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Amanda Lima - Turma XXVII Módulo 1 - Problema 4 Proteínas e Organelas ● Definir proteínas; São as macromoléculas mais importantes por terem estruturas complexas e inúmeras funções, formados por aminoácidos unidos por ligações peptídicas. ● Principais determinantes da forma e função biológicas, influenciam a cor, o tamanho, o comportamento e a fisiologia dos organismos. ● 20 aminoácidos são encontrados nas proteínas, todos L, (há +300 AA); ● Hidrólise completa pode liberar praticamente todos os AA; ● AA determinam a estrutura tridimensional e as propriedades biológicas da proteína (espécie e ordem); ● Além dos 20, muitos outros AA desempenham funções no organismo. ● R determina polaridade, grau de ionização em H2O e define as 4 classes. Ligações Peptídicas: Uma ligação peptídica é formada pela ligação da extremidade amino (NH2) de um aminoácido com a extremidade carboxila (COOH) de outro aminoácido (Figura 9.2). Uma molécula de água é removida durante a reação; a cadeia de polipeptídios sempre apresenta uma extremidade amino (NH2) e uma extremidade carboxila (COOH). EXCEÇÃO: prolina e a hidroxiprolina, pois contêm o grupo NH (imino) em substituição ao grupo NH2. Classificação: @mandavmed Amanda Lima - Turma XXVII ● o que diferencia proteínas é: nº, a sequência e a natureza de AA. ● histidina, isoleucina, leucina, lisina, metionina, fenilalanina, treonina, triptofano e valina - são os chamados aminoácidos essenciais. Como não podem ser sintetizados pelo corpo humano, temos de conseguí-los por meio dos alimentos. Os outros são não-essenciais. Classificação de proteínas: composição: - simples: somente aminoácidos; - conjugadas: aminoácido + grupo prostético {ex.: metalproteina; cromoproteínas [hemeproteína (ferro+grupo porfirona= mioglobina, hemoglobina)]; lipoproteina; glicoproteina; nucleoproteínas e cromoproteínas (pigmentos)} número de cadeias: - Monoméricas: 1 cadeia polipeptídica; - Oligoméricas: +1 cadeia polipeptídica < 100 (estrutura e funções + complexas) Forma: - Fibrosas: estrutura espacial, + simples (estruturais); - Globulares: estrutura espacial, + complexas, 3D (dinâmicas); Estrutura Primária: ● sequência de aminoácido com ligação peptídicas (esqueleto covalente da molécula); ● + simples e + importante (define todo o arranjo espacial); ● amino terminal (+H3n) - carboxyl terminal ; ● Ligação de Hidrogênio estabiliza. Estrutura Secundária: ● arranjo espacial de aminoácidos próximos na sequência primária; ● último nível p/ proteína fibrosas [pele, cabelo, tendões (colágeno e queratina)]; ● ocorre pela rotação das C ∝’s c/ amina e carboxila; ○ regular: ângulos ligantes são iguais e se repetem (∝-Hélice, Folha-β); ○ não regular; ● Ligação de Hidrogênio estabiliza. Estrutura Terciária: - Arranjo espacial de aminoácidos distantes entre si na sequência polipeptídica; @mandavmed Amanda Lima - Turma XXVII - Proteínas globulares + complexas (enzimas e anticorpos) Estabilizadas por: resíduos de prolina (formam joelhos); impedimento estérico (cadeias laterais grandes que precisam se acomodar); pontes dissulfeto (ligações covalentes radicais sulfidrila de resíduos de cisteína que formam CISTINA); ligação de Hidrogênio; interações hidrofóbicas (R apolar vai para o interior); interações iônicas (R’s com cargas opostas se atraem.) Enzimas: Os locais ativos das enzimas são boas ilustrações das interações precisas dos grupos R. Cada enzima apresenta um bolsão denominado sítio ativo, ao qual seu substrato ou substratos conseguem se adaptar. No sítio ativo, os grupos R de determinados aminoácidos estão estrategicamente posicionados para interagir com um substrato e catalisar uma reação química específica. Estrutura Quartenária: - Oligoméricas; - ligação entre diferentes cadeias de polipeptídios (subunidades); - subunidades podem atuar de forma independente ou cooperativamente no desempenho da função bioquímica da proteína. Estabilizadas por: forças covalentes. pontes dissulfeto; ligação não covalente; ligação de hidrogênio; interações hidrofóbicas. ● Caracterizar ribossomos; Ribossomo é sítio da síntese proteica, realiza diversas funções com precisão e velocidade. - Composto por uma subunidade grande e uma pequena, composta por RNA ribossômico (1-3 tipos) e proteínas (50); - Procariotos (30s e 50s; 70s); Eucariontes (40s e 60s; 80s); - Tradução é um processo antigo, origem ancestral comum; - Reune tRNA e mRNA na tradução. - O sítio de ligação do mRNA está na subunidade menor. - As de tRNA tem 3 locais de