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Noções de Biologia Molecular 2 Considerações gerais Os nucleotídeos participam do metabolismo celular Ácidos Nucléicos fornecem roteiro para todos os eventos realizados numa célula. São as moléculas com função de armazenamento e expressão da informação genética. Existem 2 tipos de ácidos nucléicos: O Ácido Desoxirribonucléico - DNA O Ácido Ribonucléico - RNA Ac. Nucléicos são macromoléculas formadas pela ligação tipo fosfodiéster entre cinco nucleotídeos diferentes. 3 OS ÁCIDOS NUCLÉICOS – DNA e RNA ÁCIDO DESOXIRRIBONUCLÉICO E ÁCIDO RIBONUCLÉICO James Watson e Francis Crick FUNÇÕES DO DNA - É o principal constituinte dos cromossomos; FUNÇÕES DO RNA - Participa da síntese das proteínas. NUCLEOTÍDEOS NUCLEOTÍDEOS NUCLEOTÍDEOS - Constituem os genes; - Responsáveis pelas características dos indivíduos - Formado a partir do DNA; FOSFATO PENTOSE Desexirribose BASE NITROGENADA ADENINA GUANINA CITOSINA TIMINA PÚRICAS PIRIMÍDICAS 1 23 4 5 3 5 3 5 3 5 3 5 3 5 5 3 5NUCLEOTÍDEOS 5 3 3 4 NUCLEOTÍDIOS E AC. NUCLÉICOS Nucleotídeos São as unidades fundamentais dos ácidos nucléicos. Ligam-se uns aos outros através de ligações fosfodiéster, formando cadeias longas com milhões de resíduos de comprimento. Participam da estrutura dos ácidos nucléicos. Atuam como componentes na estrutura de coenzimas importantes no metabolismo oxidativo da célula. Agem como forma de energia química - ATP. Funcionam ainda como ativadores e inibidores importantes em várias vias do metabolismo intermediário da célula. 5 NUCLEOTÍDIOS E AC. NUCLÉICOS Estrutura dos Nucleotídeos As bases nitrogenadas Púricas: Adenina e Guanina Pertencem a 2 famílias Pirimídicas: Citosina, Timina Uracila Tanto DNA como RNA possuem = bases púricas, e a citosina. A timina existe apenas no DNA, e no RNA, uracila. Em alguns tipos de DNA virais e no RNAt podem aparecer bases incomuns. As propriedades das bases afetam a estrutura dos ácidos nucléicos. { 6 NUCLEOTÍDIOS E AC. NUCLÉICOS DNA • A demonstração de que o DNA continha a informação genética foi feita pela primeira vez em 1944. (mostraram que o tipo de cápsula de um pneumococo específico poderia ser transmitido para outro por meio da introdução de DNA purificado.) • Observou-se que a quantidade de nucleotídeos de desoxiadenosina A = a de nucleotídeos de timina T, assim como G=C. •Watson, Crick e Wilkins propuseram no início dos anos de 1950, um modelo de fita dupla da molécula de DNA. 7 NUCLEOTÍDIOS E AC. NUCLÉICOS DNA Estrutura A Dupla Hélice: • Há um pareamento de bases entre as fitas da molécula do DNA. Assim, temos sempre pareadas: - Adenina com Timina A-T - Citosina com Guanina C-G As bases se mantém pareadas por pontes de hidrogênio, 2 entre "A" e "T" e 3 entre "C" e "G". As fitas do DNA podem ser separadas sob certas condições experimentais, s/ rompimento das ligações fosfodiéster, e a dupla hélice pode ser desnaturada em um processo controlado e dependente de temperatura. 8 NUCLEOTÍDIOS E AC. NUCLÉICOS RNA Atua como uma espécie de "cópia de trabalho", criada a partir do molde de DNA e utilizada na expressão da informação genética. A síntese de uma molécula de RNA a partir de um molde de DNA chama-se "TRANSCRIÇÃO”. Nesta transcrição, modificações podem ocorrer sobre a molécula de RNA transcrita, convertendo-a de uma cópia fiel em uma cópia funcional do DNA. 9 NUCLEOTÍDIOS E AC. NUCLÉICOS RNA Estrutura Em relação ao DNA, 4 diferenças são importantes: O RNA possui uracila no lugar da timina na seqüência de bases. A pentose do RNA é a ribose. O RNA é formado por uma fita única, c/ eventual pareamento de bases intracadeia. A molécula do RNA é muito menor que a do DNA. 10 O Dogma Central da Biologia Molecular: Ligação fosfodiéster O grupo