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Profa. Clarisse Beltrão Em humanos a síntese de um novo filamento de DNA ocorre na velocidade de 3.000 nucleotídeos por minuto. Em bactérias: 30.000 nucleotídeos por minuto. Média de apenas 1 erro por bilhão de nucleotídeo incorporado. Ocorre em etapas: (1) Iniciação; (2) Ampliação/Alongamento de Cadeia e (3) Término da cadeia. Quando Watson e Crick deduziram a estrutura em dupla hélice do DNA, eles reconheceram que a especificidade do seu pareamento podia fornecer o princípio fundamental para um mecanismo simples de duplicação do DNA. Em cromossomos bacterianos e virais geralmente há uma única origem por cromossomo a qual controla a replicação de todo cromossomo. Nos cromossomos dos eucariontes várias origens controlam coletivamente a replicação da molécula gigante de DNA presente em cada cromossomo. Cada origem controla a replicação de uma unidade de DNA denominada de réplicon. Em 1957 Arthur Kornberg realizou a primeira síntese in vitro de DNA em Escherichia coli. Ele isolou uma enzima (DNA-polimerase I) responsável por catalisar a adição covalente de nucleotídeos à cadeia de polinucleotídica preexistente. A enzima DNA polimerase requer: ◦ 5´trifosfatos de cada um dos 4 desoxirribonucleosídeo: dATP (desoxiadenosina- trifosfato), dTTP (desoxitimina-trifosfato), dGTP (desoxiguanina-trifosfato) e dCTP (desoxicitidina- trifosfato). ◦ Mg2+ ◦ DNA preexistente (molde). A DNA Polimerase não pode iniciar a síntese de novo. O Primer fornece a extremidade 3’-OH livre, na qual os nucleotídeos vão sendo adicionado durante a síntese de DNA. A DNA Polimerase I catalisa a formação da ligação fosfodiéster entre a 3’-OH do final do primer e o 5´- fosfato do desoxiribonucleotíd eo que chega. Fornece a sequência de nucleotídeos que especifica a sequência complementar da cadeia nascente de DNA. A DNA Polimerase Irequer um molde de DNA cuja sequência d ebase dite, por seu potencial pareamento de bases, a síntese de uma sequência de bases complementares no filamento a ser sintetizado. É um polipeptídeo único com peso molecular de 103.000 codificado pelo gene polA. De fato essa enzima não catalisa a replicação semiconservativa do cromossomo de E. coli, ela possui um papel principal na replicação do cromossomo e um papel central na reparação do DNA danificado. DNA-Polimerase I: Possui atividade polimerase 5’ 3’; exonuclease 5’ 3’ e exonuclease 3’ 5’. A principal função da DNA-Polimerase I em E. coli é reparar defeitos no DNA, tais como os induzidos por radiação UV. DNA-Polimerase II: também é uma enzima de reparo de DNA com atividades polimerase 5’ 3’; exonuclease 3’ 5’. DNA-Polimerase III (complexo enzimático formado de muitas subunidades diferentes) com atividades polimerase 5’ 3’; exonuclease 3’ 5’ e exonuclease 5’ 3’ apenas em DNA unifilamentar. É a verdadeira replicase. DNA-Polimerase IV e V exercem papel na replicação de DNA danificado. São sete das DNA-Polimerases (, β, γ, δ, ε, ζ, e η). Duas ou mais enzimas (, β e/ou ε) funcionam juntas para efetuar a replicação semiconservativa do DNA. A DNA-Polimerase γ é responsável pela replicação nas mitocôndrias. As DNA-Polimerase β, ζ e η são enzimas de reparo. As DNA-Polimerase γ, δ e ε exercem atividade de exonuclease de revisão 3’ 5’. A replicação do DNA é um processo complexo que requer a ação conjunta de um grande número de proteínas. Os dois filamentos de DNA nascentes estão sendo sintetizados em cada forquilha de replicação estão sendo ampliados na mesma direção em nível macromolecular ( 5’ 3’). O filamento molde de sentido 3’ 5’ é denominado filamento Leading, requer a função iniciadora apenas na origem de replicação. O filamento molde de sentido 5’ 3’ é denominado de filamento Lagging, requer a função iniciadora para cada fragmento de Okasaki. Vídeo DNA-Ligase: fechamento covalente de corte no DNA; está envolvida também no reparo e recombinação do DNA, juntamente com a DNA- Polimerase. DNA-primase: é uma RNA-Polimerase capaz de sintetizar moléculas de RNA a partir de um molde de DNA. A DNA-polimerase I retira o primer de RNA (usando sua atividade exonuclease 5’ 3’) e os substitui por DNA (usando a atividade polimerase 5’ 3’) e usando o fragmento de okasaki adjacente como primer. A DNA-helicase promove o desenrolamento da molécula de DNA e a Proteína SSB (proteína de ligação a DNA unifilamentar) as mantêm temporariamente desenrolada. A cada 3600 de giro 10,4 nucleotídeos ficam aptos a serem replicados. São enzimas que catalisam quebras temporárias em moléculas de DNA, usando ligações covalentes para as manterem clivadas. ◦ Topoisomerase I: Produzem quebras unifilamentares temporárias ou corte no DNA, removendo super-hélices, uma de cada vez. ◦ Topoisomerase II: Produzem quebras bifilamentares temporárias no DNA, removem e introduzem super-hélices, duas de cada vez. Replicação restrita à fase S. Múltiplas origens de replicação. Em cada forquilha de replicação existem 2 ou + polimerases diferentes. Deselicoidização requer a ação de uma DNA- topoisomerase e uma DNA-helicase. A proteína responsável por deixar o DNA distendido é a Proteína A de replicação (RP-A). A Polimerase é necessária p início da replicação nas origens e p/ introduzir os primers na fita descontínua. Ela se mantém num complexo estável com a DNA-primase. A Pol δ catalisa a maior parte da síntese de DNA. Ela interage com as proteínas PCNA e Rf-C para se tornar ativa. Os primers de RNA são removidos pela ribonuclease H1 e ribonuclease FEN-1. A Pol δ então preenche os espaço com nucleotídeos e a DNA-ligase faz as ligações covalentes. A Pol ε é necessária na replicação e no reparo. Vídeo 02 A DNA-polimerase não pode replicar o segmento terminal do filamento descontínuo da fita de DNA. O telômero possui uma estrutura única que facilita a sua replicação ou deve haver uma enzima que resolva este problema da replicação em uma das pontas da fita de DNA? Síndrome de Hutchinson-Gilford.
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