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Genética GENÉTICA DE POPULAÇÕES “é o estudo quantitativo da distribuição da variação genética nas populações e como as frequências de genes e de genótipos são mantidas ou mudam ao longo do tempo, tanto dentro de uma população quanto entre populações” (Thompson e Thompson, Genética Médica) Envolve: ● Fatores genéticos ● Fatores ambientais e sociais (seleção e migração) Determinam a frequência e a distribuição dos alelos e genótipos nas famílias e nas comunidades. Na prática da genética médica, a genética de populações fornece conhecimento sobre vários genes de doença que são comuns em diferentes populações, sendo informações necessárias para diagnósticos clínicos e aconselhamento genético. CONCEITOS GERAIS Frequência genotípica: % com que cada um dos genótipos possíveis de um determinado alelo se encontra em uma população. Frequência alélica: % que um determinado alelo representa entre todos os alelos de um gene, em uma população. VARIAÇÃO GENÉTICA E DIVERSIDADE ● Exemplo das mariposas claras e escuras na Revolução Industrial. Diversidade genética: é a variação genética dentro de uma população → Útil para entender a evolução e a história das populações humanas. ex.: Por exemplo, a diversidade genética é maior em populações africanas do que em outras populações humanas, o que sugere que a África é o local de origem da espécie humana. Diversos são os fatores que alteram as frequências alélicas nas populações, sendo mutação, seleção, deriva genética e migração / fluxo gênico. Destacamos os dois últimos. Deriva Gênica Mudanças aleatórias podem ter um efeito muito maior sobre frequências alélicas em uma população pequena do que em populações maiores. ● Efeitos aleatórios do ambiente ou outra ocorrência ao acaso que são independentes do genótipo. 1 Nicole Siqueira de Arruda CB USP FMRP ● Flutuação da frequência alélica aleatória que opera em um pequeno pool de organismos, de uma geração para outra → pode tornar um alelo mais frequente. ● Efeito gargalo → separação de alguns = nova população, ligeiramente diferente da original Tais ocorrências alteram o equilíbrio de Hardy-Weinberg e causam mudanças na frequência alélica da população. Explica como frequências alélicas mudam como resultado do acaso. Efeito Fundador ● Forma especial de deriva gênica Quando uma subpopulação pequena separa-se de uma população maior, as frequências gênicas na população pequena podem ser diferentes das da população a partir da qual se originou, porque o novo grupo contém uma amostra pequena e aleatória do grupo de origem e, aleatoriamente, pode não ter as mesmas frequências gênicas do grupo de origem. Se um dos fundadores originais de um novo grupo por acaso for portador de um alelo relativamente raro, esse alelo terá uma frequência muito mais alta do que tinha no grupo maior do qual o novo grupo foi derivado. Efeito Gargalo Surge quando uma população sofre uma redução numérica drástica, mas temporária. Mas mesmo que essa população se recupere, sua diversidade genética permanece reduzida devido à deriva genética. 2 Nicole Siqueira de Arruda CB USP FMRP Fragmentação de habitats reduz diversidade → formação de corredores é importante para evitar o isolamento das espécies. 3 Nicole Siqueira de Arruda CB USP FMRP Migração e Fluxo gênico A migração pode alterar a frequência alélica pelo processo de fluxo gênico - difusão lenta de genes através de uma barreira. ● Os genes de populações migrantes com suas próprias frequências alélicas características são mesclados gradualmente ao pool genético da população para a qual eles migraram, um processo conhecido como mistura genética. obs.: Migração - atravessar uma barreira reprodutiva, seja ela racial, étnica, cultural ou geográfica 3° LEI DE MENDEL Membros de pares diferentes de genes distribuem-se para gametas independentes um do outro. 