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FASE S REPLICAÇÃO DA MOLÉCULA DE DNA INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS Profa. Délia Aguiar • Cada vez que uma célula se divide, uma cópia completa de seus genes deve ser produzida. Durante a replicação necessário um grau considerável de precisão uma taxa de erro de 0,001% (1 erro por 10.000 nucleotídeos) causará um acúmulo significante de alterações nos genes . O PADRÃO GERAL DA REPLICAÇÃO DO DNA • WATSON e CRICK – O pareamento específico sugere um possível mecanismo de replicação do material genético. • Os biologistas moleculares no início da década de 50 não tinham certeza do padrão geral do processo de replicação. • Três estratégias diferentes para a replicação da dupla hélice pareciam possíveis: O PADRÃO GERAL DA REPLICAÇÃO DO DNA 1) REPLICAÇÃO SEMI-CONSERVATIVA, na qual as moléculas filhas contêm, cada uma, um polinucleotídeo derivado da molécula original e uma fita recém-sintetizada. 2) REPLICAÇÃO CONSERVATIVA, na qual uma molécula filha contem ambos os polinucleotídeos originais e a outra contem ambas as fitas recém- sintetizadas. 3) REPLICAÇÃO DISPERSIVA, na qual cada fita de cada molécula filha é composta de segmentos do polinucleotídeo original e de segmentos recém- sintetizados. O EXPERIMENTO DE MESELSON-STAHL • Este experimento dependeu do uso de isótopos químicos. – O isótopo normal (N14) e o pesado(N15) . • E. coli provida com nitrogênio pesado irá incorporá-lo em seu DNA • DNA contendo N15 pode ser distinguido daqueles contendo N14 por centrifugação em gradiente de densidade • DNA-N15 tem uma densidade de flutuação maior que o DNA-N14 e formará uma banda em uma posição mais baixa. O EXPERIMENTO OBSERVAÇÃO 1º Cultivaram E. coli em um meio de cultura com N15 e N15 CENTRIFUGAÇÃO DENSIDADES DIFERENTES O EXPERIMENTO • Uma cultura de E. coli - crescer em presença de N15 •A cultura foi centrifugada, o meio de cultura descartado e as bactérias foram ressuspendidas em meio contendo somente N14. •Portanto, os polinucleotídeos sintetizados após a ressuspensão conteriam somente N14. • Deixava-se as bactérias crescendo por 20 minutos (um ciclo de divisão), tempo no qual o DNA se replica apenas uma vez. • Retirava-se algumas células da cultura, seus DNAs eram purificados e analisados por centrifugação em gradiente de densidade. • O resultado foi uma única banda de DNA na posição correspondente a uma densidade de flutuação intermediária entre os valores para DNA-N15 e DNA-N14, mostrando que cada molécula de DNA continha aproximadamente igual quantidade de polinucleotídeo-N14 e polinucleotídeo-N15. • Este resultado é compatível com a replicação semi-conservativa e dispersiva, porém elimina a replicação conservativa pois, por este esquema, seriam produzidos 2 tipos de moléculas de DNA, um inteiramente N15 e outro inteiramente N14, sem a formação de híbridos. • Para distinguir entre replicação semi-conservativa e dispersiva, Meselson e Stahl deixaram as bactérias crescendo por mais um ciclo de divisão celular. VER VIDEO 1 CROMOSSOMO BACTERIANO O MECANISMO DE REPLICAÇÃO DO DNA EM E. coli O MECANISMO DE REPLICAÇÃO DO DNA EM E. coli • Quebra do pareamento de bases posição específica ORIGEM DE REPLICAÇÃO gradualmente se desloca ao longo da molécula síntese dos novos polinucleotídeos enquanto a dupla hélice se abre. • A região onde o pareamento das bases da molécula parental é quebrado e os novos polinucleotídeos são sintetizados é chamada FORQUILHA DE REPLICAÇÃO. Replicação do DNA: vários pontos de origem Pontos de origem de replicação A DNA POLIMERASE • Enzima capaz de sintetizar um novo polinucleotídeo de DNA DNA POLIMERASE. • A seqüência das bases no novo polinucleotídeo é dependente da seqüência das bases na fita molde e é determinada