fosfato liga o carbono 3’ do açúcar de um nucleotídeo ao carbono 5’ do açúcar do carbono seguinte Devido a esta formação a cadeia de DNA fica com uma direção determinada, isto é, em uma extremidade temos livre a hidroxila do carbono 5’ da primeira pentose e na outra temos livre a hidroxila do carbono 3’ da última pentose. Isto determina que o crescimento do DNA se faça na direção de 5'para 3'. DNA É constituído de duas cadeias de nucleotídeos que se enrolam originando a dupla hélice Modo antiparalelo: enquanto uma vai para a direção 5’ para 3’, a outra corre na direção oposta 3’ para 5’ Pontes de hidrogênio A=T e CG DNA Replicação do DNA é semiconservativa. As fitas do DNA se abrem e servem como molde para a síntese se novas fitas de DNA, formando novamente uma dupla hélice idêntica a original. cada dupla hélice filha contém um filamento antigo e outro recém-sintetizado. Replicação do DNA a dupla-hélice de DNA é geralmente muito estável. O processo de replicação inicia com proteínas que se ligam ao DNA e promovem a abertura das fitas quebrando as pontes de hidrogênio entre as bases. Separação de um pequeno segmento de DNA com poucos pares de base por vez não requer uma grande quantidade de energia. Segmento de DNA ricos em pares de base T-A é relativamente mais fácil de ser separado sendo geralmente encontrados nas origens de replicação. Replicação do DNA • Junção iniciador: molde • O molde: fornece o DNA que irá orientar a adição de cada desoxinucleotídeo complementar • O iniciador: é um segmento curto complementar ao molde – deve possuir um grupo 3’-OH adjacente exposto para a fita simples do molde P P Diagrama do mecanismo de síntese do DNA Replicação do DNA No processo de duplicação do DNA as ligações de hidrogênio entre as bases se rompem e as duas cadeias começam a se separar, formando a FORQUILHA DE REPLICAÇÃO. A enzima responsável pela formação dessa forquilha é uma HELICASE. A enzima DNA POLIMERASE adiciona nucleotídeos à nova fita sempre no sentido 5’ 3’. Fita líder-como o DNA é sintetizado apenas pelo alongamento da extremidade 3’ apenas um dos moldes pode ser sintetizado de forma contínua Fita tardia- esse molde faz com que a DNA polimerase se desloque em direção oposta à forquilha de replicação – sintetizada de maneira descontínua Os pequenos fragmentos de DNA recém sintetizados formados na fita tardia - fragmentos de Okasaki. Após a sua síntese – os fragmentos de Okasaki são ligados covalentemente, produzindo uma nova fita de DNA contínua e intacta São intermediários e temporários na replicação do DNA Replicação do DNA Replicação do DNA Forquilha da replicação direção geral da replicação do DNA DNA- iniciador Fita líder Fita tardia DNA-helicases DNA- polimerases DNA-helicases – catalisa a separação das duas fitas de DNA Essas enzimas se ligam ao ssDNA e se deslocam unidirecionalmente, utilizando a energia de hidrólise de nucleosídeos trifosfatos Topoisomerases: Quando a DNA-helicase divide as duas fitas gera supertorções As supertorções são removidas pela topoisomerase – essas enzimas provocam a quebra de uma das duas fitas de DNA, e permanecem ligadas ao DNA Essa ação alivia o acúmulo de supertorções Replicação do DNA A primase é uma RNA-polimerase especializada em sintetizar pequenos iniciadores de RNA (5 a 10 nucleotídeos) sobre um molde de DNA. Esses iniciadores são estendidos pela DNA-polimerase que iniciam a síntese a partir desse iniciadorde RNA Cada fita líder necessita de apenas único iniciador de RNA, ao contrário da fita tardia que apresenta uma síntese descontínua e requer a síntese de um novo iniciador para cada fragmento de Okasaki Replicação do DNA Os iniciadores de RNA devem ser removidos para finalizar a replicação do DNA e substituídos dor DNA RNAseH - reconhece e remove a maior parte de cada iniciador de RNA A remoção do RNA iniciador deixa uma lacuna na molécula de DNA de fita dupla – uma junção iniciador: molde que é o substrato ideal para a DNA-polimerase. A DNA-polimerase preenche essa lacuna através do pareamento de cada nucleotídeo – deixando uma molécula de DNA completa, exceto por uma quebra no esqueleto Essa quebra é repara por uma enzima chamada: DNA-ligase Replicação do DNA Replicação do DNA As DNA-polimerases: ◦ DNA Pol I – é especializada na remoção dos iniciadores de RNA utilizados na síntese de DNA. Não apresenta alta processividade, porque adiciona apenas apenas de 20 a 100 nucleotídeos por evento de ligação. ◦ DNA Pol III – é altamente processiva. É a principal enzima envolvida na replicação do DNA Replicação do DNA Transcrição do DNA O processo de transcrição ocorre no núcleo e produz um RNA complementar a uma fita de DNA. O processo de transcrição inicia com a abertura e desespiralização de uma pequena porção da dupla-hélice do DNA. No processo de síntese de RNA, a molécula de DNA se abre e ribonucleotídeos livres começam a se emparelhar em torno de apenas uma das fitas, resultando em uma sequência de nucleotídeos complementar a fita de DNA molde. Os ribonucleotídeos, colocados na seqüência 5’ 3’, vão se ligando uns aos outros sob comando da enzima RNA POLIMERASE para formar o RNA. Uma vez concluído o processo, o RNA se desprende do DNA e este se recompõe. Transcrição O promotor é a sequencia de DNA à qual a RNA-polimerase é inicialmente ligada. ◦ Fatores gerais de transcrição atuam se ligam ao promotor onde posicionam a RNA polimerase. Ocorre a adição de um grupo fosfatona “cauda” da RNA polimerase, essa fosforilação permite o início da transcrição. A enzima além de catalisar a síntese do RNA ela também desenrola o DNA à sua frente e o recompõe atrás de si Após a transcrição de todos a extensão do gene pela polimerase ela precisa parar e liberar o RNA produzido RNA polimerase •Transcreve RNA a partir do DNA •Atuam somente na presença de DNA, que servem de molde para a síntese de cadeias de RNA de fita simples •Somente uma das fitas é utilizada como fita molde para a síntese de RNA •A síntese de RNA sempre ocorre em direção fixa, inicia na extremidade 5’ e com término na extremidade 3’ RNA mensageiro Exons- regiões com informações codificantes Íntrons- regiões que não tem função codificante, portanto não aparecem representadas na proteína Carrega a mensagem para o citoplasma, onde liga-se aos ribossomos de acordo com uma seqüencia de códons DNA Códon – todos os aminoácidos nas proteínas são codificados por uma combinação de três bases do DNA. Triptofano e metionina são codificados por um único códon. Principais Tipos de RNA RNA mensageiro (mRNA): contém a informação genética para a sequência de aminoácidos das proteínas. É formado no núcleo e contém a “mensagem” - o código transcrito a partir do DNA - para a síntese das proteínas. Cada conjunto de três nucleotídeos no RNAm é chamado de CÓDON. Os códons relacionam-se com os 20 tipos de aminoácidos. RNA transportador (tRNA): Está presente no citoplasma e é responsável pelo transporte dos aminoácidos até os ribossomos para a síntese protéica. No RNAt existe uma seqüência de nucleotídeos correspondente ao códon chamada de ANTI-CÓDON. RNA ribossômico (rRNA): Faz parte da estrutura dos ribossomos e participa do processo de tradução dos códons para construção das proteínas. Síntese de proteínas O aminoácido é ligado ao seu correspondente RNAt pela ação da enzima aminoacil-RNAt sintetase. A célula possui 20 aminoacil-RNAt sintetases diferentes. As ligações peptídicas ocorrem dentro do ribossoma. Translocação Obrigada!
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