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MANIPULAÇÃO MOLECULAR E BIOTECNOLOGIA – EXAME TEÓRICO EM 
 
O DNA complemantar (cDNA) de um gene contém: 
a) Sequencia correspondente aos intrões 
b) A Sequencia correspondente à região promotora 
c) As sequencias correspondentes aos codões 
d) Uracilo em vez de Timina 
e) Um local múltiplo de clonagem 
 
O rastreio de colónias azuis/brancas baseia-se num fenómeno chamada alfa complementação. Para se poder usar 
este sistema de rastreio é necessário deispor de uma estirpe especial de E. coli que: 
a) Expresse o fragmento C-terminal da B-galactosidase 
b) Expresse o fragmento N-terminal da B-galactosidase 
c) Possua o gene lacZ’ num plasmidio F+ 
d) Degrade o substrato X-Gal de modo espontâneo 
e) Possua o gene CcdB funcional 
 
A presença de IPTG nos meios de cultura para rastreio de colonias azuis/brancas tem como função: 
a) Inativar o operão lac 
b) Inativar a proteína repressora do operão lac 
c) Produzir uma cor azul ao ser hidrolisado pela B-galactosidase 
d) Substituir a função do X-Gal 
e) Inibir a expressão do fragmento N-terminal da B-galactosidase 
 
A técnica de clonagem conhecida por TA cloning baseia-se: 
a) Na utilização de enzimas de restrição mais ligase 
b) Na propriedade natural dos promotores TATA sofrerem recombinação 
c) Na propriedade especial da Taq DNA polimerase, que deixa extremidades protuberantes 3’-A nos 
amplificados 
d) No facto de sequencias ricas em AT poderem ser mais facilmente amplificadas 
e) Em plasmídeos linearizados que possuem uma timina protuberante numa extremidade e uma adenina 
protuberante na outra extremidade 
 
A tecnologia de DNA microarrays 
a) Permite detecção e quantificação simultânea de milhares de mRNAs numa amostra 
b) Só é aplicável a detecção de sequencias especificas de DNA genómico da amostra 
c) Faz uso de um só tipo de fluorocromos 
d) Baseia-se no uso da Taq DNA polimerase 
e) É utilizada para transfectar células estaminais embrionárias 
 
A mutagénese dirigida sitio especifica pode ser efectuada por PCR. Para isso: 
a) O programa do termociclador deve ser terminado num período de 95ºC para se obter DNA em cadeia 
simples 
b) Os primers incorporam a mutação pretendida 
c) O resutado da amplificação é um produto circular 
d) Durante a reação de PCR o DNA amplificado tem que sofrer metilação 
e) A reacção deve conter 3 primers em vez de dois 
 
A técnica mais habitual para introduzir DNA estranho em plantas é baseada em: 
a) Electroporação 
b) Aceleração de partículas 
c) Infecçao via plasmidio TI 
d) Microinjecção 
e) Lipossomas 
 
Uma biblioteca genómica contém 
a) Todos os genes do organismo 
b) Apenas genes expressos 
c) Fragmentos do genoma cortados com varias enzimas de restrição 
d) Fragmentos do genoma que resulta de uma digestão parcial com uma enzima de restrição 
e) Vetores de clonagem que são somente fagos como por exemplo fago EMBL 
 
Clonagem posicional é um método que permite 
a) Clonar regiões distantes de um cromossoma por ciclos sucessivos de hibridação 
b) Clonar regiões homologas de dois cromossomas por ciclos sucessivos de hibridação 
c) Clonar regiões próximas num cromossoma utilizando fragmentos de DNA sobreponíveis em ciclos sucessivos 
de hibridação 
d) Clonar regiões trans de um cromossoma por hibridação utilizando sondas de cDNA sobreponíveis 
e) Clonar genes relacionados funcionalmente através de hibridações com sondas de fragmentos de DNA 
distantes no cromossoma 
 
Na síntese de cDNA a partir de mRNA utiliza-se: 
a) Terminal transferase 
b) Transcriptase reversa 
c) DNA polimerase I de E. coli 
d) T4 DNA ligase 
e) RNA polimerase 
 
