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REPLICAÇÃO, TRANSCRIÇÃO E TRADUÇÃO Profª Vanessa Abrantes REPLICAÇÃO OU DUPLICAÇÃO Iniciação Os locais onde o DNA é aberto são chamados de origens de replicação e são marcados por uma sequência particular de nucleotídeos. 1- Proteína de Ligação do DNA de Fita Simples (SSB) – Mantém a separação das fitas e protegem o DNA de nucleases que clivam DNA de fita simples; 2- DNA-Helicase – separa as fitas de DNA (requer ATP). A síntese do DNA novo ocorre nas zonas ou forquilhas de replicação e é bidirecional Alongamento da Cadeia DNA-Polimerase – Sintetiza a nova fita usando uma das fitas velhas como molde e catalisa a adição de nucleotídeos à fita de DNA em crescimento, verificando se foram corretamente incorporados. A enzima DNA-polimerase só sintetiza fitas novas na direção 5’ 3’, fazendo a leitura da fita molde na direção 3’ 5’ Os fragmentos são posteriormente unidos (DNA-ligase), formando uma fita contínua. Terminação O primer de RNA é alongado pela DNA- polimerase III até que outro RNA seja encontrado O primer de RNA é removido pela DNA-polimerase I (atividade 5`3` exonuclease) e a lacuna é preenchida com desoxirribonucleotídeos pela própria enzima (atividade 5`3` polimerase) A quebra restante é ligada pela DNA-ligase catalisa a ligação fosfodiéster final entre os grupos 5’-fosfato da cadeia de DNA sintetizada pela DNA- polimerase III e o grupo 3’-OH da cadeia feita pela DNA-polimerase I. Resumindo... A DNA-polimerase é a enzima responsável pela polimerização do novo DNA As fitas novas são sintetizadas em direções opostas (contínua e descontínua) A polimerização sempre ocorre na direção 5` 3` Fragmentos são unidos e duas fitas contínuas são formadas Um primer de RNA é utilizado na síntese da nova fita (e posteriormente removido) TRANSCRIÇÃO Características Essenciais da Transcrição Altamente Seletiva: de acordo com o tipo celular, para algumas regiões do DNA muitos transcritos são feitos enquanto que, para outras, poucos transcritos são feitos. RNAs podem sofrer várias modificações. Estas modificações convertem o transcrito primário em uma molécula funcional. Transcrição – Visão Geral Transcrição: Processo de síntese do RNA, que utiliza uma das fitas do DNA com molde. 1 – Desenrolamento, abertura da dupla- hélice e exposição das bases de cada fita do DNA 2 - A sequência de NT da fita do RNA é determinada pela sequência de NT da fita molde do DNA. 3- Os ribonucleotídeos incorporados são covalentemente ligados à cadeia em formação do RNA em uma reação catalisada por enzima. A cadeia nova de RNA é produzida sempre na direção 5` 3`e os ribonucleotídeos são adicionados um por vez, de acordo com os nucleotídeos presentes na fita de DNA usada como molde. A enzima responsável pelo processo é a RNA-POLIMERASE A RNA-Polimerase Funções na Transcrição: 1. Reconhece sítios de iniciação (sítios promotores) no DNA; 2. Desespiraliza um curto trecho da dupla hélice do DNA próximo a ela, liberando um molde de fita única; 3. Seleciona o ribonucleosídeo fosfato correto e catalisa a formação de uma ligação fosfodiéster; este processo é repetido muitas vezes à medida que a enzima se move ao longo do DNA; 4. Detecta sinais de terminação; 5. Interage com ativadores e repressores que modulam a velocidade da transcrição. Enzima multimérica. Percorre o DNA, estendendo a fita nova de RNA na direção 5` 3` 1. INICIAÇÃO INICIAÇÃO: Envolve a ligação da RNA-polimerase a uma região do DNA que determina a transcrição de um gene em particular. Esta região é conhecida como REGIÃO PROMOTORA. • Região Promotora I = Sequência TATAAT –10 (TATA BOX). Situada 10 nucleotídeos à esquerda (à montante) da primeira base do sítio de início da transcrição. • Região Promotora II = Sequência - 35 = Sequência TTGACA. Situada 35 nucleotídeos à esquerda da primeira base do sítio de início da transcrição. Promotores de genes transcritos pela RNApol II Tata Binding Protein Complexo TFIID 5’- A T G C C A G T A G G C - 3’ 3’- T