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MICR OBIOL OGIA DE ALI MEN TOS - PROFE SSOR A EVE LIN E D E AL ENCAR COSTA CELSO MACHADO DOS SANTOS - 1º SEMESTRE - 2016 1 celso35@uol.com.br TAXONOMIA 1. INTRODUÇÃO A taxonomia é a ciência de classificação dos organismos. Sua finalidade é mostrar as relações entre os organismos. A taxonomia também fornece um meio de identificar os organismos. 2. O ESTUDO DAS RELAÇÕES FILOGENÉTICAS A filogenia é a história evolutiva de um grupo de organismos. A hierarquia taxonômica mostra as relações evolutivas ou filogenéticas entre os organismos. As bactérias foram separadas no Reino Prokaryotae em 1968. Os organismos vivos foram divididos em cinco reinos em 1969. 3. OS TRÊS DOMÍNIOS Os organismos vivos atualmente são classificados em três domínios. Um domínio pode ser dividido em reinos. Nesse sistema, plantas, animais, fungos e protistas pertencem ao Domínio Eukarya. Bacteria (com peptideoglicana) forma um segundo domínio. As arquibactérias (com paredes celulares incomuns) são colocadas no Domínio Archaea. 4. A HIERARQUIA FILOGENÉTICA Os organismos são agrupados em taxa de acordo com as suas relações filogenéticas (a partir de um ancestral comum). Algumas das informações para as relações eucarióticas são obtidas de registros de fósseis. As relações procarióticas são determinadas por sequenciamento de rRNA. MICR OBIOL OGIA DE ALI MEN TOS - PROFE SSOR A EVE LIN E D E AL ENCAR COSTA CELSO MACHADO DOS SANTOS - 1º SEMESTRE - 2016 2 celso35@uol.com.br 5. CLASSIFICAÇÃO DOS ORGANISMOS Nomenclatura científica De acordo com a nomenclatura científica, a cada organismo são designados dois nomes, ou um binômio: um gênero e um epíteto específico ou espécie. As regras para a designação de nomes para bactérias são estabelecidas pelo International Committee on Systematics of Prokaryotes. As regras para denominar fungos e algas estão publicadas no International Code of Botanical Nomenclature. As regras para denominar protozoários são encontradas no International Code of Zoological Nomenclature. A hierarquia taxonômica Uma espécie eucariótica é um grupo de organismos que cruzam entre si, mas não cruzam com indivíduos de outra espécie. Espécies similares são agrupadas em um gênero; gêneros similares são agrupados em uma família; famílias, em uma ordem; ordens, em uma classe; classes, em um filo; filos, em um reino; e reinos, em um domínio. Classificação dos procariotos O Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology é a referência-padrão na classificação bacteriana. Um grupo de bactérias derivadas de uma única célula é chamado de linhagem. Linhagens intimamente relacionadas constituem uma espécie bacteriana. Classificação dos eucariotos Os organismos eucarióticos podem ser classificados no Reino Fungi, Plantae ou Animalia. Os protistas são essencialmente organismos unicelulares; esses organismos estão sendo atualmente distribuídos nos reinos. Fungi são quimio-heterotróficos capazes de absorção que formam esporos. Fotoautotróficos multicelulares são colocados no Reino Plantae. Heterotróficos multicelulares com capacidade de ingestão são classificados como Animalia. Classificação dos vírus Os vírus não são colocados em um reino. Eles não são compostos de células e não podem crescer sem uma célula hospedeira. Uma espécie viral é uma população de vírus com características similares que ocupa um nicho ecológico particular. MICR OBIOL OGIA DE ALI MEN TOS - PROFE SSOR A EVE LIN E D E AL ENCAR COSTA CELSO MACHADO DOS SANTOS - 1º SEMESTRE - 2016 3 celso35@uol.com.br 6. MÉTODOS PARA CLASSIFICAÇÃO E IDENTIFICAÇÃO DE MICRO-ORGANISMOS O Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology é a referencia-padrão na identificação laboratorial de bactérias. As características morfológicas são úteis na identificação de micro-organismos, em especial com a ajuda de técnicas de coloração diferenciais. A presença de várias enzimas, como determinado por testes bioquímicos, é utilizada para identificar micro-organismo. Testes sorológicos, envolvendo as reações de micro-organismos com anticorpos específicos, são úteis para determinar a identidade de linhagens ou espécies, assim como as relações entre os organismos. O ELISA e o Western blotting são exemplos de testes sorológicos. A fagotipagem é a identificação de espécies e linhagens bacterianas pela determinação de sua suscetibilidade a diversos fagos. O perfil de ácidos graxos pode ser utilizado para identificar alguns organismos. A