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Metabolismo de Nucleotídeos Resumo – Alberto Galdino LoL Os nucleotídeos contêm resíduos de ácido fosfórico, de um açúcar (em geral uma pentose: Ribose ou 2'-desoxiribose) e de uma base púrica ou pirimídica. Quer as bases púricas quer as pirimídicas são anéis heterocíclicos contendo átomos de nitrogênio e carbono. As bases púricas podem ser entendidas como constituídas por um anel pirimidina (anel com 6 átomos: 4C,2N) ligado a um anel imidazol (anel com 5 átomos: 3C,2N). São bases púricas: Adenina (6-aminopurina) Guanina (2-amino-6-oxipurina) Hipoxantina (6-oxipurina) Xantina (2,6-dioxipurina). São bases pirimídicas: Citosina (2-oxi-4-aminopirimidina) Uracilo (2,4-dioxipirimidina) Timina (2,4-dioxi-5-metilpirimidina) Ácido orótico (2,4-dioxi-6-carboxipirimidina). Metabolismo de Nucleotídeos Resumo – Alberto Galdino LoL Por hidrólise dos nucleotídeos (saída dos resíduos fosfato) geram-se nucleosídeos PÚRICOS ou (adenosina, guanosina, inosina, xantosina) PIRIMÍDICOS (citidina, uridina, timidina e que contém uma base e a uma ose ligados por uma ligação glicosídica de tipo N. orotidina) “Um nucleosídeo é constituído por uma base nitrogenada e por uma pentose: a ribose RNA ou a desoxirribose DNA. Um nucleosídeo equivale a um nucleotídeo sem o grupamento fosfato.” No caso dos nucleosídeos púricos as palavras que os designam terminam em “osina” e a ligação envolve o átomo N9 da base. A inosina é o nucleosídeo que contém hipoxantina. No caso dos nucleosídeos pirimídicos as palavras que os designam terminam em “dina” e a ligação envolve o átomo N1 da base. Ribonucleosídeos e desoxiribonucleosídeos são essenciais para todas as células São precurssores do DNA e RNA Nucleotídeos servem como transportadores intermediários ativados na síntese de alguns carboidratos, lipideos e proteínas Núcleotídeos são componentes estruturais de várias coenzimas, por exemplo: a Coenzima A, FAD, NAD+, NADP+. As bases púricas e pirimídicas que fazem parte dos nucleotídeos podem ser sintetizadas de novo ou ser obtidas pela reutilização das bases pré-formadas oriundas do metabolismo normal da célula ou da dieta, ou seja, através da rota de salvação. Metabolismo de Nucleotídeos Resumo – Alberto Galdino LoL A síntese “de novo” do anel purina em células de mamíferos utiliza: aminoácidos como doadores de carbono e nitrogênio tetra-hidrofolato (THF) como doador de um carbono CO2 como doador de carbono. A via “de novo” para síntese de purina nucleotídeos levando a inosina-5’-monofosfato (IMP) consiste de 10 etapas metabólicas. Hidrólise de ATP é necessária para direcionar várias reações desta via. No final, a via “de novo” para síntese de purina nucleotídeos é dispendiosa em termos moles de ATP utilizados por mol de IMP sintetizado. →Síntese de Purinas Todas as enzimas envolvidas na síntese de purina nucleotídeos estão presentes no citosol. Entretanto, nem todas as células (por exemplo, os eritrócitos) são capazes de síntese “de novo” de purina nucleotídeos. Na via “de novo”, uma série de reações leva à síntese de IMP, que é o precursor de ambos, adenosina 5’-monofosfato (AMP) e guanosina 5’-monofosfato (GMP). →Sintese de IMP Vários pontos sobre esta via devem ser enfatizados: 5’ -fosforribosil-1-pirofosfato (PRPP) é sintetizado a partir da ribose 5-fosfato gerada pela via das pentoses-fosfato. Metabolismo de Nucleotídeos Resumo – Alberto Galdino LoL Metabolismo de Nucleotídeos Resumo – Alberto Galdino LoL →Conversão de IMP em AMP e GMP IMP, o primeiro ribonucleico formado na via “de novo”, é o precursor comum para asíntese de AMP e GMP. Eles são convertidos em ATP e GTP, respectivamente, por nucleosídeo 5’- monofosfato quinases e nucleosídeo 5’-difosfato quinases, que não são limitantes. Na síntese “de novo” de purina nucleotídeos, a fprmação de 5-fosforribosilamina a partir de glutamina e 5’-fosforribosil -1-pirofosfsto (PRPP) é a etapa de comprometimento na formação de IMP. A enzima de tecidos humanos tem distintos sítios de ligação de nucleotídeos. Um sítio liga especificamente oxipurina nucleotídeos (IMP, XMP, e GMP), enquanto o outro sítio liga especificamente