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Ligação Gênica Prof. Lucas Nunes da Luz lucasluz@cariri.ufc.br Universidade Federal do Cariri – UFCA Centro de Ciências de Agrárias e Biodiversidade – CCAB Curso de Agronomia Genes Independentes Segregação independente • Os genes estão localizados em cromossomos diferentes; • Geração F2: 9: 3: 3:1 • Cruzamento teste: 1:1:1:1 • Os genes podem estar no mesmo cromossomo, mas se a distancia entre eles for superior a 50%, eles são considerados independentes. • Qualquer alteração na frequência esperada na geração F2 e na geração do retrocruzamento indica que os genes estão ligados. Ligação gênica • 1903 - Walter Sutton • Organismos tinham muito mais “fatores” do que cromossomos; • Certos genes não eram transmitidos conforme as Leis de Mendel; • Certos genes estavam localizados no mesmo cromossomo e eram transmitidos como uma única entidade. • Atualmente, sabe-se que os cromossomos consistem de centenas ou milhares de genes e aqueles que estão no mesmo cromossomo tendem a estar ligados. • Morgan: Estudos em Drosophila • Recombinação ou Permuta • Ligação Gênica • Mapa Genético Genes Ligados Fenótipos Gerações P1 P2 F1 F2 C. teste Red. Simples 15 126 23 Red. Composto 25 63 85 Along. Simples 23 66 83 Along . Composto 4 19 TOTAL 23 25 15 259 210 O = redondo o = alongado S = simples s = composta 189 : 70 192 : 67 Genes ligados Fenótipos Geração F2 C. teste FO FE DESVIO FO FE DESVIO Red. Simples 126 145.7 -19.7 23 52.5 -29.5 Red. Composto 63 48.6 14.4 85 52.5 32.5 Along. Simples 66 48.6 17.4 83 52.5 30.5 Along . Composto 4 16.1 -12.1 19 52.5 -33.5 TOTAL 259 259 X2= 22.25 210 210 X2= 75.79 O = redondo o = alongado S = simples s = composta Genes Ligados • Ligação Incompleta ou parcial • Dois genes localizados no mesmo cromossomo. Porém, não ocorre permuta ou não é detectado crossing over; • Gametas formados: 04 gametas do tipo parental com a mesma freqüência. • Ligação Completa • Dois genes localizados no mesmo cromossomo com crossing over ocorrendo entre duas cromátides não irmãs; • Gametas formados: 04 tipos de gametas, sendo dois do tipo parental e dois recombinantes; • Quando a distância entre dois locos aumenta, a freqüência de gametas do tipo parental diminui e a do tipo recombinante aumenta. • Genes Independentes • O gene para altura da planta (alta/anã - 1) segrega independentemente do gene para cor de fruto (vermelho/amarelo - 2); • O gene para altura da planta (alta/anã - 1) segrega independentemente do gene para número e lóculos no fruto (cromossomo 1). • Genes Ligados • O gene para altura da planta (alta/anã - 1) está ligado ao gene para textura do fruto. Crossing-over ou Permuta • É um processo físico de quebra e fusão ou junção que ocorre durante a prófase I; • Cromossomos homólogos pareiam; • Troca recíproca de segmentos de genes pode ocorrer; • Recombinação. Crossing over • O crossing-over ocorre após a replicação ou duplicação dos cromossomos: cada cromossomo representado por duas cromátides. • O crossing-over é detectado pela presença de quiasmas • Quiasmas: região onde ocorre a troca de material genético. • É muito importante não confundir a freqüência do evento crossing-over com a freqüência dos cromossomos recombinantes; cada evento meiótico de crossing-over produz dois cromossomos recombinados. • O grau de crossing-over entre dois locos em um cromossomo é proporcional a distancia entre eles: distância interlocos Crossing over Freqüência da Recombinação Freqüência de ocorrência dos genótipos recombinantes. Se não há permuta são formados apenas genótipos parentais. Fenótipos P1 P2 F1 F2 CT Fruto redondo e inflorescência simples - - 15 126 23 Fruto redondo e inflorescência composta - 25 - 63 85 Fruto alongado e inflorescência simples 23 - - 66 83 Fruto alongado e inflorescência composta - - - 04 19 Total 23 25 15 259 210 Freqüência de recombinação Cruzamento teste % r = (N° rec. / Total de ind. CT) * 100 % r = 23 + 19/ 210 = 20% 10% OS e 10% os Demais gametas: 40% Os e 40% oS Estimativa da proporção de gametas em F2 Fem. Masc. 1 OS 4 Os 4 oS 1 os 1 OS 1 OS/OS 4 OS/Os 4 OS/oS 1 OS/os 4 Os 4 Os/OS 16 Os/Os 16 Os/oS 4 Os/os 4 oS 4 oS/OS 16 oS/Os 16 oS/oS 4 oS/os 1 os 1 os/OS 4 os/Os 4 os/oS 1 os/os Red. Simples 