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O “SEGREDO DO GENOMA” QUAIS GENES SÃO EXPRESSOS? QUANDO SÃO EXPRESSOS? CONTROLE DA EXPRESSÃO GÊNICA Controle da expressão gênica pode ser exercido em diferentes etapas Transcrição: fita codante x fita molde mRNA é complementar à fita molde, e “igual à fita codante” Transcrição envolve o desenovelamento de pequenas regiões do DNA Estrutura do RNA mensageiro: procariotos Procariotos: transcrição e tradução são acopladas Estrutura do RNA mensageiro: eucariotos mRNA sofre modificações pós transcricionais: estabilidade CAP poliA Sharp e Roberts 1977, descoberta do Splicing Splicing Alternativo gera proteínas diferentes a partir do mesmo gene Proteínas geradas por splicing alternativo tem funções variadas Genes podem ser constitutivos ou podem ser regulados Genes constitutivos estão sendo transcritos o tempo todo Genes regulados são ligados e desligados: - durante o desenvolvimento (espacial e/ou temporal) - em resposta a estímulos externos Estrutura do gene em eucariotos Eucariotos: RNA Pol II precisa de fatores auxiliares para se ligar ao DNA e iniciar a transcrição Expressão basal RNA Pol II precisa de fatores de transcrição que regulam sua atividade To enhance – aumentar, melhorar, realçar Enhancer - indutor Expressão basal N ív e l d e e x p re s s ã o Idade, localização, estresse... Indução Repressão Regulação da expressão gênica: transcrição Controle da Expressão do gene de B-Globina humano: vários fatores de transcrição, regulação tanto na região 5’ como 3’ A expressão gênica diferencial é responsável pela morfologia das diferentes células Célula A Célula C Célula B B A B+ C A + B + C A + B A + C C Expressão gênica Padrões de expressão Identificação de elementos regulatórios em promotores de genes vegetais Identificação de elementos regulatórios de fatores de transcrição em vegetais Identificação de elementos regulatórios: gene AIP1 Gene reporter: uma ferramenta fundamental para o estudo da expressão gênica Promotor dirige a expressão do gene, ele determina, quando, como, onde e com que força o gene é expresso Promotor + gene reporter Promotor Gene produto ? Como estudar a regulação do gene? Produto facilmente visível -Enzimas oxidativas usadas na bioluminescência luciferin + ATP → luciferyl adenylate + PPi luciferyl adenylate + O2 → oxyluciferin + AMP + LUZ -Exemplo mais conhecido: luciferase do vagalume Photinus pyralis Tipos de gene reporter usados em vegetais: luciferase 1986: luciferase de vaga-lumes são enxertados em folhas de tabaco. As folhas começam a brilhar. Tipos de gene reporter usados : beta-glucuronidase (GUS) Enzima da bactéria Escherichia coli, que quando incubada com alguns substratos específicos - sem cor ou não fluorecentes - podem transformá-los em coloridos ou fluorescentes. Substratos: -5-bromo-4-chloro-3-indolyl glucuronide (X-Gluc): ensaio histoquímico, gerando produto azul -p-nitrophenyl β-D-glucuronide : para ensaio espectrofotométrico - 4-methylumbelliferyl-beta-D-glucuronide (MUG) : para ensaio fluorimétrico Expressão em resposta ao estímulo ambiental Regulação espacial e temporal Ensaio histoquímico de beta-glucuronidase (GUS) Localização tecidual Tipos de gene reporter : green fluorescent protein (GFP) -Primeira GFP isolada da água viva Aequorea victoria. - A GFP de A. victoria tem o pico maior de excitação em 395 nm e o pico de emissão em 509 nm, que é a região verde menor no espectro de luz visível. Color Frequency Wavelength violet 668–789 THz 380–450 nm blue 631–668 THz 450–475 nm cyan 606–630 THz 476–495 nm green 526–606 THz 495–570 nm yellow 508–526 THz 570–590 nm orange 484–508 THz 590–620 nm red 400–484 THz 620–750 nm Espectros de excitação e fluorescência da GFP A GFP de A. victoria tem o pico maior de excitação em 395 nm e o pico de emissão em 509 nm Variações da green fluorescent protein (GFP) Promotor constitutivo + gene reporter (GFP) - GFP +GFP
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