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Aminoácidos e Proteínas: estrutura, propriedade e função. Protease Vera Lúcia. Introdução: • Histórico: em 1839 G. J Mulder atribuiu o termo proteína, do grego: proteios = primário. em 1934 J.D.Bernal e Dorothy C. Hodgkin mostraram que a pepsina produzia um padrao definido de difraçao quando colocada em um feixe por raios X (evidencia de uma molécula estruturada). • Aminoácidos: os tijolos da construção….. ProteínasProteínas ProteiosProteios Moléculas orgânicas mais abundantesMoléculas orgânicas mais abundantes Humano 70Kg Humano 70Kg 11 Kg proteínas11 Kg proteínas Introdução Macromoléculas Macromoléculas informacionais informacionais Introdução Estrutura Estrutura XX FunçãoFunção ProteínasProteínas O que são? Aminoácidos Grupo Carboxila Grupo Amino Radical ou Cadeia lateral Carbono 20 aminoácidos Classificação (cadeia lateral) R Estrutura Geral dos Aminoácidos Aminoácidos L-aminoácidos Classificação dos Aminoácidos pelo Grupo R 20 Aminoácidos Primários Encontrados nas Proteínas Aminoácidos: polares Pontes dissulfeto! Aminoácidos: polares Imidazol Aminoácidos: polares Aminoácidos O Zwitterion AminoácidosTitulação de Aminoácidos Aminoácidos As possibilidades de existirem proteinas diferentes são enormes: 2,4 x 10 18 Segundo Voet (2006), há mais possibilidades de sequências de aminoácidos do que estrelas no céu”. Pentapeptídio Serilgliciltirosinilalanileucina Forma catiônica Protonada Forma Aniônica Desprotonada Forma Isoelétrica = pI = pKa1 + pKa2/2 Ligação Peptídica Ligação Peptídica Ser - Gly - Tyr – Ala - Leu Ligação Peptídica Rígida e Planar!!! Cα – C – N - Cα Cistína - Aspartame Composição de Aminoácidos Pausa! Níveis de Estrutura em Proteínas Estrutura Primária É a seqüência de aminoácidos ao longo da cadeia polipeptídica e é específica para cada proteína. Determina a ordem dos aminoácidos na cadeia polipeptídica Ligação peptídica representada por único traço – mas tem característica entre ligação simples e dupla ligação – interação entre as duas formas de ressonância Conseqüência – não há possibilidade de rotação em torno da ligação peptídica – formação de plano rígido Cadeia polipeptídica – arranjo flexível de unidades planas (unidades peptídicas) Estrutura Secundária Descreve a formação de estruturas regulares bidimensionaisao longo da cadeia polipeptídica formando organizações estáveis Estrutura em alfa Hélice Estrutura beta pregueada Estrutura Hélice É o enrolamento da cadeia polipeptídica ao redor de um eixo Manutenção – a alfa-hélice é mantida por pontes de hidrogênio entre o oxigênio do –C=O de uma unidade peptídica e o nitrogênio do grupo –NH da quarta unidade subseqüente Distância – a alfa-hélice tem um passo de 0,54 nm e apresenta 3,6 resíduos por volta Queratina do Cabelo. Queratina – é uma proteína meca nicamente durável e quimicamente não-reativa – presente nos cabelos , unhas , penas. Essas características são proporciona das pela montagem de uma estrutura espiral-enrolada ou super-hélice e é uma conseqüência de sua estrutura primária Conformação Folha Pregueada Estrutura de folha pregueada (ou configuração beta) – é a interação lateral de segmentos de uma cadeia polipeptídica, através de pontes de hidrogênio. As ligações são estabelecidas entre cadeias polipeptídicas diferentes, distendidas ou entre segmentos distantes e distendidos de uma mesma cadeia Os grupos R dos aminoácidos projetam-se para cima ou para baixo do plano da folha pregueada Estrutura Super Secundária - Motivo Estrutura Supersecundárias ou Motivos – são regiões moleculares de estrutura secundária (alfa, beta e curvatura) definida e que se repetem em diferentes proteínas Das 7 mil estruturas de proteínas relatadas, não existem dois registros exatamente iguais. Os principais tipos de elementos secundários estruturais, -hélice e folha -pregueada ocorrem em proteínas globulares em proporções e combinações variáveis – a mesma forma estrutural pode estar presente em proteínas não relacionadas – diferentes famílias de proteínas Motivo alfa-hélice – curva – alfa-hélice Motivo beta – alfa - beta Dois motivos beta-alfa-beta unidos por uma alfa-hélice – alinhadas em duas diferentes formas Motivos - Domínios Domínios – São aglomerados globulares constituídos por motivos -podem conferir às proteínas uma aparência multiglobular -os domínios podem se repetir em uma mesma proteína – possuem multidomínios - e exercem função biológica Motivos de uma proteína repressora que desliga a síntese de mRNA Interage com sulcos na região do DNA do Operador Detalhe da figura acima onde as glutaminas 28 e 29 do repressor fazem pontes de hidrogênio com as bases AT e CG respectivamente Estrutura Terciária