4 Nicole Siqueira de Arruda CB USP FMRP ● Alelos de genes em loci diferentes segregam-se independentemente. ● Isso é verdade para genes em cromossomos diferentes, mas nem sempre para genes localizados no mesmo cromossomo (genes sintéticos). Recombinação gênica→ depende da distância gênica 2 gametas recombinantes e 2 gametas parentais 2 LÓCUS 2 ALELOS Se dois lócus não estiverem no mesmo cromossomo (isto é, não forem sintênicos) ou se estiverem no mesmo cromossomo mas muito distantes entre si (θ >0,5), haverá igual número dos quatro tipos de gametas. Alelos em loci em diferentes cromossomos segregam de maneira independente 2 loci polimórficos - 1 e 2 - em cromossomos diferentes, com alelos A e a (1) e B e b (2). Genótipo AaBb Fenótipo AB Suponhamos que o genótipo de um indivíduo é Aa e Bb (heterozigota em ambos os loci; AaBb), com alelos A e B herdados do pai e alelos a e b herdados de sua mãe. obs.: quando sabe-se o fenótipo e não o genótipo, pode-se realizar um cruzamento teste com duplo recessivo para descobri-lo. Os 2 cromossomos diferentes se alinham na placa metafásica na meiose I em uma de duas combinações de igual probabilidade. Haverá 4 possíveis combinações de alelos: 25% AB, 25% ab, 25% Ab, 25% aB⇒ Segregação independente. 5 Nicole Siqueira de Arruda CB USP FMRP - Pelo fato dos gametas AB conterem apenas alelos derivados de seu pai e os gametas ab apenas os alelos materno, esses gametas são designados de gametas parentais (não recombinantes). - Os gametas Ab ou aB, cada um contendo um alelo de origem paterna e outro materna, são chamados de gametas não parentais (recombinantes). 6 Nicole Siqueira de Arruda CB USP FMRP Alelos ligados segregam juntos, formando haplótipos (conjunto de genes) Loci ligados → 2 loci próximos, herdados juntos mais frequentemente do que separados⇒ por estarem muito pertos há pouca chance de se separarem por crossing over. Fase de ligação: ● Loci ligados no mesmo cromossomo⇒ em acoplamento ou cis (constituem um haplótipo) ● Loci ligados em cromossomos homólogos⇒ em repulsão ou trans A1 e B1 ; A2 e B2 = em acoplamento / cis A1 e B2 ; A2 e B1 = em repulsão / trans Alelos ligados podem se recombinar → depende da distância entre eles. 7 Nicole Siqueira de Arruda CB USP FMRP FRAÇÃO DE RECOMBINAÇÃO Taxa de recombinação (Θ) é a medida da distância que separa 2 loci. ● Indicação da probabilidade de ocorrer um crossing over entre eles → quanto mais próximos são os alelos maior a chance de sofrer recombinação. ● Como proporção e não como % ● Θ varia de 0 (nenhuma recombinação) a 0,5 (segregação independente) Θ = 0⇒ completamente ligados Θ = 0,5⇒ segregação independente e não são loci ligados Distância no mapa A extensão de recombinação observada, θ, entre os loci. Centimorgans Unidade de mapa → cM ● Definidos como o comprimento genético* sobre o qual, em média, um crossover ocorre em 1% das meioses. 1 cM → crossing over em 1 em cada 100 meioses⇒ Θ = → Θ = 0,011100 *Não trata-se de distância física A. Os locus estão distantes e pelo menos um crossover entre eles tem chance de ocorrer em cada meiose Gametas de genótipo não recombinante (AB e ab) e recombinante (Ab e aB) em igual proporção na prole. B. Os locus estão tão próximos que o crossover entre eles não é observado Serão formados apenas genótipos não recombinantes (iguais aos cromossomos parentais AB e ab) e a frequência dos genótipos recombinantes é 0. C. Os locus estão próximos no mesmo cromossomo, mas suficientemente afastados para que ocorra crossover em algumas meioses, mas não em outras. Genótipo parental é mais frequente que o genótipo recombinante. Frequência de cromossomos recombinantes varia de 0-50%. O ponto crucial é que quanto mais próximos dois loci estiverem, menor será a frequência de recombinação e menor o número de genótipos recombinantes observados na prole. 