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HISTORICO 1600 1800 Células, organelas 1900 Genes e enzimas Beadle e Tatum, 1940 DNA:depositário Avery, 1944 Dupla Hélice Watson e Crick, 1953 Descoberta do microscópio Fundação da genética (Mendel, 1866) e da evolução (Darwin, 1859) Nucleína (Miecher, 1869) Cromatina (Flemming,1879) Divisão Celular Sutton e Boveri, 1902 Fatores e fermentos Garrod e Bateson, 1909 Princípio transformante Griffiths, 1928 1950 Biologia Molecular (Genética Molecular) Se relaciona com o estudo da estrutura e função do DNA, dos genes, bem como da organização e funcionamento do genoma. Cepa Lisa (L) Camundongo morre Camundongo sobrevive Cepa rugosa (L) Camundongo sobrevive Cepa Lisa (L) inativada pelo calor Cepa Lisa (L) inativada pelo calor Cepa rugosa (L) viva + Camundongo morre O princípio transformante: Griffiths, F. 1928 Avery – MacLeod – McCarty - 1944 Cepa Lisa (L) inativada pelo calor Cepa rugosa (L) viva Camundongo morre O princípio transformante: Avery O. 1944 O DNA é o depositário da informação genética proteínas RNA polissacarídeos lipídeos DNA Camundongo sobrevive Cepa rugosa (L) viva 1952- Experimento de Hershey-chase Experimentos que levaram ao modelo da dupla hélice Alexander Todd descreve que o DNA é um polinucleotídeo REGRAS DE CHARGAFF Primeira regra (~1950) Verificou que a quantidade de G era igual à de C; e a quantidade de A, igual à de T. Erwin Chargaff 1905–2002 Segunda regra (~1950) A composição de bases do DNA varia de espécie para espécie com relação à porcentagem de A, C, G e T Esta diversidade molecular (antes desconhecida) fazia com que o DNA fosse um candidato mais plausível para carregar a informação genética (do que as proteínas) Rosalind Franklin faz experimentos de difração de Raios-X que são “mostrados” a Watson Esses experimentos sugerem uma estrutura helicóide, com duas fitas e um diâmetro com pirimidinas e purinas pareando Experimentos que levaram ao modelo da dupla hélice Experimentos que levaram ao modelo da dupla hélice Erwin Chargaff se encontra com Watson e Crick e relata seus achados: as quantidades relativas de A e T são iguais e C e G também. Dogma Central da Biologia Molecular DNA – guardião da informação genética RNAs e proteínas celulares Síntese dos constituintes celulares Proposto por Francis Crick em 1957 Evolução do conhecimento em biologia molecular desde a dupla-hélice 1950 1960 Hibridização por Sothern,1975 Genômica, 1991 Dupla-hélice, 1953 Transcrição 1957 Replicação, 1958 DNA polimerase, 1961 Código genético, 1961 Regulação da expressão gênica,1961 DNA recombinante, 1973 Sequencimento de DNA, 1975 Primeiro gene humano,1977 Insulina recombinante,1982 Transgênicos, 1980 Bancos de armazenamento de dados 1971 PCR,1985 Enzimas de restrição,1971 Retrotranscrição, 1970 1970 1980 1990 Eletroforese em gel é uma técnica de separação de moléculas que envolve a migração de partículas em um determinado gel durante a aplicação de uma diferença de potencial. As moléculas são separadas de acordo com o tamanho, pois as menores irão migrar mais rapidamente que as de maiores. A eletroforese normalmente é utilizada para separar proteínas e moléculas de DNA e RNA. Visualização Visualização Cortar o DNA Enzimas de restrição: tesouras moleculares Enzimas de Restrição: Clivam a fita dupla de DNA em sequências específicas de de nucleotídios, o sítio de restrição da enzima. Atualmente se conhecem mais de1.200 BamHI - Bacillus amyloliquefaciens H 5’ G/GATCC 3’ EcoRI - Escherichia coli R 5’ G/AATTC 3’ HaeIII - Haemophilus aegyptius 5’ GG/CC 3’ PstI - Providencia stuartii 5’ CTGCA/G 3’ Plasmídios: Pequenas moléculas de DNA circular que se replicam independentemente do DNA cromossômico Presentes em bactérias. São utilizados para gerar batérias transgênicas. DNA Estranho Fragmentos do DNA estranho “insert” Plasmídio aberto, Gene resistente à Ampicillina Plasmídio circular, com “Insert” Mistura com aenzima Ligase L I G A T I O N Criação de moléculas recombinantes Isolar o DNA - digerir com enzimas de restrição - digerir os plasmídeos com a mesma enzima - ligar as