCTGCACTCCAG CCTGGTGACAGAGCGAGACTCCATCTCAAAAAAAACCGAT CCATG 20 vezes mais dna em elementos de transposição do que codificando proteínas. Como sobrevivemos aos transposons??? Estão em regiões não codificantes ou introns Estão inativos Mutações Mecanismos epigenéticos. Doenças causadas por transposons Hemofilia A (Fator VIII) Hemofilia B (Fator IX) Neurofibromatose (NF1) Câncer de mama (BRCA2) Inserção de transposons em “abrigos seguros” Possível uso em terapia gênica Regulação dos elementos de transposição do hospedeiro Mudanças reversíveis de atividade de Ac Mudança de fase Alterações na estrutura da cromatina – epigenética Silenciamento de transgene Co-supressão Genes silenciadores Proteção contra vírus e transposons Seleção durante a evolução Bibliografia Introdução a Genética Griffths, Wessler, Lewontin, Gelbart, Suzuki, Miller 8ª Edição, 2005
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