pela complementariedade no pareamento das bases. • A síntese de DNA ocorre somente no sentido (ou direção) 5'3'. Crescimento da cadeia A síntese do DNA é feita no sentido 5 - 3. A extremidade 5´ trifosfato do nucleosídeo forma uma ligação fosfodiéster com o grupo hidroxil da nova cadeia. EVENTOS NA FORQUILHA DE REPLICAÇÃO • A enzima responsável pela replicação do DNA em E. coli DNA POLIMERASE III. • Enzima HELICASE rompimento do pareamento das bases entre as duas fitas da molécula de DNA parental. • SSB proteínas ligam-se aos DNA-fita simples resultantes da ação da helicase, impedindo o repareamento das duas fitas. • A DNA polimerase III sintetiza DNA somente no sentido 5'3', o que significa que a fita molde deve ser lida no sentido 3'5‘. • Para uma das fitas parental, a FITA LÍDER, o novo polinucleotídeo pode ser sintetizado continuamente. Porém a outra, a FITA TARDIA, não pode ser copiada continuamente, pois isto necessitaria uma síntese 3'5'. • A FITA TARDIA tem de ser copiada em seções: – uma porção da hélice parental é dissociada e esse pequeno trecho exposto da fita tardia é replicado, a hélice se dissocia mais um pouco e o trecho é copiado e assim por diante. O PROBLEMA DA INICIAÇÃO Todas as DNA polimerases precisam de um grupo 3'-OH para estender a cadeia de DNA Como, então, se inicia a síntese de DNA? Uma enzima chamada primase sintetiza um PRIMER de RNA tanto na fita lider como nos fragmentos de Okasaki Uma RNA polimerase pode sintetizar também um primer da fita líder • Primeiros nucleotídeos - são ribonucleotídeos que são colocados por uma RNA polimerase. • Após isso, a RNA polimerase é liberada e a polimerização, desta fez de DNA, é continuada pela DNA polimerase III. • Na fita tardia, a DNA polimerase III somente pode sintetizar DNA até uma certa distância antes de atingir o iniciador na extremidade 5' do próximo fragmento de Okazaki. Aqui a DNA polimerase III é substituída pela DNA polimerase I que continua a síntese, retirando os ribonucleotídeos que constituem o iniciador do fragmento de Okazaki adjacente (atividade exonuclease 5'->3') e substituindo-os por desoxirribonucleotídeos. Quando todos os ribonucleotídeos são substituídos, a DNA polimerase I ou para, ou se desloca para outra região com iniciador, promovendo a substituição dos nucleotídeos. • Reação final - união dos fragmentos de Okazaki - DNA LIGASE (sintetiza uma ligação fosfodiéster) ATIVIDADE DE REVISÃO • Tanto a DNA polimerase I como a III possuem atividade exonuclease 3'5', sentido contrário à síntese. Isto significa que, se um nucleotídeo for inserido incorretamente durante a síntese, a enzima é capaz de retroceder e substituir o nucleotídeo incorreto pelo adequado. Sistema de reparo: pareamentos errados são instáveis e provocam dobras na molécula (alteração espacial): percebidos e corrigidos. O PROBLEMA TOPOLÓGICO • Os 2 polinucleotídeos da hélice parental estão enrolados um no outro - o deslocamento da forquilha de replicação ao longo da molécula parental requer não somente a separação das 2 fitas, mas também seu desenrolamento. DNA TOPOISOMERASE • As enzimas que desenrolam a dupla hélice - DNA TOPOISOMERASES, pertencentes a 2 classes, TIPO I e TIPO II. • As topoisomerases tipo I quebram apenas um dos polinucleotídeos e passam a outra fita pela fenda, antes de desfazer a quebra. • As enzimas tipo II, das quais faz parte a DNA GIRASE, realizam o mesmo tipo de reação,porém quebram ambas as fitas em posições adjacentes. REPLICAÇÃO DO DNA EM EUCARIOTOS • A replicação do DNA processa-se de um modo muito similar em todos os organismos, e os eventos descritos em E. coli também valem para os eucariotos. • Células de mamíferos têm 5 DNA polimerases diferentes chamadas , , , e . FIM
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