Uma reação de sequenciação de DNA pela técnica de cycle sequencing envolva a presença de: 
a) DNA polimerase I 
b) Dois primers por reação 
c) Um primer por reação 
d) Quatro tipos de ddNTPs marcados radioactivamente por reação 
e) Quatro tipos de ddNTPs marcados com um fluorocromo por reação 
 
As cadeias de DNA obtidas numa reação de sequenciação são separadas: 
a) Em gel desnaturante de agarose 
b) Em gel não desnaturante de agarose 
c) Em gel desnaturante de poliacrilamida 
d) Em gel não desnaturante de poliacrilamida 
e) Em gel de agarose de concontração mínima 
 
Quais são as moléculas de DNA que apresentao uma maior temperatura de desnaturação, Tm? 
a) As moléculas com um conteúdo mais rico nos pares de bases AT 
b) As moléculas com um conteúdo mais rico nos pares CG 
c) As moléculas com menor quantidade de GA 
d) As moléculas com menor quantidade de CT 
e) As moléculas com igual conteúdo de GA e CT 
 
FISH é um processo de hibridação que designa 
a) Hibridação in situ com fluorescência 
b) Hibridação intra cadeias de DNA com genes da mesma família 
c) Hibridação livre (free) in solution 
d) Hibridação in state com fluorocromos específicos 
e) Todas as alíneas estão erradas 
 
A hibridação Northern 
a) Inclui o uso de anticorpos como sonda 
b) Permite a determinação do tamanho de um intrão 
c) Permite a identificação de DNA especifico 
d) O tamanho do genoma 
e) Permite a determinação do tamanho dum mRNA 
 
Duas cadeias de DNA podem-se manter emparelhadas apesar de pertenceram a organismos diferentes e 
apresentarem uma percentagem de identidade de sequencia 80%. Isso acontece se as duas cadeias estiverem sobre 
baixas condições de restringência. Estas condições de baixa restringência, relativamente a restringência elevada, 
implicam: 
a) Uma temperatura dde hibridação maior 
b) Uma concentração maior de um agente desnaturante na solução de hibridação 
c) Ausência de agente desnaturante na solução de hibridação 
d) Uma menor concentração de sal na solução de hibridação 
e) Um pH mais básico na solução de hibridação 
 
A extração e purificação de DNA genómico de organismos eucariontes parte sempre de 
a) Homogeneização das células e isolamento dos núcleos 
b) Fixação das células com glutaraldeido 
c) Isolamento dos cloroplastos e mitocôndrias 
d) Cristalização do DNA 
e) Precipitação com etanol do DNA 
 
No procedimento de purificação com DNA é por vezes necessário extrair o DNA com fenol ou com uma mistura de 
fenol – clorofórmio. A preparação é submetida a uma centrifugação para se retirar da solução 
a) O RNA que se encontra na fase aquosa superior 
b) As proteínas que se encontram na fase superior fenólica 
c) As proteínas que estão precipitadas no limite entre a fase fenólica e a fase aquosa 
d) O RNA que se encontra na fase inferior fenólica 
e) Os glicolípidos que se encontram na fase aquosa 
 
Uma técnica que permite determinar o tamanho de moléculas de DNA especificas é: 
a) Western blot 
b) Northern blot 
c) Eastern blot 
d) Southern blot 
e) Zoo blot 
 
