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Disciplina: BIOINFORMÁTICA AV 02265 - ANÁLISE FILOGENÉTICA 1. Ref.: 6069588 Pontos: 0,00 / 1,00 Analise a figura abaixo: Imagem: Leandro Pederneiras De acordo com a figura, são estabelecidas várias relações entre as espécies. Analise as alternativas e assinale a que retrata essa relação de forma correta. O grupo T S é parafilético e seria um grupo polifilético se incluísse as espécies Q P O N. O grupo J K é polifilético e possui maior relação de aproximação do grupo L M do que do grupo X Y. O grupo A B C é monofilético e está mais próximo filogeneticamente do grupo L M do que do grupo F G. H G F é mais próximo filogeneticamente de I J do que de U V. O grupo Z Z é irmão do clado I J K L M, não existindo nenhuma outra linhagem entre eles. 2. Ref.: 6069594 Pontos: 0,00 / 1,00 A seguir são apresentadas diferentes árvores filogenéticas (de A ao E). Analise os gráficos e responda: javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206069588.'); javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206069594.'); Imagem: Leandro Pederneiras Qual dos gráficos acima (a, b, c, d ou e) é um filograma e um cronograma, respectivamente? Árvore a e c Árvore b e e Árvore d e e Árvore e e b Árvore d e a 3. Ref.: 6069586 Pontos: 0,00 / 1,00 Analise a figura abaixo: javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206069586.'); Imagem: Leandro Pederneiras Considerando a figura acima, porque W é mais próximo relacionado a U do que a Y? Porque W e U são separados somente por dois nós. Porque W e U são mais similares entre si do que com Y. Porque W e Y possuem um ancestral comum mais recente do que W e U Porque W e U possuem um ancestral comum mais recente do que W e Y Porque o ancestral de W e U viveram antes do ancestral de Y 02925 - NCBI E ALINHAMENTO DE SEQUÊNCIAS 4. Ref.: 6045464 Pontos: 0,00 / 1,00 Pesquisadores do Grupo Pardini em parceria com a UFMG desenvolveram um teste de genotipagem para as variantes P.1 (Manaus), P.2 (RJ) e B.1.1.7 (Reino Unido) do SARS- CoV-2. A partir da sequência genética de cada uma das variantes do vírus causador da covid- 19, eles desenvolveram um par de primers que vão "grudar" naquela sequência exata do vírus. (Fonte: https://www1.folha.uol.com.br/equilibrioesaude/2021/04/laboratorio-lanca-teste- capaz-de-identificar-variantes-do-coronavirus.shtml). Qual das características abaixo contribui para que os primers usados sejam bastante específicos para a região do genoma que contém a mutação? Temperatura de melting baixa, menor que 55°C. Comprimento suficientemente grande, maior que vinte nucleotídeos. Temperatura de anelamento baixa, menor que 50°C. Produtos amplificados maiores que 100pb. Porcentagem baixa de guanina (G) e citosina (C) ao longo da sequência (menor que 40%). javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206045464.'); 5. Ref.: 6045539 Pontos: 1,00 / 1,00 Uma árvore filogenética busca desvendar a história evolutiva de um grupo de organismos. Isso pode ser feito a partir da comparação de sequências biológicas. Uma boa estratégia é escolher um gene que todas as espécies comparadas possuam, e identificar a partir de alinhamentos as similaridades entre as sequências de cada espécie. Supondo que você irá comparar a sequência completa do gene para DNA polimerase de 50 espécies bacterianas diferentes, qual o tipo de alinhamento é o mais adequado nessa situação? Alinhamento múltiplo e global. Alinhamento múltiplo e local. Alinhamento simples e múltiplo. Alinhamento simples e local. Alinhamento local e global. 6. Ref.: 6045459 Pontos: 0,00 / 1,00 A partir do portal do NCBI (National Center for Biotechnology Information) é possível ter acesso a diferentes bancos de dados biológicos. É importante saber de qual dado precisamos para escolher corretamente em qual banco vamos realizar a busca. Caso você esteja desenvolvendo seu trabalho de conclusão de curso, qual banco de dados você utilizaria para obter resumos e/ou textos completos de artigos publicados em milhares revistas diferentes? RefSeq. UniProt/SwissProt. PubMed. GenBank. KEGG. 03015 - ANOTAÇÃO GÊNICA 7. Ref.: 6054637 Pontos: 1,00 / 1,00 Técnicas como espectrometria de massas (EM) e eletroforese bidimensional em gel de poliacrilamida (2D-PAGE) são usadas para caracterizar moléculas de acordo com suas propriedades químicas. A seguir é listada uma série de estudos ômicos. Assinale a alternativa que é um exemplo de estudo ômico que utiliza essa técnica: Proteômica. Genômica. Lipdômica. Transcriptômica. Farmacogenômica. 8. Ref.: 6055138 Pontos: 0,00 / 1,00 javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206045539.'); javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206045459.'); javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206054637.'); javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206055138.'); Não é interessante que o mesmo tipo de dados biológico esteja fragmentado em diferentes bancos, pois isso dificultaria o acesso a essas informações. Nesse sentido, a Colaboração Internacional de Bancos de Dados de Sequências de Nucleotídeos (International Nucleotide Sequence Database Collaboration, INSDC) agrega informações dos seguintes bancos de dados primários: PDB, EMBL e GenBank. Swiss-Prot, EMBL e GenBank. DDBJ, EMBL e GenBank. DDBJ, EMBL e KEGG. DDBJ, EMBL e Swiss-Prot. 03017 - INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA 9. Ref.: 6075100 Pontos: 1,00 / 1,00 (adaptado de CESPE -2013-Química) O excesso de peso e uma alimentação rica em gordura podem causar alterações genéticas, segundo um estudo que analisou o genoma de 703 pessoas obesas, magras e com excesso de peso. Nesse estudo, os pesquisadores mostraram que o gene LY86, possível contribuidor da obesidade, sofreu uma metilação sobre vários substratos. Os resultados revelam uma mudança química no genoma, como se o organismo se adaptasse ao "novo" ambiente. Considerando as informações apresentadas, é correto afirmar que a alteração sofrida pelo gene LY86 está relacionada. À replicação. À sequência de bases nitrogenadas. À taxa de transcrição gênica. Ao aumento do splicing. Ao número de cópias de DN. 10. Ref.: 6075099 Pontos: 0,00 / 1,00 Adaptada de UPENET/IAUPE - 2017 - UPE ¿ Biólogo) Ao compararmos um gene e uma proteína, ficamos restritos a tratar da sequência de DNA, que se estende entre os pontos correspondentes às extremidades da proteína. O processo pelo qual um gene dá origem a uma proteína é chamado expressão gênica. Nesse contexto, observe as sequências selvagem (esquerda) e mutante (direita) da cadeia β da hemoglobina. Para responder, utilize a tabela de códons a seguir: javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206075100.'); javascript:alert('C%C3%B3digo%20da%20quest%C3%A3o:%206075099.'); Após analisar as sequências de nucleotídeos normal e selvagem e a tabela de códon, analise a relação entre as assertivas a seguir: I. A diferença entre o DNA selvagem e mutante da cadeia β da hemoglobina, é devido a uma mutação silenciosa após a troca do nucleotídeo A pelo T. PORQUE II. A alteração no nucleotídeo de A pelo T não altera o aminoácido que é adicionado na cadeia peptídica, sendo nos dois casos adicionados a alanina. A respeito dessas asserções, assinale a opção correta: As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I. A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira. As asserções I e II são proposições falsas. A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa. As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justificativa da I.
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