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Genética bacteriana Visão geral da construção de uma célula recombinante e alguns exemplos de sua aplicação Genes pertencentes a uma determinada célula de um organismo podem ser inseridos e expressos em células de outro organismo. Células geneticamente modificadas podem ser utilizadas para produzir uma grande variedade de produtos úteis. Replicação do DNA Replicação bidirecional de uma molécula circular de DNA bacteriano Replicação bidirecional de uma molécula circular de DNA bacteriano Bactérias: Onde encontramos genes????????? DNA Bacteriano, Plasmídios, DNA Fágico, Transposons Replicons Variações Temporárias (Sem alterações no genoma) (Alterações Fenotípicas) - Produção de beta galactosidase quando tem lactose no meio (regulação gênica) Fisiológicas -Serratia marcescens: 37º C – sem pigmento 25º C – vermelhas, -Bacillus sphaericus: 2% peptona (células vegetativas) 0,1% peptona (esporos) -Gram positivos: Culturas novas – cels. azuis Cultura velhas – cels. vermelhas, - Azomonas x sacarose x cápsula Morfológicas Variações Permanentes Com alterações no genoma) (Alterações genotípicas) Mutação e Recombinação Genética A plasticidade do genoma é resultado de aquisição de DNA por transferência horizontal de genes (THG) como por exemplo pela absorção de plasmídeos, fagos e DNA livre e redução do genoma de ADN por deleções, rearranjos e mutações pontuais. A ação combinatória de aquisição de DNA e perda de genes resulta em processo de otimização do genoma , que ocorre em resposta a certas condições de crescimento incluindo os processos de infecção e colonização do hospedeiro. Ahmed ety al. Nature Reviews Microbiology 6, 387-394 (May 2008) Transferência horizontal de genes por transformação, transdução e conjugação Otimização do genoma (rearranjos e mutações) Redução do genoma (deleção) Otimização do genoma (rearranjos e mutações) A absorção de elementos genéticos móveis (fagos, plasmídeos de virulência, ilhas de patogenicidade), e perda de porções de DNA-cromossômico em linhagens distintas de Escherichia coli, possibilitou surgimento de clones de diferentes patotipos de E. coli associados a sintomas de doenças específicas. LEE - locus of enterocyte effacement; PAIs - pathogenicity island; pEAF - enteropathogenic E. coli adhesion-factor plasmid; pENT- enterotoxin-encoding plasmids; Stx - Shiga-toxin-encoding bacteriophage. Ahmed ety al. Nature Reviews Microbiology 6, 387-394 (May 2008) E. coli enterohemorrágica -EHEC E. coli enteropatogênica-EPEC E. coli enterotoxigênica-ETEC E. coli enteroinvasiva-EIEC e Shigella sp. E. coli uropatogênica-UPEC E. coli comensal Plasmídeos Fagos Ilhas de patogenicidade 1. População de uma bactéria em processo de multiplicação minutos , horas, dias, meses tempo 2. Processo de crescimento e divisão produzem naturalmente células mutantes 3. População continua multiplicação, e originando ocasionalmente, mais células mutantes Células são expostas a um composto antimicrobiano Pressão seletiva 4. Células são mortas ou impedidas de multiplicação pela antimicrobiano com exceção dos mutantes resistentes ao antimicrobiano específico. 5. Os mutantes continuam com o crescimento na presença do antimicrobiano e iniciam dispersão pelo ambiente Variação permanente resultante de Mutação Mutação cria variação Mutação desfavorável é selecionada contra Ocorre reprodução e mutação Com a mutação favorável é provável que o mutante sobreviva... ....e se reproduza Variação permanente resultante de Mutação Variação permanente resultante de Recombinação Genética 1. Duas populações bacterianas A e B crescem em um mesmo ambiente. A espécie B é resistente a droga X. 2. Troca de DNA (elementos genéticos móveis) ocorre entre células em baixa frequência. 3. Células da espécie A recebem o gen de resistência a droga X, presente no elemento genético móvel da espécie B. Pressão seletiva Bactérias são expostas a droga X. 4. Na presença da droga X, as células da espécie A que receberam gen da resistência da espécie B são capazes de multiplicar-se enquanto que as células originalmente sensíveis não multiplicam-se. MUTAÇÃO “Alteração brusca no material genético” “Alteração hereditária em uma seqüência de bases do DNA” Mutante Natural (10-6 a 10-10 ) Adquirida ou Induzida (Agentes Físicos e Químicos) Klebsiella pneumoniae (Aspecto mucóide (molhado) de colônias) Variação S R Variação S (Smooth) R (Rough) em K. pneumoniae por mutação Resistência à drogas antimicrobianas por mutação (Tipo