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1 Aula 3: NUTRIÇÃO E CRESCIMENTO MICROBIANO Nutrição microbiana - Todas as células são constituídas por água, sais minerais e macromoléculas : Proteínas, Carboidratos, Lipídeos, Ácidos nucléicos Lipídeos, Proteínas Carboidratos Ácidos nucléicos Ácidos nucléicos e Proteínas Fonte: lookfordiagnosis.com Nutrição microbiana - Fornecimento de nutrientes Síntese de seus componentes 4 -Água - Essencial para os microrganismo - Macronutrientes – necessários em maior quantidade C, N, H, O, P, S, K, Na. Necessários a síntese das macromoléculas - Micronutrientes e cofatores - necessários em menor quantidade Mg, Fe, K, Co, Cu, Mn, etc. - Energia Exigências Nutricionais 5 Fontes de Energia - Fototróficos - Luz -Quimiotróficos - Degradação de compostos orgânicos ou inorgânicos. 6 MACRONUTRIENTES Carbono - Todos os organismos requerem alguma forma de carbono; - Esqueleto das 3 maiores classes de nutrientes orgânicos: lipídeos, carboidratos e proteínas; - Autotróficos utilizam o CO2 como fonte de carbono; - Heterotróficos utilizam compostos orgânicos como fonte de carbono Ex: Açúcares, bases nitrogenadas, ácidos graxos, compostos aromáticos. 7 Preferência da fonte de Carbono por fungos filamentosos 1- Metano 2- Hidrocarboneto de cadeia longa 3- álcool 4- Glicerol 5- açúcar alcoólicos 6- dissacarídeos 7- monossacarídeos 8- amido 9- celulose e hemicelulose 10- lipídeos e proteínas 11- quitina 12- queratina 13- lignina Complexidade química Pr op or çã o d e u so 13 7 1 Lignina Glicose 8 Fonte de Carbono Grupo nutricional CO2 Autotróficos Compostos Orgânicos Heterotróficos Classificação Nutricional dos Organismos Fonte de Energia Grupo nutricional Compostos orgânicos/ inorgânicos Quimiotróficos Luz Fototróficos Fonte de Energia Fonte de Carbono C. orgânicos/ inorgânicos CO2 C. orgânicos/ inorgânicos Compostos Orgânicos Luz CO2 Luz Compostos Orgânicos Grupo nutricional Quimioautotróficos Fotoautotróficos Quimioheterotróficos Fotoheterotróficos 9 10 MACRONUTRIENTES Nitrogênio •Depois do Carbono, é o elemento mais abuntante (12% do peso seco células) •Todos os organismos necessitam porque faz parte dos aminoácidos (proteínas), ácidos nucléicos e vários outros compostos celulares Inorgânico (Maior parte): sais de amônia e nitratos (N2, NO3 -, NH3) Orgânico: aa, bases nitrogenadas ureia, farinha de soja, resíduos de frigoríficos e resíduos de fermentação Bactérias - podem utilizar o N2 (fixação biológica), nitratos, nitritos e sais de amônia. Ex: Bactérias do solo (ex. bactérias dos gêneros Rhizobium e Bradyrhizobium) utilizam N gasoso diretamente da atmosfera para obtenção de N, tanto para elas como para as plantas que convivem simbioticamente (algumas leguminosas – soja, feijão). Hidrogênio (H) - Juntamente com o C, encontrado todos compostos orgânicos e diversos inorgânicos (água, sais e gases); - Principal função: Manutenção do pH Oxigênio (O) - Elemento comum encontrado nas moléculas biológicas (aminoácidos, nucleotídeos, glicerídeos ...) - Obtido a partir - proteínas e gorduras. - Na forma de oxigênio molecular (O2) - requerido - muitos para processos geração de energia. MACRONUTRIENTES 12 Enxofre (S) Essenciais a todos os organismos; S é necessário na biossíntese de cisteína, cistina, metionina (aminoácidos) e de vitaminas (tiamina e biotina); - Fontes inorgânicos sulfatos (SO4 2-) e sulfetos (HS-) - Fontes protéicas (aminoácidos) Cisteína Biotina MACRONUTRIENTES Fósforo (P) Essenciais a todos os organismos; P é essencial para a síntese de ácidos nucléicos, ATP, fosfolipídeos - Fosfatos Inorgânicos e Orgânicos Fosfolipídeo MACRONUTRIENTES 14 Potássio (K), Magnésio (Mg), Cálcio (Ca) K cofator enzimático; Mg atua na estabilidade de ribossomos, membranas e ácidos nucléicos, atua como cofator enzimático; Ca estabilização parede celular e formação