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Introdução a genética - Marcadores moleculares, Extração de DNA, PCR, sequenciamento de DNA, Microssatélite. ( Módulo 1 ) 1 🧪 Introdução a genética - Marcadores moleculares, Extração de DNA, PCR, sequenciamento de DNA, Microssatélite. ( Módulo 1 ) Marcadores moleculares • Até meados da década de 1960. Marcadoresmorfológicos para estudos de melhoramento genético. • Isoenzimas. informação genética baseado em enzimas(proteínas) • Enzimas de restrição (RFLP). acesso direto ao DNA Extração de DNA • DNA: nuclear, mitocondrial e do cloroplasto:geralmente faz-se uma extração total • Primeiro passo para utilização em técnicas marcadoresmoleculares baseadas em DNA• Importante que o DNA esteja íntegro!• Quantidade de DNA? Depende do marcador• Protocolos diferem quanto ao organismo, tecido e estado deconservação do tecido. • Importante que o DNA esteja íntegro! • Quantidade de DNA? Depende do marcador • Protocolos diferem quanto ao organismo, tecido e estado deconservação do tecido. Etapa básicas da extração Introdução a genética - Marcadores moleculares, Extração de DNA, PCR, sequenciamento de DNA, Microssatélite. ( Módulo 1 ) 2 • Destruição das células (maceração,detergentes) • Destruição de proteínas (proteinase K) • Retirada de proteínas, açúcares (filtragemde afinidade) • Retirada de DNA da coluna - Precipitaçãode DNA Visualização do DNA em gel de eletroforese. Quantificação via espectrofotômetro (e análise comparativa em gel). PCR PCR envolve a síntese enzimática in vitro de milhões de cópias deum segmento específico de DNA • Realizada através da enzima DNA polimerase • A técnica se baseia no anelamento e extensão enzimática de um parde oligonucleotídeos (pequenas moléculas de DNA de fita simples)PRIMERS! • Primers são sintetizados artificialmente, com o objetivo de quepossam ser complementares ao DNA, possibilitando o anelamento. 🔬 Termociclador Etapas do ciclo de PCR • Desnaturação elevação da temperatura 92 a 95 C • Anelamento temp. rapidamente reduzida 35 a 60 C • Extensão elevação da temperatura 72 CA repetição dos ciclos gera milhões de cópias Cerca de 20 bases de comprimento. “Desenhados” especificamente para uma região Introdução a genética - Marcadores moleculares, Extração de DNA, PCR, sequenciamento de DNA, Microssatélite. ( Módulo 1 ) 3 Uso para sequenciamento de DNA, microssatélites, etc. Microssatélites • Microssatélites são pequenas sequências (motifs) de 1 a 4 bases repetidas em série. • São mais frequentes, distribuídas ao acaso eformam locos genéticos muito polimórficos • O polimorfismo é relativamente grande. Cadamicrossatélite é um loco genético muito variável Sequenciamento de DNA • Duas etapas básicas. – Reação de sequenciamento (termociclador?) – *Migração de fragmentos em gel (sequenciamento?) • Cycle sequencing reaction(muito parecida com PCR comum) - DNA (produto de PCR) purificado equantificado - primer da direção que deseja sequenciar - Enzima DNA polimerase • Fragmentosmigram no gel • Fluorescem sobfeixe de laser Banco de Germoplasma Introdução a genética - Marcadores moleculares, Extração de DNA, PCR, sequenciamento de DNA, Microssatélite. ( Módulo 1 ) 4
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