SIMULADO 02 BIOINFORMATICA

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Disc.: BIOINFORMÁTICA   
Aluno(a): FABIO JOAO TURNES 202108265314
Acertos: 10,0 de 10,0 26/04/2023
Acerto: 1,0  / 1,0
Na era pós-moderna, com o advento e a consolidação da revolução robótica no século XX, foi possível aprimorar a criação de
tecnologias computacionais nas mais variadas áreas do conhecimento, o que tem provocado profundas mudanças sociais em
âmbito individual e coletivo. Nesse cenário, a bioinformática ou biocomputação surge na década de 1980, a �m de superar as
fronteiras das ciências pelo desenvolvimento de novas abordagens capazes de promover a análise e a apresentação de dados
biológicos, bem como de garantir a investigação de novos métodos para a resolução de complexas perguntas.
Fonte: ARAÚJO, N. D.; et al. A era da bioinformática. Estud Biol. 2008 jan/dez;30(70/71/72):143-8. Sobre a bioinformática
analise as a�rmativas a seguir:
I. A bioinformática é uma disciplina interdisciplinar que combina diferentes disciplinas, com destaque para a Estatística,
biologia, química, informática e física.
II. A bioinformática possibilitou a interpretação da linguagem dos de genes por algoritmos.
III. Atualmente, os programas de computadores estão muito modernos, e é possível realizar todas grandes análises de forma
rápida e precisa, como prever a ligação de diferentes átomos em uma molécula.
É correto o que se a�rma em:
II.
I e III.
I.
III.
 I e II.
Respondido em 26/04/2023 17:33:06
Explicação:
Existem diversas ciências envolvidas com a bioinformática, que desfrutam do seu avanço, entretanto as áreas mais intimamente ligadas
de acordo com a questão 17 são: Estatística, biologia, química, informática e física. Essa nova ciência permitiu que algoritmos fossem
criados auxiliando na interpretação de genes, alinhamentos dos genes, descobrir sequências e funções de genes desconhecidas. No
entanto, ainda precisamos de programas de computadores mais avançados, para por exemplo, analisar as dinâmicas moleculares
(interação de átomos de diferentes proteínas), mas complexas e mais longas.
Acerto: 1,0  / 1,0
 Questão1
a
 Questão2
a
https://simulado.estacio.br/alunos/inicio.asp
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Desde a descoberta da estrutura do DNA e do desenvolvimento da biologia molecular, o homem vem buscando novas
alternativas que o auxiliem na busca por maior �uidez nos trabalhos de pesquisa, acelerando a geração de processos e
produtos. A bioinformática tem contribuído para avanços na pesquisa básica, mas também na ciência aplicada (....).
Fonte: adaptado de ARAÚJO, N. D.; et al. A era da bioinformática. Estud Biol. 2008 jan/dez;30(70/71/72):143-8.
A seguir são listadas algumas aplicações da bioinformática.  Analise as a�rmativas a seguir:
I. Identi�cação de alvos proteicos com potencial para serem modi�cados diretamente pela interação com fármacos.
II. A identi�cação de moléculas que poderão atuar como princípio ativo na elaboração de produtos terapêuticos, inibindo ou
acelerando certas reações bioquímicas, poderá apresentar efeitos sobre a cura ou a atenuação da doença.
III. Proporcionar melhor entendimento dos processos evolutivos e das relações �logenéticas.
IV. Ampli�cação do material genético para a veri�cação quantitativa e qualitativa de um determinado DNA em uma amostra
biológica. 
V. Identi�car a expressão gênica durante um tumor, identi�car suas alterações para que genes defeituosos, ausentes ou
superativados sejam reconstruídos ou desligados, para garantir o desenvolvimento de medidas terapêuticas ou preventivas
contra tumores e agentes infecciosos.
Assinale a opção correta.
Apenas I.
Apenas II.
Apenas III e IV.
I, II e III.
 I, II, III e V.
Respondido em 26/04/2023 17:34:34
Explicação:
A bioinformática é a ciência integra essencialmente o desenvolvimento de programas computacionais para tratar dados biológicos
preexistentes e identi�car sequências de genes, predizer a con�guração tridimensional das proteínas, identi�car inibidores
enzimáticos, promover o agrupamento de proteínas, estabelecer árvores �logenéticas e analisar experimentos da expressão gênica. No
entanto, ela não ampli�ca o DNA para a sua detecção em uma amostra biológica, essa análise é realizada pela reação de polimerase da
cadeia, que pode apenas detectar a presença (qualitativa) ou então veri�car a concentração (quantitativa). As demais alternativas estão
corretas.
Acerto: 1,0  / 1,0
Em 2017 a revista "Nature" publicou o artigo "Physical properties of the HIV-1 capsid from all-atom molecular dynamics
simulations" de Perilla & Schulten (2017), onde um supercomputador conseguiu fazer uma simulação de todos os átomos
presentes no capsídeo do vírus HIV-1 por 400 nanossegundos, foram cerca de 4 milhões de átomos. Qual técnica da
bioinformática permite realizar essa análise?
