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ENZIMAS O que são ENZIMAS? Características Extraordinária eficiência catalítica, aumentando a velocidade de reação em 109 a 1020 vezes; Alto grau de especificidade em relação ao substrato (reagente); Não é consumida ou alterada durante as reações; Não altera o equilíbrio químico das reações. Cada enzima catalisa uma etapa de uma série ordenada de reações que no conjunto formam uma via bioquímica ou metabólica. REAGENTE A PRODUTO 1 PRODUTO 2 PRODUTO 3 PRODUTO 4 PRODUTO 5 E1 E2 E3 E5E4 Estrutura Sítio ativo Sítio alostérico Sítio Ativo Ligação E + S Enzimas ligam o(s) substrato(s) temporariamente, diminuindo a energia de ativação. Invertase Sacarose Complexo enzima- substrato Ligação ES Dois modelos: a) CHAVE-FECHADURA (Emil Fischer, 1894): formato de S e a conformação do sítio ativo são complementares. Enzima Substrato b) ENCAIXE INDUZIDO (Koshland, 1958): E e/ou S sofrem mudanças conformacionais. Substratos se ligam ao sítio ativo que muda a forma para encaixá- los (indução pelo substrato). Substratos ligam-se ao sítio ativo por interações fracas, tais como ligações de hidrogênio e ligações iônicas. Substratos são convertidos em produtos. Produtos são liberados. Sítio ativo está livre para ligar novos substratos. Complexo ENZIMA- SUBSTRATO PRODUTOS ENZIMA SUBSTRATOS http://highered.mcgraw- hill.com/sites/0072495855/student_view0/chapter2/animation__how_enzymes_work.html Enzimas alostéricas Contêm uma região separada daquela em que se liga o substrato, na qual pequenas moléculas regulatórias (efetores = indutores/inibidores) podem se ligar e modificar a atividade catalítica destas enzimas. Ativador ATIVAÇÃO ALOSTÉRICA Certas enzimas requerem um ou mais componentes não protéicos para sua ativação: Cofatores: normalmente são íons metálicos, como Ca2+, Cu2+, Fe2+, Zn2+, K+, Mg2+. Coenzimas: compostos orgânicos não protéicos, muitas vitaminas e compostos delas derivados. http://highered.mheducation.com/sites/0072943696/student_vi ew0/chapter17/animation__b_vitamins.html Coenzima/ cofator Porção não proteica = ativador Apoenzima (parte proteica). Inativa Holoenzima (enzima completa). Ativa SUBSTRATO Cinética enzimática Reação enzimática em 2 etapas E + S k1 k2 ES k3 E + P k = constante de velocidade= [produto] [substrato] Cinética enzimática “A velocidade de uma reação química é expressa, normalmente, em termos de mudança da concentração de um dos reagentes ou de um produto em um dado intervalo de tempo.” A + B P Diminuição do(s) substrato(s) Formação de produto Atividade enzimática Substrato Produto Cinética Enzimática Determinar as constantes de afinidade do S e dos inibidores; Conhecer as condições ótimas da catálise; Ajuda a elucidar os mecanismos de reação; Determinar a função de uma determinada enzima em uma rota metabólica. Cinética enzimática Abordagem de Michaelis-Menten E + S ES E + P k = cte. de velocidade k1 k3 k2 V [S] KM = [S] para atingir Vmáx/2 Inverso da medida da afinidade da enzima pelo substrato. Km Constante de Michaelis Medida da afinidade de E por S Específico para cada enzima Cinética enzimática Km= [S] Numericamente, Km pode ser expresso como a [substrato] necessária para que a velocidade da reação seja metade da velocidade máxima V máx [S] V Vmax 2 Michaelis e Menten expressaram matematicamente a velocidade da reação pela fórmula: V= Vm . [S] Km +[S] Km + [S] = [S]. Vm V Quando V = Vm 2 Km= [S] . Vm . 2 [S] Vm Km= [S] E + S k1 k2 ES k3 E + P Km Pequena [substrato] para a reação atingir metade da Vmáx. > Afinidade da enzima pelo substrato Km Grande [substrato] para a reação atingir metade da Vmáx. < Afinidade da enzima pelo substrato Fatores que afetam a atividade de uma enzima E + S ES E + P - pH - temperatura - concentração do substrato - concentração da enzima - afinidade da enzima pelo substrato - cofatores/coenzimas - presença de inibidores Mantidas as condições de - temperatura ótima - pH ótimo - [enzima] [S] Concentração do substrato Concentração de substrato Em baixas concentrações de substrato a velocidade da reação é de primeira ordem – proporcional a [S]. Em altas concentrações de substrato, a velocidade da reação é de ordem zero – constante e independente da [S]. [S] Mantidas as condições de - temperatura ótima - pH ótimo - [S] em excesso [E] Concentração de enzima pH Temperatura Taxa de reação Temperatura C Outros fatores que podem afetar a atividade enzimática 1) Presença e concentração do cofator/coenzima (enzimas alostéricas); 