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Processamento Pós- Transcricional Eucariotos PrincipaisPrincipais etapasetapas envolvidasenvolvidas nana expressãoexpressão de um genede um gene Processamento de RNA • Transcritos primários • rRNA, tRNA e mRNA Transcrição e processamento: papel do CTD • O domínio C-terminal da PolII é extremamente maleável • Diversos fatores se aderem a ele durante a transcrição – Proteínas de processamento – Influência na própria transcrição Transcrição e processamento do mRNA Fosforilação da calda C-terminal e recrutamento dos complexos de processamento Processamento do mRNA eucarioto • hnRNA e hnRNP • Adição do CAP • Adição da cauda poli(A) • Metilação • Splicing: sequências consenso – Spliceossomo – Auto-splicing grupoI e grupoII ADIÇÃO DO 5ADIÇÃO DO 5´´CAP CAP Adição do quepe (ii) • O complexo de ligação ao quepe (CBC) é responsável pelo recrutamento de fatores de exportação nuclear. POLIADENILAÇÃO POLIADENILAÇÃO Adição da cauda Poli(A) ao pré-mRNA eucariótico SPLICING DE RNASPLICING DE RNA -- REMOÇÃO DE INTRONSREMOÇÃO DE INTRONS -- PROCESSAMENTO DA REGIÃO 5PROCESSAMENTO DA REGIÃO 5´´ DO mRNADO mRNA A palavra splicing • De acordo com o New Shorter Oxford English Dictionary – Splice (verb) – encadear (fragmentos de filme, fitas, etc.) pela união das extremidades. • Tradução no contexto da Biologia Molecular: – Encadeamento (dos éxons) • Donde se depreende a remoção dos íntrons Panorama geral do encadeamento O íntron consensual de eucariotos Mecanismo básico do encadeamento Tipos de encadeamento (splicing) Classe Abundância Mecanismo Maquinária Catalítica Pré-mRNA nuclear Comum, usado na maioria dos genes eucarióticos Duas reações de transesterificação a partir do sítio A Spliceossomo Introns grupo I Raro rRNA nuclear em alguns eucariotos genes de organelas e uns poucos genes procarióticos. Duas reações de transesterificação a partir do sitio G Mesmo que o grupo II Introns grupo II Raro; usado em alguns genes de organelas eucarióticas e procariotos O mesmo qu para os pré-mRNAs RNA codificado por introns (ribozimas) Em todos os casos, o protagonismo é das moléculas de RNAm. Perfil da junção do laço • As reações de encadeamento ocorrem por ataque nucleofílico e são catalisadas sem gasto de ATP Componentes do spliceossomoComponentes do spliceossomo grande partícula ribonucleoprotéica de 50-60S (tamanho equivalente ao de uma subunidade ribossômica) montagem em vários estágios: diversos complexos pré-splicing interações: RNA-RNA; RNA-proteína e proteína-proteína SpliceossomoSpliceossomo pequenos RNAs nucleares (snRNAs) complexados com proteínas específicas: snRNPssnRNPs (ou “snurps”) diversos fatores protéicos O íntron consensual de eucariotos As pequenas ribonucleoproteínas nucleares (snRNPs) As proteínas de U1 a U6 (não existe U3) formam o chamado complexo de encadeamento (spliceosome, em inglês). O encadeamento passo a passo IntronsIntrons do do grupogrupo I e II:I e II: se auto-removem a partir de um pré-mRNA que os contém Auto splicing (Auto splicing (self splicingself splicing)) • Introns do grupo I - rRNA nuclear de eucarioto inferior (T. termophila e P. polycephalum) • genes mitocondriais de fungos • genes do fago T4 (em 3 genes) • bactérias Introns do grupo II transcritos primários mitocondriais de fungos, algas e plantas Do ponto de vista evolucionário, esta é um dos mais importantes remanescentes do “mundo de RNA”. Encadeamento e variabilidade genética Splicing alternativo 24 exons Mecanismos de encadeamento diferencial Contribuem para o fenômeno sítios de encadeamento ligeiramente degenerados hnRNPs: ribonucleoproteínas nucleares heterogêneas. Transporte para O citoplasma Exportação de mRNAs Processamento do pré-rRNA bacteriano Processamento do pré-rRNA em vertebrados PROCESSAMENTO DE tRNA EM EUCARIOTOS E PROCARIOTOS RIBOZIMA RIBOZIMA -- RNA com atividade catalítica RNA com atividade catalítica 1.1. RibonucleaseRibonuclease PP (uma RNP): o RNA catalisa a clivagem do substrato (tRNA) enquanto a proteína desempenha uma função indireta (estrutural) 2. 2. VirusóidesVirusóides (pequenos RNAs de vegetais): catalisam uma reação intramolecular de auto-clivagem (engenharia genética: modificações criando “enzimas” para diferentes substratos) RNAi siRNA miRNA Outras classes de RNA Produzidos Pela RNA Pol II Processamento miRNA Outras modificações pós- transcricionais Editoração (“RNA Editing”)Editoração (“RNA Editing”) Mudança na informação genética em nível de mRNA 2 situações diferentes: - células de mamíferos: substituição de uma base - mRNAs mitocondriais de tripanossomas:mudanças mais amplas em transcritos de vários genes Adição ou deleção de bases: - muda fase de leitura - cria códons de iniciação - cria códons de terminação CDAR: C vira U ADAR: A vira I, que pareia com C Edição regulada de RNAms de metazoários Edição regulada de RNAms em tripanossomatídeos Um método simples de amplificar a variabilidade gênica em alvos bem definidos. TransTrans--splicingsplicing: 2 moléculas diferentes: Spliced Leader RNASpliced Leader RNA (RNA SL, 35 nt) mRNA mRNA tripanossomatídeos e alguns mRNAs de C. elegans (nematódeo) Partículas envolvidas: snRNPs: U2, U4 e U6 O mundo de RNA RNA mRNA ncRNA RNA não-codante. RNA transcrito tem papel estrutural, funcional ou catalítico rRNA RNA ribossomal Participa da síntese de proteínas tRNA RNA transportador Interface entre RNAm e aminoácidos snRNA RNA nuclear pequeno RNA que fazem parte do complexo de encadeamento snoRNA RNA nucleolar pequeno Encontrado no nucléolo e esta envolvido na modificação do RNAr miRNA micro-RNA Pequenos fragmentos de RNA que estão envolvidos na regulação da expressão gênica Outros RNAs maiores compondo a estrutura da cromatina e relacionados à modelagem alélica. siRNA Pequeno RNA interferente Silencia genes stRNA RNA temporário pequeno RNA com função de regulação do desenvolvimento biológico
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