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Enzimas Estrutura e Função Élio Waichert Júnior Introdução São proteínas envolvidas atividade catalítica Praticamente todas as funções do corpo são mediadas por enzimas Com exceção de uma pequena classe de RNAs com atividade catalítica Aceleram a velocidade das reações no organismo Altamente eficientes, acelerando a velocidade das reações (108 a 1011 vezes mais rápida) Classificação e nomenclatura das enzimas Existem 3 métodos para nomenclatura enzimática: - Nome Sistemático: Mais complexo, nos dá informações precisas sobre a função metabólica da enzima. Ex: ATP-Glicose-Fosfo-Transferase - Nome Usual: Consagrados pelo uso; Exs: Tripsina, Pepsina, Ptialina - Nome Recomendado: Mais curto e utilizado no dia a dia de quem trabalha com enzimas. Utiliza o sufixo "ase" adicionando ao nome do substrato (molécula sobre a qual a enzima exerce ação catalítica) para caracterizar a enzima. Nome do substrato + “ase” Ex: Urease= Hidrolisa a Uréia Polimerase= Polimeração de Nucleotídeos para formar DNA - Nome recomendado: N° Classe Tipo de reação 1 Oxidorredutases Transferência de elétrons (átomos de H) 2 Transferases Reações de Transferência de grupos 3 Hidrolases Catalisa a quebra da ligação através de adição de água. Ex peptidases 4 Liases Catalisam a quebra ou formação de ligações duplas 5 Isomerases Transferência de grupo dentro da mesma molécula 6 Ligases Catalisam a formação de ligações entre carbonos e outros átomos com custo de energia(utiliza ATP) Propriedades das Enzimas Sítios ativos - As moléculas de enzimas contém uma região específica, formando uma fenda, que é chamado sítio ativo - Contém cadeias laterais de aa que criam uma superfície tridimensional complementar ao substrato - O sítio ativo é o local onde o substrato se liga à enzima, formando um complexo enzima-substrato (ES) E + S E S P + E Substrato se liga ao SÍTIO ATIVO da enzima Propriedades das Enzimas Especificidade As enzimas são altamente específicas, interagindo com um ou alguns poucos substratos e catalisando apenas um tipo de reação. Forças não-covalentes: Forças de Van der Walls, Interações eletrostáticas, Ligações de Hidrogênio, Interações hidrofóbicas - Ligação da enzima ao substrato: Modelo Chave-fechadura Modelo de Encaixe induzido Ligação da Enzima ao substrato: Modelo Chave-Fechadura Assume um alto grau de similaridade entre a forma do substrato e a geometria do sítio de ligação na enzima. O substrato liga-se à um sítio cuja forma complementa sua própria forma. Ligação da Enzima ao substrato: Modelo do Encaixe Induzido A ligação do substrato induz uma mudança conformacional na enzima,o que resulta em um encaixe complementar ao substrato Mecanismo de ação das enzimas O mecanismo de ação das enzimas podem ser definidos por duas perspectivas Alteração de energia que ocorre durante a reação Química do sítio ativo Alteração de energia Toda a reação possui uma barreira de energia que separa os reagentes do produto Energia livre de ativação é a diferença na energia entre os reagentes e o estado de transição A velocidade da reação é determinada pela energia livre de ativação Enzima promove uma rota alternativa Alteração de energia Química do sítio ativo O sítio ativo não é um receptáculo passivo a ligação do substrato O sítio ativo possui algumas funções que podemos resumir Estabilização do estado de transição o sítio ativo da enzima possui o molde do substrato no estado de transição aumentando a concentração desse intermediário O sítio ativo pode fornecer grupos catalíticos o que pode favorecer a formação do substrato no estado de transição A enzima mantem os substratos alinhados, através de muitas interações fracas, nas posições apropriadas para promover a catalise Cinética enzimática FATORES QUE INTERFEREM NA ATIVIDADE ENZIMÁTICA: Estrutura Tridimensional da enzima Estrutura e forma do centro ativo Atividade enzimática dependente da concentração do substrato, do pH e da temperatura do meio Influência do pH - A maioria das enzimas apresentam um valor de pH para o qual a sua atividade é máxima - A atividade enzimática diminui à medida que o pH se afasta deste valor ótimo - Valores extremos de pH podem levar a desnaturação da enzima, pois a atividade catalítica depende do caráter iônica das cadeias laterais dos aa Influência da Temperatura Ocorre um aumento da atividade enzimática devido a um aumento da cinética molecular Influência da concentração do substrato A velocidade de uma reação catalisada por enzima aumenta conforme a concentração do substrato, até uma velocidade máxima (Vmáx) ser atingida A obtenção de um platô na velocidade de reação em altas concentrações de substrato reflete a saturação pelo substrato de todos os sítios de ligação disponíveis nas moléculas enzimáticas presentes Obs: Curva hiperbólica ENZIMAS – INIBIÇÃO ENZIMÁTICA Qualquer substância que reduz a velocidade de uma reação enzimática. Inibidores Reversíveis Competitivos Não Competitivos Irreversíveis INIBIÇÃO DA ATIVIDADE ENZIMÁTICA Inibição: Reversível e Irreversível - Inibição Reversível: Interações fracas O inibidor liga-se a uma enzima por meio de ligações não-covalentes. Após o desligamento do inibidor, a enzima recupera sua atividade enzimática. - Inibição Irreversível: Interações covalentes (fortes) A enzima inibida não recupera a sua atividade após o desligamento do inibidor. Inibição: Competitiva ou não- competitiva: Inibição Competitiva: - O inibidor tem semelhança estrutural com o substrato - O inibidor liga-se reversivelmente ao mesmo sítio de ligação que o substrato normalmente ocuparia, competindo desta forma com o substrato por esse sítio - O efeito do inibidor competitivo é revertido pelo aumento da concentração do substrato Inibição Competitiva substrato enzima sítio ativo substrato inibidor Inibição não-competitiva: - Inibidor e substrato ligam-se a sítios diferentes sobre a enzima. - O inibidor pode ligar-se tanto a enzima livre quanto ao complexo ES, de modo a impedir que a reação ocorra. - O efeito inibidor não pode ser revertido pelo aumento da concentração do substrato, diminuindo a velocidade da reação substrato enzima sítio ativo substrato inibidor Inibição não-competitiva Regulação da Atividade Enzimática A regulação da velocidade das reações enzimáticas é essencial para o organismo coordenar seus inúmeros processos metabólicos A regulação pode ser feita por: Controle ou modulação alostérica Regulação por modificação covalente Regulação Enzimática Modulação Alostérica: Ocorre nas enzimas que possuem um SÍTIO DE MODULAÇÃO, ou ALOSTÉRICO, onde se liga de forma não-covalente um modulador alostérico que pode ser positivo (ativa a enzima) ou negativo (inibe a enzima) Regulação Enzimática Modulação Alostérica: Negativo Um modelo muito comum de regulação alostérica é a inibição por "FEED-BACK", onde o próprio produto da reação atua como modulador da enzima que a catalisa. A B C D E Feedback negativo - Coordena o fluxo de moléculas por uma via metabólica
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