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Classificação dos seres vivos Profa. Patrícia Gomes Cardoso Origem da Vida e a Diversificação Microbiana Origem da Terra - 4,6 bilhões de anos Atmosfera da terra em tempos remotos: Baixa concentração de O2 (ambiente redutor), temperatura alta e meteoritos. Altas concentrações de Metano (CH4), dióxido de carbono (CO2), Nitrogênio (N2), Amônia (NH3) e Cianeto de hidrogênio (NH3 + CH3= HCN). Traços de Monóxido de carbono (CO), Hidrogênio (H2), Sulfeto de Ferro (FeS), Sufeto de Hidrogênio (H2S). Prováveis fontes de energia- (UV), radioatividade, calor + gases = moléculas importantes. Atmosfera primitiva Atmosfera atual Hidrogênio (H2) Nitrogênio (N2) Metano (CH4) Oxigênio (02) Amônia (NH3) Gás carbônico (CO2) Vapores de água Vapores de água Gás carbônico (CO2), CO Gases nobres Fotossíntese? Estromatólitos modernos compostos por cianobactérias termofílicas, crescendo em um lago termal no Parque Nacional de Yellowstone (~3,5 bilhões de anos) Posteriormente: H2O, O2, compostos orgânicos, ozônio (O3)... Como seria o primeiro organismo auto-replicante? Aleksandr Ivanovitch Oparin (1894-1980)- formação do primeiro ser vivo a partir de moléculas orgânicas complexas. Moléculas orgânicas foram produzidas a partir de reações ocorridas entre os gases existentes e as reações provocadas pela energia do raios ultravioletas do Sol e pelas descargas elétricas dos raios durantes as tempestades. Os aminoácidos formados devem ter combinado entre si dando origem a outras substâncias mais complexas, chamados proteínas. Essas foram se acumulando nos mares primitivos e se juntando em minúsculos aglomerados, que Oparin chamou de coacervados. No interior destes ocorreram muitas reações, até que, depois de milhões de anos, surgiram os ácidos nucleicos. Fósseis com 3,4 bilhões de anos encontrados numa praia da costa ocidental da Austrália revelam como eram os primeiros seres vivos. O estudo baseia-se no achado de microfósseis de bactérias que cumprem os requisitos que atestam uma origem biológica: constituem marcas preservadas de estruturas tipo células, todas de um mesmo tamanho, semelhantes a fósseis que datam dois bilhões de anos e indiciam a ocorrência de atividade biológica. E, por fim, constituem evidência da existência de metabolismos biológicos. Estes fósseis foram descobertos por uma equipe de cientistas da University of Western Austrália e da Oxford University entre os grãos de areia quartzítica numa das praias mais antigas que existem, não havendo dúvidas relativamente à sua idade porque se situam entre dois eventos vulcânicos bem localizados no tempo. Os valiosos microfósseis revelam que nas primeiras formas de vida eram bactérias que, vivendo num mundo em que ainda não havia oxigênio (visto que não existia plantas ou algas que realizassem a fotossíntese), dependiam dos compostos de enxofre para obter energia - como indicam os cristais de pirita que estão associados aos restos fossilizados das bactérias, que seriam um produto secundário do seu metabolismo -, como é o caso das bactérias que habitam ainda hoje as fontes hidrotermais. Possível cenário para a evolução de formas de vida RNA catalíticos (ribozimas) Pressão seletiva por maior eficiência e fidelidade na replicação DNA Organismos primitivos: reações anóxicas, fermentação, autotrofia primitiva...fotossíntese anoxigenica e oxigênica em cianobactérias... Estágios da Evolução Biológica Origem dos eucariotos modernos por meio de eventos endossimbióticos Baseia-se na hipótese de que as células eucarióticas evoluíram de células procarióticas a partir de eventos de fusão celular. Mitocôndrias teriam evoluído quando uma proteobactéria tornou-se um “endosimbionte” numa célula hospedeira. Cloroplastos evoluíram pelo engolfamento de uma bactéria capaz de realizar fotossíntese oxigênica (cianobactéria). Evidências da Teoria Endossimbiótica Cyanophora paradoxa, protista hospedeiro de uma eubactéria Conceitos importantes na classificação dos seres vivos Sistemática- Ramo da Biologia que descreve, analisa e interpreta a diversidade biológica