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Universidade Federal de Mato Grosso Disciplina de Bioquímica Prof. Msc. Reginaldo Vicente Ribeiro Enzimas Cuiabá Outubro de 2009 • Definição: – São proteínas especializadas na catálise de reações biológicas; – Formadas por longas cadeias de aminoácidos; – exceção: grupo de RNA catalítico (RIBOZIMAS). • Função: –Viabilizar a atividade das células, regulando a velocidade de todos os processos fisiológicos. ENZIMAS � Aceleram reações químicas; � Coordenam cadeias de reações; � Estudo de patologias genéticas (enzimopatias); � Acompanhamento de doenças e tratamentos; � Diagnóstico de doenças; � Processamento de alimentos. ENZIMAS – Visão Geral 4 • Catálise biológica → início séc. XIX – digestão da carne: estômago; – digestão do amido: saliva. • Década de 50 – Louis Pasteur: fermentação do açúcar em álcool pela levedura é catalisada por “fermentos” = enzimas. • Eduard Buchner (1897): – extratos de levedo podiam fermentar o açúcar até álcool; – enzimas funcionavam mesmo quando removidas da célula viva. ENZIMAS - HISTÓRICO 5 • James Sumner (1926): - Isolou e cristalizou a urease; - Cristais eram de proteínas; - Postulou que “todas as enzimas são proteínas”. • John Northrop (década 30) - Cristalizou a pepsina e a tripsina bovinas; • Década de 50 – séc. XX - 75 enzimas → isoladas e cristalizadas; - Ficou evidenciado caráter protéico. • Atualmente + 2000 enzimas são conhecidas. ENZIMAS - HISTÓRICO 6 - Adição do sufixo ”ASE” ao nome do substrato: * gorduras (lipo - grego) – LIPASE * amido (amylon - grego) – AMILASE - Nomes arbitrários: * Tripsina e pepsina – proteases Nomenclatura Enzimática 7 1955 - Comissão de Enzimas (EC) da União Internacional de Bioquímica (IUB) →→→→ nomear e classificar. Cada enzima →→→→ código com 4 dígitos que caracteriza o tipo de reação catalisada: 1° dígito - classe 2° dígito - subclasse 3° dígito - sub-subclasse 4° dígito - indica o substrato Nomenclatura Enzimática 8 1. Oxido-redutases (reações de oxidação-redução ou transferência de elétrons) 1.1.atuando em CH-OH 1.2.atuando em C=O 1.3.atuando em C=O- 1.4.atuando em CH-NH2 1.5.atuando em CH-NH- 1.6.atuando em NADH, NADPH 2.Transferases (transferem grupos funcionais entre moléculas) 2.1.grupos com um carbono 2.2.grupos aldeído ou cetona 2.3.grupos acil 2.4.grupos glicosil 2.7.grupos fosfatos 2.8.grupos contendo enxofre 3.Hidrolases (reações de hidrólise) 3.1.ésteres 3.2.ligações glicosídicas 3.4.ligações peptídicas 3.5.outras ligações C-N 3.6.anidridos ácidos �Classificação das enzimas segundo a Comissão de Enzimas. Nomenclatura Enzimática 4.Liases (catalisam a quebra de ligações covalentes e a remoção de moléculas de água, amônia e gás carbônico) 4.1. =C=C= 4.2. =C=O 4.3. =C=N- 5.Isomerases (transferência de grupos dentro da mesma molécula para formar isômeros) 5.1.racemases 6.Ligases (catalisam reações de formação de novas moléculas a partir da ligação entre duas pré-existentes, sempre às custas de energia) 6.1. C-O 6.2. C-S 6.3. C-N 6.4. C-C �Classificação das enzimas segundo a Comissão de Enzimas. Nomenclatura Enzimática 10 Subclasses Exemplos de Subclasses Tipo de reação catalisada Classe Hidratases Adicionam H2O à ligas duplas Liases Quinases Transferem fosforilas do ATP Transferase Mutases Movem fosforilas dentro da mesma molécula Isomerase Sintases Síntese independente de ATP Transferases Sintetases Síntese dependente de ATP Ligases Nomenclatura Enzimática 11 ADP + D-Glicose-6-fosfatoATP + D-Glicose IUB - ATP:glicose fosfotransferase E.C. 2.7.1.1 2 - classe - Transferase 7 - subclasse - Fosfotransferases 1 - sub-subclasse - Fosfotransferase que utiliza grupo hidroxila como receptor 1 - indica ser a D-glicose o receptor do grupo fosfato Nome trivial: Hexoquinase Nomenclatura Enzimática � São produtos naturais biológicos; � Apresentam um alto grau de especificidade; � Desempenham a mesma função consecutivamente, sem serem consumidas no processo; � São altamente eficientes, acelerando a velocidades das reações; �Reduzem a energia de ativação; � Atividade em temperatura e pH fisiológicos; � Mais eficientes que vários catalisadores não biológicos. ENZIMAS - CARACTERÍSTICAS GERAIS Catalisadores Aumentam a velocidade das reações Atuam diminuindo a energia de ativação ENZIMAS Atuam em pequenas concentrações 1 molécula de Catalase