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Aminoácidos, peptídeos e proteínas Profa. Dra. Ana Carolina Silva Siquieroli 2013 UNIVERSIDADE FEDERAL DE UBERLÂNDIA INSTITUTO DE GENÉTICA E BIOQUÍMICA CURSO DE AGRONOMIA - MONTE CARMELO DISCIPLINA DE BIOQUÍMICA Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas AMINOÁCIDOS São as unidades monoméricas das proteínas Fornecem a chave para a estrutura de milhares de proteínas diferentes: Cada resíduo de aa liga-se ao seu vizinho por um tipo específico de ligação covalente Enzimas, hormônios, anticorpos, transportadores, músculos, teia de aranha, chifres, proteínas do leite B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas AMINOÁCIDOS O primeiro aa descoberto foi a asparagina, em 1806 E o último foi a treonina, em 1938 20 aminoácidos distintos asparagina Ácido glutâmico aspargo Glutén do trigo Tirosina queijo B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas AMINOÁCIDOS Possuem um grupo carboxila e um grupo amino, ligados ao mesmo átomo de carbono Diferem entre si por suas cadeias laterais ou grupos R, os quais variam em estrutura, tamanho e carga elétrica e influenciam a solubilidade do aa na água Todos os 20 aminoácidos são α-aminoácidos B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 grupo amino grupo carboxila B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas AMINOÁCIDOS OU por um símbolo de uma única letra São designados por abreviações de três letras B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas AMINOÁCIDOS O carbono α é um centro quiral Todos os aa, exceto a glicina , o carbono α se liga a quatro grupos substituintes diferentes glicina alanina B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas AMINOÁCIDOS Que são imagens especulares não-superponíveis Por causa do arranjo tetraédrico, os quatro diferentes grupos substituintes podem ocupar duas disposições espaciais distintas Representam uma classe de estereoisômeros, chamada de enantiômeros B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas AMINOÁCIDOS L-estereoisômeros Os aminoácidos nas moléculas protéicas são sempre B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas AMINOÁCIDOS Agrupamento em 5 classes principais, tendo como base as propriedades dos seus grupos R Os aminoácidos podem ser classificados pelos seus grupos R Em particular sua polaridade, ou tendência para interagir com a água em pH biológico (próximo de 7) B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas GRUPOS R NÃO-POLARES E ALIFÁTICOS Os grupos R nessa classe de aa são hidrofóbicos (insolúveis em água) e não-polares B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas GRUPOS R AROMÁTICOS Esses aa com suas cadeias lateriais aromáticas, são relativamente apolares (hidrofóbicos) B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas GRUPOS R AROMÁTICOS Esses aa absorvem luz na região ultravioleta do espectro Esses fato é responsável pela forte e característica absorbância da luz pelas proteínas no comprimento de onda de 280nm B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas GRUPOS R NÃO-CARREGADOS, MAS POLARES Os grupos R desses aa são mais solúveis em água, ou hidrofílicos porque contém grupos funcionais que formam pontes de hidrogênio com a água B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas GRUPOS R CARREGADOS POSITIVAMENTE (BÁSICOS) Os aa pertencentes a este grupo possuem uma carga positiva líquida em pH 7 e são hidrofílicos B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas GRUPOS R CARREGADOS NEGATIVAMENTE (ÁCIDOS) Os aa pertencentes a este grupo possuem uma carga líquidanegativa em pH 7 e são hidrofílicos B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas Quando um aminoácido é dissolvido em água, ele existe na solução como um íon dipolar, ou zwitterion (íon híbrido) Fórmula geral iônica dos aminoácidos, em pH 7,4 B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas Portanto,em soluções aquosa os aminoácidos estão sempre ionizados A forma não iônica não ocorre em quantidades significativas em soluções aquosas e , portanto, o zwitterion predomina em pH neutro B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas Forma predominante B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas O zwitterion pode agir como um ácido (doador de prótons) e como uma base (receptor de prótons) B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas Apresenta dois grupos, o grupo COOH e o grupo NH3+, que podem se ionizar para liberar prótons Um aminoácido simples como a glicina é na realidade um ácido diprótico, quando está totalmente protonado B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas pH ácido pH neutro pH básico B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas A carga elétrica de um Aa varia com o pH do meio + 1 0 - 1 B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas O pH característico no qual a carga total é igual a zero é denominado ponto isoelétrico, designado por pI + 1 0 - 1 B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas Para aqueles aa que tem apenas um grupo ionizável ácido e apenas um grupo ionizável básico, é calculado pela média dos valores do pKa. pI = ½ (pK1 +pK2) = ½ (2,34 + 9,60) = 5,97 B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas PEPTÍDEOS Peptídeos são cadeias de aminoácidos Formando assim um dipeptídeo Duas moléculas de aa podem ser unidas covalentemente por meio de uma ligação peptídica Mas podem também formar um tripeptídeo, tetrapeptídeo, pentapeptídeo OLIGOPEPTÍDEOS POLIPEPTÍDEOS B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas PEPTÍDEOS Ligação Peptídica É formada por remoção dos elementos da água (desidratação) de um grupo carboxila de um aa e de um grupo amino de outro B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas As unidades de aminoácidos de um peptídeo são chamadas de resíduos O resíduo de aa presente na extremidade que exibe um grupo amino é o resíduo aminoterminal (N-terminal). O resíduo na outra extremidade, que exibe uma carboxila livre, é o resíduo carboxiterminal (C-terminal). PEPTÍDEOS B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas PEPTÍDEOS Podem ser distinguidos entre si por meio de seu comportamento de ionização Esses grupos se ionizam da mesma forma que o fazem nos aminoácidos livres Os peptídeos contém apenas um grupo amino livre e um grupo carboxila livre, em cada uma das extremidades da cadeia B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas PEPTÍDEOS Os outros aa estão ligados covalentementes entre si , fazendo parte das ligações peptídicas, a qual não se ioniza, e assim não contribuem para o comportamento ácidobásico dos peptídeos Porém, os grupos R de alguns aa podem se ionizar e isso contribuirá para as propriedades ácidobásicas globais dos peptídeos que os contenham Assim, o comportamento ácidobásico de um peptídeo pode ser predito a partir de seus grupos amino e carboxila livres e da natureza de seus grupos R ionizáveis B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas PEPTÍDEOS Existem em uma ampla faixa de tamanhos Peptídeos de ocorrência natural variam em tamanho, entre dois a muitos milhares de resíduos de aa B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas PEPTÍDEOS Dipeptídeo comercial sintético ASPARTAME B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas PEPTÍDEOS Peptídeos de pequeno tamanho biologicamente ativos Oxitocina – estimula as contrações uterinas: 9 resíduos de aa Bradicinina – inibe a inflamação dos tecidos: 9 resíduos de aa Venenos extremamente tóxicos de cogumelos antibióticos B IO Q ÍMIC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 Aminoácidos, Peptídeos e Proteínas PEPTÍDEOS Polipeptídeos biologicamente ativos INSULINA: duas cadeias (30 e 21 resíduos) B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3 B IO Q ÍM IC A A G R O P ro fa . D ra . A n a C a ro li n a S il v a S iq u ie ro li /2 0 1 3
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