dos seres vivos. Taxonomia- É a ciência de nomear e descrever os organismos vivos. Permite estabelecer relações entre grupos de organismos de modo que possamos diferenciá-los. Normalmente, baseia-se em características fenotípicas: morfologia (estrutura), fisiologia e bioquímica dos organismos vivos. Taxa (Taxon-sig) Grupos taxonômicos onde são agrupados organismos que compartilham características comuns. Classificação: Agrupamento de organismos baseada em relações evolutivas hipotéticas resultantes de análises filogenéticas. Análise filogenética: É a ciência que estuda a relação evolutiva (parentesco) de diferentes organismos visando estabelecer a história evolutiva destes organismos. Utiliza principalmente métodos moleculares para comparar características genotípicas. Reino- Filo- Classe- Ordem- Família- Gênero- Espécie Aristóteles: duas categorias apenas (plantas ou animais) Carolus Linnaeus (1753): 2 Reinos (Regras para linguagem universal dos seres vivos que são seguidas até hoje) Carl von Nägeli (1857) propôs que as bactérias e os fungos fossem colocados no reino das plantas. Seres Vivos Reino Animal Reino Vegetal Classificação dos Seres Vivos Classificação dos Microrganismos Esquemas de classificação Reinos/ Domínios Organismos incluídos no esquema de classificação Carolus Linnaeus (1753) Plantas Animais Bactérias, fungos, algas e plantas Protozoários e animais superiores Ernest Haeckel (1865) Plantas Animais Protistas Algas multicelulares e plantas Animais Bactérias, protozoários, algas, fungos filamentosos e leveduras Robert Whittaker (1969) Plantas Animais Protistas Fungos Monera Algas multicelulares e plantas Animais Protozoários e algas unicelulares Fungos filamentosos e leveduras Todas as bactérias (procariotos) Carl Woese (1977) Archaea Eubacteria Eucarya Metanogênicos, halofílicos e termoacidófilos Bactérias patogênicas, do solo, da água, fotossintetizantes, etc. Protozoários, algas, fungos, plantas e animais Reino Critérios Exemplos Esquema Monera Unicelular sem núcleo organizado. bactérias Protista Unicelular com núcleo organizado. protozoários Fungos Unicelulares ou pluricelulares Bolores, cogumelos Plantas Seres fotossintéticos uni/ ou pluricelulares Algas, musgos, feto, plantas com flor. Animal Pluricelulares com núcleo organizado; nutrição por ingestão Espongiários, anelídeos, nematodes, cordados Classificação de Robert Whittaker (1969) Seis Reinos da Vida (Cavalier-Smith) Império Prokaryota Reino Bacteria Império Eukaryota Reinos: Protozoa Animalia Fungi Plantae Chromista Thomas Cavalier-Smith Departamento de Zoologia/ Universidade de Oxford (Reino Unido). Análises de características ultra estruturais, proteína e DNA Cavalier-Smith, T. A revised six-kingdom system of life. Biol. Rev., 73, pp. 203-266, 1998. Cavalier-Smith, T. Only six kingdoms of life. Proc. R. Soc. Lond., 271, pp. 1251-1262, 2004. Os Três Domínios – Carl R. Woese Propôs elevar os três tipos de células (eucarioto e dois tipos distintos de procariotos) para um nível acima de Reino Domínio Os três diferentes Domínios são diferenciados quanto às diferenças nas sequências de nucleotídeos do rRNA, na estrutura da membrana lipídica, nas moléculas de tRNA e sensibilidade a antibióticos O primeiro a reconhecer o rRNA como uma ferramenta útil na construção de relações filogenéticas Carl Woese- 3 Domínio, 25 Reinos 3 Reinos Archaea (Crenarchaeota, Euryarchaeota e Korarchaeota) 13 Reinos Bacteria (Proteobacteria, Firmicutes, Cyanobacteria, Chlamydia, Planctomycetae, Flavobacteria, Chlorobia,Spirochetes, Xenobacterias, Thermomicrobia, Thermotogae, Thermodesulfobacteria e Aquificae) 9 Reinos Eukarya (Mycota, Chytridia, Chromista, Straminioila, Protozoa, Acheozoa, Animalia, Plantae e Rodophyta) Microrganismos Procarióticos Domínio Bacteria Árvore filogenética do Domínio Bacteria Proteobacteria- maior filo Escherichia coli- organismo modelo para estudo), Pseudomonas, Azotobacter(fixadora de N), Gram+: Bacillus, Streptomyces(produtor a de antibióticos) Cianobactérias(fototróf icos) Planctomyces(aquáticas) Espiroquetas (sífilis) Microrganismos