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Tradução Modificando o alfabeto molecular Prof. Dr. Francisco Prosdocimi Tradução em eukarya e prokarya Eventos pós-transcricionais Processo de síntese de proteínas • RNAm contém o código do gene • RNAt é o adaptor que liga o mundo do ácido nucléico ao mundo das proteínas • RNAr faz parte do ribossomo e contém a enzima que catalisa a ligação entre aminoácidos adjacentes tRNA é o adaptador de Crick ~60-90bp Transcrição e processamento do RNAt • É transcrito de um gene presente no DNA • ... E então processado • Contém o código do adaptador O código genético • Tradução in vitro de sequências de poli- nucleotídeos conhecidos • Diferenças nas cadeias laterais dos aminoácidos – Ribozimas X Enzimas O código genético é redundante • Gamow: 20 aminoácidos devem ser codificados por, pelo menos 3 bases Leu Pro ArgLisIle UUA CCU AUU AAA CGG CUG CCG AUA AAG CGA Códon: cada grupo de três nucleotídeos consecutivos Open reading frame • determinação da janela de leitura (ORF) • Código não-sobreposto As seis fases de leitura possíveis 5'3' Frame 1 gaggtctggtttgcaactggggtctctgggaggaggggttaagggtggttgtcagtggcc E V W F A T G V S G R R G - G W L S V A 5'3' Frame 2 gaggtctggtttgcaactggggtctctgggaggaggggttaagggtggttgtcagtggcc R S G L Q L G S L G G G V K G G C Q W 5'3' Frame 3 gaggtctggtttgcaactggggtctctgggaggaggggttaagggtggttgtcagtggcc G L V C N W G L W E E G L R V V V S G 3'5' Frame 1 ggccactgacaaccacccttaacccctcctcccagagaccccagttgcaaaccagacctc G H - Q P P L T P P P R D P S C K P D L 3'5' Frame 2 ggccactgacaaccacccttaacccctcctcccagagaccccagttgcaaaccagacctc A T D N H P - P L L P E T P V A N Q T 3'5' Frame 3 ggccactgacaaccacccttaacccctcctcccagagaccccagttgcaaaccagacctc P L T T T L N P S S Q R P Q L Q T R P Pareamento códon-anticódon • Pareamento de bases Watson-Crick nas duas primeiras bases do códon – 3’-5’ to 5’-3’ (pareamento anti-paralelo) Bases oscilantes (wooble) • A base 3’ do códon é oscilante • O contato químico não é perfeito (3D) Inosina, derivado de Adenina tRNA contém bases modificadas • Processamento do tRNA Como o aminoácido correto é ligado ao tRNA? • Como o tRNA correto é ligado ao aminoácido? • Como o código genético funciona molecularmente tRNA-aminoacil sintetases • Ligam o tRNA e o aminoácido • Reconhecem o anticódon e carregam o aminoácido correto Aminoácidos ativados Ativação do triptofano Quantas tRNA-aminoacil transferases? • Uma por aminoácido? – Ou uma por códon? • Uma única amino acil tRNA sintetase liga um aminoácido a todos os seus tRNAs Classes de tRNA aminoacil transferases Controle da tradução I • Afinidade da enzima pelo tRNA disposto no código – tRNA errado liga-se lentamente e desliga-se rapidamente • A adição do aminoácido ao tRNA incorreto é muito lenta Controle da tradução II • O aminoácido deve se encaixar no sítio sintético da tRNA-aminoacil -sintetase • ... e não ao sítio de edição • Mecanismo de peneira dupla (des)Controle da tradução III • Não acontece verificação do aminoácido na tradução • O controle, portanto, é feito apenas no momento da aminoacilação do tRNA O congelamento do código genético • Conservado em praticamente todos os organismos vivos • Maquinaria altamente complexa e eficiente • Surgiu uma única vez e todos os organismos vivos hoje são descendentes do organismo onde o código surgiu → adaptação! Ribossomos Estrutura 2D e 3D do RNAr Ribossomos de E. coli Ribossomos eucarióticos • O peso do ribossomo se deve mais ao componente de RNA do que ao componente protéico Ribosomal components Reciclagem ribossomal Sítios ribossomais utilizados na tradução Quatro sítios: um para mRNA e três (sítio A, P e E) para tRNA Prokarya X Eukarya • RNA policistrônico Operon • RNA monocistrônico interação entre proteínas que se ligam a cauda poliA e proteínas do Complexo de Iniciação Iniciação da tradução • Procariotos: Shine-delgarno (Ribosome Binding Site) • Consenso de Kosak – hipótese do “scanning” pelo ribossomo – necessidade do 5’ CAP GCCRCCAUGG Start codon • Normalmente codifica