de endosporos; MACRONUTRIENTES 15Fonte: Madigan et al., 2010 16 MICRONUTRIENTES OU ELEMENTOS TRAÇO - Exigidos em quantidades traço - Atuam na manutenção das atividades celulares: osmorregulação, co-fatores enzimáticos (Fe+2), facilitam transporte de moléculas através da membrana celular - - Boro (B), Cromo (Cr), Cobalto (Co), Cobre (Cu), Manganês (Mn), Níquel (Ni), Zinco (Zn) - Fonte: Sais inorgânicos 17 Geralmente não é preciso adicionar: presentes na água; se água desmineralizada: adicionar solução elementos traços. Nem todos os nutrientes listados são requeridos por todas as células Elemento Função Celular Cobalto Vitamina B12; transcarboxilase (bactérias que metabolizam ácido propiônico) Cobre Respiração; citocromo c oxidase; fotossíntese; plastocianina e algumas superóxido dismutases. Manganês Ativador de muitas enzimas; presente em certa superóxido dismutases e na enzima que cliva a água em fototróficos oxigênicos (Fotossistema II) Molibidênio Certas enzimas contendo flavina; nitrogenase, nitrato redutase Niquel Maioria das hidrogenases; Coenzima F430 de metanogênicos, monóxido de carbono desidrogenase; urease Selênio Formato desidrogenase; algumas hidrogenases; no aminoácido selenocisteína Tungstênio Algumas formato desidrogenases; oxotransferases de hipertermófilo Zinco Vanádio nitrogenase; bromoperoxidase Ferro Citrocromos; catalases; peroxidases; proteínas contendo ferro e enxofre; todas as nitrogenases MICRONUTRIENTES 18 MICRONUTRIENTES Fonte: Madigan et al., 2010 Nem todos os nutrientes listados são requeridos por todas as células 19 Fatores de Crescimento - São compostos orgânicos que alguns microrganismos necessitam em pequenas quantidades. - Vitaminas, aminoácidos, purinas e pirimidinas. - A maioria dos microrganismos conseguem sintetizá-los - Porém, alguns requerem um ou mais desses fatores, pré- formados no meio - Vitaminas – Mais comumente requerido - Atuam como coenzimas 20 Fonte: Madigan et al., 2010 Fatores do ambiente que afetam o crescimento microbiano a) Atmosfera b) Temperatura c) pH d) Disponibilidade de água 22 Classificação quanto a exigência de oxigênio (A) Aeróbios estritos (B) Anaeróbios estritos (C) Anaeróbios facultativos (D) Microaerófilos (E) Anaeróbios aerotolerantes 23 Anaeróbios- uma grande variedade de procariotos, alguns fungos e alguns protozoários Formas reativas do oxigênio 24 25 Alguns procariotos anaeróbios obrigatórios não possuem superoxido dismutase, havendo uma enzima exclusiva a superoxido redutase, que remove o superoxido sem a produção de O2 Cultivo em anaerobiose jarra de anaerobiose câmara de anaerobiose Teste de uma cultura microbiana para detecção de catalase 26 Temperatura 27 28 Classificação dos microrganismos quanto à temperatura de crescimento 29 Estratégias de adaptação dos organismos às altas Temperaturas - Membranas- Variação no conteúdo e tipos de lipídeos e proteínas; - Parede celular- Variação nas moléculas básicas (ex: tipo de ligação, tipo de aa, etc) que compõem a parede; – Velocidade de renovação das estruturas e moléculas; - Proteínas termoresistentes: ✓ Taq polimerase (Thermus aquaticus) ✓ Pfu polimerase (Pyrococcus furiosus) – Ácidos nucléicos por exemplo com maior concentração de bases C≡G Efeito do pH no crescimento microbiano 1 3,5 7 9 14 pH Acidófilos Ex: Acidithiobacillus sp. Neutrófilos Ex: Escherichia coli AlcalófilosEx: Bacillus sp. T a x a d e cr es ci m en to pH = Acidez ou alcalinidade de uma solução. A maioria dos microrganismos cresce melhor perto da neutralidade. Poucas bactérias são capazes de crescer em pH ácido (como pH 4,0). Bactérias: faixa entre pH 7,0. Exceções:Thiobacillus de 0,5 a 6,0 com ótimo entre 2 e 3,5), Bactérias alcalifílicas: (Bacillus e Archaea) (pH 10 – 11) Fungos tendem a ser mais acidófilos que as bactérias (pH <5). 