Baixe o app para aproveitar ainda mais
Prévia do material em texto
Professor Diego Mattos Penedo diego_penedo@hotmail.com Transcrição Função A transcrição consiste no início da transferência das informações contidas no gene para a produção da proteína. Esse processo utiliza um gene do DNA como molde para criação de uma fita de RNA complementar a essa sequência específica de DNA. Corresponde ao início da expressão do fenótipo O RNA é fundamental nesse processo Existem diferentes tipos de RNA: • RNA ribossômicos (rRNA): são componentes estruturais e catalíticos dos ribossomos, as organelas que traduzem sequências de nucleotídeos em sequências de aminoácidos dos polipeptídios. • Pequenos RNA nucleares (snRNA): são componentes estruturais dos espliceossomos, as organelas nucleares que retiram os íntrons dos transcritos gênicos. • Micro-RNA (miRNA): são RNAs curtos (20 a 22 nucleotídeos), que são clivados de pequenos precursores em formato de grampo e bloqueiam a expressão de mRNA, causando sua degradação ou reprimindo sua tradução. • RNA mensageiro (mRNA): uma molécula derivada do DNA por transcrição que faz a transferência da informação no núcleo para o citoplasma. • RNA transportador (tRNA): são pequenas moléculas de RNA que atuam como adaptadores ente aminoácidos e os códons no mRNA durante a tradução. • Nas células eucariotas, os diferentes tipos de RNA são produzidos no núcleo, podendo nele permanecer ou ser enviado ao citoplasma para desempenhar diferentes funções. • Alguns deles serão utilizados no processo seguinte, finalizando a produção da proteína. Snutad et al, 2013 • A molécula de RNA produzida será complementar e antiparalela ao filamento- molde de DNA, sendo idêntica (exceto pela uracila em vez de timina), ao filamento não molde de DNA. • A transcrição ocorre no sentido 5’ 3’ Aspectos Gerais da Síntese de RNA Snutad et al, 2013 RNA polimerase Watson et al. 2015 Transcrição de rRNA Transcrição em eucariotos mRNA Transcrição de tRNA, snRNA e rRNA RNA polimerase em procariotos Catalisa a reação de transcrição – ou seja, ela é a responsável por se ligar ao DNA molde e forma o RNA complementar. Possui 5 subunidades, sendo: – Duas subunidades α (alfa): participam da formação do cerne dessa holoenzima. – Uma β (beta): é ativa na catálise, sítio de ligação aos ribonucleotídeos trifosfatos. – Uma β’: sítio de ligação ao DNA molde. – E uma ω (ômega): tem papeis na montagem da enzima e na regulação da expressão gênica. RNA polimerase em procariotos Existe ainda o fator σ (sigma), que não constitui a RNA polimerase, mas se liga a ela para que haja o reconhecimento da região promotora; também desempenha a função de separar as fitas de DNA para que a enzima possa fazer a ligação com o DNA molde e iniciar a transcrição. O fator σ só permanece ligado à enzima durante a fase de iniciação. RNA polimerase em eucariotos Em eucariotos, embora o mecanismo de transcrição seja basicamente o mesmo que em procariotos, a “maquinaria” de síntese do RNA é mais complexa, com 3 RNA polimerases. RNA polimerase I, II e III Cada uma com pelo menos 12 subunidades. Algumas dessas subunidades comuns a todas elas. Etapas da transcrição Pode ser dividida em 3 etapas: - Iniciação - Alongamento - Término Snutad et al, 2013 TRANSCRIÇÃO EM PROCARIOTOS http://oregonstate.edu/instruct/bb451/winter14/lectures/transcriptionoutline.html Iniciação 1º - a RNA pol. liga-se a uma região específica, denominada região promotora Essa região é conservada e necessária para o início da transcrição. Possui duas sequências conservadas a cerca de 10 a 35´pb antes do sítio de início da síntese de RNA –Região -35 : TTGACA –Região -10 : TATAAT Sequência de reconhecimento Facilita o desenrolamento Iniciação • O local onde é adicionado o primeiro nucleotídeo é chamado de startpoint (ou ponto de início) • Uma vez o DNA aberto para