06 estrutptn2

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AS PROTEÍNAS
ESTRUTURAS
ESTRUTURA SECUNDÁRIA: Disposição espacial, regular e periódica da cadeia principal. É mantida por ligações H entre NH e CO.
	Seus elementos são: 
-hélice
lâmina 
grampo  ou voltas reversas
estruturas não repetitivas ou dobramentos “aleatórios”
É estabilizada por ligações hidrogênio
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AS PROTEÍNAS
-hélice
C			C		B 	A
 
A – Estrutura da cadeia principal em bastão 
B – Cadeias laterais para fora 
C – Cadeia completa com ligações H entre NH e CO, próximos na mesma cadeia) estabilizando a estrutura
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AS PROTEÍNAS
-hélice 
N  C (dextrógira)
Cadeia elástica
Estabilizada por ligações H entre NH e CO próximos, na mesma cadeia
R se projeta radialmente em relação à cadeia
 2 ou + hélices podem se entrelaçar formando fibras
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AS PROTEÍNAS
-hélice
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AS PROTEÍNAS
Lâmina  
Antiparalela
Paralela
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AS PROTEÍNAS
Lâmina  
Cadeia distendida (flexível, mas não elástica)
Estabilizada por ligações H entre NH e CO de cadeias vizinhas ou de uma cadeia dobrada sobre si mesma, que correm em direções opostas (ANTIPARALELAS) ou iguais (PARALELAS) 
R se projeta para cima e para baixo da cadeia (perpendicularmente)
Ligação H perpendicular ao eixo da cadeia
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AS PROTEÍNAS
Lâmina  
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AS PROTEÍNAS
Grampo  ou voltas reversas
	
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CO do aa n faz ligação H com o NH do aa n+3  Reversão da cadeia.
Normalmente encontradas no final das lâminas . 
Ex: para conectar  antiparalelas
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AS PROTEÍNAS
Estruturas não repetitivas ou dobramentos “aleatórios”
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AS PROTEÍNAS
	 Os aminoácidos tem diferentes freqüências de ocorrência nos distintos elementos de estrutura secundária
Freqüência relativa de ocorrência dos resíduos de aminoácidos nas estruturas secundárias das proteínas
		
 
		 a – ramificação no C desestabiliza a -hélice por impedimento estereo
		 b – cadeia lateral com muita mobilidade
		 c – rompem a -hélice porque as cadeias laterais possuem grupos que 
 competem pelos NH e CO para formar ligações H
	 d – anel rígido impede rotação sobre a ligação C-N.
Uma mesma seqüência pode participar de uma  ou . 
Tudo dependerá do ambiente onde for enovelada a proteína
AA
(-hélice
Lâmina ( 
Grampo (
AA
(-hélice
Lâmina ( 
Grampo (
Ala
1,29
0,90
0,88
Val
0,91
1,49
0,47a
Cis(Cys)
1,11
0,74
0,80
Ile
0,97
1,45
0,51
Leu
1,30
1,02
0,59
Fen(Phe)
1,07
1,32
0,58
Met
1,47
0,97
0,39
Tir(Tyr)
0,72
1,25
1,05
Glu
1,44
0,75
1,00
Trp
0,99
1,14
0,75
Gln
1,27
0,80
0,97
Tre(Thr)
0,82
1,21
1,03
His
1,22
1,08
0,69
Gli(Gly)
0,56
0,92
1,64 b
Lis(Lys)
1,23
0,77
0,96
Ser
0,82
0,95
1,33 c
Asp
1,04
0,72
1,41 c
Arg
0,96
0,99
0,88
Asn
0,90
0,76
1,28 c
Pro
0,52
0,64
1,91d
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AS PROTEÍNAS
Estruturas supersecundárias