decompõe 5 000 000 de moléculas de H2O2 pH = 6,8 em 1 min Número de renovação = n° de moléculas de substrato convertidas em produto por uma única molécula de enzima em uma dada unidade de tempo. ENZIMAS - Catalisadores • Catalisam as reações reduzindo a energia de ativação. – É a energia inicial necessária para que uma reação química aconteça. – Diferença entre os níveis de energia do estado basal e do estado de transição. C6H12O6 + 6O2 → 6CO2 + 6H2O + ATP Energia de ativação Energia de ativação Energia Caminho da Reação Energia de ativação sem enzima S P Energia de ativação com enzima Estrutura Enzimática ProteínasRibozimas RNAs SimplesConjugadas Holoenzima Apoenzima Cofator + apoenzima Enzimas - Estrutura Enzimática Proteína Apoenzima ou Apoproteína Cofator Pode ser: • íon inorgânico • molécula orgânica Coenzima Holoenzima 19 � Algumas enzimas que contêm ou necessitam de elementos inorgânicos como cofatores ENZIMA COFATOR PEROXIDASE Fe+2 ou Fe+3 CITOCROMO OXIDASE Cu+2 ÁLCOOL DESIDROGENASE Zn+2 HEXOQUINASE Mg+2 UREASE Ni+2 Enzimas - Cofator 20 Coenzima Abreviatura Reação catalisada Origem Nicotinamida adenina dinucleotídio NAD+ Oxi-redução Niacina ou Vitamina B3 Nicotinamida adenina dinucleotídio fosfato NADP+ Oxi-redução Niacina ou Vitamina B3 Flavina adenina dinucleotídio FAD Oxi-redução Riboflavina ou Vitamina B2 Maioria deriva de vitaminas hidrossolúveis Classificam-se em: - transportadoras de hidrogênio - transportadoras de grupos químicos Transportadoras de hidrogênio Enzimas - Cofator E + S E S E + P E - Enzima S - Substrato ES - Complexo Enzima -Substrato P - Produto Componentes da Reação Enzimática E + S E S P + E Substrato se liga ao SÍTIO ATIVO da enzima Componentes da Reação Enzimática Centro Catalítico / Sítio Ativo • Região da molécula enzimática que participa da reação com o substrato; • Pode possuir em sua constituição componentes não protéicos - cofatores; • Possui aminoácidos auxiliares e de contato. Ligação da Enzima ao Substrato �2 modelos propostos: • Chave-Fechadura � • Encaixe Induzido ִ Enzimas Substratos Complexo ES (Enzima-Substrato) Ligação Sítio Ativo Chave-fechadura Encaixe induzido Liberação do Produto + Enzima inalterada 26 Emil Fischer (1894): alto grau de especificidade das enzimas originou →→→→ Chave-Fechadura ����, que considera que a enzima possui sitio ativo complementar ao substrato. Ligação enzima - substrato 27 Koshland (1958): Encaixe Induzido ִִִִ, enzima e o substrato sofrem conformação para o encaixe. O substrato é distorcido para conformação exata do estado de transição. Ligação enzima - substrato • É a parte da enzimologia que estuda a velocidade das reações enzimáticas, e os fatores que influenciam nesta velocidade. • Na cinética enzimática avalia-se a quantidade de produto formado ou a quantidade de substrato consumido por unidade de tempo de reação.Cinética Enzimática - pH; - temperatura; - concentração das enzimas; - concentração dos substratos; - presença de inibidores. Fatores que alteram a velocidade de reações enzimáticas Equação de Michaelis-Menten: • Descreve como a velocidade de uma reação enzimática (Vo) depende da concentração do substrato. Vo = Vmax [S] / Km + [S] • A [S] é muito maior que a [E], o que leva a uma baixa [ES]; • A Vo é diretamente proporcional à [S]. INLUENCIA DA CONCENTRAÇÃO DE ENZIMAS E DE SUBSTRATOS 31 Ordem da reação Quando a formação de P for proporcional à [S] velocidade da reação é de 1a ORDEM Quando a velocidade da reação independe da [S] a reação é de ORDEM ZERO Vo= Vmax V [S] Vo = [S] 32 O efeito do pH sobre a enzima deve-se às variações no estado de ionização dos componentes do sistema à medida que o pH varia. Enzimas →→→→ grupos ionizáveis, existem em ≠ estados de ionização. Influência do pH 33 ↑↑↑↑ temperatura dois efeitos ocorrem: I - a taxa de reação aumenta, como se observa na maioria das reações químicas; II - a estabilidade da proteína decresce devido a desativação térmica. Enzima →→→→ temperatura ótima para que atinja sua atividade máxima, é a temperatura máxima na qual a enzima possui uma atividade crescente por um período de tempo. Influência da Temperatura INIBIÇÃO ENZIMÁTICA “Pode-se viver no mundo uma vida magnífica quando se sabe trabalhar pelo que se ama e amar aquilo em que se trabalha”. Tolstói
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