transcrição, forma-se a bolha de transcrição (com tamanho aproximado de 18 nucleotídeos) • Importante: – Ao abrir a fita, a RNApol causa um super enrolamento, que é desfeito pela ação da topoisomerase (DNA girase) Iniciação • Ao sair da região promotora, o fator sigma é liberado da RNA polimerase. • Complexo DNA + RNApol + RNA que está sendo transcrito é considerado estável (ou seja, não será desfeito e seguirá o processo) depois que a RNApol percorreu 10pb e saiu da região promotora. Transição para a fase de alongamento Alongamento • O alongamento de cadeias de RNA é catalisado pela RNA polimerase após a liberação da subunidade sigma. • A própria RNA polimerase é capaz de desenrolar e restabelecer o DNA durante o processo. Snutad et al, 2013 Alongamento • A cadeia de RNA que está sendo formada vai sendo deslocada do filamento-molde de DNA à medida que a RNA polimerase avança – permanecem de 8 a 9 pb ligados entre DNA/RNA, formando um “híbrido” momentâneo. https://www.khanacademy.org/science/biology/gene-expression-central-dogma/transcription-of-dna-into-rna/a/stages-of-transcription O mRNA transcrito é quase idêntico à fita que não serve de molde (“não-modelo”), com exceção da substituição T por U. Terminação O término das cadeias de RNA ocorre quando a RNA polimerase encontra um sinal de término. Duas estratégias podem ocorrer: - Término independente da proteína Rho; - Término dependente da proteína Rho. Rho-independente • Depende de sequências específicas na fita de DNA que serve como modelo. • À medida que a RNA polimerase se aproxima do final do gene que está sendo transcrito, ela atinge uma região rica em nucleotídeos C e G. • O mRNA transcrito desta região se dobra sobre si mesmo e os nucleotídeos C e G complementares se ligam. O resultado é um grampo (hairpin) estável que faz com que a polimerase pare. Snutad et al, 2013 Além do grampo, a fraca interação entre A-U na porção final da cadeia de RNA, ainda ligada ao DNA, aumenta a instabilidade da ligação, facilitando o RNA se soltar do DNA. Rho-dependente • Uma proteína chamada fator Rho se liga a um local específico do RNA, denominado rut (rho utilization - utilização de rho). – O fator Rho liga-se a esta sequência do RNA e inicia uma "subida" pelo transcrito em direção à RNA polimerase. • No DNA existe uma sequência que, quando transcrita, forma um grampo na fita de RNA; • Quando a RNA polimerase transcreve a região do grampo, faz uma pausa, o que possibilita a Rho alcançá-la e usar sua atividade de helicase para desfazer o pareamento de bases do DNA/RNA no término e liberar tanto o transcrito de RNA quanto a RNApol. https://www.khanacademy.org/science/biology/gene-expression-central-dogma/transcription-of-dna-into-rna/a/stages-of-transcription https://www.youtube.com/watch?v=cXlv21NCGxQ&t=74s TRANSCRIÇÃO EM EUCARIOTOS http://oregonstate.edu/instruct/bb451/winter14/lectures/transcriptionoutline.html Iniciação Existem 3 RNA polimerases. – A RNA polimerase II transcreve mRNA. A RNA pol II necessita de fatores gerais de transcrição (GTFs) - proteínas que regulam a transcrição de genes. - Seu papel é atrair a RNApol II e posicioná-la no local correto onde deve iniciar a transcrição. Iniciação Os Fatores de Transcrição (TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF) interagem com promotores na sequência correta para iniciar a transcrição. Snutad et al, 2013 http://www.mun.ca/biology/desmid/brian/BIOL2060/BIOL2060-23/23_20.jpg Região Promotora Região Promotora Sequências conservadas curtas. A mais próxima ao sítio de início da transcrição (posição +1) é chamada de sequência TATA (ou TATA box), que está centralizado aproximadamente na posição -30. Alongamento A RNA polimerase II sofre fosforilação em um sítio específico (chamado cauda), o que permite sua liberação do complexo de fatores de transcrição – escape da região