Cromossômica) Mutação Resistente a 500 g Bactéria sensível a estreptomicina (1 g) Modelo de um passo (“one step”) Bactéria sensível a Penicilina (1 g) Mutação Resistente a 10 g Resistente a 20 g Mutação Resistente a 50 g Mutação Modelo de vários passos (“multi step”) Tipos de Resistência Cromossômica Surgimento de mutantes auxotróficos devido mutação Placa mãe (crescimento em meio completo) Veludo estéril Aro de plástico Bloco de madeira Pressionar a placa sobre o veludo Veludo com a impressão das colônias Transferir a impressão das colônias para meios não inoculados Mutantes não crescem Todas as bactérias crescem Meio completo = placa mãe Meio mínimo Incubação “Moléculas distintas de DNA são combinadas numa mesma molécula, graças a um processo físico de quebra e ligação destas moléculas” RECOMBINAÇÃO GENÉTICA: Doadora Receptora DNA externo = DNA Exogenoto Destinos possíveis (? ) TRANSFORMAÇÃO (Griffith-1928) (Reversão Pneumocócica (RS) (Rough – Smooth) “Incorporação de DNA solúvel” (Lise ou Liberação Espontânea) (Plasmídeos são passíveis de transferência também) Condições para ocorrer a transformação DNA homólogo, Dupla fita e PM elevado (105 a 107), Meio sem DNAase (DNA solúvel, Qualquer momento, Determinado estágio do ciclo celular, Condições Especiais) Bactéria Receptora em Estado de Competência Fisiológica Transformação CONJUGAÇÃO (Tatum e Lederberg - 1947 - E.coli) “Transferência através de comunicação entre as duas bactérias” ( Unidirecional) Pili (Gram negativa) Ponte de conjugação (Gram positiva) Conjugação bacteriana Conjugação de Gram negativa Enterococcus faecalis pheromone-responsive conjugative system. Pheromone A released from the potential recipient cell (right) interacts with plasmid A in the potential donor cell (left) to induce synthesis of aggregation substance. Attachment of aggregation substance to binding substance causes the cells to clump into visible aggregates. Once the pheromone-responsive plasmid A has transferred from donor to recipient cell, synthesis of pheromone A is shut off. Doadora Receptora Conjugação de Gram positiva Adaptado de Murray, B.E. (1998) Processo mediado por Plasmídeos (Ex. Plasmídeo R=Resistência à drogas, F=Fertilidadede, Virulência, Col, Metabólico, Críptico, etc) Obs. DNA cromossômico também pode ser transferido durante a conjugação. Plasmídeo conjugativo Plasmídeo R TRANSDUÇÃO ( Zinder e Lederberg - 1952) Transferência (DNA bacteriano e Plasmídios)ocorre por meio de um vírus (Bacteriófago) TRANSDUÇÃO ( Zinder e Lederberg - 1952) Transferência (DNA bacteriano e Plasmídios) ocorre por meio de um vírus (Bacteriófago) Um fago infecta a célula bacteriana doadora O DNA e proteínas do fago são produzidos, e o DNA bacteriano quebrado em fragmentos. Ocasionalmente, durante a montagem do fago, fragmentos do DNA bacteriano são empacotados no capsídeo do fago. Então a célula doadora é lisada e as partículas de fago são liberados. Um fago carreando o DNA bacteriano infecta a nova célula hospedeira, a célula receptora. A recombinação pode ocorrer, produzindo uma célula recombinante com um genótipo diferente da célula doadora e da célula receptora. Ciclo Lítico (vírus virulento) Ciclo Lisogênico (vírus temperado) Transdução Generalizada – Fragmentos ao acaso do DNA bacteriano são empacotados e transferidos para células receptoras (ciclo lítico) Transdução Especializada – Fragmentos específicos do DNA bacteriano unem-se ao DNA do fago e são empacotados e transferidos (ciclo lisogênico) Transposon Genes Saltadores, Elementos Móveis ou “Jumping genes” Codificam Resistência a Drogas, Síntese de Toxinas e Enzimas Degradantes. Encontrados tanto em DNA cromossômico como em Plasmídios Tem sequência (de Inserção) que codifica enzima Transposase (Transposição ) Interfere com sequência linear do gene Mutação, Inativação ou Quebra; Mutagênese por Transposons Interação entre DNA e Proteínas Reguladoras Regulam síntese de RNAm e Atividade de enzimas específicas Regulação da Expressão Gênica Evitar síntese desnecessária de metabólitos, desperdício energético, acúmulo intracelular de metabólitos tóxicos. (Ex. Operon Lac em E.coli ( Operon Indutível); Operon Trp de E. coli (Operon repressível) Operon Lac de E. coli (Operon indutível) Operon Lac de E. coli (Operon indutível) Operon Lac de E. coli (Operon indutível) Operon Trp de E. coli (Operon repressível) Operon Trp de E. coli (Operon repressível) Operon Trp de E. coli (Operon repressível) Muito obrigado!!!!
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