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Regulação em Eucariotos Resumo Regulação em Eucariotos • Procariotos: ajuste das células às mudanças nutricionais no ambiente, de forma que o seu crescimento e divisão sejam otimizados. • Eucariotos: regula um programa genético fundamental para o desenvolvimento embrionário e a diferenciação. Procariotos X Eucariotos Regulação em Eucariotos • Procariotos: molécula de DNA “mais disponível” para transcrição no nucleóide. • Eucariotos: a transcrição deve levar em consideração a compactação do DNA nos nucleossomos e as formas mais compactas da estrutura da cromatina. Procariotos X Eucariotos Regulação em Eucariotos Procariotos X Eucariotos mRNAs eucarióticos são monocistrônicos P A B C P P P A B C mRNAs bacterianos são policistrônicos! Cada gene com seu promotor específico sendo traduzido em uma proteína Um promotor específico para vários genes são traduzidos em várias proteínas Regulação em Eucariotos • Procariotos: genes freqüentemente controlados por uma única seqüência regulatória, tipicamente localizada próxima ao promotor. • Eucariotos: proteínas reguladoras (repressores e ativadores) atuam mesmo quando estão ligadas ao DNA a milhares de pares de nucleotídeos distantes do promotor. Procariotos X Eucariotos Regulação em Eucariotos: Promotores e elementos de controle Regulação em Eucariotos • Procariotos: uma RNA-polimerase, capaz de iniciar a transcrição sem o auxílio de proteínas adicionais. • Eucariotos: três tipos: RNA-polimerase I, RNA-polimerase II e RNA-polimerase III. Requerem a ajuda de um grande conjunto de proteínas chamadas fatores gerais de transcrição. Procariotos X Eucariotos Regulação em Eucariotos RNA-polimerases • RNA-polimerase I: maioria dos rRNA; • RNA-polimerase II: Pré mRNA, mais alguns genes que codificam pequenos RNAs (ex. “spliceosomes”); • RNA-polimerase III: tRNAs, rRNA 5S Regulação em Eucariotos Tipos da RNA- polimerase Regulação em Eucariotos Fatores de Transcrição • Os promotores isoladamente são geralmente ineficientes. • Os Fatores de Transcrição seletivos aumentam a atividade do promotor; • Em alguns casos, proteínas adicionais (mediadores, coativadores) também são requeridos para estimular a transcrição; Regulação em Eucariotos Fatores de Transcrição • Posicionam corretamente a RNA-polimerase no promotor; • Ajudam na separação das fitas de DNA para permitir o início da transcrição; • Liberam a RNA-polimerase do promotor quando a transcrição se inicia; Regulação em Eucariotos Etapas na formação do complexo de iniciação da transcrição em eucariotos Fatores de Transcrição Os fatores transcricionais seletivos aumentam a atividade do promotor • Os promotores isoladamente são geralmente ineficientes. Fatores de transcrição seletivos que se ligam à região “upstream” e a “enhancers” aumentam a iniciação. • Em alguns casos, proteínas adicionais (mediadores, coativadores) são requeridos para estimular a transcrição. • Proteínas que se ligam a seqüências de “enhancer” devem atuar de forma semehante àquelas que se ligam próximas ao promotor. O DNA entre o “enhancer” e o promotor forma uma alça para permitir que as proteínas ativadoras ligadas ao “enhancer” façam contato com as proteínas ligadas ao promotor. Complexo TBP-TFIIA-TFIIB-DNA Regulação na Transcrição • As proteínas reguladoras ou fatores de transcrição estimulam a transcrição e possuem dois domínios um de ligação ao DNA e outro de ativação transcricional. • As proteínas reguladoras são proteínas que ligam- se ao DNA reconhecendo regiões específicas, denominadas domínios ou motivos. Dentre estes domínios tem-se: 1. Hélice-giro-hélice 2. Dedo de zinco 3. Homeodomínio 4. Zíper de Leucina 5. Hélice alça hélice 1. Domínio Hélice-giro-hélice • Compreende cerca de 20 a m i n o á c i d o s e m d o i s segmentos curtos de α hélice. • Cada α hélice contém de sete a n o v e r e s í d u o s d e aminoácidos de comprimento e são separadas por uma volta β. • Um dos dois segmentos é c h a m a d o d e h é l i c e d e reconhecimento ou seja o mais próximo a carboxila liga-se ao DNA. Regulação na Transcrição 2. Domínio dedo de zinco • 30 res íduos de a m i n o á c i d o s formando uma alça mantida junta pela base por meio de um íon de Zn, que está coordenado a quatro resíduos de Cys e duas His. • V á r i a s c a d e i a s laterais hidrofóbicas n o n ú c l e o d a estrutura levam a estabilidade. • Os dedos de Zn ligam-se ao DNA • R e c e p t o r e s d e h o r m ô n i o s esteróides Fatores de Transcrição: eucariotos Hélice-giro-hélice Hélice-alça-hélice Regulação em Eucariotos