Perguntas*que*o*pessoal*se*lembra*
1"questão*8*das*fichas*em*inglês*
2"*calculo*da*eficiencia*e*do*rendimento*
3"*tb*acho*eu*para*que*serve*o*Nothern*blotting**
4"Como*se*chama*à*manipulação*de*extractos,*desde*DNA,*proteínas,*etc:**
a)Transgenia*b)Biotecnologia*...**
5"No*cycle*sequencing..*
a) usam"se*2*primers*por*reacção**b)*usa"se*1*primer*por*reacção**c)tal*e*tal*DNA*polimerase**
6"As*bibliotecas*genómicas**
a) contém*todos*os*genes*de*um*organismo*b)fragmentos*de*DNA*cortados*com*enzimas*de*
restrição*c)*fragmentos*de*DNA*digeridos*parcialmente*com*uma*enzima*de**
7"saiu*uma*imagem*do*ciclo*de*PCR,*e*tinhamos*de*dizer*o*nome*de*cada*fase*do*ciclo*e*o*que*
podia*melhorar*em*cada*fase*para*aumentar*o*rendimeno*deste**
8"clonagem*posicional/*separaçao*de*proteinas*por*fenol/*mutagene*dirigida/*1o*passo*
extracao*dna*eucariotico/*cloning*ta/*para*que*serve*microaaray//vantagem*qpcr//*separacao*
para*sequenciacao*em*que*gel/*baixar*a*restringencia*como/*transcriptase*reversa*para*fazer*
cdna/**
9"fazer*primer*degenerado*a*partir*de*sequencias*de*varios*organismos/*fazer*primers*de*uma*sequencio*(como*exame*modelo)/*
*
*
Correção*das*perguntas*do*exame*de*época*normal*2013"MMB*EM*teórica*
1.c); 2.a); 3.b); 4.c); 5.a); 6.b); 7.c); 8.c); 9.c); 10.b); 11.c); 12.c); 13.b); 
14.a); 15.e); 16.c); 17.a); 18.c); 19.d);*
*
Manipulação Molecular e Biotecnologia  
 
 
 
 
 
NOME:   ____ CURSO:    
 
 
Na  experiência  esquematizada  na  figura, 
bacteriófagos  com  elevada  frequência  de 
infecção  (e.o.p.  =1)  na  estirpe  original  X, 
foram usados para re‐infectar quer a estirpe 
X novamente, quer a estirpe Y. 
 
Em cada círculo representando uma placa de 
Petri, indique a frequência de infecção (e.o.p. 
– efficiency of plating) esperada:  
  1 para e.o.p elevada. 
  2 X 10‐4 para e.o.p. baixa  
 
 
 
Porque razão, para o mesmo bacteriófago, a 
eficiência  de  infecção  não  é  sempre  igual 
para as mesma estirpes? 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Se um DNA for propagado numa estirpe de E. 
coli  com  fenótipo  (r–,  m+)  poderá,  uma  vez 
clonado  nesta  estirpe  e  após  extraído  e 
purificado, ser propagado numa outra estirpe 
sem mutações nos 3 genes hsd? Justifique. 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
1
5 ‐ Relativamente à Sau3A1 (’GATC) diga, das seguintes enzimas qual ou quais a) são isoesquizómeros; b)têm 
extremidades compatíveis: 
 
1. XhoII – R’GATCY 
2. PsuI – R’GATCY 
3. FbaI – T’AGATCA 
4. NdeII – ’GATC 
5. BamHI – G’GATCC 
6. DpnI – GA’TC 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
2‐ Foi obtido um fragmento de restrição por digestão de gDNA de Arabidopsis com a enzima BglII, e clonado no local 
BamHI do plasmídeo pUC57. Para recuperar este importante fragmento de DNA, porque é que não foi possível usar 
nem a BamHI nem a BglII? Explique a sua resposta (se preferir, recorrendo a um esquema).  
Locais de reconhecimento das enzimas 
BamHI: G/GATCC e BglII: A/GATCT. 
 
 
 
 
 
Na imagem abaixo está representado o resultado da separação, por electroforese em gel de agarose 
de: 1 plasmídio pUC  extraido de E. coli e não cortado; 2 – plasmídio pUC digerido com enzima HindIII; 
3‐ Marcador DNA de lambda digerido com HindIII. A enzima HindIII possui apenas um local de 
reconhecimento no plasmídio pUC.  (Ao lado encontramse os fragmentos obtidos por restrição de DNA 
de lambda com HindIII e respectivos tamanhos) 
 
a) A que configuração corresponde a banda mais forte do 
plasmídio pUC na pista 1? 
 
 
 
 
 
b – Porque razão a banda da pista 2, que corresponde ao mesmo plasmídio, se 
encontra numa posição correspondente a um tamanho molecular mais 
elevado? 
 
