Questionário virologia - monitores

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1. Defina Capsômero:
Capsômero é a unidade primária de formação da cápside
2. Quais são os passos da replicação do Vírus de DNA de fita simples? Assinale a
alternativa com a ordem correta:
3. Explique a importância da arquitetura celular na entrada viral. Qual a diferença
entre a infecção viral localizada e sistêmica?
Os vírus infectam o organismo pela via apical do epitélio. Em infecções virais localizadas, a
disseminação é lateral, ou seja, o vírus não é capaz de atravessar a membrana basal. Já
em infecções virais sistêmicas, a disseminação é vertical: o vírus é capaz de atravessar a
membrana basal e causar uma infecção mais profunda, se difundindo na corrente
sanguínea e chegando a outros tecidos.
4. Qual é a importância dos canyons para os vírus? Cite uma família em que é
possível encontrá-los:
Os canyons são depressões nos vírus não envelopados onde encontram-se os receptores
virais. Eles permitem que os receptores celulares do tipo imunoglobulina se liguem de forma
correta (assim como Anticorpos) e são encontrados na família Picornavírus (também na
Poliovirus).
5. Quais destes componentes estão presentes em TODOS os vírus?
6. Defina Vírion:
Virion é uma partícula viral infecciosa, completa e madura.
7. Cite 3 tipos de moléculas de superfície celular que o vírus pode usar como
receptor:
Integrinas, colectinas e a superfamília do tipo imunoglobulina (+caderinas, heparin-sulfato,
colágeno, ácido siálico)
8. Defina Tropismo Viral e Rango do Hospedeiro:
Tropismo viral é a predileção do vírus por um tipo celular específico. O rango do hospedeiro
é a capacidade que um vírus tem de infectar um organismo ou cultivo celular, funcionando
como um ranking, em função da presença de receptores celulares e também da
permissividade da célula.
9. Explique em que se baseia a classificação de Baltimore. Qual foi o erro dessa
classificação e qual família não foi incluída?
A classificação de baltimore tem 6 grupos e é baseada na forma como se produz o mRNA,
já que toda a síntese proteica viral depende da maquinaria de tradução da célula
(ribossomos) e por isso, todos os vírus precisam produzir mRNA para gerar as proteínas (a
função universal do genoma viral é produzir mRNA para codificar proteínas). No entanto,
essa classificação não considerou que o genoma poderia ser usado como molde para
produzir outro genoma viral e por isso, não incluiu a família Hepadnaviridae (Classe VII -
DNA parcialmente duplo + intermediário de RNA).
10. Classifique os Vírus*
11. Quantas funções tem a cápside? Cite pelo menos 3 delas:
A cápside tem 8 funções:
- Proteção do genoma;
- União a receptores;
- Sinalização para o desnudamento;
- Interação com componentes celulares: transporte do genoma ao sítio de replicação;
- Interação com componentes celulares para transporte de proteínas para a montagem;
- Interação com o sistema imune;
- Reconhecimento do genoma e empacotamento;
- Interação com membranas celulares (vírus envelopados)
12. Após a união do vírus à célula, a entrada viral é promovida por 3 mecanismos.
Cite quais são usadas por vírus não envelopados e quais por vírus envelopados:
As 3 são: Endocitose, fusão de membranas e formação de poros em superfícies.
- Vírus não envelopados: endocitose e formação de poros;
- Vírus envelopados: endocitose e fusão de membranas.
13. Qual o único vírus de RNA que entra no núcleo ainda como RNA para se replicar?
Influenza
14. A especificidade do vírus é por conta de:
15. Explique os dois termos das alternativas da questão 14:
Uma célula susceptível é aquela que possui o receptor que se liga ao receptor viral. Uma
célula permissiva, além de possuir o receptor, permite também a replicação deste vírus no
seu interior.
16. Quais são os mecanismos de deslocamento do vírus no citoplasma da célula
hospedeira?
17. Marque as questões verdadeiras
18. Como se dá a formação da Cápside? Explique um pouco sobre a economia
genética:
A formação da cápside se dá através da interação entre os capsômeros. Os vírus possuem
uma propriedade chamada economia genética, na qual codificam multicópias de uma ou
poucas subunidades repetitivas e pequenas, o que permite que com pouco espaço no
genoma, o vírus possa formar uma cápside (já que ela vai usar um ou poucos genes).