51% Along. Simples 24% Red. Composta 24% Along. Composto 1% Estimativa da proporção de gametas em F2 Fen. Freq. Observado Esperado Redondo Simples 126 132,09 Alongado simples 66 62,16 Redondo Composto 63 62,16 Alongado Composto 4 2,59 Red. Simples 51% Along. Simples 24% Red. Composta 24% Along. Composto 1% • Valor de Z = N° (rec. I x N° rec II) / (N° P1 x N° P2) = (126) x (04) / (63) x (66) = 504/4158 Z = 0,12 (Tabela) • Com este valor de Z entra-se na tabela de Z e procura (Repulsão ou Atração) o valor de Z e a %r correspondente. • %r = 0,23 ou 23 % Freqüência de recombinação Teste Z Mapa Genético • A. H. Sturtevant sugeriu que a freqüência dos gametas recombinantes produzidos fosse usada como um índice da distância entre dois genes no cromossomo • A unidade de distância é o Centimorgan, ou unidades de mapa ou percentagem de recombinação (%r): • Ex: gene b (black body) está a 18 cM do gene vg (asa vestigial) em drosophila • 18 uM=18 cM=18% recombinação. • Todos os genes em um dado cromossomo constituem um grupo de ligação; uma espécie terá tantos grupos de ligação quanto for o número básico de cromossomos • O mapa refere-se a distância entre genes presentes em um organismo Mapa Genético • Métodos utilizados para a confecção do mapa • Cruzamento teste • Método do Produto; • Método da Máxima Verossimilhança • Dois pontos • Três Pontos Mapa genético Fenótipo da Descendência Genótipo Frequência Observada Normal ABC 235 Brilhante, e estéril Abc 62 Estéril ABc 40 Estéril, virescente aBc 4 Brilhante, estéril, virescente abc 270 Brilhante AbC 7 Brilhante, virescente abC 48 Virescente aBC 60 Total 726 Caracteres Monogênicos (Dominância Completa): a: planta virescente; A: planta normal; b: plântula brilhante; B: planta normal; c: planta macho- estéril; C: planta normal. ABC/abc x abc/abc Mapa Genético –Teste dos Três pontos • Identificação das classes paternas; • Maior frequência • Identificação dos produtos de DR duplo: • Menor frequência • Determinação da posição dos genes • Observar os produtos resultantes de duplo DR • Identificação dos recombinantes na região I; • Estimativa da distância na região I • Identificação dos recombinantes na região II; • Estimativa da distância na região II Mapa Genético - Teste dos Três Pontos Construção de uma mapa genético • Predição para a geração F2; • Estimativa da frequência de recombinantes na região I; • Estimativa da frequência de recombinantes na região II; • Estimativa da frequência dos tipos parentais. Construção de uma mapa genético Estimativa da frequência de recombinantes na região I • Recombinação entre as distâncias da região A x B FR (I) = 62 (Abc) + 60 (aBC) + 7 (AbC) + 4 (aBc) / 726 FR (I) = 18,3% Desse modo a distância entre os genes é de 18,3 cM Construção de uma mapa genético Estimativa da frequência de recombinantes na região II • Recombinação entre as distâncias da região B x C FR (I) = 40 (ABc) + 48 (abC) + 7 (AbC) + 4 (aBc) / 726 FR (I) = 13,6% Desse modo a distância entre os genes é de 13,6 cM Interferência • A permuta em uma região pode interferir com a ocorrência de permuta em uma outra região; • Quanto mais próximos tiverem os genes maiorserá a interferência; • Grau de Interferência I = 1 – CC • Coeficiente de Coincidência CC= FPDO / FPDE Interferência • Frequência de permuta dupla observada (FPDO) FPDO= (N° de duplos recombinantes observado/N° total) * 100 • Frequência de permuta dupla esperada (FPDE) FPDE= Distância na região (RI) x distância da região (RII) / 100 • Logo I = 1 – FPDO/FPDE I = 1 – (1.5/2.5) = 0,4 Interferência a _______________ b _________ c I = 40% 18,3 13,6 Pleiotropia • Um gene controla dois ou mais caracteres • Pleiotropia relativa • Alelo P do feijoeiro – cor do caule, hipocótilo, caule, flores e tegumento; • Alelo dl em tomate – reduz os pelos no caule, pendúculos e anteras - dldl afeta a autofecundação • Alelo dr em mamona – forma da semente e coloração do caule • Pleiotropia sindrômica – penas reviradas em galinhas Correlação e seleção indireta • Associação entre duas características • Positiva • Negativa • Genética, fenotípica e ambiental • Análise de trilha • Ganho genético Mapa genético e hot spots Correlação e seleção indireta Hot spots
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