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BIOQUÍMICA Aula 1 – Introdução a bioquímica 1 PARTE 1 Conceito Estudo da química dos processos biológicos que ocorrem em todos os organismos vivos Descreve e explica em termos moleculares todo o processo químico das células vivas Estuda a estrutura e função de macromoléculas como proteínas, carboidratos, lipídeos e ácidos nucléicos. Como estudar a bioquímica: Química estrutural: componentes da matéria viva e sua relação com as funções biológicas Reações bioquímicas e rotas metabólicas: ocorrem nos organismos para manutenção da vida Processos e substâncias: armazenam e transmitem informação biológica Definição dos sistemas dos organismos vivos - Alto grau de complexidade química e organização estrutural - Sistemas para extrair, transformar e utilizar energia do ambiente - Capacidade para autorreplicação de automontagem - Mecanismos para perceber e responder a alterações do ambiente - Funções definidas para cada componente e interações reguladas entre eles - História de mudança evolutiva As células e estrutura A maioria dos organismos vivos são organismos celulares, que apresentam estrutura distintas Constituição organismos vivos A vida depende de reações químicas que ocorrem dentro das celular reações bioquímicas dos metabolismos Constituição da matéria viva: - água - sais minerais - vitaminas - proteínas - carboidratos - lipídios - ácidos nucléicos Moléculas orgânicas são aquelas que contém Carbono Biomoléculas Desempenham funções que permitam a sobrevivência, crescimento e reprodução BIOQUÍMICA Aula 1 – Introdução a bioquímica 2 - Carboidratos - Proteínas enzimas (catalizadores biológicos) - Lipídeos formados a partir dos ácidos graxos - Nucleotídeos formados pelas bases nitrogenadas Ações de metabolismo integrados que contribuem com a homeostase e funcionamento da célula Biomoléculas são compostas de carbono com uma grande variedade de grupo funcionais Possui grande versatilidade de ligação - Ligação simples (tetraédrico) - Ligação dupla (trigonal planar) - Ligação tripla (linear) Interações entre biomoléculas - Interações de Van der Walls: atração entre moléculas polares - Ligações de H: interação do H a F, O e N - Interações hidrofóbicas: entre moléculas com grupos apolares - Ligações covalentes: entre átomos Características das biomoléculas - A “personalidade” química de um composto é determinada pela química de seu grupo funcional e pela sua disposição no espaço tridimensional (configuração e conformação) - Essas características são essenciais para interação da macromolécula com seu receptor biológico Mesmo lado: isomeria cis Lados opostos: isomeria trans - Isomeria óptica BIOQUÍMICA Aula 1 – Introdução a bioquímica 3 Carbono quiral – ligado a quatro grupos diferentes Enantiômeros e diastereoisômeros Se as posições estão em forma que uma seja imagem especular uma da outra teremos um ou outro Receptor quiral Pode estar em uma ordem anti-horário: S Ou horário: R BIOQUÍMICA Aula 1 – Introdução a bioquímica 4 Mesma molécula, mas distribuído em anti-horário ou horário No caso do (R)-Carvona tem um cheiro de hortelã e o (S)-Carvona de cominho Transformações químicas celulares As milhares de reações bioquímicas se encaixam dentre cinco tipos gerais: 1. Oxidação (perda de elétrons) – redução (ganho de elétrons) 2. Reações que formam ou quebram ligações carbono-carbono 3. Reações que rearranjam ao redor do átomo de carbono 4. Transferência de grupos funcionais 5. Reações onde moléculas se condensam e eliminam água PARTE 2 Moléculas inorgânicas – Água - Estrutura molecular simples: formada por dois átomos de hidrogênio e um átomo de oxigênio H2O - Funções da água: o Transporte de substâncias o Facilita reações químicas o Termorregulação o Lubrificante o Reações de hidrólise BIOQUÍMICA Aula 1 – Introdução a bioquímica 5 o Equilíbrio osmótico o Equilíbrio ácido-base (capacidade de fazer uma autoionização, além de ser uma substancia anfótera, que pode assumir caráter ácido ou básico) - Substância mais abundante na matéria viva e o teor varia entre espécies diferentes e dentro da mesma espécie: o Idade mais jovem, mais água no corpo o Entre os sexos mais músculos, mais água no corpo o Em função da atividade metabólica maior metabolismo, maior teor de água o Importância biológica relacionada com propriedades físicas e químicas da molécula - Água e ligação de hidrogênio: o átomo de oxigênio, por ele ser um átomo mais eletronegativo, vai puxar todos os elétrons da ligação para ele, o que forma o delta negativo. Consequentemente, os outros polos estarão positivos. Portanto, numa