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Diagnóstico laboratorial em microbiologia Profa. Thais Revisão da aula passada • Microbiologia: bactérias, vírus e fungos • Importância: sanitária, ambiental, industrial, agrícola... • Microrganismos Causam infecção com ou sem doença • Hospedeiro-específicos • Oportunistas ou patogênicos • A doença depende: inóculo, infecção, sistema imunológico, patogenicidade da cepa Revisão da aula passada • Fatores de virulência: • Adesinas • Cápsula • Parede celular • Multiplicação • Depende de pH • Nutrição • Temperatura • Disponibilidade de ferro • Potencial de redução de oxidação Revisão da aula passada • Exo e endotoxinas Toxinas bacterianas Exotoxinas Endotoxinas Proteínas ou polipetídeos Lipopolissacarídeos Produzidos por Gram + e - Gram - Letais Letais em grandes quantidades Sensíveis ao calor, químicos e estocagem Estáveis ao calor, químicos e estocagem Podem ser convertidos em toxoides para produção de vacinas Não conversíveis em toxoides Efeito semelhante independente da bactéria Revisão da aula passada • Resposta imune inata e adquirida • Inata: • Anticorpos • Proteinas do sistema complemento • Enzimas • Proteinas de fase aguda • Proteinas ligadas a ferro • Imunidade adquirida • Celular e humoral Revisão da aula passada • Vírus em fase virêmica • Bactérias extracelulares Anticorpos O que indica Local de ação IgM Infecção recente Intravascular IgG Infecção secundária/tardia Intravascular Espaços teciduais IgE infecções parasitárias e reações de hipersensibilidade (vacinação) Subcutâneo Submucosa IgA Infecção viral ou bacteriana em mucosas Secreções (leite, saliva, mucosas) Revisão da aula passada • Cocos • Bacilos ou bastonetes • Filamentosas ou miceliais • Espiralados Revisão da aula passada • Parede bactérias Gram +, Gram – ou BAAR Mais permeável Rosa Micobactérias Impermeável à entrada de corantes básicos Resistência ao ressecamento e à desidratação Maior rigidez Roxa Diagnóstico laboratorial em microbiologia Profa. Thais Para que serve o diagnóstico? • Etiologia da doença • Tratamento de doenças infecciosas antibióticos • Tratamento de doenças não-infecciosas (ex.: corticoides) são contraindicados em casos de infecção • Isolamento do agente Colheita e transporte • Transporte rápido • Ressecamento e exposição a O2 LACEN “Para que o laboratório possa obter um resultado confiável não basta que execute as técnicas de forma correta, é necessário que receba uma amostra adequada em quantidade suficiente, recipiente apropriado, bem identificada, conservada e transportada corretamente”. 2017 Transporte e acondicionamento • Evitar vazamento e contaminação • Requisições de exames em saco plástico separadas das amostras • Colocar os tubos em estantes • Recipientes de transporte: • Manter a temperatura ideal; • Umidade • Identificados com o símbolo risco biológico Transporte • Meio de transporte • Solução em matriz gel • Não contém nutrientes • Pouca ou nenhuma multiplicação Transporte anaeróbios • Líquidos com bact. anaeróbias devem ser cultivados imediatamente • Ex.: exsudato, efusão, abscesso • Eliminar o ar da seringa e tampar com rolha estéril • Swab: meio de transporte anaeróbio (Stuart) • Temperatura AMBIENTE Transporte e acondicionamento Amostra Diagnóstico direto • Pesquisa vírus Diagnóstico indireto • Pesquisa de anticorpos Isolamento • Animais • Ovos embrionados • Cultivo celular Esfregaço direto • Observa forma • Coloração por Gram ou Romanowsky (Wright’s ou Giemsa) • Presença de microrganismos em locais estéreis significativo • Identificação de 1 bactéria/campo de imersão em óleo em urina que se deixou secar e foi corada representa 105 bactérias/ml de urina Cultivo bacteriano • Amostra é cultivada no meio • Quantidade de colônias na placa indica