 
 
 
3 – Por comparação com o marcador molecular na pista 3 (Lambda/HindIII) 
qual é o tamanho aproximado do plasmídio? Justifique 
 
 
 
 
 
 
Symbol 
[1]  Description  Bases represented 
W  weak  A        T 
S  strong     C  G    
M  amino  A  C       
K  keto        G  T 
R  purine  A     G    
Y  pyrimidine     C     T 
B  not A     C  G  T 
D  not C  A     G  T 
H  not G  A  C     T 
V  not T  A  C  G    
N 
any base (not a 
gap)  A  C  G  T 
6‐ Messing e colaboradores desenvolveram uma classe de vectores (pUC) que permitem a identificação histoquímica 
dos clones recombinantes. Para isso 
a)incorporaram no vector o gene que codifica a beta‐lactamase 
b)incorporaram no vector o gene completo da beta‐galactosidase 
c)introduziram um local de clonagem múltipla no gene parcial da beta‐galactosidase 
d) introduziram um local de clonagem múltipla no gene resistência à ampicilina 
e)introduziram no vector a mutação lacZ'M15 (corresponde a uma delecção na porção que codifica a região N‐
terminal da beta‐galactosidase)  
 
7 ‐ O rastreio de colónias azuis/brancas baseia‐se num fenómeno chamado de alfa‐complementação. Para se poder 
usar este sistema de rastreio é necessário dispor de uma estirpe especial de E. coli que (assinalar opção correcta):  
a) Expresse o fragmento C‐terminal da b‐galactosidase 
b) Expresse o fragmento N‐terminal da b‐ galactosidase 
c) Possua o gene lacZ’ num plasmídeo F’ 
d) Degrade o substrato X‐Gal de modo espontâneo 
e) Possua o gene CcdB funcional 
 
Na síntese de cDNA a partir de mRNA utiliza‐se (assinalar a opção correcta) 
a) terminal transferase 
b) DNA polimerase I de E. coli  
c) T4 DNA ligase 
d) RNA polimerase 
e) transcriptase reversa 
 
Na síntese de mRNA a partir de cDNA utiliza‐se (assinalar a opção correcta) 
a) terminal transferase 
b) DNA polimerase I de E. coli  
c) T4 DNA ligase 
d) RNA polimerase 
e) transcriptase reversa 
 
 
Um  cDNA  possui  uma  extremidade  NotI  a  5'  e  uma  extremidade  EcoRI  a  3'  (poli‐A)  e  está  inserido  no  vector 
pBluescript SK  II  (ver mapa em anexo). A partir do referido cDNA clonado pretende‐se obter uma SONDA de RNA 
por  transcrição  in  vitro para detectar os  respectivos mRNAs  em  técnicas de  "Northern blotting".  Para  isso,  após 
linearização do plasmídio com enzima de restrição adequada adiciona‐se  
 
a)ribonucleotídeos e a RNA polimerase específica para o promotor T3  
b) ribonucleotídeos e a RNA polimerase específica para o promotor T7  
c) desoxirobonucletídeos e uma transcriptase reversa  
d) um iniciador (poli‐dT) que emparelhasse com a sequência poli‐A do cDNA e transcriptase reversa  
e) um iniciador que emparelhasse com a sequência do promotor T7 e a respectiva RNA polimerase 
 
Justifique a resposta anterior 
 
A enzima Taq DNA polimerase (assinalar com V ou F, respectivamente para “verdadeiro” e “falso”)  
____apresenta actividade de exonuclease de 5’ para 3’ 
____apresenta actividade de exonuclease de 3’ para 5’ 
____apresenta actividade de “proofreading” 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
7 – Faça a legenda da figura. 
 
8 – Caracterize, justificando,  os 3 pares de “primers” relativamente a  
  a) eficiência 
  b) especificidade 
 
 
 
 
 
 
 
20 ‐ Com o objectivo de expressar a proteína em E. coli e após ser conhecida a sequência de cDNA de cardosina A foram 
desenhados dois primers com adaptadores NheI. Pretendia amplificar‐se a zona de 76 a 1515 da sequência abaixo. A sequência 
de reconhecimento da NheI é G^C T A G C 
Assinale na sequência da ficha abaixo a zona de emparelhamento dos primers Primer F ‐ Pro‐NheIe  e Primer R  ‐NheI (Reverse). 
Indique abaixo,  a sequência nucleotídica do Primer R  ‐NheI (Reverse) 
Primer F ‐  Pro‐NheI, GCTAGCTCCGATGACGGATTGATTCGA e  
Primer R  ‐NheI,_________________________________ 
Qual é o tamanho do amplificado com os primers referidos contendo o local NheI?_____________________ 
Porque razões foram acrescentadas aos primers sequências de reconhecimento para a enzima NheI? 
 