promotora. A partir desse ponto os nucleotídeos são adicionados pela RNA polimerase II, catalisando o alongamento da cadeia de RNA pelo mesmo mecanismoda RNA polimerase em procariotos. Alongamento No início do alongamento, a extremidade 5’ do RNA são modificadas pela adição de um cap de 7-metilguanosina (7-MG). Esse cap 7-MG é adicionado quando o RNA tem ainda 30 nucleotídeos de comprimento e ajudam a proteger a cadeia de RNA em crescimento contra degradação (por nucleases). Snutad et al, 2013 Terminação O alongamento do mRNA continua até que a sequência conservada AAUAAA ou AUUAAA seja identificada por fatores de clivagem (“separação”), marcando a extremidade 3′ do transcrito. Uma sequência é adicionada ao final do mRNA pela enzima Poli(A) polimerase – esta adiciona cerca de 200 Adeninas à extremidade 3’ do RNA (cauda PoliA). - essa cauda gera estabilidade e tem papel importante no transporte do núcleo ao citoplasma. PROCESSAMENTO DO MRNA (SPLICING) https://www.khanacademy.org/science/biology/gene-expression-central-dogma/transcription-of-dna-into-rna/a/eukaryotic-pre-mrna-processing Processamento do mRNA O RNA transcrito é maior do que o RNA que será traduzido (próxima etapa da expressão gênica), sendo chamado de pré- mRNA. São transcritos íntrons (sequências não codificantes dentro do gene) e éxons (sequências codificantes) – os íntrons têm que ser removidos. Processamento do mRNA Sequências de nucleotídeos determinam onde esse processamento vai acontecer. • Sequência GU no sítio de processamento 5’ do íntron • Sequência AG no sítio de processamento 3’ do íntron • Resíduo A no sítio de ramificação (15 a 45 nucleotídeos acima do sítio de corte 3’) *N – qualquer nucleotídeo pode estar presente. Processamento do mRNA Essas sequências são reconhecidas por 5 tipos de snRNA (“RNA pequeno nuclear”), clivando e removendo os íntrons e juntando os éxons. Ao complexo de snRNAs que atuam nesse processo se dá o nome de Spliceossomo. https://www.youtube.com/watch?v=cyrJEZN3Cbc Resumindo Splicing alternativo A existência de splicing do pré-mRNA em eucariotos tem uma vantagem importante: os transcritos primários podem sofrer splicing de diferentes maneiras e produzir diferentes mRNA (transcritos variáveis) – dependendo do tipo de célula na qual o gene está sendo expresso, por exemplo -, caracterizando o splicing alternativo. Assim, diferentes proteínas podem ser produzidas a partir do mesmo gene (denominadas isoformas proteicas). Splicing alternativo Encaminhamento do RNA O mRNA é encaminhado para a próxima etapa (tradução). Nos procariotos, ele é encaminhado diretamente ao ribossomo, por não existir separação núcleo-citoplasma. Nos eucariotos, o mRNA precisa ser enviado do núcleo para o citoplasma, atravessando o envelope nuclear. Slide 1: Transcrição Slide 2: Função Slide 3: O RNA é fundamental nesse processo Slide 4 Slide 5: Aspectos Gerais da Síntese de RNA Slide 6: RNA polimerase Slide 7: RNA polimerase em procariotos Slide 8: RNA polimerase em procariotos Slide 9: RNA polimerase em eucariotos Slide 10: Etapas da transcrição Slide 11: Transcrição em procariotos Slide 12: Iniciação Slide 13: Iniciação Slide 14: Iniciação Slide 15: Alongamento Slide 16: Alongamento Slide 17: Terminação Slide 18: Rho-independente Slide 19 Slide 20: Rho-dependente Slide 21 Slide 22: https://www.youtube.com/watch?v=cXlv21NCGxQ&t=74s Slide 23: Transcrição em eucariotos Slide 24: Iniciação Slide 25: Iniciação Slide 26: Região Promotora Slide 27: Alongamento Slide 28: Alongamento Slide 29: Terminação Slide 30: Processamento do mRNA (Splicing) Slide 31: Processamento do mRNA Slide 32: Processamento do mRNA Slide 33: Processamento do mRNA Slide 34: https://www.youtube.com/watch?v=cyrJEZN3Cbc Slide 35: Resumindo Slide 36: Splicing alternativo Slide 37: Splicing alternativo Slide 38: Encaminhamento do RNA
Compartilhar