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1 NUTRIÇÃO E CRESCIMENTO MICROBIANO Profa. Patrícia Gomes Cardoso 2 Nutrição microbiana - Mecanismo que fornece ás células as ferramentas químicas necessárias à síntese de diversos monômeros - Fornecimento de nutrientes Síntese de macromoléculas Catabolismo Anabolismo Metabolismo 3 4 Grupo nutricional Fonte de Carbono Fonte de energia Exemplos Quimioautotróficos ou Quimiolitotrófico CO2 Compostos inorgãnicos Bactérias nitrificantes e sulfurosas Quimioheterotrófic os ou Quimiorganotrófico Compostos Orgânicos Compostos Orgânicos Maioria das bactérias, fungos, protozoários e animais Fotoautroficos CO2 Luz Algas, Cianobactérias e plantas Fotoheterotróficos Compostos orgânicos Luz Bactérias violetas não sulfurosas Classificação Nutricional dos Organismos 5 6 Microrganismos quimioautotróficos: capazes de se desenvolver em meios minerais, utilizam CO2 como fonte de carbono e compostos inorgânicos como fonte de energia. Ex: Bactérias nitrificantes, ferro e enxofre. Microrganismos quimioheterotróficos: requerem compostos orgânicos como fonte de carbono e energia. Ex: Bactérias, fungos, protozoários e animais. Microrganismos fotoautotroficos: utilizam CO2 como fonte de carbono e a luz como fonte de energia. Ex: Bactérias sulfurosas, verdes e púrpuras, algas, plantas, cianobactérias. Microrganismos fotoheterotróficos: utilizam compostos orgânicos como fonte de carbono e a luz como fonte de energia. Ex: Bactérias púrpuras e verdes não sulfurosas. Meio de cultivo para algumas algas: Luz, água, CO2, íons (geralmente menos exigentes que bactérias) 7 Condições necessárias para o crescimento de Microrganismos - Fatores Químicos (nutrientes, água, O2 etc.) - Fatores Físicos ( temperatura, pH, pressão osmótica). Tabela 1-Composição química média de bactérias, leveduras e fungos (% peso seco) Elementos Bacteria Levedura Fungo Carbono 50-53 45-50 40-63 Hidrogênio 7 7 Nitrogênio 12-15 7.5-11 7-10 Fósforo 2-3 0.8-2.6 0.4-4.5 Enxofre 0.2-1 0.01-0.24 0.1-0.5 Potássio 1-4.5 1-4 0.2-2.5 Sódio 0.5-1 0.01-0.1 0.02-0.5 Cálcio 0.01-1.1 0.1-0.3 0.1-1.4 Magnésio 0.1-0.5 0.1-0.5 0.1-0.5 Cloreto 0.5 - - Ferro 0.02-0.2 0.01-0.5 0.1-0.2 8 Exigências Nutricionais -Água Essencial para os microrganismos: absorção nutrientes dissolvidos. Disponibilidade variável no ambiente. -Macronutrientes Carbono, nitrogênio, fósforo, hidrogênio, oxigênio (microrganismos aeróbicos) e enxofre. Necessários a síntese de lipídeos, carboidratos, proteínas e ácidos nucléicos. -Micronutrientes e cofatores Mg+2, Fe+2, K+ , Na+2 , Co, Cu, Mn, etc. 9 Fontes de Energia Luz ou compostos orgânicos ou inorgânicos. Fontes de Carbono -Todos os organismos requerem alguma forma de carbono; - Esqueleto das 3 maiores classes de nutrientes orgânicos: lipídeos, carboidratos e proteínas; - Autotróficos utilizam o CO2 como fonte de carbono; - Heterotróficos utilizam compostos orgânicos como fonte de carbono ex: Glicose, sacarose, melaço de cana, melaço de beterraba, amido, lactose, glicerol. Fatores que influenciam a escolha da fonte de carbono: - Alta concentração de açúcares rapidamente metabolizados, custo, pureza da fonte e facilidade de esterilização. 10 Preferência da fonte de Carbono por fungos filamentosos 1- Metano 2- Hidrocarboneto de cadeia longa 3- álcool 4- Glicerol 5- açúcar alcoólicos 6- dissacarídeos 7- monossacarídeos 8- amido 9- celulose e hemicelulose 10- lipídeos e proteínas 11- quitina 12- queratina 13- lignina Complexidade química Pr op or çã o d e u so 13 7 1 Nutrição microbiana 11 Fontes de Nitrogênio Todos os organismos necessitam porque faz parte dos aminoácidos (proteínas) e ácidos nucléicos; Inorgânico : sais de amônia e nitratos (N2, NO3-, NH3. Ex:NH4Cl, (NH4)2SO4 ). Orgânico: aa, bases nitrogenadas ureia, farinha de soja, resíduos de frigoríficos e resíduos de fermentação. Bactérias são mais versáteis para utilizar diferentes formas de N que Eucariotos; podem utilizar o N2 (fixação biológica), nitratos, nitritos e sais de amônia. Ex: Bactérias do solo (ex. bactérias dos gêneros Rhizobium e Bradyrhizobium) utilizam N gasoso diretamente da atmosfera para obtenção de N, tanto para elas como para as plantas que convivem simbioticamente (algumas leguminosas – soja, feijão). Maior fertilidade do solo sem a necessidade de implementação de fertilizantes químicos. Fatores que influenciam a escolha da fonte de nitrogênio: Ausência de inibidores, custo, mistura de fontes de N influenciam a regulação metabólica. 