Exercícios bioquímica sobre carga elétrica de peptídeos e proteínas

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Exercícios sobre estrutura e carga elétrica de aminoácidos, peptídeos e proteínas 
 
Questões: 
 
1. Explique o que é pI de uma proteína. 
 
2. Verificar a veracidade das seguintes afirmações, e justificar sua resposta: 
 
a) Em valores extremos de pH, uma proteína apresenta menor número de grupos com 
cargaelétrica do que em pH 7. 
 
b) Uma proteína que apresenta menor solubilidade em pH 9,0 é rica em aminoácidos 
básicos. 
 
c) Uma proteína cujo pI é 4,1 tem mais aminoácidos ácidos do que aminoácidos apolares. 
 
d) Aminoácidos que apresentam três pKa participam de interações hidrofóbicas presentes 
na estrutura terciária das proteínas. 
 
e) As pontes de hidrogênio da estrutura em folha β-pregueada de uma proteína são 
estabelecidas entre os grupos R dos aminoácidos. 
 
 
3. pH e absorção de fármacos. A aspirina é um ácido fraco com um pKa de 3,5. Ela é 
absorvida para o sangue pelas células que revestem o estômago e o intestino. A absorção 
requer a passagem através da membrana plasmática, cuja velocidade é determinada pela 
polaridade da molécula: moléculas carregadas e altamente polares passam lentamente, 
enquanto que moléculas hidrofóbicas neutras passam rapidamente. O pH do conteúdo 
estomacal é de cerca de 1,5 e o pH do conteúdo do intestino delgado é de 
aproximadamente 6,0. 
a) Explique o que é um ácido fraco. 
b) Explique o que é pKa. 
c) Explique o que é polaridade. 
d) Indique e represente quais seriam as formas da aspirina encontradas em pH 1,5 e 6,0 
(formas dissociada e não dissociada). 
e) A maior quantidade na corrente sanguínea foi absorvida no estomago ou no intestino 
delgado? Justifique sua escolha. 
 
4. Carga líquida de peptídeos. Um peptídeo possui a sequencia 
Glu-His-Trp-Ser-Gly-Leu-Arg-Pro-Gly 
 
a) Indique a classe de todos os aminoácidos acima mencionados. 
b) Qual é a carga liquída da molécula em pH 3; 8 e 11? (consultar a tabela dos pKa dos 
grupos amino, carboxílico terminais e das cadeias laterais) 
 
5.Predição de estrutura secundária. 
5.1 O que é estrutura secundária? 
 
5.2 O poliglutamato, um polipeptídeo formado apenas de resíduos de glutamato (L-Glu) 
possui uma conformação alfa-helicoidal em pH 3,0. Quando o pH sobe para 7,0 ocorre a 
perda desta conformação. Explique porque isso acontece. 
 
5.3 Qual dos seguintes peptídeos é mais propenso a assumir uma estrutura alfa-
helicoidal? Justifique sua resposta. 
(a) LKAENDEAARAMSEA 
(b) CRAGGFPWDQPGTSN