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Variação Genética em Indivíduos Diversidade Genética Humana Cristian Petter Qualquer mudança na seqüência de nucleotídeos ou arranjo do DNA. MUTAÇÃO? Variação Genética em Indivíduos Linhagem Germinativa Células somáticas Mutações Mutações espontâneas x Mutações induzidas Mutágenos Categorias das Mutações • Genômicas • Cromossômicas • Gênicas Genômicas Alteram a dosagem ou os níveis de expressão de centenas ou milhares de genes através de ganho ou perda de cromossomos inteiros ou conjuntos haploides completos. Euploidias Triploidias, tetraploidias Aneuploidias Trissomias, monossomias Cromossômicas Pode afetar a expressão de milhares de genes (deleção, duplicação, inversão, translocação) Síndrome Cri-du-Chat Gênicas Efeito depende da função do gene e de como a alteração interfere na expressão do gene. Perda completa da expressão do gene ou a formação de uma proteína variante com propriedades alteradas. Classe de mutação Mecanismo Exemplos Genômica Não disjunção dos cromossomos Aneuploidia (Trissomia do 21)/Câncer Cromossômica Rearranjo cromossômico Sobrevida ou reprodução/Câncer Translocações Gênica Mutação de par de bases Erros no processo da replicação Falha no reparo do DNA Espontâneas X induzidas (mutágenos) Mutação de ponto •Nem todas as mutações têm conseqüências clínicas. Base Molecular das Mutações 1. Substituições de Nucleotídeos 2. Mutações de Término de Cadeia 3. Mutações de Recomposição (Splicing) de RNA 4. “Pontos quentes” de Mutação 5. Deleções e Inserções (pequenas, grandes, recombinação) 1. Substituições de Nucleotídeos ou Mutação de Ponto Mutações de sentido trocado (missense) Regiões codificantes ou não-codificantes Contribuem com mais da metade de todas as mutações relatadas como causadoras de doenças genéticas Mutações de sentido trocado (missense) 2. Mutações de Término de Cadeia Mutações sem sentido (nonsense) Introdução/ destruição de um códon finalizador Códons TAA, TAG, or TGA Contribuem com 12% de todas as mutações que causam doenças 3. Mutações de Recomposição (Splicing) de RNA Exon/intron (5´) – sítio doador Intron/exon (3´) – sítio aceptor Substituições de bases em introns criando sítios aceptores ou doadores alternativos Contribuem com 10% de todas as mutações que causam doenças 4. Pontos Quentes de Mutação Transição: Purina por Purina (A por G) Pirimidina por Pirimidina (T por C) Transversão: Purina por uma Pirimidina Metilação de citosinas (5 metilcitosina) 5’ da guanina – 5’-CG- 3’ Citosina Metil Citosina Timina 5. Deleções e Inserções • Pequenas (mudanças na matriz de leitura) Mudança da Matriz de Leitura 5. Deleções e Inserções EX. Neurofibromatose tipo 1 Gene 59 éxons – neurofibrina –supressor de tumor (muitas mutações descritas) Grandes (6% das mutações causadoras de doenças) Inserções de sequências Alu 6. Mutações Dinâmicas • Envolvem amplificação de sequências de repetição de trinucleotídeos β-Talassemia • Beta-polipeptídeo da hemoglobina não sintetizado ou sintetizado em quantidades reduzidas anemias. • 100 mutações diferentes – regiões de éxons ou introns. Nomenclatura das Mutações • Posição no gene • A1 ... C556 ... A2110... • Início da transcrição ATG – bases +1/ -1 • Mudança de nucleotídeo G1444 >A • Intron seqüência intercalar(IVS) sítio aceptor – IVS33+2T >A / doador IVS33-2A >T Nomenclatura das Mutações • Pequenas deleções 1524-1527del • Pequenas inserções 1277-1278insTATC - doença de Tay-Sachs • Mutação Sentido trocado: Glu6Val - anemia falciforme Sem sentido: Gln39X – ß0-talassemia Estimativas das Taxas de Mutações Gênicas Germinativas em Humanos Taxa de mutação de um gene em geral é expressa pelo número de novas mutações por lócus, por geração. Dependente de: • Tamanho do gene • Fração dos alelos mutantes que está associado ao fenótipo observado • Mecanismo mutacional • Presença de hotspots • Idade e sexo do genitor Taxa média de mutação gênica é de 1X10-6 Mutações Herdadas nas Diferenças Sexuais Humanas Ovocitogênese Espermatogênese 22 divisões mitóticas na vida fetal 30 divisões mitóticas desde o estágio embrionário até a puberdade Meiose I (suspensa até a ovulação) Erros na replicação > chance de erros 1 em cada 10 espermatozóides tem uma nova mutação deletéria Diversidade Genética Humana • Alelo • Polimorfismo Genético Alelos comuns encontrados em mais de 1% na população geral • Variantes Raras Alelos com freqüências de menos de 1% na população geral • Variação na Sequência de DNA X Variação nas Proteínas Codificadas • Individualidade Química Variação Herdada e Polimorfismo em Proteínas Grupos Aglutinógeno Aglutinina Genótipo A A Anti-B IA IA, IA i B B Anti-A IB IB, IB i AB AB Ausência IA IB O Ausência Anti-A e Anti-B ii Grupos Sanguíneos Sistema ABO – locus no cromossomo 9 Glicosiltransferases São responsáveis pela transferência dos resíduos específicos de açúcar 1 3-N-acetil-galactosamina transferase ou 1 3-N-galactosil transferase ao substrato H convertem ao antígeno A ou B respectivamente. N- acetilgalactosamina D-galactose Glicosiltransferases Antígeno H É um carboidrato produzido pela ação da enzima -2-L-fucosiltransferase codificada no locus FUT1 do cromossomo 19, na posição q13.3, sendo portanto, geneticamente independente do locus ABO. Sistema Rh Grupos Aglutinógeno Rh Genótipo Rh- Ausente dd Rh+ Presente DD Geneticamente existem dois loci muito ligados, sendo o principal o locus D (gene no cromossomo 1) que é o responsável pela DHRN. Doença hemolítica do Neonato Polimorfismo do DNA Classificações de acordo com a sequência de DNA: SNPs (Polimorfismo de único nucleotídeo) Indels (Polimorfismos por inserções ou deleções) – 2 a 100 nucleotídeos: ▫ microssatélite (Short Tandem Repeats) – curtas repetições em tandem – 2 a 5 bases repetidas de 1 a 10 vezes) ▫ minissatélite (Variable Number Tandem Repeats) – número variável (centenas, milhares) de repetições – 10 a 100 pares de bases) Polimorfismos de Minissatélite Minissatélite Polimorfismos de Microssatélite Microssatélite Variação Herdada e Polimorfismo de DNA Polimorfismos de Comprimento de Fragmentos de Restrição (RFLP) Utilização dos Marcadores Genéticos • Mapeamento de genes • Diagnóstico pré-natal de doenças genéticas • Detecção de portadores heterozigotos de doenças genéticas • Avaliação de risco de pessoas com predisposição a distúrbios adultos • Testes de paternidade e exames forenses • Identificação de variantes raras http://www.youtube.com/watch?v=6RVSMTmFoMM &feature=related JN (2009)
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