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REPLICAÇÃO DO DNA Prof. Dr. Joanilson Guimarães Estrutura do DNA Descreve a Replicação � O DNA funciona como uma molécula de informação da vida. � A estrutura da molécula da indícios da sua função biológica. � As fitas de DNA estão pareadas em orientações opostas. � Cada fita complementar serve de molde para a síntese de uma nova fita. � A informação de uma fita prediz a informação da outra fita. Estrutura do DNA Etapas da Replicação do DNA � Iniciação da cadeia � Ampliação ou alongamento da cadeia � Termino da cadeia Replicação Semiconservativa Replicação semiconservativa da molécula do DNA � Cada filamento parental pode dirigir a síntese de um novo filamento complementar devido a exigência de pareamento específico. � Cada filamento parental funciona como um molde, um único filamento parental especifica a sequencia de nucleotídeos do novo filamento complementar � Cada molécula nova de DNA sintetizada conserva um filamento complementar da dupla hélice parental (semiconservativa) Síntese do DNA tem Inicio nas Origens de Replicação � A replicação do DNA tem inicio em SÍTIO específico denominado de origem (OR) � O sitio de origem geralmente são caracterizados por uma sequencia específica de nucleotídeos � Os sítios de origem da replicação são compostos por sequencia de DNA que atraem as proteínas iniciadoras. � São segmentos fáceis de separar formado principalmente por A-T. Forquilha de Replicação � Local onde dupla hélice de DNA se abre (despirilização). � A formação da forquilha de replicação ocorre através da quebra das pontes de hidrogênio entre os nucleotídeos. � Duas forquilhas de replicação são formadas a partir do ponto de origem e se movimentam em direções opostas. � A replicação do DNA nos eucariotos é bidirecional. Proteínas que se Associam na Forquilha de Replicação Helicase (DNA Helicase) � Enzima que promove a abertura da hélice de DNA, separando as duas fitas simples para que possa ocorre a replicação do DNA. � Age através da quebra das pontes de hidrogênio entre as bases purinas e pirimidinas em ambas as cadeias de DNA. � A hilicase move-se ao longo da fita de DNA utilizando a energia da hidrolise do ATP Proteínas que se Associam na Forquilha de Replicação Proteínas ligadoras de DNA de fita simples (SSB) � Proteínas desestabilizadoras da hélice � Ligação cooperativa � Auxiliam as helicases estabilizando a conformação abertas Proteínas que se Associam na Forquilha de Replicação Topoisomerase Impedem que o DNA se Emaranhe na Replicação � A topoisomerase é uma nuclease reversível que adiciona covalentemente um fosfato no DNA, quebrando a ligação fosfodiéster que os nucleotídeos adjacentes � Topoisomerase I – provoca quebra transitória de fita simples. � Topoisomerase II – provoca quebra transitória de fitas duplas. Topoisomerase Impedem que o DNA se Emaranhe na Replicação � Topoisomerase I – produzem quebras unifilamentares temporária. � A quebra unifilamentar transitória fornecem um eixo de rotação permitindo que os segmentos de DNA girem de maneira independente � A topoisomerase I é energeticamente eficiente pois conservam a energia das ligações fosfodiéster clivadas estocando-a em ligações covalente que pode ser usada para ressoldar as quebras. Topoisomerase Impedem que o DNA se Emaranhe na Replicação Topoisomerase Impedem que o DNA se Emaranhe na Replicação � Topoisomerase II – induzem quebras bifilamentares transitórias removendo super- hélices positivas (duas de cada vez) por mecanismo dependente de ATP. � A topoisomerase é ativado em sítios onde as duplas hélices se cruzam 1 - a topoisomerase se liga ao sitio de cruzamento das hélices, 2 - quebra uma