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05/09/2017 1 EnzimasEnzimas Introdução Introdução –– enzimasenzimas • Definição: são um grupo de substâncias orgânicas de natureza normalmente protéica com atividade intra ou extracelular que têm funções catalisadoras, catalisando reações químicas que, sem a sua presença, dificilmente aconteceriam. • Proteínas mais notáveis e altamente especializadas; • Catalisadores das reações em sist. Biológicos; • Alto grau de especificidade pelos seus substratos; • Aceleram reações químicas específicas; • Funcionam em condições muito suaves de temp. e pH. Importância da Importância da enzimologiaenzimologia Medicina: Estudo de desordens metabólicas (excesso, deficiência ou ausência); Medição da atividade de enzimas plasmáticas > diagnóstico e monitoramento; Indústria química: Importantes ferramentas práticas; Processamento de alimentos; Agricultura; Dia-a-dia Preparo de alimentos; Limpeza doméstica. 05/09/2017 2 EnzimologiaEnzimologia Histórico: Catálise biológica >> final dos anos 1700; Digestão de carne (sec. Estômago); Amido> açúcar Louis Pasteur – “fermentos inseparáveis” Frederick W. Kuhne – “enzimas” 1926 >> James Sumner cristalizou a urease> avanço >> propriedades físicas e químicas das enzimas; Século XX >> caracterização das enzimas do metabolismo celular; A maioria das enzimas são proteínasA maioria das enzimas são proteínas Exceção: moléculas de RNA com propriedades catalíticas TODAS as enzimas são proteínas; Atividade catalítica depende de sua conformação nativa; A atividade se perde se ocorrer desnaturação ou dissociação de suas subunidades; Estruturas primárias, secundárias, terciárias Estruturas primárias, secundárias, terciárias e quaternárias e quaternárias são essenciais são essenciais para o para o exercício da sua atividade catalítica.exercício da sua atividade catalítica. FeedbackFeedback –– est. tridimensionalest. tridimensional 05/09/2017 3 A maioria das enzimas são proteínasA maioria das enzimas são proteínas Características estruturais Peso entre 12.000 até mais de 1 milhão Kda; Algumas requerem cofatores >> componentes químicos necessários para serem ativas: Cofatores > (um ou mais íons inorgânicos) Coenzimas > (moléculas orgânicas complexas) Grupos prostéticos Holoenzima Apoenzima ou apoproteína 05/09/2017 4 As enzimas são classificadas pelas reações As enzimas são classificadas pelas reações que catalisamque catalisam Palavra ou frase que descreve sua atividade + Sufixo “ase” Nome do seu substrato + sufixo “ase” As enzimas são classificadas pelas reações As enzimas são classificadas pelas reações que catalisamque catalisam Classificação enzimática internacional (número) E.C. 2.7.1.1 Onde: primeiro dígito (2) classe (transferase) segundo dígito (7) subclasse (fosfotransferase) terceiro dígito (1) fosfotranferases OH como receptor quarto dígito (1) D-glicose como receptor do fosfato 05/09/2017 5 Como as enzimas trabalham?Como as enzimas trabalham? Reações químicas não catalizadas tendem a ser lentas Moléculas são estáveis em ambiente aquoso (pH neutro e temp. moderada) Reações bioquímicas improváveis >> intermediários com carga, instáveis Sítio ativo Como as enzimas trabalham?Como as enzimas trabalham? As enzimas As enzimas nãonão afetam o afetam o equilíbrio químico equilíbrio químico das reações, mas sim a das reações, mas sim a velocidadevelocidade com a com a qual elas ocorremqual elas ocorrem 05/09/2017 6 Força catalítica e especificidadeForça catalítica e especificidade Características gerais dos complexos ES Aumento da velocidade de 5 a 17 ordens de magnitude; Muitos específicas, discriminam bem os substratos com estruturas similares; De onde vem toda essa energia??? Modelo chave-fechadura, Fisher (1894) Noção moderna de catálise enzimática Linnus pauling (1946) 05/09/2017 7 Forças catalíticas e especificidadeForças catalíticas e especificidade Príncipios básicos Reações químicas ES >> grupos do S e cadeias laterais de aa, íons metálicos e coenzimas >> abaixam a energia de ativação Tipos comuns de catálises enzimáticas Interações fracas, não-covalentes >> ES Formação de um complexo ES específico Força que estabiliza as estruturas protéicas >> ligações de H e interações hidrofóbicas iônicas e de van der Waals Energia de ligação >>> complexo ES Forças catalíticas e especificidadeForças catalíticas e especificidade Príncipios básicos Reações químicas ES >> grupos do S e cadeias laterais de aa, íons metálicos e coenzimas >> abaixam a energia de ativação Tipos comuns de catálises enzimáticas Interações fracas, não-covalentes >> ES Formação de um complexo ES específico Força que estabiliza