QSAR
Ancoramento molecular
Alinhamento molecular
 Dinâmica molecular
Modelagem molecular
Respondido em 26/04/2023 17:35:06
Explicação:
A dinâmica molecular é um modelo de ajuste induzido que tenta mimetizar o que acontece no ambiente real. Na dinâmica molecular
cada átomo, seja da proteína, do ligante ou da água é levado em consideração para calcular a movimentação de todo o sistema por
 Questão3
a
alguns nano ou milissegundos e entender as movimentações existentes e assim concluir como as interações acontecem. O
ancoramento molecular utiliza o modelo chave-fechadura, pois a variável tempo não é levada em consideração. O alinhamento
molecular visa identi�car genes que compartilham funções ou determinada ancestralidade, podemos também usar o alinhamento para
encontrar proteínas moldes, durante a etapa de modelagem molecular. O QSAR é uma técnica estatística de tratamento de dados a
partir de descritores, visa prever a atividade de uma molécula nova contra determinado receptor.
Acerto: 1,0  / 1,0
Muitos programas de computador já foram e vêm sendo desenvolvidos para auxiliar no desenho de primers usados na
PCR (Reação em Cadeia de Polimerase). Dentre eles, podemos citar o Primer3, que pode ser usado de forma on-line por
qualquer pessoa. Qual das opções abaixo contém uma informação essencial que o usuário precisa fornecer
obrigatoriamente, para que um programa consiga desenhar primers?
Temperatura de melting.
 Sequência de nucleotídeos do alvo no DNA.
Tamanho do produto ampli�cado.
Conteúdo GC.
Temperatura de anelamento.
Respondido em 26/04/2023 17:35:44
Explicação:
Os primers são uma sequência de nucleotídeos que é complementar à sequência molde, que queremos ampli�car. Essas sequências
moldes podem ser obtidas em bancos de dados biológicos de sequências de nucleotídeos, como GenBank e RefSeq, disponíveis no
portal no NCBI. Nos programas utilizados para desenhar esses oligonucleotídeos, é impossível desenhar uma sequência complementar
de primers sem ter essa sequência.  As outras alternativas da questão são todos parâmetros para o desenho de primers, mas o usuário
não precisa alterar as con�gurações do programa, só se ele achar necessário.
Acerto: 1,0  / 1,0
(PR4 - UFRJ - Biólogo  -UFRJ - Biologia Molecular - 2016)
Um pesquisador e sua equipe acabam de obter a sequência de nucleotídeos de um gene de camundongo antes desconhecido.
Querendo saber se esse gene ou um gene similar está presente no genoma humano, ele deve recorrer à seguinte ferramenta
de bioinformática:
 
 BLAST.
Mega.
GenBank.
Velvet.
Multialignm.
Respondido em 26/04/2023 17:36:07
Explicação:
O BLAST é um software para alinhamento simples e local de sequências biológicas. Essas sequências podem ser de nucleotídeos ou
aminoácidos. Como o pesquisador quer descobrir se a sequência de nucleotídeos de um gene de camundongo antes desconhecido
está presente no genoma humano, essa é a ferramenta mais aplicada, pois ele vai comparar sequências simples. O Mega é um software
para análises �logenéticas. Multialignm é um programa para alinhamento múltiplo de sequências. Velvet é um algoritmo para
montagem de genomas. GenBank é um banco de dados.
 Questão4a
 Questão5
a
Acerto: 1,0  / 1,0
O PubMed é um dos bancos de dados disponíveis no portal do NCBI. A partir dele, podemos buscar por artigos cientí�cos da
área biomédica publicados por cientistas em todo o mundo. Caso você queira direcionar a sua busca para obter artigos mais
adequados ao seu interesse, o que poderia ser feito?
Cadastrar seus dados pro�ssionais e receber uma autorização para acessar a parte restrita do PubMed que permite
buscas avançadas.
Pagar uma assinatura mensal ao PubMed para que ele direcione automaticamente suas buscas de acordo com os
critérios que você deseja.
Não existe a possibilidade de direcionar a busca, é necessário avaliar todos os títulos que aparecem como resultado
para escolher aqueles mais adequados.
Acessar o PubMed por meio de rede de Internet de instituição pública, como universidades ou bibliotecas. Só assim é
possível direcionar a busca por artigos.
 Utilizar os �ltros de busca, que incluem ano e tipo de artigo, por exemplo, ou, ainda, optar pela busca avançada.
Respondido em 26/04/2023 17:37:04
Explicação:
Qualquer usuário pode acessar ao PubMed, via NCBI, e fazer buscas direcionadas usando �ltro ou o modo avançado. Pode acontecer
de alguns dos artigos que aparecem como resultados não estejam disponíveis para leitura de todo o conteúdo, mas isso depende da
revista em que o artigo foi publicado, e não do PubMed.