8 Nicole Siqueira de Arruda CB USP FMRP Proporção máxima de recombinação Se 100% das células apresentarem crossover: 25% A1B1, 25% A2B1, 25% A1B2, 25% A2B2 Se 50% das células apresentarem crossover: (25 + 12,5) % A1B1 e (25 + 12,5) % A2B2 Parentais 12,5% A1B2 e 12,5% A2B1 Recombinantes Considerandovários lócus: ● Distância máxima entre qualquer par de loci = 50% ● Distância entre o 1° e o último lócus de uma série é igual a soma das distâncias entre os lóci intermediários. Cruzamento entre parental 9 Nicole Siqueira de Arruda CB USP FMRP Cruzamento teste (com um parental homozigoto recessivo): MAPEAR + de 2 loci: Resultado do cruzamento AaBbCc x aabbcc 10 Nicole Siqueira de Arruda CB USP FMRP Passos para calcular a distância intergênica 1. Encontrar os genótipos parentais (os com maiores frequências) 2. Separar os locus 2 as 2 (ABC - A-B, B-C e A-C) 3. Considerar na soma das frequências apenas os genótipos diferentes dos parentais, que são os genótipos recombinantes (ex.: parental = aBc; Ab, AB são diferentes do parental) 11 Nicole Siqueira de Arruda CB USP FMRP 4. Somar as frequências recombinantes de cada par 2 a 2 5. Dividir cada soma pelo total das frequências e multiplicar por 100 (centimorgans) 6. O valor encontrado é a distância entre os alelos A distância entre o 1° e o último loci é menor que a soma das distâncias devido a possibilidade de ocorrência de duplo crossing over (pode “desfazer” uma recombinação, retornando ao genótipo parental) MAPEAMENTO GENÉTICO vs CITOGENÉTICO (físico) I. Genético ● Posição relativa dos genes ● Distância entre genes determinada pela taxa de recombinação (Θ) II. Citogenético ● Localização regional no cromossomo 12 Nicole Siqueira de Arruda CB USP FMRP LIGAÇÃO vs ASSOCIAÇÃO Ao surgir por mutação um novo alelo em um determinado loco, os alelos ligados (próximos) estarão associados ao alelo novo. Exemplo: Por exemplo, se o indivíduo for homozigoto L1/L1 no Loco 1 e, no Loco 2, surgir uma mutação D, este novo alelo ficará associado a um dos alelos L1. Note que todas as vezes em que o alelo D estiver presente, estará presente um alelo L1 no loco vizinho (ligado), mas nem sempre o L1 será acompanhado da mutação D. Se a mutação D for dominante e causar uma doença, podemos usar o alelo associado para auxiliar no diagnóstico: diante de um paciente com suspeita da doença, examina-se o Loco 1. A ausência do alelo L1 significa que o paciente NÃO tem a doença, mas a presença dele não confirma a doença. Apenas aumenta a probabilidade. EQUILÍBRIO DE HARDY-WEINBERG Modelo matemático → Verificar se está ocorrendo evolução. PREMISSAS ● Organismos com locus diplóides. ● A população está em panmixia (todos os indivíduos têm igual probabilidade reprodutiva e os genitores se cruzam ao acaso). ● A população é infinitamente grande → erro de amostragem e deriva gênica são desprezíveis, ou seja, não alteram as frequências alélicas. ● Ausência de fatores evolutivos → não ocorrem mutações, seleção, deriva genética ou migração (fluxo gênico). Considere hipotéticamente um conjunto gênico, que é uma mistura de genes que irão dar origem à geração seguinte. Nesse conjunto gênico, qualquer gameta masculino tem igual probabilidade de se unir a qualquer gameta feminino. Assim, as frequências genotípicas esperadas no zigoto da próxima geração podem ser previstas, desde que se conheçam as frequências dos alelos considerados, A e a. Suponhamos que: p = frequência de A q = frequência de a 13 Nicole Siqueira de Arruda CB USP FMRP Cruzando-se dos indivíduos heterozigotos para o lócus em questão (Aa x Aa), tem-se a distribuição genotípica: Assim: p2 = frequência esperada de AA 2pq = frequência esperada de Aa q2 = frequência esperada de aa sendo, p + q = 1 e p2 + 2pq + q2 = 1 REFERÊNCIAS BIBLIOGRÁFICAS McInnes, Roderick R. Thompson & Thompson Genética Médica. Disponível em: Minha Biblioteca, (8th edição). Grupo GEN, 2016. 14
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