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Citogenética O que é? Para que serve ? Citogenética � O que é? Estudo dos cromossomos. - número - tamanho - posição do centrômero - localização de NOR - localização de sequências específicas - localização de heterocromatina Citogenética � O que é? Estudo dos cromossomos. Citogenética � O que é? Estudo dos cromossomos. Cariograma: apresentação organizada dos cromossomos (com pares reconhecidos e ordenados) Cariótipo: conjunto de cromossomos de uma espécie, de uma população, de um indivíduo. Citogenética � Estudo dos cromossomos. � Para que serve? - inferências acerca da evolução cromossômica - comparação interespecífica - identificação de espécies crípticas -identificação de híbridos interespecíficos -investigação de doenças genéticas (humanas) - identificação de variações interpopulacionais O que é cromossomo? �DNA � Proteínas � RNA pequenos Microscopia óptica Microscopia eletrônica centrômero ou constrição primária telômero telômero telômero Ácido desoxirribonucléico (DNA) Uma fita dupla de DNA (double strand DNA - dsDNA) 5´ 3´ 3´ 5´ 3´ 3´ 5´ 5´ Uma fita dupla de DNA (double strand DNA - dsDNA) 5´ 3´ 3´ 5´ 1 nm 2 nm Descrição da sequência de nucleotídeos • 5´CACT3´ ou p-CACT-OH • Cada nucleotídeo: dCMP dTMP dGMP dAMP A C T C G C G C G C G C G C G C G C G T A A T G A G C G C G C G C G C G C G C G C A T T A C T C C C C C C C C G G G G G G G G T A A T G A G G G G G G G G C C C C C C C C A T T 5´ 3´ 5´ 3´ 3´ 5´ 3´ 5´ • Ricos em CG? • Rico em CpG? e 36o Arranjo espacial da molécula Figure 4-5 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008) e 36o regiões ricas em CpG Formas da hélice de DNA Genoma Conjunto de moléculas de DNA característico de um organismo (ou célula ou indivíduo, etc.) Genoma Genoma ≠≠ ccóódigo gendigo genéético tico www.ncbi.nlm.nih.gov • 23 pares de moléculas de DNA (genoma diplóide) Genoma nuclear humano: genoma haplóide = 23 moléculas de DNA 3,2 x 109 pares de base (ou 3.201 Mkb) (3,2 x 109 x 0,34 nm = 1 x 109 nm = 1 m) •~25.000 genes Em eucariotos: interações histonas/DNA Em eucariotos: interações histonas/DNA Interações iônicas Pontes de H Fibra de 30nm ou solenóide Níveis de compactação do DNA Fibra de 10nm Modelo da estrutura da heterocromatina associada ao telômero em levedura Fibra de 30nm ou solenóide Níveis de compactação do DNA Fibra de 10nm cromossomo humano - ME Proteínas resistentes à extração = “esqueleto protéico” CinetocoroCinetocoro Sítio de ligação dos MT cinetocóricos Human and mice: 500 – 1500 kb Nucleosomes with CENP-A Nucleosomes with H3K4me2 Nucleosomes with H3K9me2,3 Allshire & Karpen (2008) Alpha-satellite 17bp CENP-B boxes Telômeros: repetição de TTAGGG ⇒ proteínas específicas Citogenética X Estudos moleculares Citogenética Estudos Moleculares ++ Estudo do cariótipo + Estudo do genoma DNA simples (cópia única) SINES LINES famílias gênicas (ex.: histonas, DNAr, globinas) microssatélites minissatélites satélites Classe D N A a l t a m e n t e r e p e t i t i v o D N A m o d e r a d a m e n t e r e p e t i t i v o variável-- Disperso750.000 Em geral, menos de 500pb Disperso50.000-100.0006000 variável (em cluster ou não) variávelvariável Disperso10-1001-5 (1-6) Disperso / telômero10-1009-100 (6-100) Centrômero / heterocromatina >10002-2000 LocalizaçãoNúmero de cópias/genoma Número de pb no repeat
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