Descreve o dobramento final da cadeia polipeptídica por interações de regiões com estrutura regular (alfa-hélice, folha pregueada e curvaturas) ou de regiões sem estrutura definida – interações através do grupo R Pontes de Hidrogênio – união do grupo C=O e o próton de um grupamento NH Interações Hidrofóbicas - Ligações Eletrostáticas ou Iônicas – interação de grupos de carga positiva com os de carga negativa – Camada de Solvatação – íon dipolo com a água Ponte dissulfeto – ligação covalente entre cadeias laterais através de dois grupos SH de cisteína por desidrogenação Manutenção da Estrutura Terciária Estrutura Quaternária Descreve associação de duas ou mais cadeias polipeptídicas (subunidades) para compor uma proteína funcional . A estrutura quaternária é mantida por ligações não covalentes •Quanto ao número de cadeias: monoméricas: oligoméricas: •Quanto a forma: fibrosa: globular: •Quanto à composição: simples: conjugadas: exemplos: hemeproteínas lipoproteínas, glicoproteínas metaloproteínas. As proteínas podem ser classificadas: Proteínas Fibrosas: São aquelas que apresentam moléculas distendidas e filamentosas, semelhantes a longos fios. colágeno e fibrina são exemplos de proteínas fibrosas. Proteínas Globulares: Apresentam as moléculas enroladas como novelos e são geralmente solúveis em água formando micelas. A maioria das proteínas apresentam estrutura globular como, por exemplo, as enzimas, anticorpos, hemoglobina. Fibroína da Seda: Fibrosa. Proteína fibrosa obtida de larvas cultivadas (Bicho da seda) da mariposa Consiste de folhas antiparalelas com as cadeias laterais estendendo-se paralelamente ao eixo da fibra Proteína Globular: Hemoglobina (Hb), Mioglobina. Kaestner | Dreamstime.com Estrutura 3D da mioglobina, proteína globular de 153 aminoácidos, que contém um grupo prostético heme no centro. Proteínas Conjugadas: componentes não protéicos. Exemplo: grupo prostético heme (Hb e mioglobina). Carboidratos (Glicoproteínas) servindo como marcadores biológicos. Lipídios: (Lipoproteínas plasmáticas) servindo como transportadores de lipídios no sangue. Colágenos sofre hidroxilação nos resíduos de prolina e lisina: escorbuto. Algumas proteinas sofrem fosforilação nos residuos de serina, treonina e tirosina: proteínas com função enzimática. Proteínas Conjugadas: aminoácidos modificados. Alterações Estruturais das Proteínas: desnaturação. Desnaturação de Proteínas Renaturaçãoda ribonuclease Alterações Estruturais das Proteínas: substituição de aminoácidos. Elas exercem funções diversas, como: Catalisadores; Elementos estruturais(colágeno) e sistemas contráteis; Armazenamento(ferritina); Veículos de transporte (hemoglobina); Hormônios; Anti-infecciosas (imunoglobulina); Nutricional (caseína); Enzimáticas (lipases); OBRIGADA..... •STRYER, L. e col. – Bioquímica. Ed. Guanabara Koogan. Rio de Janeiro. 6ª ed. 2008. •VOET, D.; VOET, J. G. - Bioquímica. Ed. ARTMED. Porto Alegre. 1ª ed. 2006. •DEVLIN, T.M. e col. – Manual de Bioquímica com Correlações Clínicas. Ed. Edgard Blucher. Tradução da 6ª ed. Americana. São Paulo. 2007. •NELSON, D. L. & COX, M. M. – Lehninger Princípios de Bioquímica. Ed. Sarvier. São Paulo. 4ª ed. 2006. •CAMPBELL, M.K. – Bioquímica. Ed. ARTMED. Porto Alegre. 3a ed. 2001. REFERENCIAS: • Mistura de SubstânciasMistura de Substâncias – Proteínas > 85%Proteínas > 85% – Substâncias orgânicas e inorgânicasSubstâncias orgânicas e inorgânicas • Defesa/ SobrevivênciaDefesa/ Sobrevivência • Fonte de várias proteínas (toxina: neurotoxinas) Fonte de várias proteínas (toxina: neurotoxinas) com importantes aplicações médicas.com importantes aplicações médicas. VenenoVeneno •Instrumentos de pesquisa –Substâncias de baixo peso molecular –Relativamente fáceis de se obter –Grande estabilidade física, pH, temperatura, força iônica –Boa Seletividade •Ferramentas moleculares no estudos dos canais iônicos •Neurotoxinas -> Grande avanço no estudo da eletrofisiologia •Canais de Sódio, Potássio, Cálcio Venenos - Neurotoxinas Fosfolipases AFosfolipases A22 Ações da PLA2 Neurotoxicidade Citotoxicidade Miotoxicidade Cardiotoxicidade Atividade Hemolítica Atividade hemorragica/antihemorragica Atividade Edematogênica Slide 1 Slide 2 Slide 3 Slide 4 Slide 5 Slide 6 Slide 7 Slide 8 Slide 9 Slide 10 Slide 11 Slide 12 Slide 13 Slide 14 Slide 15 Slide 16 Slide 17 Slide 18 Slide 19 Slide 20 Slide 21 Slide 22 Slide 23 Slide 24 Slide 25 Slide 26 Slide 27 Slide 28 Slide 29 Slide 30 Slide 31 Slide 32 Slide 33 Slide 34 Slide 35 Slide 36 Slide 37 Slide 38 Slide 39 Slide 40 Slide 41 Slide 42 Slide 43 Slide 44 Slide 45 Slide 46 Slide 47 Slide 48 Slide 49 Slide 50 Slide 51 Slide 52 Slide 53
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