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Genética bacteriana Sumário • Cromossomo e plasmídeos bacterianos • Estrutura, função • Transposons, os elementos móveis de DNA • Mutações • Transversão e Transição • Reparo • Transformação, Transdução e conjugação Experimento de Avery Cromossomos • Na grande maioria das eubactérias, o cromossomo é pequeno, circular e apresenta grande densidade de genes (poucas sequências de DNA não transcrevem em um gene ou RNA funcional) • Encontra-se muito empacotado, em uma estrutura superenrolada (supercoiled), o que facilita a organização do DNA e agrupamento das enzimas • Na maioria das eubactérias, o processo de transcrição é intimamente ligado ao de tradução, com ambas ocorrendo quase simultaneamente A replicação do DNA • Bactérias com cromossomos circulares possuem uma única origem de replicação (OriC em E. coli), a partir de onde a DNA polimerase III pode atuar sobre a dupla-fita Nucleotídeos adicionados de 5’ 3’ Síntese do DNA/RNA • SEMPRE na direção 5’ 3’ • As cadeias de DNA de dupla- fita são antiparalelas • Ao observar uma fita, a sua complementar tem o sentido invertido • Ligação entre as bases é feita por PONTES DE HIDROGÊNIO • Dupla-hélice com volta a cada aproximadamente 10 nucleotídeos Leitura do DNA • A sequência do DNA é LIDA SEMPRE na sequência 3’5’ • Ou seja, quando observar uma fita de DNA, o primeiro nucleotídeo a ser lido é o da extremidade 3’ de uma das fitas • A fita complementar a esta vai ser sintetizada em SEU sentido 5’3’ CONTROLE DA EXPRESSÃO GENTÉTICA François Jacob e Jacques Monod Operons • Unidade Funcional do genoma sob controle de um único promotor • Cria uma cadeia longa de mRNA, que pode ser traduzida em um único RNA policistrônico ou dividido em mRNAs monocistrônicos • Possuem, a montante, uma sequência regulatória onde um operador é reprimido por uma proteína repressora, ou indutora. Através de um sinal específico (p.e. Presença de açúcar ou aminoácido), o repressor é desligado do operador e inicia-se a transcrição • Na presença de lactose, o repressor lac se desliga da região repressora, fazendo com que a RNA polimerase possa iniciar a transcrição dos genes responsáveis pela captura e degradação da lactose. Repare como os genes bacterians organiam-se em tandem, um em seguida do outro, sendo todos eles transcritos em um só mRNA. Notem também que o ribossomo inicia a tradução simultaneamente à RNApol. Promotor Induzível: A presença de determinada molécula libera a transcrição Promotor Repressível: A presença de determinada molécula impede a transcrição MUTAÇÃO Mutações • Ocorrem quando a sequência de DNA é modificada • Pode ser espontânea ou induzida • Podem levar a mutações sem sentido, de sentido errado, mudança de fase de leitura e supressora Sistemas de Reparo • Sistema SOS e adaptativo • Sistema SOS ativado pela luz UV – controlada pelos genes RecA e LexA (repressor) • Ação de endonucleases, que removem o trecho afetado por dímeros de timidina • Reparo por excisão • Reparo por recombinação homóloga – Presente apenas em eucariotos PLASMÍDEOS Plasmídeos • Pequenos elementos extracromossomais independentes (2- 50kb, em média), sendo que bactérias podem obter e descartar plasmídeos sem interferir com seu genoma • Podem conferir vantagem ao adicionar à célula genes de resistência a antibióticos, resistência ambiental ou fornecer uma nova via metabólica que forneça energia a partir de um substrato mais abundante • Pode haver mais de um plasmídeo IGUAL em uma célula (mesma cópia de um plasmídeo) • REPLICA DE MANEIRA INDEPENDENTE DO CROMOSSOMO, MAS USANDO A MAQUINARIA PRÉ-EXISTENTE Estrutura geral de um plasmídeo Plasmídeos • Todo plasmídeo deve conter, pelo menos, uma origem de replicação e um gene de resistência/diferenciação. O gene permite à célula sobreviver em uma condição adversa e continuar com o plasmídeo • Muitos plasmideos têm a habilidade de