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EXTRAÇÃO DE ÁCIDOS NUCLÉICOS Extração de Ácidos Nucléicos Vírus Bactérias Fungos Protozoários Helmintos DNA Diagnóstico Pesquisa RNA Extração de DNA Lise das células Desproteinização Concentração do DNA Extração de DNA Lisozima EDTA SDS Extração de DNA Extração de DNA Lise celular: - Rompimento da célula (membrana e parede) - Liberação do conteúdo citoplasmático detergente tampão quelante pH ≥ 7 lise estabilidade DNases DNA Extração de DNA extrato celular resíduos celulares Nomograma Força G / RPM Extração de DNA Desproteinização: - Separação de proteínas, lipídeos e restos celulares solvente orgânico centrifugação fase orgânica fase aquosa Extração de DNA ProteaseRNase Extração de DNA Concentração do DNA: - Precipitação do DNA através do álcool solução aquosa centrifugação DNA etanol Extração de DNA Solubilização do DNA DNA água NaOH 8mM (overnight a 4oC) (uso imediato) Estocagem do DNA DNA água etanol (4oC) (- 70oC) uma semana um ano Quantificação da concentração de DNA Absorbância de Luz Ultravioleta DNA A260 = 1 (50 μg/ml de DNA) Proteína A280 = 0.5 (25 μg/ml de proteína) A260/ A280 ≥ 1,8 (< 1,8 contaminação) Quantificação da concentração de DNA - Representa a quantidade de DNA dupla fita - Não necessariamente uma única dupla fita - Razão menor que 1,8 indica contaminação com proteínas ou fenol Extração de DNA com CTAB CTAB (brometo de cetiltrimetilamônio) Extração de DNA com Tiocianato de Guanidina Extração de DNA com Tiocianato de Guanidina Extração de RNA - RNA suscetível à degradação e autodegradação - Ribonucleases são estáveis, difícil inativação e não necessitam de co-fatores - Equipamentos e reagentes isentos de ribonucleases Β-mercaptoetanol Extração de RNA Lise celular detergente tampão inibidor pH < 7 lise RNA estável RNases DNA Extração de RNA Desproteinização: solvente orgânico centrifugação fase orgânica fase aquosa Extração de RNA Concentração do RNA: solução aquosa centrifugação RNA etanol Solubilização do RNA RNA uso imediato água + inibidor (overnight a 4oC) Estocagem do RNA RNA etanol etanol (- 20oC) ou um mês água + inibidor (- 70oC) alguns anos Slide Number 1 Extração de Ácidos Nucléicos Extração de DNA Extração de DNA Extração de DNA Extração de DNA Extração de DNA Nomograma Força G / RPM Extração de DNA Extração de DNA Extração de DNA Extração de DNA Solubilização do DNA Estocagem do DNA Quantificação da concentração de DNA Quantificação da concentração de DNA Extração de DNA com CTAB Extração de DNA com Tiocianato de Guanidina Extração de DNA com Tiocianato de Guanidina Extração de RNA Extração de RNA Extração de RNA Extração de RNA Solubilização do RNA Estocagem do RNA
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