 
 
 
FICHA DO GENEBANK: 
LOCUS CCA132884 1515 bp mRNA PLN 30-SEP-1999 
DEFINITION Cynara cardunculus mRNA for preprocardosin A. 
ACCESSION AJ132884 
VERSION AJ132884.1 GI:4581208 
KEYWORDS cardA gene; cardosin A; preprocardosin A. 
SOURCE Cynara cardunculus. 
 ORGANISM Cynara cardunculus 
 
REFERENCE 1 (bases 1 to 1515) 
 AUTHORS Faro,C., Ramalho-Santos,M., Vieira,M., Mendes,A., Simoes,I., 
 Andrade,R., Verissimo,P., Lin,X., Tang,J. and Pires,E. 
 TITLE Cloning and characterization of cDNA encoding cardosin A, an 
 RGD-containing plant aspartic proteinase 
 JOURNAL J. Biol. Chem. 274 (40), 28724-28729 (1999) 
 MEDLINE 99428553 
REFERENCE 2 (bases 1 to 1515) 
 AUTHORS Faro,C.J. 
 TITLE Direct Submission 
 JOURNAL Submitted (25-MAR-1999) Faro C.J., Biologia Molecular e 
 Biotecnologia, Centro de Neurociencias de Coimbra, Universidade de 
 Coimbra, Edificio IBILI, Azinhaga de Sta Comba, 3000 Coimbra, 
 PORTUGAL 
FEATURES Location/Qualifiers 
 source 1..1515 
 /organism="Cynara cardunculus" 
 /db_xref="taxon:4265"/dev_stage="young flower buds" 
 /country="Portugal:Centro" 
 gene 1..1515 
 /gene="cardA" 
 CDS 1..1515 
 /gene="cardA" 
 /note="During maturation of the protein a propeptide (from 
 nucleotide 76 to 204) and an internal peptide (from 
 nucleotide 931 to 1242) known as PSI are removed." 
 /codon_start=1 
 /product="preprocardosin A" 
 /protein_id="CAB40134.1" 
 /db_xref="GI:4581209" 
 /translation="MGTSIKANVLALFLFYLLSPTVFSVSDDGLIRIGLKKRKVDRID 
 QLRGRRALMEGNARKDFGFRGTVRDSGSAVVALTNDRDTSYFGEIGIGTPPQKFTVIF 
 DTGSSVLWVPSSKCINSKACRAHSMYESSDSSTYKENGTFGAIIYGTGSITGFFSQDS 
 VTIGDLVVKEQDFIEATDEADNVFLHRLFDGILGLSFQTISVPVWYNMLNQGLVKERR 
 FSFWLNRNVDEEEGGELVFGGLDPNHFRGDHTYVPVTYQYYWQFGIGDVLIGDKSTGF 
 CAPGCQAFADSGTSLLSGPTAIVTQINHAIGANGVMNQQCKTVVSRYGRDIIEMLRSK 
 IQPDKICSHMKLCTFDGARDVSSIIESVVDKNNDKSSGGIHDEMCTFCEMAVVWMQNE 
 IKQSETEDNIINYANELCEHLSTSSEELQVDCNTLSSMPNVSFTIGGKKFGLTPEQYI 
 LKVGKGEATQCISGFTAMDATLLGPLWILGDVFMRPYHTVFDYGNLLVGFAEAA" 
 
