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Resu expre expre comu comp com expre identi patoló quad mas g Cânc expre indica com SAGE técnic (de 1 conté uma estive conta para deter long meno gene ou ai uma vários class tabela analis tecido tecido dividi image maior quant conta norm de um para pode de ta UNIVER CAMPUS CURSO Disciplin Prof. Jeff umo aula – E Vários gen essão destes essão de ge um exemplo parar os gen células saud essão aume ificação des ógico se co ros patológic geralmente e Na aula de cer dos Esta essão gênica ando um dife base na co E (Sequence ca se baseia 0 ou 17pb) o ém um pedaç biblioteca de er sendo ex adas, indican ele serão i rminado gen tag (etiqueta or a tag maio A busca pe (Gene symb nda o nome tabela com s resultados sificação. Qu a são aprese sada a parti os. Clicando os do corpo da por parte ens, o nível r que 512 ( tidade de tag agem das ta alização dos m determina cada análise Comparand mos observa ags observad SIDADE FEDERA S DE PARNAÍBA DE BIOMEDICIN na: BIOINFORMÁ ferson Soares de Expressão d nes são ex s genes é r enes geralm deste tipo d es que são e dáveis do m ntado ou di tes genes, o onfigura com cos. A anális estudando as e hoje iremos ados Unidos a em tecidos erente nível ntagem de e Analysis G a da criação obtidas de m ço de cada m e SAGE, a e xpresso, tag ndo o nível d dentificados e. As tags d a longa). O or a chance d elo padrão d bol), o núme do produto a melhor tag s da análise uanto maior entados três r de tecidos o em uma d e o nível de e do corpo, de expressã (> 520) tags gs encontrad gs do gene s dados é fe ado gene qu e experiment do o padrão ar se (1) não das nas dua AL DO PIAUÍ NA ÁTICA Oliveira de Genes pressos a t egulado pela mente estão de alteração expressos e esmo tecido minuído, e ou a análise mo important se da expres s moléculas s explorar um s chamada normais e m de expressã tags de SAG Gene Expres de tags (etiq mRNAs expre mRNA prese xpressão de gs para este de expressão . Esta análi de 10pb são tamanho da de encontrar e expressão ero de acess do gene (Ge g para o gen da expressã o Rank, ma imagens. A ; a segunda das imagens e expressão a ferramen ão é apresen s. Cada inte das no tecido de interesse ita para perm ue foi analisa tal um núme o de expres o houver alte as condiçõe todo instant as necessid associadas o pode ser o m células ne o, observarem outros terão e do compor te etapa no ssão de gen de mRNA p ma ferrament SAGE Anat malignos hum ão gênica. A GE identifica ssion) signific quetas) que s essados em ente na célula e um determi e gene não o do gene. Q ise permite chamadas d tag indicará r sua sequen o do gene po so do GenBa ene keyword ne (Best tag ão dos gene aior a confia primeira apr a de células s será apres dos genes e nta recebe o ntado em um ervalo é ide o. O número e para cada mitir que seja ado a partir ro total de ta ssão do gen eração no ní es se encon te dentro de ades celular s a diferent observado na eoplásicas d mos que alg o sua expre rtamento de o entendime nes pode ser resentes na ta presento n tomic Viewe manos pelo s A análise da adas para c ca Análise S são pequena um determi a. Uma vez q inado gene é serão verifi Quanto mais verificar o p de short tag á a especific cia em gene ode ser realiz ank do gene d). Após reali for gene). N s organizado abilidade do resenta resu e a terceira sentada um em cada um o nome de S ma escala var ntificado po o de tags apr 200.000 tag a possível co de amostra ags diferente ne no tecido ível de expre tram no me e uma célu res. Alteraçõ es quadros as células ne e um determ uns genes t ssão ativada genes dura nto do dese r feita de dife célula ou as no site do Ins er. Esta ferra sombreamen expressão ada tecido a erial da Exp as sequencia nado tecido. que uma tag é observada cados. As t expresso um padrão de e (etiqueta cu cidade para es diferentes. zada informa (GenBank a zar a busca esta tabela os com base os dados. No ltados da ex a da combina a tabela co deles. Como SAGE Anato riando de me r uma color resentado é gs analisada omparar o n as teciduais será obtido. o normal com essão do gen esmo interva ula. O padrã ões no padr patológicos eoplásicas. A minado tipo c terão seu nív a ou inativa ante um pro envolvimento ferentes man s proteínas. stituto Nacio ramenta mos nto de cada ó dos genes é analisado. A pressão Gên as de nucleot . Cada tag g g é identificad . Se um gen tags também m gene, mas expressão d urta) e as de um gene. Q . ando o símbo accession nu será aprese são apresen e em um Ra o lado direit xpressão de g ação de célu ontendo difer o a visualiza omic Viewer enor que 2 ( ração e mos feito com ba as no tecido nível de expr diferentes, j . m o cancer ne, quando o alo; (2) houv ão de ão de s. Um Ao se celular vel de ada. A ocesso o dos neiras, nal do stra a órgão, é feita A sigla nica. A tídeos gerada da em ne não m são s tags de um e 17pb Quanto olo do umber) entada ntados ank de to, da genes ulas e rentes ação é r. Nas < 2) a stra a ase na . Esta essão á que ígeno, o total ve um aume quant quan norm expre situaç há inf recon criter gene pode encon apres capaz colora outra recon símbo melho anális UNIVER CAMPUS CURSO Disciplin Prof. Jeff ento no níve tidade de ta do é observa al. Quando é essão e qua ções podem formações s Algumas ta nhecer outro iosa, uma ve de interesse m identifica ntra abaixo d sentada uma zes de ident ação rosada as tags que nheça outro( olo destes g or tag para se dos dados SIDADE FEDERA S DE PARNAÍBA DE BIOMEDICIN na: BIOINFORMÁ ferson Soares de el de expre ags em um ada uma red é observado ndo é obser aparecer as obre o padrã ags utilizada s genes. Ca ez que os da e. Para verif r outros ge da tabela qu a tabela com ificar a expre a são a melh também ide s) gene(s), a genes (Other o gene reco s. AL DO PIAUÍ NA ÁTICA Oliveira ssão do ge intervalo m dução na qua o aumento na rvada reduçã s informaçõe ão de expres as para iden aso isso ocor ados observa ficar se tags nes, devem ue apresenta m todas as essão deste or tag para o entificam o g aparecerá no r Gene(s) M onhece outro ene quando maior que aq antidade de a expressão, ão, temos u es “Not appli ssão deste ge ntificação de rra, a análise ados podem utilizadas pa os acessar a a melhor ta tags criada gene (List o o gene, as q gene. Caso o final da pág Mapping to A os genes, um no tecido n quele encont tags no tecid , esta alteraç ma hipoexpr icable” ou “N ene no órgão e um determ e dos dados não refletir o ara identifica o link “Vie ag para o ge as para o g f Tags for G que não estã alguma tag gina uma no Above Tag(s) ma vez que neoplásico é trado no tec do canceríge ção é classif ressão do g No data”, que o indicado. minado gene s deve ser fe o real padrão ação de um d w all tags f ne. Ao aces ene de inte ene). As tags ão marcadas g presente n ova tabela ind )). É importa este evento é observada cido normal eno em relaç ficada como ene. Em alg e indicam qu e podem tam eita de forma o de express determinado for gene” q ssar este link eresse e qu gs que aprese s em róseo s na tabela tam dicando o no ante verificarpode interfe a uma e (3) ção ao hiper- gumas ue não mbém a mais são do o gene ue se k, será e são entam são as mbém ome o r se a erir na
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