12 Enxofre, Hidrogênio e Fósforo Essenciais a todos os organismos; S é necessário na biossíntese de cisteína, cistina, metionina e de vitaminas (tiamina e biotina); P é essencial para a síntese de ácidos nucléicos e ATP; Sais inorgânicos (sulfatos) podem ser utilizados para suprir estes elementos também presentes em fontes protéicas (aa), e (fosfatos) no DNA e RNA; Alguns destes elementos podem ser encontrados na água ou na atmosfera. Potássio, Magnésio, Cálcio e Ferro K, Mg cofatores enzimático; Ca estabilização parede celular e formação de endosporos; Fe faz parte dos citocromos, proteínas e transporte elétrons. 13 Carbono Hidrogênio Oxigênio Nitrogênio Ferro Potássio Magnésio Sódio Cálcio Enxofre Fósforo Elementos Macronutrientes e micronutrientes encontrados na natureza e em meios de cultura 14 Exigidos em quantidades traço, Cofatores de enzimas; geralmente não é preciso adicionar: presentes na água; se água desmineralizada: adicionar solução elementos traços. Micronutrientes Nem todos os nutrientes listados são requeridos por todas as células 15 Fatores de Crescimento São compostos orgânicos que alguns microrganismos necessitam em pequenas quantidades. Vitaminas, aminoácidos, purinas e pirimidinas. Microrganismos muito exigentes nutricionalmente apresentam menor capacidade biossintética que os microrganismos menos exigentes. Alguns microrganismos apresentam exigências nutricionais complexas, indefinidas e não podem ser cultivados em meio artificial. Ex: agente etiológico da hanseníase que deve ser cultivados “in vivo”. 16 Consistência ou estado físico dos meios de cultivo Meio líquido: nutrientes são dissolvidos em água e esterilizados. Usados em estudos de crescimento, cultivo em fermentação e na produção de biomassa Meio sólido: são preparados a partir da adição de um agente solidificante, antes da esterilização do meio. Usados para contagem e isolamento de microrganismos (1,5% Agar) Meio semi-sólido: são preparados pela adição de uma quantidade menor do agente solidificante (0,7% Agar). Usados para a detecção de placas de lise em culturas bacterianas infectadas por vírus e microrganismos microaerofílicos ou móveis. Meio de cultura ou Meio de cultivo Meio de cultura: preparado em laboratório. Fornece os nutrientes indispensáveis ao crescimento do microrganismo fora do seu habitat natural. São preparados com água destilada ou deionizada, acondicionados em tubos de vidro, Erlenmeyers, etc. Podem também ser adquiridos prontos para uso. 17 Ágar: polissacarídeo complexo extraído de algas marinhas com propriedade de fundir a 96oC e solidificara 45oC. Não é usado como fonte de nutrientes pela maioria dos microorganismos Meio Mínimo (MM): é sintético e fornece somente nutrientes essenciais ao desenvolvimento da célula. Meio Completo (MC): é sintético e fornece todos nutrientes para o desenvolvimento da célula. Definidos: são preparados pela adição de quantidades precisas de compostos químicos inorgânicos ou orgânicos altamente purificados a uma determinada quantidade de água. Indefinidos: A composição exata de cada nutriente não é conhecida. Ex: peptona, extrato de levedura, leite soja, carne entre outros (Meio complexo). 18 Composição do meio de cultura Meios naturais: composição química não é definida ex: infusão de batata, sangue, leite, farelos,etc. Meios sintéticos: com componentes químicos puros, orgânicos e/ou inorgânicos. Meios semi-sintéticos: composição química parcialmente conhecida. BDA (batata-dextrose-ágar- fungos) Batata (caldo) 200g Dextrose 20g Ágar 15g Água dest. 1000mL Caldo Nutriente (bactérias) Extrato de carne 3,0g Peptona 5,0g Água dest. 1000mL Meios complexos são altamente nutritivos, geralmente mais fáceis de preparar, são os mais usados ( composição exata não é necessária), mais adequados para fastidiosos. 