A C G G T C A T C C G - 5’ 5’- A U G C C A G U A G G C - 3’ (DNA) Fita codificadora (DNA) Fita molde RNA A enzima RNA-polimerase utiliza a fita 3’5’ do DNA como molde, produzindo uma fita de RNA na direção 5’3’. A fita molde do DNA é antiparalela e complementar à fita codificadora do DNA e ao RNA. O RNA sintetizado possui, portanto, a mesma direção que a fita codificadora e U no lugar de T. 1. INICIAÇÃO 2. ALONGAMENTO Alongamento: Uma vez que a região promotora tenha sido reconhecida, a RNA-polimerase começa a sintetizar o transcrito e a subunidade sigma é liberada; A RNA-polimerase desenrola a fita, expondo uma nova região de fita molde e adiciona ribonucleotídeos à nova fita de RNA, na direção 5` 3`. A nova seqüência de nucleotídeos é determinada pela fita molde do DNA 3. TERMINAÇÃO Terminação: O alongamento continua até um sinal de terminação ser atingido... OBS: Em alguns casos, uma proteína adicional (fator Rho) pode ser requerida para a liberação do transcrito. No final, RNA-polimerase e o transcrito são liberados... Pr oc a ri ot os E uc a ri ot os Splicing Remoção de Íntrons: A funcionalidade do RNAm eucariótico pode envolver a remoção de sequências de RNA (íntrons) que não codificam proteínas. As sequências restantes (exons) são unidas para formar o RNA maduro. Catalisado por enzimas snRNPs (pequenas partículas de ribonucleoproteína nuclear) que são formadas por Proteína + RNA Permite que muitos genes possam ser processados, produzindo RNAm diferentes. 1 gene ≠proteínas Modificação Pós-Transcricional do RNA = Identidade do RNA Remoção de íntrons pelo “spliceossomo”: associação de ribonucleoproteínas pequenas (snRNPs) formando um complexo de 3x103 kDa TRADUÇÃO Tradução em Eucariotos e Procariotos Eventos pós-transcricionais • Francis Crick • Hipótese do adaptador Molécula adaptadora Habilidade de reconhecer o códon no mRNA e transportar um aminoácido específico, correspondente ao códon. RNA transportador • Sítio A: Liga-se ao aminoacil-tRNA • Sítio P: Liga-se ao peptidil-tRNA • Sítio E: sítio de saída de novas proteínas Ribossomos Tradução e o Código Genético • 4 bases = 4n combinações possíveis = 4³ = 64 códons • Existem apenas 20 aminoácidos • A maioria dos aa é especificada por mais de um códon = código degenerado • Leucina e arginina são especificadas por seis códons • Metionina e triptofano são especificados por apenas um códon Tradução e o Código Genético • 3 códons são finalizadores (ou sem sentido): término da tradução (UGA, UAA, UAG) • Códon de iniciação: AUG (metionina) • Na tradução tRNA possui anticódons complementares aos códons do RNAm Código Genético tRNA-aminoacil sintetases • Ligam o tRNA e o aminoácido; • Reconhecem o anticódon e carregam o aminoácido correto. • Procariotos: Shine-delgarno (Ribosome Binding Site) • Consenso de Kosak Iniciação da Tradução ACCAUGG • Fatores de iniciação da tradução • IF-1 e IF-3 • tRNA carregando metionina • Proteínas são geradas do N ao C terminal Iniciação da Tradução • Seleção do tRNA correto! A U G U U U C U U G A C C C C U G A G G C G U U Ribossomo RNA mensageiro 5´ 3´ U A C H H -OOC – C – N - COH R N-terminal 5´ H -OOC – C - NH2 R A U G U U U C U U G A C C C C U G A G G C G U U U A C • Formação da ligação peptídica A U G U U U C U U G A C C C C U G A G G C G U U H -OOC – C - NH2 R A U G U U U C U U G A C C C CU G A G G C G U U H -OOC – C - NH2 R Alongamento • O alongamento continua até o aparecimento de um códon de parada (stop codon) • UAA • UAG • UGA Terminação da Tradução • Fator de terminação liga-se ao stop codon • UAA, UGA, UAG • Proteína é liberada • Complexo é desfeito Chaperonas • Complexo protéico que auxilia na montagem da estrutura 3D de uma proteína. Processamento Pós-Traducional • Modificações sofridas após a síntese da proteína: • Modificações químicas: adição de fosfato, glicosilação • Clivagem para retirada de sequências de aa terminais H2N CCOH Proteína Pronta • Destinos possíveis...
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