aminopurina nucleotídeos (AMP). Quando AMP e GMP (ou IMP) estão presentes simultaneamente, a atividade enzimática é inibida sinergisticamente. Entre formação de 5-fosforribosilamina e IMP, não há etapas reguladas conhecidas, embora alterações nos níveis de tetra-hidrofolato tenham um efeito sobre a síntese “de novo” de purina nucleotídeos. No entanto, há regulação no ponto de ramificação de IMP para AMP e de IMP para GMP. O ATP geralmente é a fonte de fosfatos transferidos para formar as moléculas di e tri fosfatos, porque está presente em maiores concentrações do que os outros nucleosídeos tri-fosfatos. ADENILATO QUINASE: ADENILATO QUINASE: mais ativa no fígado e músculo e tem função de manter um equilíbrio entre AMP, ADP e ATP. GUANILATO QUINASE: Essas enzimas monofosfato quinases não são específicas para ribose ou desoxiribose NUCLEOSÍDEO DIFOSFATO QUINASE: as enzimas difosfato quinases são muito específicas (diferente das monofosfato quinases) Regulação da Sintese de Purinas AMP + ATP →← 2 ADP GMP + ATP →← GDP + ADP GDP + ATP →← GTP + ADP CDP + ATP →← CTP + ADP Metabolismo de Nucleotídeos Resumo – Alberto Galdino LoL →Rotas de Salvação ou Vias de Recuperação Purinas oriundas de: Metabolismo normal dos acidos nucleicos celulares Ou oriundas da dieta e que não são degradadas São convertidas em nucleotídeos trifosfato e usados pelo corpo via “rota de salvação da purinas”. As bases: hipoxantina, guanina e adenina são convertidos em seus respectivos nucleotídeos, via enzimas específicas. A eficiência do metabolismo normal é demonstrada pela presença de duas “vias de recuperação” distintas. Uma via utiliza nucleobases, hipoxantina, guanina e adenina, como substratos, enquanto a outra via utiliza nucleosídeos pré-formados como substratos. Cada via é específica com relação à nucleobase ou ao nucleosídeo que está sendo “recuperado” (salvaged). A “recuperação” de nucleobases requer atividade de fosforribosil transferases que utilizam PRPP como doador de ribose fosfato. Existem duas fosforribosil transferases distintas. Hipoxantina-guanina fosforribosil transferase (HGPRTase) catalisa as reações: Hipoxantina + PRPP IMP + PPi Guanina + PRPP GMP + PPi Adenina fosforribosil transferase (APRTase) catalisa: Adenina + PRPP AMP + PPi “Estas enzimas utilizam o PRPP como fonte do grupo ribose 5-fosfato para formar IMP,GMP e AMP – nestas reações a liberação do pirofosfato (PPi) torna estas reações irreversíveis OBS: Deficiência de HGPRT causa síndrome de Lesch-Nyhan.” Nucleosídeos como Adenosina são “recuperados” por Adenosina-quinase, uma 5’- fosfotransferase que utiliza ATP como doador de fosfato. A especificidade do substrato da 5’-fosfotransferase varia com a nucleosídeo quinase particular. Metabolismo de Nucleotídeos Resumo – Alberto Galdino LoL →Formação de Ácido Úrico O produto final do metabolismo daspurinas é o ácido úrico (em humanos) Outros mamíferos (exceção dos primatas)o ácido úrido pode ser oxidado. A degradação de purina nucleotídeos, nucleosídeos e nucleobases segue uma via comum, que leva à formação de ácido úrico. Asenzimas envolvidas na degradação dos ácidos nucléicos, nucleotídeos e nucleosídeos variam em especificidade. NUCLEASES são específicas para RNA ou DNA e, também, para as bases e a posição do sítio de clivagem nas ligações 3’-5’-fosfodiéster. Nucleotidases vão desde aquelas com especificidade relativamente alta, como a 5’-AMP nucleotidase, até aquelas com especificidade ampla, como as fosfatases ácida e alcalina, que hidrolisarão qualquer um dos 3’- ou 5’-nucleotídeos. AMP deaminase é específica para AMP. Um grupo amino é removido do AMP para produzir IMP, ou da adenosina para produzir inosina (hipoxantina-ribose) O IMP e GMP são convertidos em suas formas nucleosídeos inosina e guanosina pela ação da 5’nucleotidase A purina nucleosídeo fosforilase converte a inosina em guanosina em suas respectivas bases púricas: hipoxantina e guanina A guanosina é desaminada para formar xantina. A hipoxantina é oxidada pela xantina oxidase. A xantina é subsequentemente oxidada pela xantina oxidase em ácido úrico, que é o produto final da degradação humana das purinas. O ácido