Enhancer • Proteínas que se ligam a seqüências de “enhancer ” devem atuar de forma semelhante àquelas que se ligam próximas ao promotor. • O DNA entre o “enhancer” e o promotor forma uma alça para permitir que as proteínas ativadoras ligadas ao “enhancer” façam contato com as proteínas ligadas ao promotor; Regulação em Eucariotos: Fatores de Transcrição Regulação em Eucariotos: Combinação de Proteínas • A maioria das proteínas reguladoras de genes atuam como parte de um “comitê” de proteínas reguladoras, • Todas essenciais para a expressão de determinado gene na célula correta, sob determinadas condições, no tempo certo e no nível requerido; • O termo controle combinatorial refere-se a forma como grupos de proteínas trabalham juntas para determinar a expressão de um único gene. Uma Única Proteína Pode Coordenar a Expressão de Diferentes Genes • Embora o controle da expressão gênica em eucariotos seja combinatorial, o efeito de uma única proteína reguladora pode ser decisiva para ligar e desligar, simplesmente completando a combinaçção necessária para ativar ou reprimir um gene. • Um exemplo disso em humanos é o caso do receptor de glicocorticóide. Para se ligar aos sítos no DNA o receptor precisa formar um complexo com uma molécula de um hormônio esteróide (p.ex. cortisol). Em resposta aos hormônios glicocorticóides, as células do fígado aumentam a expressão de vários genes. Características principais que distinguem a regulação em eucariotos Mecanismos de repressão em eucariotos • Modelos para a mudança da cromatina 1. Modelo de competição prévia: • Histonas versus Fatores de transcrição • Se a cromatina estiver na forma de nucleossomo os fatores de transcrição e a RNA pol não podem se ligar • Se fatores de transcrição e a RNA pol se ligarem no promotor as histonas são excluídas Pontos de regulação DNA Nucleossomos Nucleossomos formando solenóides Um ‘loop’ Uma roseta (Seis ‘loops’) Uma cromátide Centrômero Cromossomo metafásico Nucleossomo • A transcrição de um gene eucariótico é fortemente reprimida quando o DNA está condensado dentro da cromatina na forma de nucleossomo. Modificações na Cromatina aumenta a acessibilidade ao DNA • A cromatina é remodelada pela acetilação e por deslocamentos nucleossomais. • Complexos enzimáticos são capazes de catalisar as alterações estruturais da cromatina durante a transcrição. • Estas enzimas acetilam e deacetilam as histonas básicas do nucleossomo, outras usam a química do ATP para remodelar os nucleossomos no DNA. Modificações na Cromatina aumenta a acessibilidade ao DNA Coativadores acetilam as histonas do nucleossomo Modificações na Cromatinaaumenta a acessibilidade ao DNA (a) Repressor dirige a deacetilação da histona na extremidade N terminal do nucleossomo inibindo a ligação dos fatores de transcrição reprimindo a expressão gênica. (b) O ativador dirige a hiperacetilação da histona na extremidade N terminal do nucleossomo facilitando o acesso dos fatores de transcrição requeridos para a ativação da expressão gênica. Repressão e ativação de muitos genes em eucariotos superiores ocorre de modo similar. Modificações na Cromatina aumenta a acessibilidade ao DNA • Expressão gênica também esta associada à metilação • Metilação nas proximidades do promotor principalmente na citosina reprime a transcrição • A metilação do DNA está associada ao silenciamento gênico em mamíferos • Uma minoria dos sítios é metilado nos tecidos em que o gene não é expresso, mas genes ativos nunca estão metilados. • Exemplo de metilação: Inativação do cromossomo X em mamíferos Características principais da regulação gênica transcricional em eucariotos • Restrição ao acesso dos promotores eucarióticos pela estrutura da cromatina e a ativação da transcrição é associada com alterações múltiplas na estrutura da cromatina na região transcrita. • Predominância dos elementos regulatórios positivos. Todo gene eucariótico requer ativação para ser transcrito. • As proteínas regulatórias são multiméricas, grandes e complexas. • A transcrição no núcleo eucariótico está separada tanto no espaço, quanto no tempo da tradução no citoplasma. Controle da expressão gênica pós transcricional ou no processamento do pré mRNA mensageiro Regulação em Eucariotos: Processamento pré mRNA Processamento Alternativo • Um mesmo gene pode originar diferentes produtos pelo processamento alternativo (Alternative splicing) ou recomposição alternativa dos transcritos gênicos primários ou seja um único gene codifica polipeptídeos diferentes Processamento Alternativo
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