BASE COUNT 400 a 298 c 368 g 449 t 
ORIGIN 
 1 atgggtacct caatcaaagc aaacgtgctt gccttgttct tgttttatct tctatcacct 
 61 actgtatttt cggtctccga tgacggattg attcgaattg gacttaaaaa gaggaaggtg 
 121 gaccgaatcg accaacttcg tggacgtcgt gcgttaatgg aaggaaatgc tcgaaaagat 
 181 ttcggcttcc gtggtacagt tagggactcg ggtagtgccg ttgttgcact aacgaacgat 
 241 agggatactt cgtattttgg tgagattggt atcggaactc cacctcagaa gttcacagtg 
 301 attttcgata ccggaagttc tgttctatgg gtgccttctt caaagtgcat caattcaaaa 
 361 gcttgtcgtg cgcactcaat gtatgagtcg agcgattcaa gtacctacaa ggaaaatggg 
 421 acatttggcg ctattatata tggaaccgga tcaatcacgg gtttttttag ccaagactct 
 481 gtcacgatcg gtgatcttgt tgttaaagag caggatttta tagaggcaac cgatgaggcc 
 541 gacaatgttt tcttgcatag gttgtttgac ggtatactcg gcctttcatt tcaaacgatc 
 601 tccgttcctg tctggtacaa catgcttaat caaggtcttg ttaaagaacg gaggttttcc 
 661 ttttggttga atcgcaatgt tgatgaggaa gaaggtggcg aactcgtgtt tggtgggctt 
 721 gaccctaatc attttagggg tgaccacact tatgtccctg tgacttatca gtactattgg 
 781 cagtttggaa tcggtgacgt tcttattgga gataaaagta ccggattttg cgcccctggt 
 841 tgtcaagcat ttgccgactc tggaacctct ttgttgtcag gtccaacggc tattgttact 
 901 caaatcaatc atgcaattgg cgctaacggg gtcatgaacc agcaatgcaa gacagtggtt 
 961 agtcgttatg gaagggatat aattgagatg ctccgatcta agatacaacc tgataaaatc 
 1021 tgttcgcaca tgaagttatg cacttttgac ggtgctcgcg atgttagttc aatcattgag 
 1081 agcgtggttg acaagaataa cgacaagtct tctggtggca tacatgatga gatgtgcacc 
 1141 ttctgtgaga tggcggtcgt ttggatgcaa aacgaaatca aacaaagcga gactgaagat 
 1201 aacataatca actatgccaa cgagttgtgt gaacacttat ccacttcatc tgaagaatta 
 1261 caagtagatt gcaacactct ttcctccatg cccaatgttt cctttacaat tggtggcaaa 
 1321 aaatttgggc tcaccccaga gcagtacatc ttgaaagtcg gtaagggaga agcaacacaa 
 1381 tgcatcagtg gattcactgc gatggatgcg actcttcttg gacctctgtg gatcctcgga 
 1441 gatgttttca tgcgtccata tcacacagtg tttgattatg gcaatttact agttggattt 
 1501 gcagaagcag cttga 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
Para optimizar uma reacção de qPCR para detecção de RNA específico, foi obtida uma recta padrão a partir de uma 
série de diluições do molde. C= concentração inicial, C X 10‐1; C X 10‐2 etc. 
log(1) = 0 
log(0,1) = ‐1 
log(0,01) = ‐2 
etc. 
 
Para se garantir o rigor quantitativo de qPCR, deve ser demonstrado que o valor de Ct tem uma relação de 
proporcionalidade com o log da quantidade de molde inicial presente na reacção. Habitualmente isso consegue‐se 
 
a) Analizando o gráfico de Ct vs. diluições sucessivas de quantidade inicial de molde 
b) Testando previamente a qualidade dos fluorocromos 
c) Averiguando se as concentrações de cada componente individual da reacção se encontra optimizado 
d)Testar o termociclador e verificar que se encontra em modo optimizado de funcionamento 
 
A partir do gráfico podemos afirmar que 
a) ao Ct de aprox. 35 corresponde a concentração mais elevada 
b) ao Ct de aprox. 10 corresponde uma diluição de 10‐4 
c) ao Ct de aprox. 35 corresponde uma diluição de 10‐4 
d) ao Ct de aprox. 35 corresponde o DNA não diluído 
 
A vantagem mais notável de qPCR sobre PCR convencional é: 
a) Não haver produtos de amplificação inespecíficos  
b) Permitir amplificar RNA sem necessidade da reacção prévia com a transcriptase reversa 
c) Ser muito mais rápida na obtenção de resultados 
d) Poder ser usada para determinar com rigor a quantidade inicial de molde na reacção 
e) Poder ser usada em grande escala com reagentes mais baratos 
 
A  recta‐padrão anterior permite estimar a gama de diluições em que o Ct  tem uma  relação de proporcionalidade 
com o log da quantidade de molde inicial presente na reacção. Podemos afirmar que 
a) existe proporcionalidade em toda a gama de diluições utilizadas 
b) não se conseguiu determinar o Ct para as duas amostras mais diluídas 
c) não se observa uma relação linear para as duas amostras mais concentradas 
d) não se deve diluir a amostra  
 