número de microrganismos na amostra • Não fazer enriquecimento • Exceto organismos como Salmonella • Microrganismos isolados de local estéril + células inflamatórias = infeção • Microrganismos isolados de local estéril sem células inflamatórias = contaminação da amostra • Meio enriquecido • Meio que favorece o crescimento de uma determinada espécie de bactérias • Aumenta o número de bactérias que se deseja isolar, Cultivo bacteriano • Bactérias aeróbias • Ágar sangue • Ágar MacConkey • Entéricos crescem bem, ex.: E. coli, Klebsiela, Enterobacter • Gram positivos não crescem Cultivo bacteriano • Bactérias anaeróbias • Ágar sangue • Livrar o meio de oxigênio • Bactérias anaeróbias: • Fístulas drenantes • Abcessos • Efusões • Piometra • Osteomielite • Fezes, urina, microbiota vaginal possuem bactérias anaeróbias, portanto a cultura não é indicada Jarra de anaerobiose Adição H2O envelope H2 + CO2 H2 + O2 = H2O + H Meios de cultivo • Devem permitir crescimento de microrganismos • Exceção de meios de transporte • Água, pH certo, oxigênio, estéril, temperatura ideal • Divididos quanto à consistência, natureza e composição Consistência do meio de cultura • Sólidos • Possuem nutrientes e ágar • Semi-sólidos • Possuem nutrientes e pequena porcentagem de ágar (0,5-0,8%) • Úteis em comprovar motilidade • Líquidos • Nutrientes em solução aquosa Natureza do meio de cultura • Animado • Constituído de células vivas • Ex.: animais, ovo embrionário, tecidos • Inanimado • Não possui células vivas • Natural • Ex.: leite • Sintético • Preparado em laboratório • Ex.: ágar Composição do meio de cultura • Meio rico • Permite crescimento de microrganismos • Possui nutrientes • Pode possuir sangue, soro ou extrato de tecidos (ex.: extrato de carne) Diagnóstico de doenças virais • Isolamento e identificação viral: • Surto de doença vesicular (ex.: aftosa) • Em casos de doenças que afetem todo o rebanho Fonte: BRASIL (2009) Fonte: BRASIL (2009) Métodos moleculares • Quando a cultura é demorada • Necessidade de diagnóstico rápido • Agentes infecciosos que ameaçam outros animais e pessoas Diagnóstico de doenças virais • Diagnóstico rápido para evitar transmissão • Isolamento e identificação quando: • Surto de doença vesicular • Em doenças de rebanhos • Etiologia deve ser conhecida devido ao potencial zoonótico • Em casos de exposição humana • Para identificar incidência e prevalência de doenças Diagnóstico de doenças virais Em casos de eutanásia, coletar amostras teciduais frescas Tipo de lesão Idade e espécie Tamanho da carcaça Tipo de doença Respiratória (pulmões, traqueia) Vesicular (pele, vesículas) Diagnóstico de doenças virais • Anamnese • Soroconversão (sorologia pareada) • Isolamento e identificação • Identificação de animais infectados eliminação do rebanho • Isolamento viral não significa que o vírus é o causador da doença • É comum isolamento de vírus vacinal atenuado Isolamento viral • Cultivo celular • Cultura celular primária • Ovos embrionados • Animais de laboratório • Culturas celulares são observadas por 7-10 dias • Efeito citopático ocorre entre 24-72 horas Isolamento viral • Isolamento em ovos embrionados Isolamento viral • Inoculação em Animais • Informações sobre tropismo celular • Virulência • Patogenia • Transmissibilidade • Observação diária • Coleta de sangue • Necropsia de animais mortos • Isolamento viral e histopatologia em tecidos coletados • Incineração da carcaça Fonte: O camundongo como animal de experimentação Identificação viral • Microscopia EletrônicaFonte: ALMEIDA et al. (2008) Identificação viral • Imunofluorescência Identificação viral • Reação em cadeia da Polimerase (PCR) ELISA Detecção sorológica de vírus • Soroneutralização (SN) • Neutralização Viral no Soro Detecção sorológica de vírus • Inibição