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Centro Universitário - UNIBRASIL PCR Reação em Cadeia de Polimerase Professora: Lyia Alunas: Aldiny Paula Kamelyn Casagrande 4BMAD PCR – consiste em fazer cópias de DNA “in vitro”, usando os elementos básicos do processo de replicação natural do DNA. PCR alcançou objetivos bem mais amplos que os propostos inicialmente. PCR é comparada em importância à definição da estrutura do DNA. 1984 - PCR foi apresentada pela primeira em um encontro científico Publicação: Mullis and Faloona, 1987 Saiki at al. 1988 1976: Thomas D. Brock descobriu a DNA polimerase termoestável de Thermus aquaticus. 1988: Esta DNA polimerase foi usada por Saiki para fazer PCR. PCR requer 7 componentes essenciais: - DNA polimerase termoestável - Um par de oligonucleotídeos para iniciar a síntese de DNA - Deoxinucleotídeos trifosfato (dNTPs) - Cátion divalente: toda DNA pol. requer cátion divalente, usualmente Mg2+ - Tampão para manter o pH Cátions monovalentes, usualmente K+ (KCl) - Template de DNA Considerações -Validade dos reagentes -Número de congelamentos e descongelamentos -Contaminação (cabelos, pele...) Pureza (1,8 valor de referência, espectrofotômetro) -Quantidade de material genético –Pouco: pouca amplificação –Muito: pouca amplificação Abs 260 P= ________ Abs 280 PCR é um processo iterativo, consistindo de três elementos: 1- Desnaturação da template por aquecimento 2- Pareamento dos iniciadores à sequência alvo fita única 3- Extensão dos iniciadores pela DNA polimerase termoestável Cada uma das novas fitas de DNA estendidas a partir dos “primers” serve como template para síntese de uma nova fita. Os “primers” presentes na reação fazem o pareamento com as novas fitas, na região de complementariedade antiparalela entre “primer”- “template”. Isso garante a aumento exponencial do número de novas fitas. Todas as fitas de DNA sintetizadas durante a PCR têm a sequência de um dos primers na extremidade 5’ e a sequência complementar ao outro primer na extremidade 3’ 1) 2) 3) Fases da PCR: 1ª Fase: Aquecimento a mais de 90ºC para a separação da dupla fita Separa tanto a Fita de DNA original quanto os produtos de amplificação 2ª Fase: Anelamento dos primers Hibridização Temperatura varia entre 40 a 70ºC conforme o par de primers Determina a especificidade da ligação 3ª Fase: Extensão dos primers - duplicação do DNA Temperatura ótima em torno de 72ºC Ao final da reação, a quantidade de DNA amplificado em relação ao DNA inicial é igual a 2n, sendo que n= número de ciclos da PCR Exemplo: PCR de 29 ciclos: 229= 536.870.912 cópias para cada fita original 1989 - DNA Thermal Cycler, primeiro termociclador automático Efeito Plateau: desvio da quantidade teórica >>Perda da atividade da Polimerase >>Acúmulo de inibidores >>Limitação dos componentes >>Competição entre produtos >>Pareamento Produto x Molde >>Competição com anelamento do primer Tipos de PCR e Variações da técnica PCR que ocorre dentro de uma célula em lâmina. Pode ser realizada em células ou tecidos fixados. Variação da PCR Convencional, na qual são utilizados 2 pares de primers (ao invés de um par), para amplificar um mesmo fragmento. 2 Pares para amplificar um mesmo fragmento PCR com 2 ou mais conjuntos de primers para amplificar diferentes fragmentos de uma mesma amostra. Amplificar diferentes fragmentos de uma mesma amostra Real Time – PCR -Detecção, amplificação e quantificação numa única etapa (agilidade na obtenção de resultados) É uma ótima técnica quantitativa e muito utilizada atualmente Utiliza Mix comerciais como reagente Metodologia da PCR + Detecção de sinais fluorescentes PCR: Aplicabilidade - diagnóstico médico (Polimorfismos) - mapeamento genético - detecção de doenças hereditárias - clonagem de genes - testes de paternidade criação de organismos transgênicos Genética forense Real Time – PCR: -Todas as aplicações da PCR tradicional -Quantificação de Carga Viral -Quantificação de Expressão gênica -Testes de Eficiência terapêutica -Detecção de Agentes Infecciosos -Caracterização de Agentes (Genotipagem) Doença de Alzheimer -Genes da proteína β- amilóide (PPA,cromossomo 21) e -Da proteína apolipoproteína E (APOE, cromossomo 19) >> PSEN1, PSEN2, TNF-a, o PSEN1 e o CYP46 Referencias utilizadas: BOTELHO, Ingrid Thaís Beltrame .Reação em cadeia da Polimerase. UFSC. Disponível em:<http://proto.ufsc.br/files/2012/03/PCR.pdf> .Acesso em:26/10/2015 VIEIRA, Daniel Perez. Técnicas de PCR: Aplicações e Padronização de Reações. Disponível em:< http://etallcorp.xpg.uol.com.br/aula3.pdf>. Acesso em:27/10/2015 Obrigada!!
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