dupla hélice reversivelmente criando uma “porta” no DNA, 3 - A segunda dupla hélice mais próxima passa através dessa abertura, 4 – e liga a quebra dissocia-dissociando-se do DNA Topoisomerase Impedem que o DNA se Emaranhe na Replicação Abertura da Dupla Hélice de DNA na Forquilha de Replicação DNA Polimerase � São enzimas que auxiliam a síntese de qualquer fita nova de DNA através da polimerização (adição de novos nucleotídeos), sendo os novos filamentos produzidos no sentido 5´→ 3´. � A enzima polimerase só entra em ação na presença de Mg e uma fita molde de DNA. DNA Polimerase DNA Polimerase Atividade Polimerase � A polimerização ocorre no sentido 5’→3’, � A polimerase catalisa ligação de cada desoxirribonucleosideo através do grupo fosfato 5’ ao grupamento 3’ hidroxi livre no mononucleotídeo precedente na cadeia do DNA, formando uma ligação fosfodiéster 5’-3’. � O pirofosfato (Ppi) liberado após formação da ligação fosfodiéster é hidrolisado em duas moléculas fosfato inorgânico. FITA MOLDE dATP, dGTP, dCTP, dTTP Mg DNA Polimerase Pequenos Segmentos de RNA Atuam Como Iniciadores da Síntese do DNA � A polimerase não possui a capacidade por si só de iniciar a síntese de uma cadeia de DNA � A polimerase somente promove o alongamento de uma cadeia pré-existente � DNA Primase – enzima responsável pela síntese de um segmento curto de RNA a partir da fita do DNA molde � RNA Prime - segmento de RNA com cerca de 10 nucleotídeos o qual estabelece pareamento com a fita molde fornecendo a extremidade 3’-pareada como ponto de inicio para ação da DNA polimerase. Replicação da Fita de DNA é Bidirecional � O crescimento da cadeia copiada ocorre simultaneamente em sentidos opostos a partir do ponto de origem na forquilha de replicação � Fita 5’− 3’ (Forquilha assimétrica) � Fita 3’− 5’ � A DNA polimerase pode apenas catalisar o crescimento da cadeia em apenas uma direção, a adição de novas subunidades ocorre somente na extremidade de 3’ da cadeia � A síntese do DNA só pode ocorre na direção 5’→ 3’ Polimerização da Fita Complementar, Fragmentos de Okazaki � Fragmentos de Okazaki � Fragmentos de DNA de 100 a 200 nucleotídeos Sintetizados na fita de sentido 5’→ 3’ �O prime é colocado algumas centenas de nucleotídeos adiante, permitindo que a 3’OH, esteja disponível para a polimerase �A fita 5’→ 3’ (lagging) apresenta uma replicação descontinua, através da síntese dos fragmentos de Okazaki. � A fita 3’→ 5’ (leading) apresenta uma replicação continua Polimerização da Fita Complementar, Fragmentos de Okazaki Reparação do DNA – Revisão Da Cadeia Nascente � A fidelidade da duplicação do DNA apresenta um erro a cada 1 bilhão de pares de bases sintetizadas. � A não correção dos erros leva a uma tendência do acúmulos desses nas células ocasionando mutações e perda da funcionalidade. � A maioria das lesões no DNA podem ser diretamente corrigidas com intervenção de sistemas enzimáticos intracelulares que atuam numa sequencia interventiva de excisão- reparação (REVISÃO DA CADEIA NASCENTE). � Desde que uma cadeia continue intacta, a cadeia lesionada pode ser completamente reparada. Reparação do DNA (proof-reading) 1. Intervenção de endonucleases nas alterações reconhecidas removendo-as por hidrolise. 2. Atuação de exonucleases, removendo os dímeros anormais por atividade catalítica (POLIMERASE I). Atividade polimerase 5’→3’, Atividade exonuclease 3’→5’ 3. A polimerase I recopia o segmento de forma correta. 4. Preenche o espaço da excisão com desoxirobonucleótideos trifosfatos a partir da extremidade 3’OH livre. 5. A DNA Ligase conclui a reparação da cadeia lesada. Reparação do DNA (proof-reading)
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