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14/3/2013 1 marciliopeixoto@hotmail.com IM P O R T N C IA B IO M ÉD IC A IM P O R T N C IA B IO M ÉD IC A ESTRUTURA E CLASSIFICAÇÃO ESTRUTURA E CLASSIFICAÇÃO DAS PROTEÍNASDAS PROTEÍNAS NA NATUREZA: FORMA = FUNÇÃO N ÍV EI S D E ES TR U TU R A N ÍV EI S D E ES TR U TU R A PROTEÍNASPROTEÍNAS ES TA B IL IZ A Ç Ã O D A F O R M A ES TA B IL IZ A Ç Ã O D A F O R M A PROTEÍNASPROTEÍNAS Depende da(s): � Sua estrutura primária � Interações químicas resultantes entre as cadeias laterais dos aminoácidos � Modificações pós- traducionais � Condições do meio em que elas estão inseridas 14/3/2013 2  N G U LO S D A S LI G A Ç Õ ES P EP TÍ D IC A S  N G U LO S D A S LI G A Ç Õ ES P EP TÍ D IC A S PROTEÍNASPROTEÍNAS Ligações ω planares Ângulos torsionais  N G U LO S D A S LI G A Ç Õ ES P EP TÍ D IC A S  N G U LO S D A S LI G A Ç Õ ES P EP TÍ D IC A S PROTEÍNASPROTEÍNAS ES TR U TU R A S EC U N D Á R IA ES TR U TU R A S EC U N D Á R IA PROTEÍNASPROTEÍNAS • Descreve o arranjo espacial dos átomos na cadeia principal • Ocorre quando os ângulos diedros (phi e psi) permanecem quase iguais durante todo um segmento da proteína • Tipos – Hélices α – Conformações β – Alças e dobras – Indefinida (loops, coils, turns) ES TR U TU R A S EC U N D Á R IA ES TR U TU R A S EC U N D Á R IA ALFAALFA--HÉLICESHÉLICES • O arranjo mais simples que as proteínas podem assumir é um arranjo helicoidal • Esqueleto polipeptídico fica enrolado em torno de um eixo imaginário – Cada volta contém 3,6 resíduos – Φ = -57º; ψ = -47º • Grupos R se voltam para fora do eixo • Em média, 25% dos aminoácidos de qualquer proteína estão em hélices α 14/3/2013 3 ES TR U TU R A S EC U N D Á R IA ES TR U TU R A S EC U N D Á R IA ALFAALFA--HÉLICESHÉLICES REPRESENTAÇÃO GRÁFICA ES TR U TU R A S EC U N D Á R IA ES TR U TU R A S EC U N D Á R IA CONFORMAÇÃO CONFORMAÇÃO ββ • Esqueleto estendido em forma de zigue-zague • Folhas β paralelas e anti- paralelas – Paralela: Φ = -119º; ψ = 113º – Anti-par: Φ = -139º; ψ = 135º • Quanto as folhas são próximas, os grupos R devem ser pequenos ES TR U TU R A S EC U N D Á R IA ES TR U TU R A S EC U N D Á R IA CONFORMAÇÃO CONFORMAÇÃO ββ ES TR U TU R A S EC U N D Á R IA ES TR U TU R A S EC U N D Á R IA CONFORMAÇÃO CONFORMAÇÃO ββ REPRESENTAÇÃO GRÁFICA 14/3/2013 4 ES TR U TU R A S EC U N D Á R IA ES TR U TU R A S EC U N D Á R IA ALÇAS E DOBRASALÇAS E DOBRAS • A presença de resíduos em voltas ou alças invertem a direção da cadeia ES TR U TU R A T ER C IÁ R IA ES TR U TU R A T ER C IÁ R IA PROTEÍNASPROTEÍNAS ES TR U TU R A Q U A TE R N Á R IA ES TR U TU R A Q U A TE R N Á R IA PROTEÍNASPROTEÍNAS C LA SS IF IC A Ç Ã O C LA SS IF IC A Ç Ã O PROTEÍNAS FIBROSASPROTEÍNAS FIBROSAS 14/3/2013 5 C LA SS IF IC A Ç Ã O C LA SS IF IC A Ç Ã O PROTEÍNAS GLOBULARESPROTEÍNAS GLOBULARES M O TI V O S P R O TÉ IC O S M O TI V O S P R O TÉ IC O S CLASSIFICAÇÃO DAS CLASSIFICAÇÃO DAS PROTEÍNASPROTEÍNAS M O TI V O S P R O TÉ IC O S M O TI V O S P R O TÉ IC O S CLASSIFICAÇÃO DAS CLASSIFICAÇÃO DAS PROTEÍNASPROTEÍNAS M O TI V O S P R O TÉ IC O S M O TI V O S P R O TÉ IC O S CLASSIFICAÇÃO DAS CLASSIFICAÇÃO DAS PROTEÍNASPROTEÍNAS 14/3/2013 6 M O TI V O S P R O TÉ IC O S M O TI V O S P R O TÉ IC O S CLASSIFICAÇÃO DAS CLASSIFICAÇÃO DAS PROTEÍNASPROTEÍNAS D O B R A M EN TO D A S P R O TE ÍN A S D O B R A M EN TO D A S P R O TE ÍN A S �A conformação nativa de uma proteína é termodinamicamente favorecida �O dobramento é modular �Proteínas auxiliares ajudam o dobramento � Chaperons � Isomerase dos dissulfetos � Prolina isomerases P ER TU B A Ç Õ ES D A C O N FO R M A Ç Ã O P ER TU B A Ç Õ ES D A C O N FO R M A Ç Ã O � Doenças por príons � Talassemias
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