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Disciplina Bioquímica 7º Estudo Dirigido: Nucleotídeos e Ácidos Nucléicos 1) Qual é o dogma central da biologia molecular? Postulado por Francis Crick em 1958, o dogma explica como ocorre o fluxo das informações no código genético. O modelo mostra como uma sequência de um ácido nucleico forma uma proteína, contudo, o contrário não é possível. Esse dogma está representado na figura a seguir: Na figura, temos a representação do DNA, onde está contida a informação genética, e que pode ser transcrito em moléculas de RNA, onde nesse processo, uma molécula de DNA serve como molde para a criação de uma molécula de RNA. 2) Quais são os três tipos de RNA? Qual é a função de cada tipo? Temos três tipos de RNAs; O RNAm (mensageiro), que é responsável por carregar a informação genética presente nos genes para os ribossomas, onde ocorrerá a síntese da proteína correspondente. O RNAt (transferência), tem por finalidade traduzir a informação presente no mRNA em uma sequência de aminoácidos específica. O RNAr (ribossômico), funcionam como componentes dos ribossomos (complexos que sintetizam as proteínas). 3) O que são nucleotídeos? São estruturas bioquímicas formadas por bases nitrogenadas, um grupo fosfato ((HPO4) e uma pentose (Um açúcar de 5 carbonos). Unidos, formam os ácidos nucleicos. Atuam no organismo na transferência de energia em forma de ATP, como mensageiros químicos, e também no armazenamento e transmissão da informação genética. As bases nitrogenadas são: purinas adenina (A) e guanina (G) e as bases pirimidinas citosina (C), uracila (U) e timina (T). Exemplo de um nucleotídeo Grupo fosfato Bases nitrogenadas (Pirimidina e Purina) Pentose (No DNA temos a desoxirribose e no RNA temos a ribose) 4) Quais são as classes de bases nitrogenadas? Quais são as bases nitrogenadas que compõem cada classe? As Bases nitrogenadas são classificadas de acordo com o tipo de anel presente na estrutura. A conformação das bases nitrogenadas é definida em: Purinas: syn e anti (A e G) e Pirimidinas: anti (C, T e U). Purinas Pirimidinas 5) O que são ácidos nucléicos? Quais são os tipos de ácidos nucléicos? Os ácidos nucléicos são macromoléculas constituídas por nucleotídeos. Os dois tipos são o DNA (ácido desoxirribonucleico) e o RNA (ácido ribonucleico). Os ácidos nucléicos apresentam três componentes básicos: um grupo fosfato, uma pentose e uma base nitrogenada. 6) Apresente a estrutura química dos desoxirribonucleotídeos (dA, dC, dT e dG) e dos ribonucleotídeos (A, C, G e U)? Desoxirribonucleotídeos Ribonucleotídeos 7) Quais são as diferenças entre o DNA e o RNA? Considere as pentoses e as bases nitrogenadas para responder sua pergunta. A D-ribose sendo um componente do ácido ribonucleico (RNA) e a 2-desóxi-D-ribose é um componente do ácido desoxirribonucleico (DNA). Os ácidos nucleicos têm dois tipos de pentoses. As recorrentes unidades desoxirribonucleotídicas do DNA contêm 29-desóxi-D-ribose e as unidades ribonucleotídicas do RNA contêm D-ribose. O DNA e o RNA tem suas diferenças: Pentoses diferentes e a presença de uracila no RNA e timina no DNA. É a pentose que define a identidade do ácido nucleico. Se o ácido nucleico contém 29-desoxi-D-ribose, é DNA por definição, embora possa apresentar alguma uracila. Da mesma forma, se o ácido nucleico contém D-ribose é RNA, independentemente da sua composição de base. 8) Apresente a estrutura química e a formação das ligações fosfodiéster entre os desoxirribonucleotídeos dA, dC e dG, formando um segmento do ácido desoxirribonucléico (DNA), e, entre os ribonucleotídeos U, G e C, formando um segmento do ácido ribonucléico (RNA). 9) Quais são as funções dos nucleotídeos? Comente sobre cada uma. Os nucleotídeos são responsáveis pelas seguintes funções: 1- Constituintes dos ácidos nucléicos (DNA e RNA) 2- Transporte de energia química na célula - Adenosina Trifosfato (Moeda Energética) Responsável pelo transporte de energia química na célula, sendo que a hidrólise da ligação anidrida gera mais energia que a hidrólise da ligação éster. 