molécula de água temos a formação de um polo positivo e de um polo negativo. A interação do tipo ligação de hidrogênio vai ocorrer entre as moléculas de água, por ser uma ligação intramolecular, através do polo negativo de uma das moléculas de água com o polo positivo da outra. A água também faz ligação de hidrogênio com os grupos funcionais das biomoléculas (F,O,N), formando a ponte de hidrogênio BIOQUÍMICA Aula 1 – Introdução a bioquímica 6 - Água é polar: porque tem a formação de dois polos (positivo e negativo). Passível de se misturar com moléculas polares [semelhante dissolve semelhante] - Molécula apolar: ausência da formação de polos tem muita ligação C-H (hidrocarboneto) - Molécula anfipáticas: um lado polar e um lado apolar - Água é um solvente universal Lipídios: fosfolipídio por exemplo ele tem uma estrutura com um grupo fosfato ligado a uma cadeia grande de lipídeos, portanto uma parte polar e a outra parte maior polar, sendo anfipático. As moléculas de água vão se organizar de uma maneira ordenada ao redor desse lipídeo (como gaiolas), por não ter afinidade com a estrutura. À medida que mais moléculas se aproximam do lipídio, temos um aglomerado das moléculas lipídicas, que faz com que formemos estruturas de micelas, que é a organização que a água faz. Os lipídios estarão todos voltados para dentro e a de fora a parte hidrofílica, com afinidade com água. Então a micela pode se descolar no meio aquoso, porque agora há afinidade com a água. BIOQUÍMICA Aula 1 – Introdução a bioquímica 7 - Solubilidade da água em gases: Amônia: solúvel em água excreção de ureia na urina, é um produto de catabolismo dos aminoácidos que liberamos com os grupos amônia Co2, O2, H são extremamente apolares, é por isso que essas moléculas não conseguem ser transportados livremente na corrente sanguínea. Quem os transportam é a hemoglobina (O2 oxihemoglobina Hb02, CO2 carboxihemoglobina HbCO2) *óleo é hidrofóbico não se mistura com água - Água e osmolaridade Osmolaridade variação entre a concentração se soluto e solvente Mecanismo de fusão solutos passam livremente, tentando o equilíbrio entre as duas partes Osmose movimentação das moléculas de água. Numa célula norma, isotônica, temos a mesma “tonia”, mesma concentração, de íons dentro e foram da célula, porém, quando temos uma solução com muitos íons no meio extracelular, a água vai sair do meio intracelular para o extra com o intuito de diluir esses íons, deixando a célula hipertônica (murcha) BIOQUÍMICA Aula 1 – Introdução a bioquímica 8 Quando há uma maior concentração de íons dentro da célula do que fora, essa se movimenta do meio extra para o intracelular (célula hipotônica – inchada) - Ionização da água: Tem capacidade de autoionização quando há duas moléculas de água em uma solução, essas podem momentaneamente formar íons, [molécula que é considera ácida tem capacidade de doar um H+, já a base ganha o H+]. Portanto: Ganhou hidrogênio: base Perdeu hidrogênio: ácidoO equilíbrio iônico da água: moléculas autoionizam-se, formando íons hidrônio e hidróxido A água é anfótera: comporta-se como ácido, e, em outras, como base. BIOQUÍMICA Aula 1 – Introdução a bioquímica 9 PARTE 3 Sais minerais - Os sais minerais: essenciais ao metabolismo, estruturação e integrando reações vitais (respiração celular); - Regulação enzimática [ativadas ou desativadas] [atuam em várias rotas metabólicas dos processos biológicos] - Formação e manutenção dos ossos [Ca – cálcio] - Composição de moléculas orgânicas [Hemoglobina Fundamental para formação das hemácias, tem uma estrutura proteica com quatro cadeias globulinas com o ferro dentro, sendo esse um sal mineral] - Substâncias inorgânicas (não podem ser produzidas pelos seres vivos). Vitaminas - Substâncias orgânicas necessárias ao organismo humano. - Não são sintetizadas pelo organismo obtidas através da dieta. - Classificação quanto à solubilidade: – Hidrossolúveis (solúveis em água) vitaminas do complexo B e vitamina C. – Lipossolúveis (solúveis em lipídios) vitaminas A, D, E e K. Aminoácidos - São a unidade fundamental da proteína - Amino função amina + ácido - Por exemplo, o carbono da imagem está ligado a um ácido (ácido carboxílico) + nitrogênio (amina) + hidrogênio + grupo R. Portanto está ligado a quatro constituintes diferentes, sendo ele um carbono quiral. - A glicina é uma exceção, mesmo sendo ligado a quatro componentes não é considerado um carbono quiral, porque no lugar do grupo R, estará ligado o hidrogênio [grupo R + H são iguais, excluindo a possibilidade de ser quiral] - Nas estruturas dos aminoácidos há em torno de 20 grupos