Procarióticos Domínio Archaea Árvore filogenética do Domínio Archaea Metanogênicos, halófilos extremos acidófilos Hipertermófilos Halobacterium- pode utilizar a luz para sintetizar ATP) Metanobacterium- obtêm energia a a partir do metano-biodegradação da matéria orgânica) Halófilos (altas [ ] de sais para seu metabolismo e reprodução Thermoplasma (desprovidos de PC; apresentam ótimo crescimento em pHs extremamente ácidos. Microrganismos Eucarióticos Árvore filogenética do Domínio Eukarya Algas- fototróficos; cloroplastos –organelas ricas em clorofila. Fungos- leveduras – unicelulares; fungos filamentosos. Principais agentes de reciclagem de MO na natureza Protozoários- não possuem PC; móveis; algumas espécies patogênicas. Líquens- mutualismo microbiano fungo + alga ou cianobactéria. Apresentam parede celular composta por peptideoglicano: Exceções: Planctomyces-Pirella (proteínas) e Mycoplasma-Chlamydia (desprovidas de parede celular); Lipídeos da membrana com ligações éster; bicamada lipídica; Ribossomos 70S; 1 RNAs polimerases com 4 subunidades, Algumas fazem fotossíntese baseada na clorofila; Primeiro aminoácido das proteínas –Metionina modificada- Formylmetionina; Sensibilidade a antibióticos que inibe ribossomos 70S (organelas) Domínio Bactéria Domínio Archaea Formam uma monocamada lipidica; Apresentam parede celular composta de pseudopeptideoglicano ou proteínas, glicoproteínas ou polissacarídeos; Lipídeos na membrana do tipo isoprenóides com ligações eter; Ribossomos 70S, mas algumas etapas da síntese protéica semelhante a de eucariotos; Polimerases com 8 a 12 subunidades; Não realizam fotossíntese; Crescimento acima de 80oC; Apresentam moléculas de tRNA modificadas; Primeiro aminoácido das proteínas –Metionina; Sensibilidade a antibióticos que inibe ribossomos 80S. Geralmente apresentam celulose ou quitina na parede celular; Ausência de ácido murâmico na parede celular; Lipídeos da membrana com ligações éster; Ribossomos 80S e 70S (organelas); 3 RNAs polimerases com 10 a 12 subunidades Crescimento na temperatura máxima de 62oC; Fotossíntese baseada na clorofila presente nos cloroplastos; Primeiro aminoácido das proteínas –Metionina; Sensibilidade a antibióticos que inibe ribossomos 80S e 70S (organelas) Domínio Eukarya Requisitos para que uma molécula possa representar relações evolutivas verdadeiras entre os organismos: 1- A molécula deve ser de distribuição universal no grupo escolhido para o estudo 2- Deve ser funcionalmente homóloga em cada organismos – função idêntica. 3- É crucial que as duas sequências de nucleotídeos da moléculas possam ser alinhadas adequadamente, permitindo a identificação de regiões com homologia de sequência, bem como variância de sequência. 4- Deve sofrer alterações em uma taxa comensurável em relação à distância medida. Filogenia Molecular Primeiras tentativas utilizaram sequencias de proteínas (1965–1977): ATPase, RecA. Sequenciamento de proteínas foi desenvolvido antes do sequenciamento de DNA. Algumas proteínas podem ser facilmente isoladas. Mudanças na sequencia de proteínas refletem mudanças na sequencia de DNA. Filogenia Molecular Carl Woese e seus colaboradores escolheram o rRNA como uma ferramenta para estudos de sistemática molecular (cronômetro evolutivo): 1. Encontrado em todas as células e mesmo no genoma de organelas (mitocôndrias e cloroplastos) 2. Funcionalmente constantes 3. Abundante 0,3- 0,4% do genoma e fácil de ser isolado e purificado. 4. Interage com várias outras moléculas de RNA e proteínas. 5. O rRNA contêm regiões com taxas de evolução distintas (regiões de alta pressão de seleção e regiões de baixa pressão de seleção). 6. Possui tamanho adequado para estudos comparativos e análise estatística. 7. Projeto Banco de Dados Ribossomais (RDP)- (http://rdp.cme.msu.edu/html/) GenBank (EUA) DDBS (Japão) EMBL (Alemanha) Ribossomos Estrutura secundária do rRNA de representantes dos 3 domínios Sequenciamento de um gene de RNA ribossomal Preparo de uma árvore filogenética a partir de sequências de rRNA 16S
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