2) Presença de inibidores • Inibidor é qualquer substância que reduz a velocidade de uma reação enzimática. Inibidores Reversíveis Irreversíveis Competitivos Não competitivos Incompetitivos Inibições das reações enzimáticas Inibidor: substância que interfere na ação de uma E, tornando mais lenta a velocidade de uma reação. Muitos inibidores são constituintes normais das células REGULADORES. Formas de ação: 1. Inibição reversível a) Competitiva: I tem estrutura semelhante a S. Mesmo sítio ativo. E + I EI + S P Inibição Competitiva [substrato] necessária para que a enzima funcione normalmente afinidade da enzima pelo substrato Na presença do inibidor competitivo Km da enzima INIBIÇÃO COMPETITIVA Fígado Inibição Competitiva Intoxicação por metanol Metanol Álcool desidrogenase Causa lesão tecidual cegueira Infusão EV Etanol URINA Formaldeído CH3CH2OH + NAD+ CH3CHO + NADH + H+ ADH b) Não competitiva: I liga-se a um sítio diferente do sítio ativo mudança conformacional em torno do sítio ativo ES Conhecida como INIBIÇÃO ALOSTÉRICA http://highered.mheducation.com/sites/0072943696/student_vie w0/chapter2/animation__feedback_inhibition_of_biochemical_ pathways.html INIBIÇÃO NÃO COMPETITIVA http://www.chem.purdue.edu/courses/chm333/enzyme_inhibiti on.swf 2. Inibição irreversível – inibidores SUICIDAS Alguns inibidores irreversíveis são VENENOS, como é o caso de inseticidas organofosforados e carbamatos que inibem a acetilcolinesterase (EC 3.1.1.7). Essa enzima hidrolisa a acetilcolina do cérebro, de acordo com o esquema a seguir: : Malation: A inibição da enzima leva a uma maior estimulação dos receptores muscarínicos e nicotínicos e, consequentemente, a um quadro colinérgico agudo. Paralisia dos músculos necessários à respiração e parada dos batimentos cardíacos. Herbicidas inibidores de enzimas – nomes comuns Unidade enzimática internacional (UI): Quantidade de enzima que catalisa a reação de um micromol de substrato por minuto, em condições padronizadas de temperatura, pH, substratos e ativadores. Recebe o nome da reação que catalisa e/ou do composto em que atuam. Ex. Lactato desidrogenase. Nome usual consagrado pelo uso. Ex. amilase, tripsina, pectinase, quimotripsina, etc.; Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB) http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/ Nomenclatura Classes 1 Oxirredutases Catalisam reações de oxi-redução, transferindo elétrons,hidretos (H - ) ou prótons (H + ). 2 Transferases Transferem grupos químicos entre moléculas. 3 Hidrolases Utilizam a água como receptor de grupos funcionais de outras moléculas. 4 Liases Formam ou destroem ligações duplas, respectivamente retirando ou adicionando grupos funcionais 5 Isomerases Transformam uma molécula em seu isômero. 6 Ligases Formam ligações químicas por reações de condensação, consumindo energia sob a forma de ATP. Classificação segundo a Comissão de Enzimas Ex. PAL – fenilalanina amônia liase Nome sistemático: Phenylalanine ammonia-lyase Reação que catalisa: L-fenilalanina <=> ácido trans- cinâmico + NH3 Número: EC 4. 3. 1. 5 Enzyme Comission classe subclasse sub- subclasse Nº de ordem Transferase Fosfotransferase Aceptor grupo OH OH da Glu que recebe o fosfato Nome recomendado Enzyme Commission EC 2.7.1.2 Nome sistemático = ATP-glucose-fosfotransferase; Comum = glucoquinase. Ação de algumas enzimas na deterioração de alimentos • Peroxidases – Deterioração - frutas: contribui na reação de escurecimento. • Polifenol oxidase Chá/Café: desenvolvimento do escurecimento durante o amadurecimento e fermentação. Deterioração - Frutas e vegetais: reação de escurecimento. Melaninas Isoenzimas: Diferentes formas moleculares (variantes) de uma enzima, que atuam sobre o mesmo substrato, em organismos diferentes ou em tecidos diferentes de um mesmo organismo. Ribozimas: Moléculas de RNA que têm função de enzima. Removem partes de mRNA (introns) e unem os funcionais (exons). Enzimas são Catalisadores facilitam a conversão Substrato produto ligam Substratos diminuem Energia de ativação Chave-fechadura “encaixe induzido” Teorias de ligação estrutura utilizada “construir” Inibidores classificados como Competitivos Não competitivos são Controladas por Coenzimas e cofatores Mudança conformacional Efetores alostéricos Ativadores ou repressores via podem ser Usados p/ “construir” Ativação proteolítica http://www.mheducation.ca/school/applets/abbio/quiz/ch06/a_bi ochemical_pathway.swf
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