ligação. Cada tRNA ligado une as subunidades, posicionado com sua extremidade do anticódon na menor (centro decodificador - tRNA cognatos) e sua extremidade aminoacil (que carreia o aminoácido) na maior. O sítio A (de aminoacil) liga um aminoacil-tRNA, correspondente ao códon no sítio A, que chega. Na direção 5’, ele interage com o anticódon do tRNA no sítio P (de peptidil, centro peptidiltransferase). O tRNA no sítio P liga-se à cadeia de peptídios em crescimento, parte da qual se encaixa em uma estrutura semelhante a um túnel na subunidade maior. O sítio E (de saída) contém um tRNA desacilado @mandavmed Amanda Lima - Turma XXVII (que deixa de carrear um aminoácido) que está pronto para ser liberado do ribossomo. Não está claro se as interações códon-anticódon também ocorrem entre o mRNA e o tRNA no sítio E. ● Caracterizar RE ; - Toda célula eucarionte tem; - Constituído por uma rede de membranas com uma rede de cavidades 3D chamadas de “cisternas”, “lúmen” ou “luz”. - Se estende a partir do envoltório nuclear e percorre grande parte do citoplasma; - CLIMP 63, uma proteína transmembrana, cuja face cito sólica liga- se aos microtúbulos, enquanto a face luminal forma um esqueleto proteico no lúmen do retículo, contribuindo para a manutenção da morfologia das suas cisternas; As membranas do retículo também são assimétricas, tanto as proteínas quanto os lipídios estão diferentemente distribuídos entre a monocamada citosólica e a luminal. Fosfatidilcolina, fosfatidil serina e fosfatidiletanolamina localizam -se na face citosólica, enquanto esfingomielina e fosfatidilinositol estão voltados para a face luminal. A glicose- 6 -fosfatase é uma proteína intrínseca à membrana, com nove domínios heli coidais transmembranosos e o sítio ativo voltado para a face luminal da cisterna, enquanto o citocromo b5, o citocromo P450 e suas respectivas redutases estão voltados para a face citosólica. A CLIMP 63, por sua vez, é uma proteína trans membrana que provoca saliência em ambas as faces da mem brana. Essa distribuição está diretamente rela cionada com a função que essas proteínas desempenham no RE. Além disso, as porções glicídicas dos lipídios e proteínas estão voltadas para o interior da cisterna, ao contrário do que ocorre na superfície celular. RE Rugoso/ Granular (REG) @mandavmed Amanda Lima - Turma XXVII - Lâminas achatadas dispostas paralelamente; - Proteínas Chaperonas Moleculares - auxilia no enovelamento da proteína mexem nas pontes de dissulfeto (função/estrutural) - geral mente são polarizadas - localização; - Polirribossomos (c/ mRNA) associados à face citoplasmática pela subunidade maior, pois a menor liga-se a fita. (Produção ativa de prot.) ■ Células que sintetizam ativamente proteínas que permane cem no citosol: nessas células, as proteínas são sintetizadas em polirribos somos livres no citosol. São exemplos desses tipos celulares os eritroblastos, as células embrioná rias e as de tumores de crescimento rápido. ■ Células que sintetizam e segregam proteínas nas cisternas do RER e exportam essas proteínas diretamente: a síntese proteica é realizada por polirribossomos aderidos à face citoplasmá tica da membrana do RER. Elas apresentam complexo de Golgi desenvolvido, e, nelas, não há grânulos de secreção. São exemplos desse tipo celular os fibroblastos, que secre tam matriz extracelular, e os plasmócitos, que secretam anticorpos. ■ Células que sintetizam proteínas que são segregadas nas cis ternas do RER passam para o complexo de Golgie, depois, são acumuladas em grânulos, que geralmente permanecem nófilos, neutrófilos e monócitos, assim como dos macrófa gos, que apresentam no citoplasma grânulos que contêm proteínas e enzimas com diversas funções ■ Células que sintetizam, segregam e acumulam proteínas em grânulos de secreção, que serão exportados por exocitose: são exemplos as células secretoras exócrinas do pâncreas e da glândula salivar parótida, que produzem enzimas diges tivas empacotadas em vesículas ou grânulos envoltos por membrana que, sob o estímulo apropriado, serão secreta das para digerir os alimentos RE Liso/ Agranular (REL) - Vesículas globulares e túbulos retorcidos; - Glicose-6-fosfatase (glicogenólise - glicose a partir do glicogênio; hidrolase); enzimas de síntese de fosofolípidios e esteroides; glicosiltransferases (catalisam adição de oligossacarídeos a proteínas e lipidios). Cadeias transportadoras de elétrons: o citocromo P450 e o citocromo b5 e suas respectivas redutases. - movimento flip (flipases) transferência dos fosfolípideos