19. Fale sobre as duas geometrias da cápside: quais são suas principais
características?
A cápside pode ser helicoidal, que é uma estrutura aberta em que os capsômeros interagem
acompanhando o formato de hélice do genoma viral, havendo um capsômero para cada 3
nucleotídeos. É mais propícia para vírus de genoma maior e tem uma estrutura mais
simples.
Já a simetria icosaédrica representa uma estrutura mais complexa e é fechada. Seus
capsômeros formam triângulos equiláteros que juntos possuem uma forma quase esférica.
Estas cápsides possuem pelo menos 60 subunidades. A única forma de aumentar a cápside
é através da triangulação, que é um processo difícil e, por isso, esta forma é mais adequada
para vírus de genoma menor.
20. Quando a partícula viral entra em contato com a célula hospedeira, inicia uma
série de eventos altamente coordenados, sendo eles (Marque a ordem correta dos
acontecimentos):
21. Qual a diferença entre genoma de RNA positivo e a negativo? Qual dos dois,
quando desnudo, é infeccioso e por quê?
A fita de RNA positiva é aquela que possui uma estrutura similar ao RNA mensageiro e é
reconhecida pelos ribossomos (possui CAP e cauda Poli-A). Já a fita de RNA negativa é
complementar ao RNA mensageiro e, portanto, não é reconhecida pelos ribossomos. Entre
eles, o genoma desnudo infeccioso é o ssRNA(+), haja vista que não é degradado pela
célula, mas reconhecido e pode codificar proteínas, iniciando o ciclo celular. O genoma
ssRNA(-) não é infeccioso se desnudo, porque se perder as nucleoproteínas perde a
proteção e é degradado pela célula.
22. Explique o que são Epissomos.
Epissomos são uma forma de DNA circular que os vírus da herpes e papilloma formam
dentro da célula, a fim de fugir da resposta imune do hospedeiro. Ele compõe um
mecanismo viral para limitar sua replicação na célula, em que há uma baixa taxa de
manutenção da replicação e permite que o vírus possa ter uma relação de longa duração
com o hospedeiro.
23. Como ocorre a síntese do DNA viral por deslocamento? Cite proteínas envolvidas
nesse processo.
Na replicação por deslocamento, a proteína iniciadora pTP se liga à extremidade 3' da fita
molde e atrai uma DNA Polimerase viral. A duplicação se inicia e, à medida que são
adicionados desoxirribonucleotídeos à fita molde, a outra fita começa a ser deslocada e
coberta por proteínas DBP. Quando a primeira fita é polimerizada, a proteína pTP já sofreu
clivagem e passa a ser TP, que permanece no vírion. Neste momento, a outra fita
dissociada e completamente coberta por DBPs sofre o mesmo processo da primeira.
24. Qual o 1º passo da multiplicação dos vírus ssRNA(-)?
25. A entrada viral no núcleo é um processo ativo ou passivo? Explique.
A entrada viral ao núcleo é um processo ativo, pois sequências sinal NLS promovem a
sinalização necessária para a entrada ao núcleo.
26. Explique qual o papel do capsômero na simetria helicoidal:
27. Por quais mecanismos as moléculas em geral entram na célula?
As moléculas em geral, para além dos mecanismos virais, entram na célula através dos
mecanismos de endocitose, macropinocitose e fagocitose.
28. Dentre essas estruturas, quais os vírus de RNA utilizam na extremidade 5' do seu
genoma?
29. Dentre essas opções, quais o vírus utiliza na extremidade 3':
30. Como o vírus de RNA adiciona o cap?
O vírus de RNA pode adicionar o CAP a partir de suas próprias proteínas virais (no
citoplasma) ou, como é o caso do vírus Influenza, ele pode entrar ao núcleo, clivar um RNA
mensageiro celular na posição 13, acoplar a extremidade do seu genoma ao cap e começar
o elongamento, "roubando" o cap celular.
31. Qual a família de vírus representante da classe VII? Explique como ocorre sua
replicação:
O vírus Hepadnaviridae entra na célula com o seu genomade fita dupla incompleta, se
desnuda e vai ao núcleo, onde a DNA polimerase celular realiza o reparo e completa a fita
positiva. Em seguida a RNA polimerase II transcreve RNA mensageiro e também o RNA
pré-genômico (pgRNA), que é reconhecido pelas proteínas da cápside por sinalização na
sua extremidade 5' e encapsidado, juntamente com a proteína Tp e a Transcriptase reversa.