R, isso faz com que haja 20 aminoácidos diferentes BIOQUÍMICA Aula 1 – Introdução a bioquímica 10 Grupos R - Apolares: não tem afinidade com a água [tem afinidade com lipídios] - Presença do anel aromático BIOQUÍMICA Aula 1 – Introdução a bioquímica 11 Peptídeos - Quando há união entre aminoácido é gerado as proteínas - Os aminoácidos vão se ligar através da ligação peptídica formando a ligação entre o carbono de um grupo aminoácido com outro nitrogênio do outro grupo liberando água formando um peptídeo Ligação peptídica - Lembrando que, sempre que forma um peptídeo há formação de uma extremidade aminoterminal e uma extremidade carboxiterminal Ligação peptídica BIOQUÍMICA Aula 1 – Introdução a bioquímica 12 Estrutura proteica - Estrutura primaria pode sofrer alguns rearranjos, como no exemplo da imagem se formando em alfa-hélice ou beta-pregueada estrutura secundária - Já a estrutura terciaria ocorre quando um conjunto de estrutura primaria, por exemplo alfa-hélice, interagem entre sim junto com as betas-pregueadas forma-se uma cadeia polipeptídicas [mioglobina] - A estrutura quartearia vai ser a interação de várias cadeias polipeptídicas [hemoglobina] Carboidratos - São aldoses (poliidroxialdeído) [função aldeído] ou cetoses (poliidroxicetona) [função cetona ou poliidroxicetona] de função mista; - São moléculas que armazenam energia; - Energético, reconhecimento celular, estrutural; - São as biomoléculas mais abundantes; - Reserva alimentar e proteção. BIOQUÍMICA Aula 1 – Introdução a bioquímica 13 Monossacarídeo (uma molécula estrutura simples) - Podem ser: hexoses [6 átomos de carbono], pentoses [5 átomos de carbonos], triose [3 átomos de carbono] depende do número de átomos de carbono Dissacarídeo - Formado por duas moléculas de um açúcar simples. - São formados através de 2 monossacarídeos ligação glicosídica (ligação éter) Polissacarídeo - Glicogênio: presente em maior quantidade no músculo esqueléticos e fígado [á várias moléculas de monossacarídeos interligadas, na qual exerce a função de reserva energética] Lipídeos - Insolúveis em água - Funções: armazenamento de energia (gordura e óleos); estrutural (constituintes de membrana); cofatores enzimáticos; transporte de elétrons; sinalização e hormonal [hormônios são sintetizados a partir do colesterol que é um lipídeo] - Possuem três classes funcionais a. Lipídeos de armazenamento b. Lipídeos estruturais c. Lipídeos sinalizadores, cofatores e pigmentados Glicerídeos - Formados por ácidos graxos cabeça polar e uma cauda apolar - Ácidos carboxílicos com cadeias de hidrocarbonetos (4 a 36C) - Podem conter insaturações [duplas ligações] ou não - Quanto mais longo a cadeia polar e menos ligações duplas maior a solubilidade em água, porque os pontos de ligação duplas são de estabilidade na molécula BIOQUÍMICA Aula 1 – Introdução a bioquímica 14 Formação de triglicerídeos mais comum [união de três ácidos graxos com gliceróis] Fosfolipídios fosfato ligado ao lipídio - Polar e apolar - Função estrutural formar a membrana Esteroides - Colesterol - Hormônios Sexuais, sais biliares e vitaminas A, D, E, K Ácidos nucleicos - Presentes em todas as células vivas; BIOQUÍMICA Aula 1 – Introdução a bioquímica 15 - Responsáveis pelo armazenamento e transmissão da informação genética; - Tradução pela síntese de proteínas; - Moléculas longas e complexas de elevado peso molecular; - Constituído por cadeias denominadas nucleotídeo [ou bases nitrogenadas] [formados por unidade menores] - Conhecidos como DNA e RNA. - No RNA teremos uma ligação fosfato com o açúcas chamado de ribose por isso chamado de RNA = Ácido RiboNucleico ligados ás bases nitrogenadas [adenina, uracila, citosina, guanina] - No DNA temos o fosfato ligado a desoxirribose por isso chamado de Ácido DesoxirriboNucleico ligados a bases nitrogenadas [adenina, timina, citosina, guanina] - A diferença entre ambos é vista pelo tipo de açucas e pela base nitrogenada Ligação formação das fitas de DNA ou RNA - As bases nitrogenadas que forma o nucleotídeo vão ser unidas por ligação de ponte de hidrogênio, formando um emparelhamento das duplas fitas, o DNA - Além disso as moléculas se ligam entre si (fosfato, açúcar, base nitrogenada) - Se ligam no sentido 5 linha – 3 linha ou vice versa Ácidos nucleicos - Replicação: duplicação de uma molécula de DNA de dupla cadeia -Transcrição: formação do RNA a partir de DNA. Função de “informar” ao RNAt a ordem correta dos aminoácidos para tradução - Tradução: leitura da mensagem contida na molécula de RNAm pelos ribossomos, produzindo proteínas BIOQUÍMICA Aula 1 – Introdução a bioquímica 16