úrico é excretado na urina. Metabolismo de Nucleotídeos Resumo – Alberto Galdino LoL →Inibidores da Síntese de Purinas Metotrexato: é um análogo estrutural do ácido fólico (vitamina) – compete com o ácido fólico A enzima diidrofolato redutase é inibida pelo metotrexato Impede a formação de tetraidrofolato, a partir de diidrofolato Impede a síntese de DNA e RNA, pois os folatos fazem parte da rota da síntese de novo de purinas. O Metotrexato é um Quimioterápico para câncer (leucemia) Inibe a formação de tetraidrofolato Interfere na síntese de nucleotídeos e por sua vez na síntese de DNA e RNA Inibe divisão de células cancerígenas de crescimento rápido Afeta a multiplicação de células normais de crescimento rápido: tecidos fetais, medula óssea, pele, trato gastrointestinal e folículos pilosos. Degradação dos ácidos nucleicos na dieta e intestino Ácidos nucleicos são degradados a nucleosídeos (ribose ou deoxiribose) ou a bases livres purinas e pirimidinas. -Então podem ser absorvidos pelas células epiteliais da mucosa intestinal. Metabolismo de Nucleotídeos Resumo – Alberto Galdino LoL →Doenças associadas a degradação de nucleotídeos Deficiência de adenosina deaminase (ADA) Doenças distintas com imunodeficiências estão associadas com defeitos em adenosina deaminase (ADA) e purina nucleosídeo fosforilase (PNP), respectivamente. Estas enzimas estão envolvidas nas vias de degradação que levam a formação do ácido úrico. Uma deficiência em Adenosina Deaminase está associada com uma severa imunodeficiência combinada , envolvendo funções de células B e T. A deficiência de ADA surge de mutações em vários éxons, que causam os efeitos missense ou nonsense. Em pacientes ADA-deficientes, as concentrações intracelulares de dATP e de S-adenosil-homocisteína estão muito aumentadas. (O dATP é um inibidor da ribonucleotídeo redutase,e assim, da síntese de DNA). Gota Gota caracteriza-se por concentrações elevadas de ácido úrico no sangue e urina, devido a uma variedade de anomalias metabólicas, que incluem superprodução de purina nucleotídeos ou excreção diminuída de ácido úrico. Muitos dos sintomas clínicos associados com concentrações elevadas de ácido úrico surgem, devido à baixa solubilidade do ácido úrico no meio aquoso. Cristais de urato de sódio se depositam em articulações das extremidades e no tecido renal, e estes eventos tendem a causar sequelas. Deficiência de purina nucleosídeo fosforilase (PNP) É uma condição rara, associada com uma forte imunodeficiência celular, não humoral, recessiva autossômica. Estão incluídos nessas mutações, troca de padrão de leitura da ORF (frameshift) assim como erro na direção da tradução (missense), contudo, a mais comum é a mutação pontual Arg234Pro. A deficiência por PNP está associada à imunodeficiência envolvendo várias funções de células T, com pouco ou nenhum efeito nas células B. Também há a redução na formação de ácido úrico, combinada a níveis aumentados de nucleosídeos e nucleotídeos púricos. O dGTP é o principal nucleotídeo que se acumula nas hemácias. Síndrome de Lesch-Nyhan É caracterizada por hiperuricemia, produção excessiva de ácido úrico, e problemas neurológicos, que podem incluir espasticidade, retardo mental e automutilação. Esta doença está associada com uma deficiência muito severa ou total da atividade de HGPRTase. O gene de HGPRTase está no cromossomo X; consequentemente, a deficiência é virtualmente limitada ao sexo masculino. Pode ocorrer por vários motivos, como a perda da proteína HGPRTase, perda da atividade da enzima HGPRTase, “mutantes de Km”) etc. Metabolismo de Nucleotídeos Resumo – Alberto Galdino LoL →Síntese de Pirimidinas Lembrando a síntese das purinas: o anel das purinas era construído sobre uma ribose 5-fosfato. Nem todas enzimas usadas na síntese são citosolicas (CPS II “carbamoil fosfato sintetase II” é, e CPS I “carbamoil fosfato sintetase I” é mitocondrial). No caso da síntese das pirimidinas, o anel primeiro é sintetizado e depois então é ligado à ribose 5-fosfato. A síntese “de novo” do anel pirimídico em células de mamíferos utiliza aminoácidos como doadores de carbono e nitrogênio, além de CO2. Uridina 5’ –monofosfato (UMP) é sintetizado em uma via metabólica de seis etapas. Hidrólise de ATP (ou equivalente) é necessária para direcionar diversas etapas da via. Nucleotídeo quinases convertem UMP em UTP, que serve como substrato para CTP sintase. CTP sintase catalisa a formação de CTP a partir de UTP, com glutamina como doador do grupo amino. CTP sintetase apresenta cinética sigmoidal homotrópica com relação a UTP, enquanto CTP, o produto, é um efetor negativo da reação. Regulando CTP sintase, dessa maneira, as células mantêm uma razão apropriada entre UTP e CTP para as funções celulares e a síntese de RNA. Resumindo, síntese “de novo” de pirimidina nucleotídeos requer ASPARTATO como doador de carbono e nitrogênio e GLUTAMINA como doador de nitrogênio, e CO2 como doador de carbono. Cinco das 6 reações da via ocorrem no citosol da célula, enquanto a outra reação ocorre em mitocôndrias. As atividades enzimáticas citosólicas residem em proteínas multifuncionais. Metabolismo de Nucleotídeos Resumo – Alberto Galdino LoL UTP é o precursor direto de CTP. Um polipeptídeo e vários domínios A mesma cadeia polipeptídica tem 3 funções enzimáticas Carbamoil fosfato sintetase II Aspartato transcarbamoilase Diidroorotase A mesma cadeia polipeptídica tem 2 funções enzimáticas (enzima bifuncional) Ororato fosforibosil transferase Oroditilato descarboxilase (OMP descarboxilase) O aminoácido glutamina participa como doador de nitrogênio nas seguinte rotas: - Biossíntese das purinas - Biossíntese das pirimidinas - O UTP é aminado pela enzima CTP sintase para formar o CTP Degradação dos nucleotídeos pirimídicos Os anéis das purinas não são clivados nas células humanas No entanto, os anéis de pirimidina podem ser abertos e degradados a: Beta-alanina Beta-aminoisobutirato, São altamente solúveis São precurssores de Acetil CoA e Succinil CoA →Bases Pirimidicas são recuperadas para REGENERAR Nucleotídeos Pirimidinas são “recuperadas” por conversão em nucleotídeos pela pirimidina fosforribosiltransferase. A reação geral é: Pirimidina + PRPP pirimidina nucleosídeo 5’ –monofosfato + PPi A enzima de eritrócitos humanos utiliza ororato, uracil e timina como substratos, mas não citosina. Estas reações desviamas bases pirimídicas da via degradativa para a formação de nucleotídeo. Quando uma base pirimídica se torna disponível para células, há reações competidoras, que resultarão em: 1. Degradação e excreção de produtos, ou 2. Reutilização das bases para síntese de nucleotídeos. Por exemplo, quando o fígado recebe uracil, ele é rapidamente degradado a β-alanina, enquanto em célula tumorais em proliferação, uracil é convertido em UMP. Este é o resultado da disponibilidade de PRPP, dos níveis enzimáticos e do estado metabólico das células. Metabolismo de Nucleotídeos Resumo – Alberto Galdino LoL Síntese da timidina monofosfato a partir do dUMP Conversão de ribonucleotídeos em desoxiribonucleotídeos A síntese e todos nucleotideos estudados anteriormente foi de ribonucleotídeos, que podem ser utilizados na: • síntese de RNA • Transporte de açúcares (UDP-glicose na síntese de glicogênio) Os desoxiribonucleotídeos são necessários para a síntese de DNA e são sintetizados a partir dos ribonucleotídeos difosfato. Ribonucleotídeo redutase Enzima: com 2 subunidades iguais B1 e 2 B2 Função: reduzir nucleotídeos difosfato (ADP, GDP, CDP e UDP) Na forma desoxi: dADP, dGDP, dCDP e dUDP A enzima doa átomos de H para reduzir o grupo 2-hidroxila da ribose, TIOREDOXINA (coenzima da ribonucleotideo redutase) repõe os átomos de H, reduzindo a enzima novamente NADPH: reduz novamente a tiorredoxina Regulação da ribonucleotídeo redutase Função: suprir os desoxiribonucleotíedos necessários para a síntese de DNA A enzima apresenta um sítio ativo único E apresenta dois sítios regulatórios O dATP ligando-se ao sítio regulatório, vai inibir a redução dos nucleotídeos difosfato A ligação de nucleotídeos trifosfato (ATP, dATP, dTTP,dGTP) ao sítio de especificidade ao substrato -> aumenta a conversão de ribonucleotídeos em desoxiribonucleotídeos a medida que são requeridos para síntese de DNA.
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