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PROCESSAMENTO DE RNA RNA maduro Transcritos primários PROCESSAMENTO = modificações Procariotos e eucariotos nos diferentes RNAs RNAs sintetizados no processo de transcrição •rRNAs e tRNAs pro e eucariotos •mRNAs eucariotos Quase todos os mRNAs eucariotos com introns Introns – parte do transcrito primário (ou do DNA) que não está presente no RNA maduro. Exons – parte do transcrito primário que está no DNA, e é mantida no RNA maduro. PROCESSAMENTO DE RNA PROCESSAMENTO DE mRNA EM EUCARIOTOS Molécula de mRNA recém-sintetizada = transcrito primário = RNA precursor = pré-mRNA = RNA nuclear heterogêneo (hnRNA) citoplasma núcleo TRANSFORMANDO-SE EM mRNA MADURO OU PROCESSADO (mais estáveis) RNA PRECURSOR SINTETIZADO NO NÚCLEO SOFRE VÁRIAS ALTERAÇÕES BIOQUÍMICAS TRANSPORTADO AO CITOPLASMA PARA SER TRADUZIDO TRANSCRIÇÃO E TRADUÇÃO NÃO SÃO SIMULTÂNEAS COMO EM PROCARIOTOS PROCESSAMENTO DE RNA PROCESSAMENTO DE mRNA EM EUCARIOTOS MODIFICAÇÕES DO hnRNA • ADIÇÃO DA ESTRUTURA CAP NA EXTREMIDADE 5’ • ADIÇÃO DA CAUDA POLI(A) NA EXTREMIDADE 3’ • SPLICING NUCLEAR DO PRÉ-MRNA - CIS-SPLICING - TRANS-SPLICING • EDIÇÃO DO RNA (RNA EDITING) PROCESSAMENTO DE RNA PROCESSAMENTO DE mRNA EM EUCARIOTOS MODIFICAÇÕES DO hnRNA • ADIÇÃO DA ESTRUTURA CAP NA EXTREMIDADE 5’ Ligação covalente de um resíduo de guanina ao primeiro nucleotídeo do hnRNA. Fosfo-hidrolase Guanilil- tranferase Estabilidade - proteção contra ação de exonucleases. Transporte – ? Iniciação da tradução reconhecimento pelo ribossomo do sítio de início da síntese protéica. PROCESSAMENTO DE RNA PROCESSAMENTO DE mRNA EM EUCARIOTOS MODIFICAÇÕES DO hnRNA • ADIÇÃO DA CAUDA POLI(A) NA EXTREMIDADE 3’ A maioria dos mRNAs de eucariotos possui uma seqüência de ~200 resíduos de adenina na sua extremidade 3’, que é chamada de cauda de poli (A). Não está codificada no DNA e não existe nos rRNAs e tRNAs. É adicionada aos hnRNAs pela enzima poli (A)-polimerase na extremidade 3’OH gerada por uma endonuclease Seqüência conservada AAUAAA 11 a 30 nucleotídeos antes do sítio de poliadenilação (eucariotos, exceto leveduras), provavelmente reconhecida pela endonuclease seqüência sinal para poliadenilação. PROCESSAMENTO DE RNA PROCESSAMENTO DE mRNA EM EUCARIOTOS MODIFICAÇÕES DO hnRNA • ADIÇÃO DA CAUDA POLI(A) NA EXTREMIDADE 3’ Seqüência conservada AAUAAA 11 a 30 nucleotídeos antes do sítio de poliadenilação (eucariotos, exceto leveduras), provavelmente reconhecida pela endonuclease seqüência sinal para poliadenilação. •snRNPs são importantes na clivagem da extremidade 3’ do hnRNA •cauda poli(A) diminui no citoplasma – nucleases •em geral, clivagem e poliadenilação precedem a excisão de introns RNA polimerase DNA molde Complexo enzimático endonuclease poli A polimerase PROCESSAMENTO DE RNA PROCESSAMENTO DE mRNA EM EUCARIOTOS Muitos mRNAs de organismos superiores (na maioria mamíferos) possuem o nitrogênio 6 dos resíduos de adenina metilado. Metilação apenas nos exons, provavelmente para proteger as regiões que precisam ser preservadas. METILAÇÃO PROCESSAMENTO DE RNA PROCESSAMENTO DE mRNA EM EUCARIOTOS APÓS A ADIÇÃO DO CAP, DA CAUDA DE POLI(A) E, ÀS VEZES, A METILAÇÃO DE ADENINAS, O hnRNA PRECISA, FREQUENTEMENTE, SOFRER