30 Disponibilidade de água/Concentração do íon sódio Atividade de água (aw): quantidade de água livre, disponível para o uso por parte dos microrganismos. Pode variar de 0 a 1. Microrganismos marinhos tem necessidades especificas de íon sódio sendo denominados halófilos. 31 Não halófilos – 0 a 1,5% Halófilos discreto-1 a 6% de NaCl Halófilos moderado -6 a 15% de NaCl, Halófilos extremos -15 a 30% de NaCl. Halotolerantes – crescem em maiores concentrações de sais mas preferem concentrações inferiores a 9% 32 33 34 Cultivo de microrganismos em laboratório 35 36 Meios de cultura ou Meios de cultivo Meios de cultura: - Soluções nutrientes utilizadas para promover o crescimento de microrganismos em laboratório - Fornece os nutrientes indispensáveis ao crescimento do microrganismo fora do seu habitat natural. - São preparados em laboratório com água destilada ou deionizada, - Podem também ser adquiridos prontos para uso. 37 Meio líquido: nutrientes são dissolvidos em água e esterilizados. - Usados em estudos de crescimento, cultivo em fermentação e na produção de biomassa Consistência ou estado físico dos meios de cultivo Meio sólido: são preparados a partir da adição de um agente solidificante, antes da esterilização do meio. - Usados para contagem e isolamento de microrganismos (1,5% Agar) 38 Consistência ou estado físico dos meios de cultivo Meio semi-sólido: são preparados pela adição de uma quantidade menor do agente solidificante (0,7% Agar). - Usados para a detecção de placas de lise em culturas bacterianas infectadas por vírus e microrganismos microaerofílicos ou móveis 39 Meios sólidos e semi-sólidos Ágar: polissacarídeo complexo extraído de algas marinhas com propriedade de fundir a 96oC e solidificar a 45oC. Não é usado como fonte de nutrientes pela maioria dos microorganismos 40 Meio Mínimo (MM): é sintético e fornece somente nutrientes essenciais ao desenvolvimento da célula. Meio Completo (MC): é sintético e fornece todos nutrientes para o desenvolvimento da célula. Definidos: são preparados pela adição de quantidades precisas de compostos químicos inorgânicos ou orgânicos altamente purificados a uma determinada quantidade de água destilada. - A composição química exata é conhecida Indefinidos ou Complexos: A composição exata de cada nutriente não é conhecida. -Ex: peptona, extrato de levedura, soja, carne, entre outros Quanto à composição os meios podem ser classificados em: 41 Meios definidos 42 43 BDA (batata-dextrose-ágar- fungos) Batata (caldo) 200g Dextrose 20g Ágar 15g Água dest. 1000mL Caldo Nutriente (bactérias) Extrato de carne 3,0g Peptona 5,0g Água dest. 1000mL Meios complexos são altamente nutritivos, geralmente mais fáceis de preparar, são os mais usados ( composição exata não é necessária), mais adequados para fastidiosos (microrganismos nutricionalmente exigentes). Meios indefinidos ou complexos 44 Substratos para meios complexos - Extrato de Carne: extrato aquoso de tecido muscular, concentrado sob a forma de pasta, contém carboidratos, N orgânico, vitaminas hidrossolúveis e sais. - Peptona: produto da digestão da carne (enzimática ou ácida), fonte de nitrogenio orgânico e vitaminas. - Triptona: hidrolisado pancreático de carne , rica em nitrogênio- amínico; destinado ao isolamento de organismos de difícil crescimento. - Extrato de Levedura: extrato aquoso de células de leveduras lisadas, fonte excelente de substâncias estimulantes do crescimento como vitamina complexo B; contém compostos orgânicos de N e C. - Extrato de malte: extrato aquoso de cevada malteada. Rica em carboidratos, contém material nitrogenado, vitaminas e sais minerais. -Tripticase: peptona derivada da caseína por digestão pancreática,fonte rica em nitrogênio de aminoácidos 45 - Meios formulados para objetivos específicos, utilizados principalmente nos trabalhos de identificação de microrganismos. Podem ser: - Enriquecimento: Favorece o crescimento de determinada população. - Multiplicação dos microrganismos de interesse quando estes estão em pequeno número. Ex: Meio contendo celulose como fonte de carbono ou meio com fenol para microrganismos que degradam essa fonte. Meios Especiais 46 Meios Especiais Ágar sangue - diferencial Diferencial: contém substâncias químicas mais complexas e permite diferenciar os microrganismos quanto ao seu crescimento e morfologia. Ex: EMB – Colônia de E. coli verde escuro e Salmonela incolor. - Meio agar-sangue, identificação de bactérias patogênicas produtoras de hemolisinas. - Ex: Streptococcus e Staphylococcus (anel claro em torno da colônia). E.coli em EMB Seletivo: Favorece um microrganismo e inibe o crescimento de outros. - Ex: Adição de um antibiótico específico - pH específico para determinados microrganismo - Ágar Sabouraud: pH 5,6 e alta concentração de glicose (seletivo para fungos) - Ágar verde brilhante: seletivo para enterobactérias Gram - (Salmonella) o corante verde brilhante adicionado ao meio inibe as bactérias Gram (+) 48 Ágar MacConkey Ágar MacConkey - Contém sais biliares e corante cristal violeta, que inibem o crescimento de Gram + e permitem o desenvolvimento de Gram – - E lactose (diferenciar bactérias que utilizem este carboidrato). - Colónias bacterianas que fermentam lactose tornam o meio rosa choque - As bactérias que não são fermentadoras de lactose tornam o meio amarelo claro. Seletivo/diferencial: diagnóstico de patogênicos (coliformes fecais). : 49 Cultivo de Microrganismos -Isolamento - Contagem - Identificação -Segurança de águas potáveis públicas -Diagnóstico, tratamento e prevenção de doenças -Selecionar linhagens de interesse industrial Importância da Caracterização dos Microrganismos 50 Isolamento dos Microrganismos • Para se caracterizar um microrganismo ele deve estar em cultura pura, ou seja, ele precisa ser isolado dos demais microrganismos do meio onde se encontra • Cultura pura: quando uma colônia ou cultura é originada de uma única célula. • Cultura mista: se a colônia ou cultura é originada de mais de uma célula. Técnica de esgotamento por estrias Estria compostaEstria simples Isolamento do Microrganismos 52 53 Métodos Contagem 54 Contagem de colônias em placas diluição seriada Contagem de colônias em placas diluição seriada de fungos filamentosos UFC/mL= nº colônias x fator diluição / aliquota plaqueada UFC=Unidades Formadoras de Colônias 55 56 Contagem microscópica direta 57 Turbidez medida em um espectrofotômetro ou em um fotômetro 58 Curva de crescimento típica de uma população bacteriana Crescimento bacteriano-Aumento do número de células 59 60 Formas de multiplicação •Exosporulação (assexuada): Ex: Streptomyces •Fragmentação de filamentos: Ex: Nocardia •Brotamento: Ex: Rhodopseudomonas •Fissão binária: Ex: Escherichia coli 61 Cultura contínua- Quimiostato 62 Tempo de geração: é o intervalo de tempo necessário para que uma célula se duplique. - É variável para os diferentes organismos, podendo ser de 10, 20minutos até dias. - O tempo de geração não corresponde a um parâmetro absoluto, uma vez que é dependente de fatores genéticos e nutricionais, indicando o estado fisiológico da cultura. Taxa de crescimento (velocidade específica de crescimento): é a variação no número ou massa de microrganismos por unidade de tempo. 63 • O tempo de geração pode ser calculado quando uma cultura encontra-se em fase exponencial, pela fórmula: • g = t/n • g = tempo de geração • t = tempo de crescimento • n = número de gerações dentro de um tempo de crescimento dado pela equação: • N=No.2n • N= número final de células • No= número inicial de células • n= número de gerações • Como o crescimento é exponencial então: • n= log(N) - log(No)/0,301 Próxima Aula Metabolismo microbiano 64
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