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17/05/2022 Variações no DNA Página 1 de 3 Fonte: - - Variação da sequência do DNA é a base da evolução Evolução é baseado em mutação - Diversidade genética produz diferentes fenótipos, inclusive fenótipos benéficos em termos de resistência ambiental. - Mutações e consequentes fenótipos mendelianos: • Onde um ou ambos os genitores passam uma variante para os filhos, levando a ocorrência da doença. - Splicing: • processo de retirada dos introns do pré-RNA mensageiro • Assim, juntando os exons para criar uma molécula madura, que vai sair do núcleo e entrar no ribossomo e será traduzida para produzir proteína - Transcrição: produzir uma cópia de todos os exons e introns - Sequência consenso de splicing: sinalização • Início e no final de cada intron que especifica onde o splicing deve ocorrer • A sequência mostra o ponto de início e final e é cortado através do spliceossomo 1o códon: AUG Último códon: UAA, UAG, UGA - Os genomas contêm um número relativamente pequeno de genes - Splicing alternativo: a célula ao invés de produzir RNA mensageiro que consiste em exon 1,2,3,4, a célula pode produzir diferentes versões do RNA mensageiro Exemplo: exon 1 e 4 ou 1, 3 e 4 e etc. - Possuímos poucos genes que não contêm introns Ex.: bactérias não tem introns, consequentemente não fazem splicing, nem splicing alternativo - Constantemente ocorre mutações no genoma 1. Passamos muitas mutações para nossos filhos 2. A maioria é benigna 3. Quando as mutações são malignas, muitas vezes a célula morre 4. Nossas células têm mecanismos de vigilância no genoma (algumas enzimas fazem a vigilância) 5. Somente quando todos os mecanismos falham, é que temos uma doença Polimorfismo Mutação Alterações do DNA que são associados com variação normal ou que não causem impacto no fenótipo Referir a variantes que causam doenças Comum Raro Alto impacto Alterações mendelianas - Mutação de ponto: afetando apenas um par de base - Inserção e deleção • Inserção, adiciona-se um ou mais nucleotídeos ao DNA. • Deleções, retira-se um nucleotídeo ou mais, o que causa alterações na composição da proteína. - Mutação com sentido: • Trocar aminoácido por aminoácido semelhante ou diferente - Substituição sem sentido: • Quando se tem um códon de terminação (criação) ▪ UAA, UAG, UGA - As inserções e deleções elas podem ser um número variado de pares de bases ▪ Uma inserção múltiplo de 3 pares de bases é mais benigno do que de 1 ou 2 pares de bases. - O Splicing não ocorre normalmente caso há alteração na sequência consenso de Splicing. Anotação do slide Mutações/Polimorfismos -Somáticos • Alterações no DNA de células não envolvidas diretamente na formação dos gametas - Germinativos • Alterações no DNA de células envolvidas diretamente na formação dos gametas 17/05/2022 Variações no DNA Página 2 de 3 Fonte: - Mutações Gênicas - Espontâneas • Erros de replicação do DNA – estimado em 1 x 10- 10 • Como os dois genomas contém 6 x 109 nucleotídeos, pode se estimar menos de 1 erro por ciclo celular • Processos químicos espontâneos: mudanças nas propriedades químicas do DNA - Induzidas por Mutágenos • Químicos ou radiação ionizante - Normalmente a célula tem mecanismos para concertar variação anormal na sequência • Às vezes, a célula não consegue concertar, e a mudança pode ser estável - Mudanças na sequência de DNA (durante milhares de anos) são a base de evolução Fatores que afeitam a impacto de uma mutação Tipo de mutação - Substituição sinônimo - Substituição não- sinônimo • Conservativa ou não-conservativa - Substituição sem sentido - Mudança na janela de leitura - Splicing - Mutação em elemento de regulação Efeito na proteína - Proteínas tem domínios com funções diferentes - Também, tem sequências entre domínios - Efeito da mutação pode ser determinado pela importância da parte da proteína com a mutação Número/tipo de células que expressam a mutação - Mutações que acontecem em células somáticos (diploides) normalmente não tem grande efeito • Exceção importante: câncer - Mutações em gametas (herdadas ou não) são presentes em todas as células • Efeito depende na função da proteína, e nas quais células a proteína é expressada - Substituições em sequências sem papel funcional tem efeito neutro - Substituições em sequências regulatórias podem interferir na ligação de fatores de transcrição – aumentando ou diminuindo a transcrição - Substituições em bordas exon/intron podem alterar o splicing - Substituições em 5’ e 3’UTR podem interferir n estabilidade do mRNA Variações em sequência de DNA codificante Substituições - Substituições em exons • Caso não mude a codificação do codon – silenciosa • Caso mude a codificação do codon ▪ Com sentido – conservativa se o novo aminoácido codificado for de mesma natureza química que o codificado pelo códon antes da substituição; não- conservativa se a natureza química do aminoácido codificado for diferente - Sem sentido se gerar um códon de parada Novo conceito: Janela de leitura - Códons são combinações de 3 nucleotídeos - Para traduzir qualquer seqüência de DNA, temos 3 possíveis posições para começar • Posição 1, 2 ou 3 17/05/2022 Variações no DNA Página 3 de 3 Fonte: - - Deleções em exóns • De uma única base mudança na janela de leitura • De duas bases mudança na janela de leitura • De três bases (um códon) deleção de uma aminoácido. Splicing - Esse é o processo de eliminar as sequências intrónicas do mRNA e ligar as sequências exónicas - Splicing é um mecanismo de gerar variação na quantidade de proteínas que genes podem produzir - Pelo escolher diferentes combinações de exons, alguns genes podem produzir mais de uma proteína - Esse é útil, por exemplo em produzir diferentes formas da mesma proteína em diferentes tecidos Alguns genes podem escolher diferentes combinações de exons para produzir ‘isoformas’ de uma proteína Sítios de Splicing - O processo de splicing precisa de sequências especiais na fronteira entre intron e exon - Depois de reconhecer essas sequências, a célula cota o pre RNA, joga fora os introns e liga os exons Mutações em sítios de splicing podem alterar a estrutura da proteína - Splicing acontece pelo sequências especiais reconhecidas como divisão entre intron e exon - Alteração nestes sequências podem resultar em exclusão de um exon - Também podem resultar em inclusão de um intron no mRNA - Esse resulta em proteína com estrutura errada A importância dos erros Considerações simples sobre evolução • Sem variações no DNA não há oportunidade para a evolução • Erro e tentativa é o curso da evolução • Grande parte dos erros são neutros • Erros podem aumentar a vantagem reprodutiva - Seleção positiva • Erros podem diminuir a vantagem reprodutiva - Seleção Negativa • Erros podem dar vantagem e desvantagem - Seleção balanceada A maioria de doenças tem heterogeneidade alélica - Qualquer mutação num gene que afeita a função do gene pode causar a mesma doença - Às vezes a severidade da doença pode ter correlação com a grau em que a mutação afeita a função da proteína • A proteína tem função residual? É mais comum observar mutações em DNA não codificante do que em codificante - Esse é porque mutações no DNA codificante tem probabilidade de enfeitar a função da proteína - Então, genomas com essas mutações são eliminados pela seleção - - -
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