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BIOLOGIA MOLECULAR E FARMACOGENÉTICA Lupa DGT1143_201902519681_TEMAS AMPLIFICAÇÃO IN VITRO DE DNA 1. No diagnóstico clínico-molecular, a reação em cadeia da polimerase (PCR) em tempo real pode ser utilizada para a avaliação da carga viral ou bacteriana, para a determinação da resistência a antibióticos e, até mesmo, para o prognóstico de tumores malignos. A figura abaixo apresenta ciclos de amplificação de amostras por PCR em tempo real, sendo (A) uma amplificação de um determinado segmento gênico que identifica um determinado marcador tumoral em células neoplásicas e (B) uma amplificação do mesmo segmento gênico em células não neoplásicas. A partir das informações apresentadas, conclui-se que: A linha paralela ao eixo referente ao número de ciclos, na altura em que se inicia a fase exponencial da amplificação gênica, denominado threshold, representa falsos sinais positivos por contaminação das amostras por DNA genômico. O maior Ct (26) é observado no início da fase exponencial de amplificação em células não neoplásicas ( B ), e indica maior expressão comparativamente às células neoplásicas ( B ), que apresentam Ct = 17, não sendo esta sequência-alvo um bom marcador tumoral. o Ct (ciclo threshold) pode ser determinado pela intersecção da linha do limiar de detecção da reação threshold, com a linha da amplificação gênica de cada amostra. A análise comparativa das duas amostras deve ser realizada a partir da estabilização da amplificação, que ocorre na fase platô, sendo alcançada no ciclo 28 para a amostra A, e no ciclo 40, para a amostra B. O aumento da fluorescência indica que a amplificação da sequência-alvo está ocorrendo, pois a cada ciclo, durante a desnaturação da dupla fita, ocorre liberação da fluorescência. Data Resp.: 29/08/2023 16:29:19 Explicação: A resposta correta é: o Ct (ciclo threshold) pode ser determinado pela intersecção da linha do limiar de detecção da reação threshold, com a linha da amplificação gênica de cada amostra. 2. Ao se analisar a evolução das estratégias para determinação de identidade genética, que se tornaram um procedimento sensível e informativo, pode-se notar três fases: uma inicial, após a descrição de um marcador voltado ao polimorfismo genético em 1980, que deu origem às impressões digitais de DNA, com a aplicação de técnicas de polimorfismo de tamanho dos fragmentos de restrição - restriction fragment length polymorphism (RFLP) -; uma segunda fase de incorporação de novas técnicas, no final da década de 80 do século XX, como a reação em cadeia da polimerase (PCR), que permitiu um significativo aumento na sensibilidade dos métodos e a consequente identificação de indivíduos com amostras colhidas de fragmentos de unhas, goma de mascar etc.; e uma terceira etapa, mais recente, cuja ênfase foi a padronização metodológica e estatística e a geração de bancos de dados. Considerando as aplicações da PCR, assinale a opção correta. A RT-qPCR permite a amplificação por meio da adição de aminoácidos a novas fitas de polímero sintetizadas. Uma das limitações da PCR é a impossibilidade de se amplificar diferentes sequências simultaneamente. Amplificação de conjuntos de repetições em tandem curtas (short tandem repeats) facilita a identificação de indivíduos. O uso correto da PCR requer cuidados para evitar a desnaturação do DNA na etapa em que as fitas são separadas. Ao se planejar um experimento para identificação de indivíduos, deve-se ter o cuidado de escolher sondas para qPCR em regiões que não contenham mutações. Data Resp.: 29/08/2023 16:29:40 Explicação: A resposta correta é: Amplificação de conjuntos de repetições em tandem curtas (short tandem repeats) facilita a identificação de indivíduos. 3. SNPs são empregados amplamente para a identificação humana e possuem diferenças relevantes. A análise dos SNPs também pode estar associada aos fenótipos individuais, havendo uma possibilidade futura de identificação de traços físicos como, por exemplo, a cor da íris. Os SNPs são: Sequências presentes somente no DNA mitocondrial Polimorfismos de nucleotídeo único; uma variação na sequência de DNA Heterozigotos Homozigotos Elementos repetitivos do genoma nuclear Data Resp.: 29/08/2023 16:29:48 Explicação: A resposta correta é: Polimorfismos de nucleotídeo único; uma variação na sequência de DNA. 4. Em algumas situações, a obtenção de DNA a partir de RNA transcrito é importante, como, por exemplo, na construção de bibliotecas. Considerando os conceitos relacionados a essa estratégia e a figura acima, que mostra uma das possíveis estratégias para síntese de DNA a partir de RNA, assinale a opção correta. Na etapa 4, para que ocorra a reação, é suficiente a adição dos nucleosídios representados por A, U, C, G. A reação mostrada na etapa 4 ilustra a atividade da enzima DNA polimerase. O DNA obtido pelo método ilustrado é denominado tDNA. A reação mostrada na etapa 3 ilustra a atividade da enzima transcriptase reversa. A reação mostrada na etapa demonstra a desnaturação da fita de mRNA. Data Resp.: 29/08/2023 16:30:14 Explicação: A resposta correta é: A reação mostrada na etapa 4 ilustra a atividade da enzima DNA polimerase. 5. A Biotecnologia trabalha predominantemente manipulando material genético de seres vivos; para a maioria dos organismos, o material genético é a molécula de DNA. Acerca da estrutura da molécula de DNA, assinale a opção correta. O DNA é composto por quatro tipos de bases nitrogenadas: adenina, citosina, timina e uracila. O açúcar contido na molécula de DNA é a ribose. As duas fitas que compõem a molécula de DNA são ligadas por pontes de hidrogênio entre suas bases nitrogenadas. Há complementaridade entre as bases nitrogenadas adenina e timina e entre guanina e uracila. Em uma cadeia de DNA, os nucleotídeos se ligam aos açúcares e fosfatos por pontes de hidrogênio. Data Resp.: 29/08/2023 16:30:35 Explicação: A resposta correta é: As duas fitas que compõem a molécula de DNA são ligadas por pontes de hidrogênio entre suas bases nitrogenadas.
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