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* REGULAÇÃO DA EXPRESSÃO GÊNICA * PRINCIPAIS PERGUNTAS Como os eucariotos possuem diferentes padrões de expressão de genes possuindo um número limitado de proteína reguladoras? Qual o papel da cromatina na regulação gênica? Quais são os marcadores epigenéticos e como eles influenciam a expressão dos genes? * VISÃO DA REGULAÇÃO TRANSCRICIONAL Figure 11-2 O mecanismo nos procariotos está sempre ligado a menos que uma proteína repressora bloqueie a transcrição. Nos eucariotos os nucleossomos bloqueiam a transcrição, a menos que uma proteína reguladora esteja presente. Esta proteína altera o nculeossomo na posição ou densidade. Elas também podem recrutar a RNA polimerase II diretamente pela ligação. * Regulação Gênica Os genes que produzem proteínas são chamados genes estruturais; Nos eucariontes estes genes são transcritos individualmente; Nos procariotos os genes são transcritos lado a lado ao longo de uma fita simples (denominados operons) para que eles sejam transcritos juntos; Os operons contêm geralmente genes com funções relacionadas; O operon é transcrito como uma única unidade, produzindo um mRNA policistrônico; Quando este mRNA policistrônico é traduzido produz, quase que simultaneamente, diferentes proteínas; O termo cístron é igual a gene; Os genes estruturais dos eucariontes produzem apenas mRNAs monocistrônicos. * Como a Holoenzima RNA polimerase reconhece a fita certa de DNA e inicia a síntese de RNA no início de um gene (ou operon)? Obs.: Holoenzima: complexo cataliticamente ativo de enzima e cofator. A RNA polimerase liga-se aos locais de iniciação por meio de sequencias conhecidas como promotores, reconhecidas pelo fator σ correspondente; A existência de promotores foi inicialmente identificada através de mutações que aumentavam ou diminuíam as taxas de transcrição de certos genes; Promotores são sequencias de ~ 40pb localizadas na extremidade 5´do local de início da transcrição; Por convenção a sequencia do promotor é representada pela fita senso (não-molde), que possui a mesma sequencia e orientação que o RNA transcrito; posterior= downstream anterior= upstream * * Promotores de procariotos * Operons As bactérias contêm enzimas constitutivas e induzidas; Enzimas constitutivas estão em quantidades constantes nas bactérias, independem do estado metabólico do organismo; Enzimas indutivas variam sua concentração na bactéria. Elas normalmente estão presentes em quantidade mínimas, mas elas podem aumentar mais de mil vezes caso o seu substrato esteja presente no meio. Particularmente quando o seu substrato for a única fonte de carbono da célula; Nestas condições, as enzimas indutivas podem ser necessárias para transportar o substrato para dentro da célula e convertê-lo num metabólito que possa ser usado; Um exemplo é a β-galatosidase, que catalisa hidrólise da lactose produzindo D-glicose e D-galactose, primeira etapa na utilização da lactose. * Hidrólise da lactose * Lac operon Normalmente a E. coli não utiliza lactose se a glicose for disponível, pois cada célula possui cerca de 5 cópias de β-galatosidase; Mas se as bactérias forem colocadas em um meio com lactose como única fonte de energia e carbono (sem a presença de glicose), em 1 ou 2 minutos elas começam a produzir β-galatosidase em grandes quantidades, cerca de 1.000 cópias por célula; Portanto a indução de β-galatosidase hidrolisa a lactose e produz D-glicose e D-galactose que podem ser usadas como fonte de combustível e de carbono; Mas se as bactérias forem transferidas para um meio fresco contendo glicose (sem lactose) a síntese de β-galatosidase é interrompida; Portanto a indução enzimatica é econômica, enzimas induzidas são produzidas apenas quando necessárias; O agente capaz de induzir enzimas é denominado agente indutor. * Lac operon Quando a lactose é inserida no meio existe a produção de 3 enzimas em grande quantidade: a β-galatosidase, a β-galactosídeo permease e a proteína A codifica uma tiogalactosídeo transacetilase; A permease é uma proteína de membrana que promove o transporte do β-galactosídeos do meio para a bactéria; A função da proteína A não é totalmente conhecida; Quando um grupo de proteínas ou enzimas relacionadas for induzido por um único agente indutor, o processo é conhecido como indução coordenada; Esta capacidade possibilita a bactéria adaptar-se rápida e economicamente ao uso de muitos nutrientes, possivelmente diferentes, que se tornem disponíveis ao seu ambiente. * Os 3 genes estruturais lac, z, y e a são adjacentes entre si. Eles estão precedido de dois sítios controladores p (promotor) e o (operador). O Gene regulador í codifica a proteína repressora. * Lac operon in E. coli - lactose ausente Proteína indutora O Gene regulador í codifica a proteína repressora. A proteína repressora possui dois sítios de ligação, um para o operador e outro para o indutor. A forma ativa da proteína repressora se liga ao operador Inibindo a RNA polimerase de se ligar ao operador e a transcrever os genes z, y e a. * Lac operon in E. coli lactose presente Porém quando existe lactose, mas não existe glicose, a lactose (na verdade o seu isômero alolactose) se liga a proteína repressora e convertendo-a numa forma inativa que não se liga ao operador. A RNA polimerase pode se ligar ao sítio p e começar a transcrição dos 3 genes estruturais. E a tradução será feita no ribossomo citoplasmático.
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