Acerto: 1,0  / 1,0
(Adaptado de VUNESP - 2020 - EBSERH - Farmacêutico) A revolução biotecnológica tem fornecido informações
extremamente úteis para a descoberta de fármacos. O su�xo "ômica"  indica uma série de novas disciplinas e procedimentos
que visam à identi�cação funcional e/ou estrutural de tecidos, de células, de padrões de expressão gênicos e de
características metabólicas (Bhogal & Balls, 2008), dentre elas:
BHOGAL, N.; BALLS, M. Translation of new technologies: from basic research to drug discovery and development. Curr. Drug
Discov. Technol., v.5, n.3, p.250-62, 2008.
 Genômica, transcriptômica e metabolômica.
Genômica, transcriptômica e biônica.
Genômica, dicotômica e proteômica.
Genômica, lipidômica e biônica.
Proteômica, lipidômica e dicotômica.
Respondido em 26/04/2023 17:38:51
Explicação:
Genômica, transcriptômica e metabolômica são exemplos de ciências ômicas. Segundo o Dicionário Priberam da Língua Portuguesa, a
palavra "dicotômica" signi�ca "que se divide ou subdivide em dois", enquanto "biônica" signi�ca "ciência que tem por �m o estudo de
certos processos biológicos com vista a aplicar processos análogos para �ns militares, tecnológicos etc." As demais palavras são
ciências ômicas (lipidômica).
Acerto: 1,0  / 1,0
(CESPE/UNB - INMETRO - 2010- Biotecnologia Molecular)
Microarranjo é uma técnica empregada em biologia molecular que permite medir os níveis de expressão de transcritos em
larga escala. Com relação a essa técnica, assinale a opção correta.
 Questão6
a
 Questão7
a
 Questão8
a
A técnica em questão é empregada em estudos proteômicos, visto que permite a identi�cação direta das proteínas
expressas.
As lâminas de vidro utilizadas são revestidas por moléculas de lipídios.
A expressão dos genes é acompanhada com o emprego de sondas marcadas com brometo de etídio.
 O microarranjo de DNA consiste em um arranjo prede�nido de moléculas de DNA quimicamente ligadas a uma
superfície sólida.
A detecção é realizada por meio de eletroforese em gel de agarose.
Respondido em 26/04/2023 17:39:42
Explicação:
A técnica em questão é empregada em estudos transcriptômicos, visto que permite a identi�cação direta das RNAs expressas. Para a
técnica, são utilizadas lâminas de vidro revestidas com sondas de DNA. A expressão dos genes é acompanhada com o emprego de
sondas marcadas com corantes �uorescentes. A detecção é realizada por meio de detecção da �uorescência.
Acerto: 1,0  / 1,0
Analise a �gura a seguir:
Imagens: Leandro Pederneiras
Analisando as árvores da esquerda e direita é possível a�rmar que:
São árvores diferentes porque possuem relações entre grupos diferentes.
Alguns clados foram cortados e colados em diferentes ramos na árvore da direita.
 São perfeitamente similares, apenas a forma de apresentação mudou e alguns ramos giraram em seu próprio eixo.
Possuem topologias idênticas, mas a árvore da direita possui nós mais profundos.
O grupo A B C D E é mais próximo relacionado ao grupo I J K L M na árvore da esquerda do que na da direita.
Respondido em 26/04/2023 17:40:11
Explicação:
Gabarito: São perfeitamente similares, apenas a forma de apresentação mudou e alguns ramos giraram em seu próprio eixo.
Justi�cativa: As duas imagens correspondem a um cladograma, nesse tipo de árvore não é possível saber a profundidade exata dos nós
porque não possui uma escala de tempo. As duas árvores são idênticas em seus relacionamentos (topologia), apenas com ramos
torcidos em seus próprios eixos, pela alteração da forma (retangular e diagonal, respectivamente). Os grupos A B C D E e I J K L M estão
 Questão9
a
na mesma posição nas árvores, apenas com ramos torcidos, sendo assim não mudam a relação de proximidade. Não houve corte nas
árvores que justi�caria a mudança de topogra�a entre as árvores.
Acerto: 1,0  / 1,0
Observe o cladograma abaixo:
Imagem Leandro Pederneiras
A seguir são listadas alguns grupos de espécies. Analise as alternativas que, segundo o cladograma, se refere a um grupo
para�lético.
O conjunto de espécies A F.
O conjunto de espécies P Q R.
O conjunto de espécies G H I.
O conjunto de espécies U V H.
 O conjunto de espécies J K L M.
Respondido em 26/04/2023 17:41:38
Explicação:
Gabarito: O conjunto de espécies J K L M.
Justi�cativa: Grupos para�léticos são aqueles que faltam poucos descendentes, menos da metade, para se transformar em
mono�lético. Assim, na imagem da árvore �logenética, o grupo para�lético é o conjunto de espécies J K L M porque para ser
mono�lético só falta uma espécie I. O conjunto de espécies G, H, I; A e F; P, Q, R; U, V e H, precisariam incluir muito mais grupos para
ser um grupo mono�lético, pois alguns espécies do conjunto não apresentam um ancestral comum próximo, como é o exemplo do
conjunto de espécies J K L M. Lembre-se que para descobrir o ancestral comum de dois táxons basta caminhar sempre para trás da
�logenia iniciando do terminal (onde está o nome da espécie).
 Questão10
a