Na utilização da tecnologia “GeneChip microarray” para estudar a expressão genética de leveduras em meio mínimo 
quando comparada com a expressão genética em meio rico (V/F) 
___ esta  tecnologia permite quantificar os níveis de expressão  (volume de RNA) de determinados genes em cada 
situação 
___ as sondas correspondem aos RNAs extraídos das células 
___ as sondas poderão corresponder a porções de DNA imobilizados num suporte sólido 
___ o suporte divide‐se em posições (features) e cada uma tem apenas uma única molécula de DNA 
___ neste tipo de experiência ocorre emparelhamento de cadeias complementares de ácidos nucleicos formando‐se 
moléculas de cadeia dupla 
___ cada sonda deverá conter uma sequência única representativa de um gene específico 
 
 
21 ‐ Ordene os passos necessários para realizar a experiência acima referida 
____ O cDNA emparelha apenas com sondas complementares no “chip” 
____ são usados “lasers” para detectar a presença de fluorescência no “chip” 
____ a presença de fluorescência indica uma correspondência do cDNA com a sonda 
____ o RNA total é extraído de células nas diferentes condições experimentais 
____ o”chip” com a mistura de cDNAs vai a incubar a uma temperatura adequada à hibridação alvo‐sonda 
____ os cDNAs marcados são misturados e a mistura é pipetada sobre o “chip” 
____ o RNA sofre transcrição reversa para cDNA  
____ o “chip” é submetido a lavagem de modo a remover as moléculas não emparelhadas com a sonda 
____ o cDNA é marcado com fluorocromos diferentes consoante as condições experimentais das células 
 
22 ‐ Na detecção de mutações ou polimorfismos, nomeadamente SNPs por “microarrays” 
(escolher opção correcta) 
a) as sondas imobilizadas são constituídas por RNA mensageiro 
b) as sondas imobilizadas são constituídas por cDNA marcados com fluorocromos 
c) a amostra é constituída por RNA mensageiro 
d) a amostra é constituída por cDNA marcado com fluorocromos 
e) a amostra é constituída por DNA genómico 
 
 
 
 
 
 
 
O esquema representa o resultado de uma reacção de sequenciação manual realizada pelo método de Sanger. 
 
Qual é a sequência nucleotídica lida a partir do gel? 
______________________________________________________________ 
 
 
Neste esquema cada banda: 
a) Representa um nucleotídio diferente (G,A, T ou C) 
b) Representa um didesoxinucleotídio diferente (ddGTP,ddATP, ddTTP ou dd CTP) 
c) Representa um fragmento de DNA de cadeia simples que termina numa base conhecida 
d) Representa um fragmento de DNA de cadeia dupla que termina numa base conhecida 
 
22  ‐ A sequenciação pelométodo de Sanger é classicamente executada em 4 tubos separados de 
reacção. Contudo, é possível realizar quatro reacções simultaneamente no mesmo tubo desde que 
(assinalar opção correcta) 
a)  se use um nucleotídeo radioactivo incorporado no iniciador 
b) os ddNTPs sejam marcados radioactivamente 
c) os oligonucleotídeos iniciadores sejam marcados com fluorocromos emitindo diferentes cores 
d) cada ddNTP seja marcado com um fluorocromo diferente 
e)  cada  um  dos  4  dNTPs  normais  deve  ser marcado  com  um  fluorocromo  de  cor  diferente  dos 
outros 
 
 
 
Assinale com V/F as seguintes afirmações relativas à pirosequenciação: 
 
__ este processo envolve as enzimas DNA polimerase, sulfurilase e luciferase 
__ não é necessário usar oligonucleotídeos iniciadores 
__ é necessário utilizar di‐desoxinucleotídeos 
__ é necessário usar primes marcados com um fluorocromo 
__ um só tipo de dNTP é adicionado de cada vez á reacção 
__ cada vez que um nucleotídeo é incorporado, há libertação de  
__há uma relação entre o PPi libertado durante a incorporação de um nucleotídeo e a luz detectada no final da 
reacção