citometria de fluxo mede características físicas e químicas das células. A porcentagem de pares de bases GC no ácido nucleico das células pode ser utilizada para a classificação de organismos. O número e o tamanho dos fragmentos de DNA, ou fingerprinting de DNA, produzidos por enzimas de restrição são utilizados para determinar similaridades genéticas. A reação em cadeia da polimerase (PCR) pode ser utilizada para amplificar uma pequena quantidade de DNA microbiano em uma amostra. A presença ou a identificação de um organismo é indicada pelo DNA amplificado. Fitas simples de DNA, ou de DNA e RNA, de organismos relacionados formam ligações de hidrogênio e consequentemente moléculas de fita dupla; essa ligação é chamada de hibridização. Southern blotting, chip de DNA e FISH são exemplos de técnicas de hibridização de ácidos nucleicos. A sequência de bases em um RNA ribossômico pode ser utilizada para a classificação de organismos. As chaves dicotômicas são utilizadas para identificação de organismos. Os cladogramas mostram as relações filogenéticas entre os organismos. MICR OBIOL OGIA DE ALI MEN TOS - PROFE SSOR A EVE LIN E D E AL ENCAR COSTA CELSO MACHADO DOS SANTOS - 1º SEMESTRE - 2016 4 celso35@uol.com.br 7. MÚLTIPLA ESCOLHA 1. O Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology difere do Bergey´s Manual of Determinative Bacteriology porque o primeiro a. Agrupa as bactérias em espécies. b. Agrupa as bactérias de acordo com as relações filogenéticas. c. Agrupa as bactérias de acordo com as propriedades patogênicas. d. Agrupa as bactérias em 19 espécies. e. Todas as alternativas. 2. Bacillus e Lactobacillus não são da mesma ordem. Isso indica que qual das características a seguir não é suficiente para alocar um organismo em um táxon? a. Características bioquímicas. b. Sequenciamento de aminoácidos. c. Fagotipagem. d. Sorologia. e. Características morfológicas. 3. Quais das características a seguir são utilizadas para classificar os organismos no Reino Fungi? a. Capacidade de fotossíntese; possui parede celular. b. Unicelular; possui parede celular; procariótico. c. Unicelular; sem parede celular; eucariótico. d. Capacidade de absorção; possui parede celular; eucariótico. e. Capacidade de ingestão; sem parede celular; multicelular; procariótico. 4. Qual das afirmativas a seguir não é verdadeira em relação à nomenclatura científica? a. Cada nome é específico. b. Os nomes variam de acordo com o local geográfico. c. Os nomes são padronizados. d. Cada nome consiste do gênero e de um epíteto específico. e. Foi criado por Linnaeus. 5. Você poderia identificar uma bactéria desconhecida por todos os métodos a seguir, exceto a. Hibridizando uma sonda de DNA de uma bactéria conhecida com o DNA de uma bactéria desconhecida. b. Realizando um perfil de ácidos graxos do organismo desconhecido. c. Aglutinando com antissoro específico o organismo desconhecido. d. Sequenciando o RNA ribossômico. e. Determinando a porcentagem de guanina +citosina. MICR OBIOL OGIA DE ALI MEN TOS - PROFE SSOR A EVE LIN E D E AL ENCAR COSTA CELSO MACHADO DOS SANTOS - 1º SEMESTRE - 2016 5 celso35@uol.com.br 6. Os micoplasmas sem parede são considerados relacionados a bactérias gram-positivas. Qual das afirmativas seguintes fornece a evidência mais forte para isso? a. Eles compartilham sequências comuns de rRNA. b. Algumas bactérias gram-positivas e alguns micoplasmas produzem catalase. c. Ambos os grupos são procariotos. d. Algumas bactérias gram-positivas e alguns micoplasmas têm células com forma de cocos. e. Ambos os grupos contêm patógenos humanos. Utilize as seguintes escolhas para responder as questões 7 e 8. a. Animalia. b. Fungi. c. Plantae. d. Firmicutes (bactérias gram-positivas). e. Proteobacteria (bactérias gram-negativas). 7. Em qual grupo você colocaria um organismo multicelular que tem uma boca e vive no fígado humano? a 8. Em qual grupo você colocaria um organismo fotossintético que não tem núcleo e possui uma parede fina de peptideoglicana, envolta em uma membrana externa? e Utilize as seguintes alternativas para responder as questões 9 e 10. 1. Flagelos 9 +2. 2. Ribossomo 70S. 3. Fímbria. 4. Núcleo. 5. Peptideoglicana. 6. Membrana plasmática. 9. Qual(is) desses é(são) encontrado(s) nos três domínios? a. 2, 6. b. 5. c. 2, 4, 6. d. 1, 3, 5. e. Todos os seis. 10. Qual(is) desses é(são) encontrado(s) somente em procariotos? a. 1, 4, 6. b. 3, 5. c. 1, 2. d. 4. e. 2, 4, 5.
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