as estruturas protéicas >> ligações de H e interações hidrofóbicas iônicas e de van der Waals Energia de ligação >>> complexo ES AA energia de ligação energia de ligação é aé a maior fonte de maior fonte de energia livre energia livre usada pelas enzimas para usada pelas enzimas para baixar abaixar a energia de ativação energia de ativação das reações.das reações. Forças catalíticas e especificidadeForças catalíticas e especificidade 05/09/2017 8 Cinética e regulaçãoCinética e regulação enzimáticaenzimática JailtonJailton AzevedoAzevedo Doutor em Ciências - Biotecnologia em saúde - FIOCRUZ IntroduçãoIntrodução • Definição: área do conhecimento que determina a velocidade da reação enzimática e como ela se modifica em resposta aos parâmetros experimentais; Velocidade que o S é convertido em P de acordo com o tempo Concentração do substrato Concentração do substrato versusversus velocidadevelocidade Medida de eficiência da catálise de uma E 05/09/2017 9 Eq. Eq. MichaelisMichaelis--MentenMenten Medida de eficiência da catálise de uma E O comportamento cinético de uma enzima se baseia na [ES] Inibição reversível e irreversívelInibição reversível e irreversível Moléculas que interferem com a catálise, diminuindo ou interrompendo-a; [ E ]>> processos celulares >> [ I ] importantes agentes farmacêuticos; Estudo da inibição traz informações valiosas nas vias metabólicas Inibe a [E] na primeira etapa na síntese das prostaglandinas >>> DOR Inibição reversívelInibição reversível Competitiva: Concorre com o substrato pelo sítio ativo da enzima e, em geral a reação não ocorre enquanto o inibidor estiver ligado à enzima. Estrutura similar ao [S] Durante o tempo que o inibidor está ligado à enzima, ele impede a ligação do substrato Exemplo: Indivíduos que ingeriram metanol – DSH > formaldeído, adm. de álcool. 05/09/2017 10 Exemplo: Indivíduos que ingeriram metanol – DSH > formaldeído, adm. de álcool. Inibição reversívelInibição reversível Inibição reversívelInibição reversível Incompetitiva Liga-se em um sítio distinto do sítio ativo do substrato, ligando-se apenas ao complexo ES 05/09/2017 11 Inibição reversívelInibição reversível Mista Inibidor apresenta características de inibição competitiva e incompetitiva; Inibição reversívelInibição reversível Não competitiva: O inibidor se liga a um sítio alostérico da enzima e a inativa. Inibição irreversívelInibição irreversível São aqueles que se combinam com um grupo funcional na molécula da enzima e que é essencial para sua atividade, ou podendo promover destruição total do mesmo. Ex.: inibidores suicidas, indústria farmacêutica 05/09/2017 12 Exemplo: inibição irreversível (suicida)Exemplo: inibição irreversível (suicida) Exemplo: inibição irreversível (suicida)Exemplo: inibição irreversível (suicida) PBP PEG Exemplo: inibição irreversível (suicida)Exemplo: inibição irreversível (suicida) 05/09/2017 13 Exemplo:inibição irreversível (suicida)Exemplo: inibição irreversível (suicida) AtvAtv. Enzimática afetada pelo pH. Enzimática afetada pelo pH As enzimas têm um pH ótimo ou uma região de pH ótimo para sua atividade máxima; Mudança dos estados de ionização dos grupos laterais, afetando aspectos críticos na estrutura tridimensional da proteína Enzimas reguladorasEnzimas reguladoras •Metabolismo celular >> enzimas trabalhando em conjunto; •Vias metabólicas; •O produto da reação da primeira enzima tende a tornar-se o substrato da enzima na próxima reação do ciclo; •Em cada sistema, há pelo menos uma enzima que determina a velocidade de toda a sequência, catalisando a reação mais lenta ou a reação limitante da velocidade; •Enzimas reguladoras: em resposta a sinais, ou seja, às necessidades energéticas celulares; •Em muitos sistemas, a primeira enzima é a enzima reguladora; 05/09/2017 14 Enzimas reguladoras (Ex.)Enzimas reguladoras (Ex.) Enzimas reguladoras: Enzimas reguladoras: alostéricasalostéricas Enzimas alostéricas: funcionam através da ligação não-covalente e reversível de um metabólito regulador chamado modulador. São em geral maiores e mais complexas que as enzimas simples. Geralmente é regulada pelo produto final da via metabólica. Inibição por retroalimentação Enzimas reguladoras: Enzimas reguladoras: alostéricasalostéricas Subunidade Catalítica Subunidade Regulatória 05/09/2017 15 Enzimas reguladorasEnzimas reguladoras Enzimas reguladoras: outros mecanismosEnzimas reguladoras: outros mecanismos Algumas enzimas reguladoras funcionam através da ligação covalente e reversível de um metabólito. Ex.: adenosina monofosfato, difosfato ribose, grupos metil, etc. 05/09/2017 16
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