O PROCESSO DE EXCISÃO DOS INTRONS E JUNÇÃO DOS EXONS RNA SPLICING PROCESSAMENTO DE RNA RNA SPLICING PROCESSAMENTO DE mRNA EM EUCARIOTOS ANTES QUE O RNA DEIXE O NÚCLEO, TODAS AS SEQÜÊNCIAS DE INTRONS SÃO RETIRADAS E OS EXONS SÃO UNIDOS ENTRE SI INTRONS – APRESENTAM SEQÜÊNCIAS CONSERVADAS (VARIAM UM POUCO DE LEVEDURAS A VERTEBRADOS) EM TODOS OS mRNAS DE EUCARIOTOS: •Primeiros e os últimos dois nucleotídeos da extremidade 5’ e 3’ são GU e AG, respectivamente. •Adenina a ~40 nucleotídeos da extremidade 3’ •Regiões próximas às junções exons-introns •Região próxima à extremidade 3’ do intron rica em pirimidinas PROCESSAMENTO DE RNA Sequências necessárias para remoção dos introns Intron removido Porção do mRNA Porção do transcrito primário PROCESSAMENTO DE mRNA EM EUCARIOTOS PROCESSAMENTO DE RNA PROCESSAMENTO DE mRNA EM EUCARIOTOS Remoção de introns pelo “spliceossomo”: associação de ribonucleoproteínas pequenas (snRNPs) formando um complexo de 3x103 kDa snRNPs – 6-10 proteínas associadas a pequenas moléculas de RNA nuclear – snRNAs – ricas em uracil. 5 snRNAS: U1, U2, U4, U5 e U6 – U4 e U6 fazem parte de uma única snRNP. A estrutura do “spliceossomo” começa a ser montada assim que o intron é transcrito: - U1snRNP liga-se à região 5’ do intron (pareamento de bases); - U2snRNP liga-se à região intermediária rica em pirimidina (pareamento de bases); -U5snRNP associa-se à região 3’ do intron; U4/U6snRNP unem-se ao complexo completando a estrutura do “spliceossomo” – não se sabe ainda a função desta snRNP. PROCESSAMENTO DE RNA PROCESSAMENTO DE mRNA EM EUCARIOTOS RNA SPLICING PROCESSAMENTO DE RNA PROCESSAMENTO DE mRNA EM EUCARIOTOS RNA SPLICING •1ª clivagem entre o primeiro éxon e a extremidade 5’ do íntron. •A guanina 5’ do íntron liga-se à adenina conservada próxima à região 3’ deste íntron. •Ocorre então a 2ª clivagem e ligação – os éxons são unidos e o íntron é liberado na forma de laço. PROCESSAMENTO DE RNA PROCESSAMENTO DE mRNA EM EUCARIOTOS RNA SPLICING Cis-splicing – é o mecanismo de “splicing” onde ocorre a retirada de introns e junção de exons que estejam presentes em uma mesma molécula de RNA. Trans-splicing – formação de um RNA maduro unindo exons que provêm de RNAs precursores diferentes. (em Trypanosoma brucei) PROCESSAMENTO DE RNA Processamento diferencial (ou alternativo) – o que era íntron para um mRNA, passa a ser éxon para outro mRNA que provém do mesmo RNA precursor. Pode originar várias proteínas a partir de um único gene. Mudanças nos locais do processamento podem introduzir códons de terminação ou mudanças no quadro de leitura. PROCESSAMENTO DE RNA PROCESSAMENTO DE RNA PROCESSAMENTO DE RNA Processamento do precursor do tRNA tRNA maduro Modificação das bases Processamento Acontece por reações de clivagem e ligação. 40 dos 400 genes para tRNAs são interrompidos por 1 simples intron (14 a 16 pb) localizado a um nucleotídeo do extremo 3’ do anticodon, sem sequência consenso. PROCESSAMENTO DE RNA Processamento do pre-rRNA em procariotos RNAse III RNAse M16 RNAse M23 RNAse E RNAse M5 Acontece por reações de clivagem. PROCESSAMENTO DE RNA Processamento do pre-rRNA em eucariotos Acontece por reações de clivagem.
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