da hemicamada para monocamada interna - escramblases (scramble) na MP. - A posição ocupada pelo retículo no citoplasma varia de um tipo celular para outro. (próximo ao núcleo); OBS: na célula muscular estriada, o REL recebe o nome de RETÍCULO SARCOPLASMÁTICO e é responsável pelo controle da [ ] de Ca++ envolvido na contração muscular. @mandavmed Amanda Lima - Turma XXVII • Membranas do REL: ocorre a sintetização de praticamente todos os lipídios que compõe membranas celulares incluindo os fosfolipídios e o colesterol. Alguns lipídios das membranas são inicialmente produzidos no REL e suas moléculas são completadas no Complexo de Golgi (esfingomielina e glicolipídeos) • Fosfolipídios → são sintetizados na face citosolica da membrana do retículo, a partir de uma molécula de glicerol e duas moléculas de ácidos graxos ligados a coenzima A (CoA). • Colesterol → nas células que sintetizam hormônios esteroides, o colesterol é convertido em progesterona, testosterona, estradiol ou desoxicorticosterona, em um processo que envolve a ação conjunto de enzimas encontradas não somente nas membranas do REL, mas também na mitocôndria. • REL → ocorrem o processo de elongação e a desnaturação de ácidos graxos e nas células epiteliais de absorção do intestino delgado, o REL sintetiza triglicerídeos a partir dos ácidos graxos. - Desintoxicação pelo REL → o REL participa da desintoxicação no organismo. Esse processo ocorre no fígado, na pele, nos rins e nos pulmões e dele participam o citocromo P450 e sua redutase. A hidroxilação de um composto tóxico aumenta a solubilidade em água, facilitando na sua eliminação; - Participação na metabolização do glicogênio → função importante do REL de hepatócitos e de células renais à glicogenólise, ou seja, a obtenção de glicose a partir do glicogênio. Esse processo ocorre pela ação consecutiva de 4 enzimas das quais apenas uma está localizada no REL, enquanto as demais são etapas citosólicas. Esse processo é importante para isolar e liberar, para a corrente sanguínea, a glicose que será utilizada como fonte de energia. A glicose-6-fosfatase é uma proteína intríseca da membrana do retículo. - REL armazena, libera e capta íons Ca++ → há proteínas intrísecas às membranas do REL que funcionam como canais, e outras como bomba de Ca++. Dependendo do estímulo recebido pela célula, essas proteínas liberam Ca++ para o citoplasma ou captam esses íons para o interior das cisternas do RE. Cessando o estímulo, os íons Ca++ são levados de volta às cisternas do REL, por processo ativo. Exportação de lipídios: 1- Incorporadas à membrana do próprio retículo e se difundem pela bicamada. EX: lipídios que irão compor as membranas de ambos os tipos de retículo e envoltório nuclear. 2) Integradas às membranas de vesículas que brotam do retículo e se fundem com outros compartimentos. EX: destinadas para as membranas do CG, lisossomos e endossomos, para MP também. 3) Transportados por proteínas específicas. (prot. transportadoras de lípideos) EX: moléculas que constituem as membranas das mitocôndrias, plastos e peroxissomos. (a CERT, que transporta ceramida; a GLTP, que trans fere glicolipídios; a FAPP2, que atua sobre glicosilceramida; a StAR, responsável pelo transporte de colesterol; e as PITPα e b que transportam fosfatidilinositol e fosfatidilcolina.) @mandavmed Amanda Lima - Turma XXVII ● Caracterizar (descrever função) proteassomas. A via ubiquitina- proteossomo é a principal responsável pela degradação seletiva de proteínas. - realizada em complexos multienzimáticos (proteossomos [20s e 26s]) - citoplasma e núcleo; - células com alta capacidade de proliferação têm grande quantidade de proteossomos; - São encontrados no núcleo, degradando enzimas envolvidas no processo de replicação e transcrição do DNA, bem como as enzimas que regulam o ciclo celular. Pode ser regulada pelo estresse oxidativo intracelular, uma vez que uma das suas principais funções é degradar proteínas danificadas por radicais livres. - Células Cancerosas → a inibição da atividade proteolítica dos proteossomos pode retardar ou mesmo interromper a progressão do câncer, interferindo na degradação ordenada das proteínas que regulam o ciclo celular. - AUTOFAGIA; * stress oxidativo= O estresse oxidativo decorre de um desequilíbrio entre a geração de compostos oxidantes e a atuação dos sistemas de defesa antioxidante. A geração de radicais livres e/ou espécies reativas não radicais é resultante do metabolismo de oxigênio. @mandavmed
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