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UNIVERSIDADE FEDERAL DO PIAUÍ CAMPUS DE PARNAÍBA CURSO DE BIOMEDICINA Disciplina: BIOINFORMÁTICA Prof. Jefferson Soares de Oliveira Resumo aula Bancos de Dados – Parte 01 O desenvolvimento dos bancos de dados Biológicos teve por objetivo armazenar, concentrar e disponibilizar a grande quantidade de informações (Ex. sequências de proteínas e nucleotídeos) obtidas por laboratórios de pesquisa e institutos de ensino em todo mundo. Os três maiores bancos de dados de arquivamento mundial são o National Center for Biotechnology Information (NCBI), o European Bioinformatics Institute (EBI) e o DNA Data Bank of Japan (DDBJ). O NCBI é um banco de dados americano e foi criado 1988, incorporando o GenBank, um banco de dados de sequências de nucleotídeos criado 1982 que armazenava resultados de pesquisas realizadas por institutos americanos. Os japoneses criaram o DDBJ no ano de 1986 enquanto que o EBI foi tornado público no ano de 1997 pela comunidade europeia. Atualmente, todos os dados relacionados à sequências de nucleotídeos são compartilhados entre os três bancos de dados através de um acordo de colaboração internacional (International Nucleotide Sequence Database Collaboration). Assim, um pesquisador pode recorrer a qualquer um dos três bancos de dados para depósito ou obtenção de sequências. Em nossa disciplina será dado ênfase ao banco de dados americano. No entanto, em alguns momentos iremos recorre a ferramentas disponíveis nos demais bancos de dados. O NBCI é um banco de dados de arquivamento mundial que tem por missão armazenar informações relacionadas ao entendimento da natureza através da elegante linguagem molecular das células vivas. O NCBI gerencia outros bancos de dados que armazenam as mais diversas informações, como por, o PubMed que é um banco de dados de literatura científica na área médica; RefSeqGene, que é um banco de dados de sequências de nucleotídeos de referência; o SNP, um banco de dados de variações polimórficas, dentre outros. Em nossas aulas, iremos explorar estes e outros bancos de dados, analisando de que maneira estes poderiam solucionar questões comumente enfrentadas por pesquisadores, profissionais e estudantes da área da saúde.
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