da Hemaglutinação (HI) • Alguns vírus possuem hemaglutinina • Quando o vírus infecta, há produção de anticorpos contra as hemaglutininas virais • Os Ac se combinam ao vírus impedindo a hemaglutinação Detecção sorológica de vírus • Fixação do Complemento (FC) Detecção sorológica de vírus • Imunodifusão Detecção sorológica de vírus • Radioimunoensaio Detecção sorológica de vírus • Western Immunoblot Uso de anticorpos monoclonais • Anticorpos pertencem a uma classe de proteínas, conhecidas como imunoglobulinas • Produzidas e secretadas por linfócitos B em resposta à estimulação por antígenos • Anticorpos monoclonais são anticorpos produzidos por um único clone de um linfócito B • São anticorpos idênticos em relação às suas propriedades físico-químicas e biológicas • Gerados em laboratório para reconhecer e se ligar a qualquer antígeno de interesse Uso de anticorpos monoclonais • Anticorpos pertencem a uma classe de proteínas, conhecidas como imunoglobulinas • Epecíficos para uma única região do antígeno (epítopo) • mAbs são usados na produção de kits para diagnósticos ou pesquisa científica Doença Nome comum ou vírus associado Amostras a coletar Testes diagnósticos Respiratória Adenovírus (hepatite infecciosa canina) Baço, fígado, linfonodos, rins e sangue VI, HHA, FA, VN Diarreia viral bovina (pestivírus) Secreções nasais, lesões orais, pulmão, baço, sangue etc VI, FA, VN Influenza (equina, suína) (ortomixovírus) Secreção nasal, ocular, pulmão, swab traqueal VI, HA, HI Entérica Parvovírus Fezes, mucosa intestinal, linfonodos regionais, cérebro, coração VI, FA, EM, HA, HI, VN Sistema Nervoso Central Raiva (lissavírus) Cérebro, glândula salivar VI, FA, VN Mucosas e pele Febre aftosa Lesões, tonsilas, líquido vesicular, líq. esofágicos-faríngeos VI, CF, VN, FA, AGID, ELISA Genital Arterite viral equina (pestivírus) Sangue total, secreções, feto, baço VI, CF, FA, AGID Síndrome hemorrágica Anemia infecciosa equina (retrovírus) Sangue, baço, linfonodos VI, FA, VN, CF, ELISA, AGID Exercícios • A amostra adequada de ferida para cultivo de microrganismos anaeróbicos pode ser obtida: • a) Swab de lesão obtido antes da administração de antibióticos. • b) Swab de lesão obtido após a administração de antibióticos. • c) Aspirado com seringa da secreção antes da administração de antibióticos. • d) Aspirado com seringa da secreção após a administração de antibióticos • Uma amostra de secreção de abscesso da parede abdominal recebida pelo laboratório apresentou um crescimento abundante de microrganismos após semeadura em anaerobiose; entretanto, não apresentou nenhum crescimento após semeadura em aerobiose. Essa cultura contém: • a) Um aeróbio obrigatório • b) Um anaeróbio facultativo • c) Um anaeróbio obrigatório • d) Nenhuma das alternativas • A microscopia em campo escuro é mais frequentemente usada para estudo de: • a) Fungos • b) Micobacterias • c) Núcleo de parasitas • d) Espiroquetas • A morfologia típica de Staphylococcus é: • a) Cocos em cadeia. • b) Bacilos filamentosos. • c) Cocos agrupados em cachos. • d) Cocobacilos. Referências • ALMEIDA, Sabrina R. et al . Caracterização clinicopatológica da mamilite aguda em ovelhas lactantes infectadas experimentalmente com o herpesvírus bovino 2. Pesq. Vet. Bras., Rio de Janeiro , v. 28, n. 1, p. 87-94, Jan. 2008 . Available from <http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100- 736X2008000100014&lng=en&nrm=iso>. access on 12 Feb. 2018. http://dx.doi.org/10.1590/S0100- 736X2008000100014. • BRASIL. Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento. Coletânea de Imagens. Lesões de febre aftosa e de outras doenças incluídas no sistema nacional de vigilância de doenças vesiculares. Brasília, 2009.
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