19 20 21 Substratos para meios complexos - Extrato de Carne: extrato aquoso de tecido muscular, concentrado sob a forma de pasta, contém carboidratos, N orgânico, vitaminas hidrossolúveis e sais. - Peptona: produto da digestão da carne (enzimática ou ácida), fonte de nitrogenio orgânico e vitaminas. - Triptona: hidrolisado pancreático de carne , rica em nitrogênio- amínico; destinado ao isolamento de organismos de difícil crescimento. - Extrato de Levedura: extrato aquoso de células de leveduras lisadas, fonte excelente de substâncias estimulantes do crescimento como vitamina complexo B; contém compostos orgânicos de N e C. - Extrato de malte: extrato aquoso de cevada malteada. Rica em carboidratos, contém material nitrogenado, vitaminas e sais minerais. -Tripticase: peptona derivada da caseína por digestão pancreática,fonte rica em nitrogênio de aminoácidos 22 Meios Especiais Meios formulados para objetivos específicos, utilizados principalmente nos trabalhos de identificação de microrganismos. Podem ser: Enriquecimento: multiplicação dos microrganismos de interesse quando estes estão em pequeno número. Favorece o crescimento de determinada população. Ex: Meio contendo celulose como fonte de carbono ou meio com fenol para microrganismos que degradam essa fonte. Diferencial: contém substâncias químicas mais complexas e permite diferenciar os microrganismos quanto ao seu crescimento e morfologia. Ex: EMB – Colônia de E. coli verde escuro e Salmonela incolor. Meio agar-sangue, identificação de bactérias patogênicas produtoras de hemolisinas. Ex:Streptococcus e Staphylococcus (anel claro em torno da colônia). Produção de enzimas: adição substrato e verificação halo hidrólise Ágar sangue - diferencial 23 Seletivo: favorece um microrganismo e inibe o crescimento de outros. Ex: adição de um antibiótico específico, ou pH específico para determinados m.o. Ex: meio com antibiótico, ágar Sabouraud: pH 5,6 e alta concentração de glicose (seletivo para fungos), ágar verde brilhante: seletivo para enterobactérias Gram - (Salmonella); o corante verde brilhante adicionado ao meio inibe as bactérias Gram (+) Seletivo/diferencial: diagnóstico de patogênicos (coliformes fecais). Ex: ágar MacConkey - contém sais biliares e corante cristal violeta, que inibem o crescimento de Gram + e permitem o desenvolvimento de Gram - e ainda lactose (diferenciar bactérias que utilizem este carboidrato) e o indicador vermelho neutro, que distingue as Gram negativas produtoras de ácido (vermelhas) das Gram negativas não produtoras de ácido (amarelas) identificação de coliformes. ágar MacConkey 24 Cultivo de Microrganismos Importância da Caracterização dos Microrganismos -Isolamento -Enumeração -Identificação -Segurança de águas potáveis públicas -Diagnóstico, tratamento e prevenção de doenças -Selecionar linhagens de interesse industrial Isolamento dos Microrganismos Para se caracterizar um microrganismo ele deve estar em cultura pura Cultura pura: quando uma colônia ou cultura é originada de uma única célula. Cultura mista: se a colônia ou cultura é originada de mais de uma célula. 25 Técnica de esgotamento por estrias Estria simples Estria composta Transferência de inóculo 26 27 Técnicas de plaqueamento 28 Contagem de colônias em placas diluição seriada Contagem de colônias em placas diluição seriada de fungos filamentosos UFC/mL= nº colônias x fator diluição / aliquota plaqueada UFC=Unidades Formadoras de Colônias 29 Contagem de colônias em placas – Filtração (concentração da amostra) 30 Contagem microscópica direta 31 Turbidez medida em um espectrofotômetro ou em um fotômetro Contagem microscópica direta 32 MEDIDAS DE CRESCIMENTO 1. No. CÉLULAS 2. MASSA 1.1 TOTAIS 1.2 VIÁVEIS 2.1 DIRETA 2. 