metionina Iniciação da Tradução • Fatores de iniciação da tradução • IF-1 e IF-3 • tRNA carregado formil-metionina • Seleção do tRNA correto • Somente se pareia o anti-códon é que... • Liga-se também ao rRNA Complexo de iniciação da tradução • mRNA liga à subunidade menor do ribossomo • tRNA contendo metionina (formilada) liga-se ao complexo • Fatores de iniciação da tradução ajudam • Subunidade maior reune- se ao complexo Sítios peptidil e aminoacil A U G U U U C U U G A C C C C U G A G G C G U U Ribossomo RNA mensageiro 5´ 3´ U A C H H -OOC – C – N - COH R N-terminal 5´ H -OOC – C - NH2 R A U G U U U C U U G A C C C C U G A G G C G U U U A C • Formação da ligação peptídica A U G U U U C U U G A C C C C U G A G G C G U U H -OOC – C - NH2 R • Translocação • Requer GTP A U G U U U C U U G A C C C C U G A G G C G U U H -OOC – C - NH2 R A U G U U U C U U G A C C C C U G A G G C C A G H O H H H H -OOC – C – N – C – C – N – C- C –N -COH R H R O R - -- Sítios peptidil e aminoacil • O ribossomo possui 3 sítios onde cabem moléculas de tRNA • O alongamento da tradução • Proteínas são geradas do N ao C terminal Ordem de ligação de aminoácidos Ligação peptídica Alongamento da tradução Alongamento ainda... • O alongamento continua até o aparecimento de um códon de parada (stop codon) • UAA • UAG UGA Terminação da Tradução • Fator de terminação liga- se ao stop codon – UAA, UGA, UAG • Proteína é liberada • Complexo é desfeito • Releasing factor http://www.biostudio.com/demo_freeman_protein_synthesis.htm http://highered.mcgraw-hill.com/sites/0072437316/student_view0/chapter15/animations.html# Tradução em procariotos Tradução em eucariotos http://207.207.4.198/pub/flash/26/transmenu_s.swf • Tempo de execução do processo Possíveis erros no processo • Erro na tradução • Proteína incorretamente produzida • Dano metabólico Frameshift • Alteração da fase de leitura (frame) – tRNAs específicos passam pelo stop- codon – 4 bases lidas como 3 • Ultrapassa um códon de terminação • Produção de proteínas fundidas Chaperonas I • Complexo protéico que auxilia na montagem da estrutura 3D de uma proteína Chaperonas II Modificações pós-traducionais • Formação de ligações dissulfeto/dobramento • Clivagem da cadeia • Fosforilação • Glicosilação • Metilação/Acetilação • Adição de âncoras lipídicas Regulação da função protéica Proteína Pronta! • E agora? • Destinos possíveis... Endereçamento de proteínas • I - Co-traducional (vias de secreção): – ER – Golgi – Membrana plasmática – Meio extracelular • II- pos-traducional: – núcleo – mitocôndria – cloroplasto – Lisossomos/pero xissomos Sinais de endereçamento na Proteína: 1- Seqüência sinal (16-30 aminoácidos no N-terminal) 2- Sinal de endereçamento nuclear ( 4-8 aminoácidos com carga positiva, ex.: PKKKRLV) 3- Sinal de retençãono RE (KDEL) Proteínas organelares • Produzidas com sinal de exportação • Sinal é clivado quando a proteína alcança seu destino celular Proteínas transmembrana • Domínios hidrofóbicos são capazes de invadir as regiões lipídicas (também hidrofóbicas) da membrana plasmática Inibidores de síntese protéica • Antibióticos inibem a síntese de proteínas bacteriana • Tetraciclina – Liga no RNA 16S (sub 30S) – Inibe a ligação do amino- acyl tRNA no sítio A • Cloranfenicol – Liga na subunidade 50S Conclusões • Tradução é o processo de produção de proteínas • A regulação ocorre principalmente na transcrição – Modificações pós-traducionais são importantes para regular a função protéica • Diferentes tipos de RNAs e proteínas atuam no processo • A tRNA aminoacil sintetase é a protéina responsável pelo código genético • A última molécula a se juntar ao complexo de iniciação é a subunidade maior do ribossomo • As proteínas normalmente começam com o aminoácido metionina • A tradução continua até que haja um stop codon • As proteínas precisam ter uma conformação 3D correta pra funcionar (chaperonas ajudam na montagem) • Muitas proteínas contêm sinais de sinalização celular
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