3- Componentes de cofatores enzimáticos - A coenzima A é responsáveis pela transferência de grupos acil (acetil ou acetoacetil) que se ligam por meio da ligação tioéster ao grupo β- Mercaptoetilamina FAD é a forma ativa da vitamina B2, responsável pela transferência de jelétrons NAD é responsável pela transferência de hídretos (H+) 4- Moléculas reguladoras - As células respondem ao ambiente por meio de sinais químicos internos e externos 10) Descreva detalhadamente a estrutura secundária da molécula de DNA proposta pelos pesquisadores Watson e Crick? O modelo consiste em duas cadeias de DNA helicoidais enroladas em torno do mesmo eixo para formar uma dupla-hélice de orientação à direita. Os esqueletos hidrofílicos de grupos fosfato e desoxirribose alternados estão no lado de fora da dupla-hélice, orientados para a água circundante. O anel furanosídico de cada desoxirribose está na conformação C-2’endo. As bases pirimídicas e púricas das duas fitas estão empilhadas dentro da dupla-hélice, com suas estruturas hidrofóbicas em forma de anel e quase planares muito perto uma da outra e perpendiculares ao eixo longitudinal. O pareamento perfeito das duas fitas cria um sulco maior e um sulco menor na superfície do duplex. Cada base nucleotídica de uma fita está pareada no mesmo plano com a base da outra fita 11) Apresente a estrutura química de um segmento pequeno (contendo três desoxirribonucleotídeos) da dupla hélice de DNA, mostrando as duas fitas (5’-3’ e 3’- 5’) e a formação de pontes de hidrogênio entre A e T e C e G. 12) Quantas pontes de hidrogênio são formadas entre A-T e C-G? Qual é a importância dessas pontes de hidrogênio? Na ligação entre Adenina e Timina são formadas duas pontes de hidrogênio, enquanto na ligação entre Citosina e Guanina são formadas três pontes de hidrogênio. Essas ligações são importantes para garantir a estabilidade da molécula de 13) O que é a complementariedade de bases? Conhecendo a sequência de uma das fitas é possível determinar a sequência da outra fita, uma vez que estas são equivalentes. A base Adenina se liga por duas pontes de hidrogênio à uma Timina (Uracila em fita de RNA) e a Citosina se liga por três pontes de hidrogênio à uma Guanina. 14) O que é a replicação semi-conservativa do DNA? Durante a etapa de replicação da molécula de DNA, apenas uma das fitas é utilizada como molde de sntese. 15) Dada a sequência 5’-P ATTGCCTAAGGCC 3’-OH. Apresente a sequência complementar a essa sequência e a sequência do RNAm que seria transcrito a partir dessa sequência. Sequência complementar: TAACGGATTCCGG Sequência do RNAm: UAACGGAUUCCGG 16) Apresente a estrutura e a organização de um gene eucarioto. 17) O que é uma sequência palindrômica? Qual é a importância dessa sequência? Palíndromos são sequências de ácidos nucleicos de fita dupla com simetria dupla. A fim de sobrepor uma repetição (sequência sombreada) na outra, ela deve ser girada 180º em torno do eixo horizontal e então 180º em torno do eixo vertical. Tem o papel importante de formar estruturas do tipo grampo ou cruciforme. 18) O que é a desnaturação e a renaturação da molécula de DNA? Desnaturação: ocorre quando as pontes de hidrogênio entre as cadeias complementares se rompem e as fitas se separam. Em altas temperaturas ou pH extremos o DNA sofre desnaturação, isto porque ocorre ruptura das pontes de hidrogênio entre os pares de bases. Renaturação: é o ligamento das pontes de hidrogênio entre as cadeias complementares do DNA.A desnaturação ocorre quando as pontes de hidrogênio entre as cadeias complementares se rompem e as fitas se separam. O inverso é chamado de renaturação, isso permite que todas as propriedades originais da molécula sejam restabelecidas
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