conferir fertilidade à bactéria, e fazer a CONJUGAÇÃO do plasmídeo entre bactérias • Plasmídeos de Estafilococos gram+ não podem fazer conjugações • Plasmídeos de bacilos Gram-, estreptomicetos e estreptococos só podem fazer a conjugação se possuírem os genes de conjugação OU se a célula hospedar também um plasmídeo conjugativo, ocorrendo então a mobilização de plasmídeo • Plasmídeos Conjugativos – importantes para a transferência de plasmídeos FATOR F • Plasmídeos R – Resistência a antibióticos, contendo um gene de resistência e um RTF, fator de transferência da virulência, essencial para a formação dos pili sexuais. • Plasmídeos Col – produtor de colicininas, inibidoras do crescimento de bactérias sem o plasmídeo Col • Plasmideos de virulência – Conferem às bactérias novas moléculas (toxinas, adesinas) para a colonização de um hospedeiro • Plasmideos de dissimilação sobrevivência utilizando componentes incomuns TRANSPOSONS Transposons • Sequências de DNA que podem mudar de posição no cromossomo do hospedeiro • Independente da recombinação homóloga, permite a mobilidade de elementos genéticos dentro de um cromossomo, entre cromossomo e plasmídeo e inclusive entre organismos • Todos os transposons dependem da transposase codificada por um gene presente no próprio transposon • Possuem como caraterística sequências de repetições invertidas dos dois lados do transposon, flanqueados por duas repetições diretas Barbara McClintock Transposon simples • Como o transposon transmite a informação? 1. A transposase reconhece as sequências invertidas nos flancos do transposon 2. A transposase corta as repetições diretas e remove o elemento 3. A transposase encontra um novo sítio de integração igual à repetição direta original, e corta formando terminais coesivos 4. A DNA polimerase e ligase completam a lacuna, conclindo a transposição do gene Retrotransposon • Dependem, além da transposase, de uma transcriptase reversa. • Nesse transposon, um mRNA é transcrito, a transcriptase reversa sintetiza o DNA a partir do mRNA, e o novo componente genético é reinserido no genoma, criando mais uma cópia do transposon • O HIV utiliza de Retrotransposons para integrar-se ao genoma humano • LINEs e SINEs são retrotransposons que ocorrem naturalmente em humanos Transposon Conjugativo • Ocorre entre Streptococcus e outras Gram+ • Importante na disseminação de resistência a antibióticos dentro do gênero • Um bom exemplo é a resistência a tetraciclina, conjugada pelo transposon Tn916, e podem saltar entre genomas e entre o genoma e plasmídeo, amplificando o alcance da resistência TRANSFERÊNCIA DE MATERIAL GENÉTICO •Transformação •Conjugação •Transdução Transformação • Algumas bactérias (competentes) são capazes de receber moléculas de DNA do meio • A proteína RecA liga-se ao DNA parental, em seguida ao doador, e faz a troca de genes ou regiões com alta similaridade • A transformação acontece naturalmente entre poucos gêneros: Bacillus, Hemophilus, Neisseria, Acinetobacter, e algumas linhagens de Streptococcus e Stafilococcus Conjugação • Mediada por um plasmídeo, ocorre a passagem de material genético através de estruturas como o Pilus sexual ou Pontes de conjugação • Fator F fator de fertilidade. Bactérias que contemo plasmídeo são denominadas F+, e as que não possuem, F-. • Bactérias F- que recebem o plasmídeo por conjugação tornam-se F+ • Em algumas células, o plasmídeo integra-se, formando bactérias de alta frequencia recombinatoria – Hfr. • Uma bactéria Hfr tansfere uma cópia de todo o seu cromossomo para a bactéria receptora F-, mas esta continua sendo F-. Transdução • Promovida através de bacteriófagos • 2 ciclos diferentes • Lisogênico O material genético viral incorpora-se ao material da bactéria • Lítico o vírus replica-se na bactéria e lisa-a • A passagem de fragmentos depende do tamanho do genoma viral
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