2 INDIRETA 1.1.1 LÂMINA 1.1.1 ELETRÔNICA 1.2.1 PLAQUEAMENTO (diluições) 1.2.2 FILTRO (concentrar) 2.1.1 MASSA SECA 2.2.1 DENSIDADE ÓTICA 2.2.2 ATIVIDADE METABÓLICA 33 Curva de crescimento típica de uma população bacteriana Crescimento bacteriano-Aumento do número de células 34 35 Formas de multiplicação •Exosporulação (assexuada): Ex: Streptomyces •Fragmentação de filamentos: Ex: Nocardia •Brotamento: Ex: Rhodopseudomonas •Fissão binária: Ex: Escherichia coli 36 Cultura contínua- Quimiostato 37 Taxa de crescimento (velocidade específica de crescimento): é a variação no número ou massa de microrganismos por unidade de tempo. Tempo de geração: é o intervalo de tempo necessário para que uma célula se duplique. É variável para os diferentes organismos, podendo ser de 10, 20 minutos até dias. O tempo de geração não corresponde a um parâmetro absoluto, uma vez que é dependente de fatores genéticos e nutricionais, indicando o estado fisiológico da cultura. 38 O tempo de geração pode ser calculado quando uma cultura encontra-se em fase exponencial, pela fórmula: g = t/n, onde: g = tempo de geração t = tempo de crescimento n = número de gerações dentro de um tempo de crescimento dado pela equação: N=No.2n onde: N= número final de células No= número inicial de células n= número de gerações Como o crescimento é exponencial entao: n= log(N) - log(No)/0,301 39 Conservação das culturas Puras • Geladeira- pouco tempo • Nitrogênio líquido • Ultra freezer • Congelamento a seco (Liofilização) Caracterização dos Microrganismos Caracterização morfológica- microscopia Caracterização nutricional e cultural Caracterização metabólica Caracterização antigênica Caracterização patogênica Caracterização genética Fatores do ambiente que afetam o crescimento microbiano a) Atmosfera b) Temperatura c) pH d) Disponibilidade de água Classificação quanto a exigência de oxigênio (A) Aeróbios estritos (B) Anaeróbios estritos (C) Anaeróbios facultativos (D) Microaerófilos (E) Anaeróbios aerotolerantes 40 41 Anaeróbios- uma grande variedade de procariotos, alguns fungos e alguns protozoários Formas reativas do oxigênio 42 43 Alguns procariotos anaeróbios obrigatórios nãopossuem superoxido dismutase, havendo uma enzima exclusiva a superoxido redutase, que remove o superoxido sem a produção de O2 Cultivo em anaerobiose jarra de anaerobiose câmara de anaerobiose Teste de uma cultura microbiana para detecção de catalase 44 Temperatura Efeito da temperatura no crescimento microbiano Classificação dos microrganismos quanto à temperatura de crescimento 45 46 47 Estratégias de adaptação dos organismos às altas Temperaturas - Membranas- Variação no conteúdo e tipos de lipídeos e proteínas; -Parede celular- Variação nas moléculas básicas (ex: tipo de ligação, tipo de aa, etc) que compõem a parede; – Velocidade de renovação das estruturas e moléculas; - Proteínas termoresistentes: Taq polimerase (Thermus aquaticus) Pfu polimerase (Pyrococcus furiosus) – Ácidos nucléicos por exemplo com maior concentração de bases C≡G Efeito do pH no crescimento microbiano 1 3,5 7 9 14 pH Acidófilos Ex: Acidithiobacillus sp. Neutrófilos Ex: Escherichia coli Alcalófilos Ex: Bacillus sp. T a x a d e c re sc im e n to Acidez ou alcalinidade de uma solução. A maioria dos microrganismos cresce melhor perto da neutralidade. Poucas bactérias são capazes de crescer em pH ácido (como pH 4,0). Bactérias: faixa entre pH 7,0. Exceções: Bactérias acidófilas: alto grau de tolerância à acidez (Thiobacillus de 0,5 a 6,0 com ótimo entre 2 e 3,5), Bactérias alcalifílicas: (Bacillus e Archaea) (pH 10 – 11) e fungos tendem a ser mais acidófilos que as bactérias (pH <5). 48 Disponibilidade de água/Concentração do íon sódio Atividade de água (aw): ajuste da molaridade interna para o metabolismo eficiente do organismo. Pode variar de 0 a 1. Microrganismos marinhos tem necessidades especificas de íon sódio sendo denominados halófilos. Halófilos discreto-1 a 6% de NaCl, Halófilos moderado-6 a 15% de NaCl, Halófilos extremos-15 a 30% de NaCl. 49 50 51 52
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