O pgRNA é então usado de molde para a transcrição reversa, que tem como primer a
proteína Tp. No entanto, esta polimerização é extremamente lenta e, por isso, a fita positiva
sai incompleta da célula. O vírus é liberado com sua dupla fita incompleta, a transcriptase
reversa e a proteína Tp no vírion, podendo voltar para a produção de mais partículas ou
infectar outra célula.
32. Como os retrovírus escapam do splicing e porque eles não podem passar por
esse processo?
Os retrovírus não podem sofrer splicing, pois isso levaria à perda da sua informação
genética, essencial para a replicação. Para fugir desse mecanismo, eles possuem no seu
RNA um sítio de ligação similar àquele presente em RNA mensageiros que sofreram
splicing (sítio CTE), gerando o reconhecimento pela proteína TAP, que promove a mesma
sinalização para a saída do núcleo, sem que precise passar pelo processo de splicing.
33. Cite quais proteínas estão envolvidas na indução ou inibição de proteínas
reguladoras do ciclo celular, como a Rb e a P53. Como elas agem?
Numa célula normal, a proteína de Retinoblastoma (Rb), supressora de tumor, funciona
como inibidora da síntese celular, ao se ligar ao complexo de fatores de replicação E2F/Dp.
Quando fosforilada, a Rb se dissocia e o complexo de fatores de replicação promovem a
síntese de DNA. O vírus é capaz de codificar uma proteína que mimetiza a E2F e, com isso,
sequestra a Rb, liberando o complexo e promovendo a síntese. Assim, a célula entra em
fase S continuamente e em processo tumoral. Nesse caso, o vírus não interfere no DNA,
mas no ciclo de divisão celular.
Alguns exemplos de proteínas que envolvem esse mecanismo são:
- LT, do vírus SV40 (Polioma), que sequestra a Rb e a p53;
- Papilloma (HPV), E7 sequestra Rb e E6 sequestra p53;
- Adenovírus: E1A sequestra Rb e E1B sequestra p53.
34. Quais são as propriedades gerais da transcriptase reversa?
Polimerização muito lenta, baixa fidelidade (acumula mutações, principalmente na fita
positiva) e Função de RNAse H.
35. Quais as classes de vírus possuem a enzima transcriptase reversa? Cite 2 famílias
destas e qual a diferença entre elas quanto ao processo de transcrição reversa.
Classes 6 - vírus de RNA com intermediário de DNA (retroviridae) e 7 - vírus de DNA fita
incompleta com intermediário de RNA (Hepadnaviridae). A diferença é que o
hepadnaviridae não integra, enquanto os retrovirus sim.
36. Como as glicoproteínas, produzidas no citoplasma e glicosiladas no golgi,
chegam à superfície da membrana plasmática e por que precisam estar lá?
Elas chegam via vesículas e precisam estar lá porque as glicoproteinas são para a célula
essenciais para o reconhecimento de substâncias, enquanto que para os vírus é uma
maneira de adentrar em novas células utilizando este reconhecimento, na medida em que
ele é usado para reconhecimento célula-célula
37. Quais mecanismos de montagem da cápside? Explique um deles
Existem 3 tipos de mecanismos de montagem da capside. O primeiro seria a montagem em
que as subunidades da capside são traduzidas separadamente/individualmente e depois
são unidas para formar a estrutura completa; o segundo seria a montagem em que as
proteinas do capside são traduzidas uma seguida na outra pelo mesmo RNAm e depois são
unidas, como na tradução celular; e a terceira seria a junção das proteínas do capside por
chaperonas.
38. De quais maneiras pode ocorrer a lise da célula como mecanismo de liberação
das partículas virais?
A lise celular ocorre em vírus não envelopados e acontece através do rompimento da
membrana celular por meio de proteínas virais ou através da inibição da síntese proteica
39. A sinalização das proteínas virais pode ser para que as proteínas:
40. Quais são os 3 mecanismos de empacotamento do genoma viral?
Um genoma viral pode ser empacotado por meio de proteínas virais do capside
incorporadas ao genoma, proteínas virais que interligam o genoma ao capside e proteínas
celulares que também ajudam na ligação entre o genoma e o capside.