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Enzimas Cinética, inibição e regulação Danyelly Bruneska Bioquímica II 2013 Reações enzimáticas Enzima catalisador que deve baixar a energia de ativação do processo. Coenzimas x Cofatores As coenzimas que sofrem modificação de sua estrutura durante a reação catalítica são também chamadas de co-subtrato. Reações enzimáticas O sítio ativo é específico para o substrato de acordo com a organização estrutural da proteína. Reações enzimáticas Modelos Chave-fechadura e Encaixe induzido Reações enzimáticas Desnaturação da enzima Especificidade Altamente específica X Especificidade por grupos Michaelis-Menten E + S K1 K2 ES K3 K4 E +P V0 = Vmax [S] Km + [S] Km = K 2 + K 3 K 1 1. E, S e ES estão em equilíbrio rápido 2. não existe outra forma de enzimas presentes 3. a conversão de ES em E + P é uma etapa irreversível e limitante da velocidade Km V máx [S] V Vmax 2 Gráfico Lineweaver-Burk 1 V 1 [S] 1 Vmax -1 Km 1 V Vmax = Km . 1 1 + [S] Vmax Gráfico duplo-recíproco Determinação de Km e Vmáx das enzimas em laboratório. Inadequado para estudo de altas concentrações de substrato. Gráfico Eadie-Hofstee Para estudo de altas concentrações de substrato, utiliza-se uma segunda forma linear. Neste caso, v versus v/[S] apresenta no eixo y o valor de Vmáx e no eixo x e valor de Vmáx/Km. A inclinação corresponde ao valor -Km. Inibição enzimática As enzimas são inibidas de diferentes formas por drogas (naturais ou sintéticas) ou metabólitos. A inibição pode ser reversível ou irreversível. Inibição irreversível, ocorre uma modificação química que inativa a enzima. Ex: Aspirina Inibição enzimática Inibição reversível competitiva - Competição pelo sítio ativo - Aumento da concentração do substrato deve superar a ação do inibidor - Aumento aparente do Km sem modificação da Vmáx. Inibição enzimática Inibição reversível competitiva - Competição pelo sítio ativo - Aumento da concentração do substrato deve superar a ação do inibidor - Aumento aparente do Km sem modificação da Vmáx. Inibição enzimática Inibição reversível não-competitiva - Pode levar a uma inibição da atividade mesmo em altas concentrações de substrato. - Normalmente, ocorre redução da Vmáx. Inibição enzimática Inibição reversível não-competitiva - Pode levar a uma inibição da atividade mesmo em altas concentrações de substrato. - Normalmente, ocorre redução da Vmáx. Regulação Inibição reversível acompetitiva - Ligam-se ao complexo ES - Aumento da [S] não supera o efeito do inibidor - Redução na velocidade da reação - Interfere na dissociação do substrato, causando aparente redução do Km Regulação Inibição reversível acompetitiva - Ligam-se ao complexo ES - Aumento da [S] não supera o efeito do inibidor - Redução na velocidade da reação - Interfere na dissociação do substrato, causando aparente redução do Km Outros inibidores Inibidores de estado de transição L-prolina D-prolina Estado planar de transição Inibidores de transição Compostos sintéticos capazes de se ligar a enzima, mimetizando o estado de transição. Esta ligação forte pode levar a inativação da enzima. Outros inibidores Inibidores suicidas Após a conversão do substrato, o mesmo deverá permanecer covalentemente ligado à enzima, inativando-a. Isozimas x Abzimas x Sinzimas Isozimas - enzimas que catalisam a mesma reação mas apresentam estruturas diferentes (primária e/ou quaternária). Podem ser : - constituem diferentes enzimas produzidas por diferentes genes; Isozimas x Abzimas x Sinzimas Abzimas - são anticorpos catalíticos, naturais ou sintéticos. http://pathology.uth.tmc.edu/research/circ/hiv.html Isozimas x Abzimas x Sinzimas Sinzimas (“synzymes”) - enzimas sintéticas que seguem esquemas cinéticos análogos aos das enzimas naturais, resultantes do progresso nas técnicas de síntese de polímeros ou oligômeros com atividade catalítica. Em alguns casos, sinzimas são proteínas derivatizadas, geralmente obedecendo Michaelis-Menten. synzyme + S (synzyme-S complex) synzyme + P Compartimentalização Regulação enzimática O transporte de substratos, produtos e cofatores através da membrana faz com que haja um controle na concentração desta moléculas num dado compartimento. Ex: beta-oxidação e síntese de ácidos graxos. Modificação covalente Regulação enzimática Zimógenos Outras modificações covalentes Regulação enzimática Concentração de enzima na célula A regulação ocorre por meio da inibição da síntese de novas moléculas de uma determinada enzima. A B C D E Esta regulação (feedback) pode ser positiva ou negativa. Cooperatividade Regulação enzimática A cooperatividade existe normalmente em moléculas de estrutura quaternária, podendo ser negativa ou positiva. Na forma positiva, a ligação do substrato à um dos sítio facilita a ligação nos demais sítios da mesma molécula. Aplicações clínicas Imunoensaios ELISA (enzyme-linked-immunoadsorbent-assay) Busca por concentração de enzimas Diagnóstico de lesões cardíacas e hepáticas
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