fitas de DNA e plasmidiais Introduzir os plasmídeos recombinantes nas bactérias CLONAGEM DA INSULINA Insulina recombinante -Gene responsável pela produção de insulina dos seres humanos inseridos em bactérias (plasmídios) -Bactérias produzem insulina humana recombinante -produção praticamente ilimitada e com custos muito baixos. Transgenia: permite isolar um gene de interesse de uma espécie e inseri-lo no material genético de outra. Espécie Transgênica: recebeu um gene exógeno, que ele não possuia e, assim, passará a produzir a proteína codificada por ele. Transgênicos Primeiro mamífero transgênico: hormônio do crescimento Transgênico que reverteu o sexo Tabaco com gene luminescente de bactéria Clonagem : produção de cópias idênticas. Clonagem Gênica: trechos do DNA são inseridos em plasmídios para produzir inúmeras cópias da molécula. Clonagem de organismos por transferência nuclear: o núcleo de um indivíduo é extraído de uma célula somática e inserido em um óvulo sem material genético nuclear. Por meio de inseminação artificial, essa célula poderá se desenvolver em um indivíduo da mesma espécie. PCR Reação em Cadeia da Polimerase Quem inventou a PCR Kary Mullis, geneticista Nobel em Química (1993) pelo desenvolvimento de um método que permite sintetizar, em poucas horas e in vitro, uma grande quantidade de um determinado fragmento de DNA Seus estudos em 1985 permitiram amplificar o DNA Mullis, K. and Faloona, F. (1987). Specific synthesis of DNA in vitro via a polymerase-catalyzed chain reaction. Methods Enzymol 155: 335-35 PCR Polymerase Chain Reaction (reação em cadeia da polimerase) Reação enzimática de polimerização de DNA in vitro Amplificação de sequências específicas de DNA, permitindo sua visualização e/ou análise posterior É um processo termodinâmico e enzimático Reação para amplificação de segmento específico de DNA Etapas da PCR 1. Desnaturação 2. Anelamento 3. Extensão A técnica de PCR tem por objetivo amplificar uma sequência alvo específica por meio de uma enzima termoestável, in vitro. Neste método utiliza-se além desta enzima, os quatro nucleotídeos e um par de primers (iniciadores) que delimitam a região a ser amplificada. Estes primers são utilizados para direcionar a síntese do DNA, e delimitam a sequência que será amplificada. Em cada ciclo, as fitas servem de molde para a geração de novas fitas. Cada ciclo se inicia com a desnaturação da dupla-hélice do DNA, elevado a altas temperaturas (91-95o C). Esta etapa é seguida da dos primers ao DNA molde, a temperaturas que variam de 53-65oC. Posteriormente ocorre a elongação de cadeia por ação da polimerase, em geral entre temperaturas de 65-72oC. O número de ciclos varia de acordo com o objetivo e condições utilizadas. 1. Desnaturação - 94ºC – 96ºC Separa a dupla fita do template em duas fitas simples 2. Pareamento - 37ºC – 65ºC Primers ligam-se em locais específicos do DNA molde 3. Extensão - 72ºC DNA polimerase usa os dNTPs adicionando-os a nova fita de acordo com a regra de pareamento – polimerização. Principio da PCR Amplificação Exponencial Termocicladores Aplicações da PCR Diagnósticos moleculares Identificação e isolamento de genes Marcadores moleculares Expressão gênica Diagnóstico molecular – gripe aviária Meningite e penuemonia bacteriana HIV Identificação humana: teste de paternidade por DNA Hibridização por Southern + + + + + + + + + + Pólo negativo - - - - - - - - - - - - - - Poços 1. Separação do DNA fragmentado por eletroforese em gel 2. Transferência do DNA fragmentado para um suporte sólido (filtro de Nitrocelulose) 3. Hibridização com a sonda marcada 4. Lavagem do filtro para manter apenas a sonda hibridizada com o fragmento de DNA especifico 5. Exposição a um filme de Raios-X Teste de Paternidade Paternidade Inclusão Exclusão DNA na sociedade DNA Trangênicos Drogas recombinantes: insulina, vacina HBV Medicamentos inteligentes (dosagens pessoais) Diagnóstico de doenças Teste de Paternidade Projeto genoma: santo Graal Árvore da vida Código da vida Manual de informações Livro de receitas
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